{"hash":"314218456245660006","title":"TLR/MyD88-Dependent Transcriptional Regulation","description":"Reasoning: The cluster's top GO terms center on DNA-templated transcription and its regulation, with a clear signal from MyD88-dependent Toll-like receptor signaling and positive regulation of TNF production, pointing to innate immune signaling driving transcriptional programs. Pale hints of histone acetylation suggest potential chromatin remodeling accompanying transcriptional activation. The manganese ion response is incidental. Overall, this suggests a module of innate immune signaling converging on transcriptional control.","confidence":"Medium","size":18,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_065932865.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065943105.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065934975.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065939325.1","go_terms":["GO:0044154","GO:0043968","GO:0043983","GO:0043981","GO:0043982","GO:0006355","GO:0006351"]},{"accession":"XP_011439399.3","go_terms":["GO:1903351","GO:0035751","GO:0016336","GO:0071169","GO:0034130","GO:1903125","GO:0045842","GO:2000172","GO:1904887","GO:0070340","GO:1902499","GO:0060161","GO:0051014","GO:1905289","GO:0014041","GO:0022028","GO:0035564","GO:0002755","GO:0071287","GO:0090394","GO:1903215","GO:1905279","GO:0016567"]},{"accession":"XP_011456876.3","go_terms":["GO:1990166","GO:1903518","GO:0090263","GO:0051106","GO:0051103","GO:0070212","GO:0070213","GO:0008210","GO:0043504","GO:0090299","GO:0006987","GO:0035080","GO:0032212","GO:0051225","GO:1904743","GO:1904646","GO:1904762","GO:1904355","GO:1904357","GO:0048745","GO:2001170","GO:0008209","GO:0008585","GO:1904908","GO:1904044","GO:0071360","GO:0006273","GO:0016055","GO:0070198","GO:1990966","GO:0045581","GO:0070936","GO:0007219","GO:0090141","GO:0045071","GO:0006471","GO:0042787","GO:0061014","GO:0016348","GO:1901315","GO:0034389","GO:0019433","GO:0051865"]},{"accession":"XP_034300891.1","go_terms":["GO:0010152","GO:0000278","GO:0070979","GO:0051301","GO:0010229","GO:0061614"]},{"accession":"XP_034304660.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_034311517.1","go_terms":["GO:0030886","GO:1901223","GO:0007166","GO:0030913","GO:0046813","GO:0045747","GO:0043128","GO:0014005","GO:0035646","GO:2001046","GO:0007601","GO:1904352","GO:0061462","GO:0060219","GO:2000680","GO:0061298","GO:0031623","GO:0071404","GO:0090528","GO:2000145","GO:1900746"]},{"accession":"XP_034337852.1","go_terms":["GO:0007427","GO:0046011","GO:0006915","GO:0035289","GO:1902108"]},{"accession":"XP_065929381.1","go_terms":["GO:0006355","GO:0006351"]},{"accession":"XP_065931463.1","go_terms":["GO:0006954","GO:0051607","GO:0034138","GO:0042116","GO:1902350","GO:0034154","GO:0034158","GO:0008063","GO:0050729","GO:0045078","GO:0050707","GO:0010080","GO:0006963","GO:0002322","GO:0032722","GO:0043330","GO:0032741","GO:0045087","GO:1900155","GO:0034162","GO:0050830","GO:0034166","GO:0034142","GO:0007352","GO:0002730","GO:0009729","GO:0002755","GO:0002756","GO:0045416","GO:0045356","GO:0045359","GO:0009620","GO:0048833","GO:0009934","GO:0032621","GO:0071225","GO:2000321","GO:0061303","GO:0034134","GO:0030335","GO:0050701","GO:2000813","GO:0002606","GO:0051639","GO:0051638","GO:0032498","GO:0030011","GO:0050829","GO:0044546","GO:0043086","GO:0051770","GO:0006404","GO:0045345","GO:0002374","GO:0006409","GO:0043124","GO:0006407","GO:0032760","GO:0031146","GO:0032611","GO:0002830","GO:0042228","GO:0060335","GO:0035882","GO:0050711","GO:0042345","GO:0031663","GO:0050718","GO:0016045","GO:0032088","GO:1904417","GO:0046827","GO:0032715","GO:0070431","GO:1902745","GO:0032755"]},{"accession":"XP_065932036.1","go_terms":["GO:0008625","GO:0060268","GO:0021816","GO:0030036","GO:0090051","GO:0035024","GO:0098886","GO:0048009","GO:0035021","GO:0008272","GO:0051895","GO:0043547","GO:0051497","GO:0030183","GO:0046856","GO:1904425","GO:2001136","GO:0032760","GO:0007480","GO:0002692","GO:0046626","GO:0090334","GO:0060313","GO:0007264","GO:0042993","GO:0098887","GO:0060396","GO:0043314","GO:0051531","GO:0090038","GO:1900144","GO:0051684","GO:0045671","GO:0051683","GO:1900103","GO:0043114","GO:0097498"]},{"accession":"XP_065932551.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065935992.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_011430850.3","go_terms":["GO:0000055","GO:0032298","GO:0000398","GO:1903026","GO:0060707","GO:0003323","GO:0060806","GO:0035270","GO:0060972","GO:0060536","GO:0003198","GO:0007498","GO:0060021","GO:0031069","GO:0010957"]},{"accession":"XP_011446824.3","go_terms":[]},{"accession":"XP_011452258.3","go_terms":[]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0043982":1,"GO:0043968":1,"GO:0006355":2,"GO:0043983":1,"GO:0006351":2,"GO:0044154":1,"GO:0043981":1,"GO:0071287":1,"GO:1903215":1,"GO:2000172":1,"GO:0051014":1,"GO:0035564":1,"GO:0014041":1,"GO:0060161":1,"GO:1904887":1,"GO:0016336":1,"GO:0034130":1,"GO:1905289":1,"GO:0035751":1,"GO:0022028":1,"GO:0090394":1,"GO:1905279":1,"GO:1903351":1,"GO:1903125":1,"GO:0070340":1,"GO:0002755":2,"GO:1902499":1,"GO:0016567":1,"GO:0045842":1,"GO:0071169":1,"GO:0016055":1,"GO:0006471":1,"GO:0043504":1,"GO:1904355":1,"GO:0045581":1,"GO:0019433":1,"GO:0070198":1,"GO:0048745":1,"GO:0070212":1,"GO:0090141":1,"GO:1901315":1,"GO:1904908":1,"GO:0061014":1,"GO:1903518":1,"GO:0008210":1,"GO:0016348":1,"GO:0006273":1,"GO:1904044":1,"GO:1990166":1,"GO:0051103":1,"GO:0051225":1,"GO:0008585":1,"GO:1904646":1,"GO:0008209":1,"GO:1990966":1,"GO:0035080":1,"GO:0006987":1,"GO:0070213":1,"GO:0045071":1,"GO:0007219":1,"GO:0042787":1,"GO:0051106":1,"GO:2001170":1,"GO:1904762":1,"GO:0090299":1,"GO:0032212":1,"GO:1904357":1,"GO:0071360":1,"GO:0090263":1,"GO:0051865":1,"GO:1904743":1,"GO:0034389":1,"GO:0070936":1,"GO:0051301":1,"GO:0070979":1,"GO:0010152":1,"GO:0000278":1,"GO:0061614":1,"GO:0010229":1,"GO:2000145":1,"GO:1901223":1,"GO:2001046":1,"GO:0046813":1,"GO:0043128":1,"GO:0090528":1,"GO:0030886":1,"GO:0045747":1,"GO:0061298":1,"GO:0071404":1,"GO:0035646":1,"GO:0014005":1,"GO:0030913":1,"GO:0031623":1,"GO:1904352":1,"GO:0007166":1,"GO:1900746":1,"GO:2000680":1,"GO:0061462":1,"GO:0060219":1,"GO:0007601":1,"GO:0046011":1,"GO:1902108":1,"GO:0007427":1,"GO:0006915":1,"GO:0035289":1,"GO:0048833":1,"GO:2000321":1,"GO:0016045":1,"GO:0002374":1,"GO:0002730":1,"GO:0042345":1,"GO:0006407":1,"GO:0002606":1,"GO:0050830":1,"GO:0008063":1,"GO:0009729":1,"GO:0042116":1,"GO:0009934":1,"GO:0002830":1,"GO:0034134":1,"GO:0045078":1,"GO:2000813":1,"GO:0051639":1,"GO:0032498":1,"GO:0007352":1,"GO:0051770":1,"GO:0045345":1,"GO:0031146":1,"GO:0060335":1,"GO:1900155":1,"GO:0070431":1,"GO:0032755":1,"GO:0032722":1,"GO:0034166":1,"GO:0043124":1,"GO:0071225":1,"GO:0006954":1,"GO:0050701":1,"GO:0002322":1,"GO:0044546":1,"GO:0045356":1,"GO:0050829":1,"GO:1902350":1,"GO:0032088":1,"GO:0050707":1,"GO:0032715":1,"GO:0034158":1,"GO:0032611":1,"GO:0050729":1,"GO:0030011":1,"GO:0009620":1,"GO:0043330":1,"GO:0010080":1,"GO:0034138":1,"GO:0006963":1,"GO:0034142":1,"GO:0043086":1,"GO:1904417":1,"GO:0034154":1,"GO:0032760":2,"GO:0006404":1,"GO:0050711":1,"GO:0051607":1,"GO:0002756":1,"GO:0050718":1,"GO:0045359":1,"GO:0061303":1,"GO:0035882":1,"GO:0032741":1,"GO:0045087":1,"GO:0042228":1,"GO:0031663":1,"GO:0045416":1,"GO:0046827":1,"GO:1902745":1,"GO:0030335":1,"GO:0032621":1,"GO:0051638":1,"GO:0034162":1,"GO:0006409":1,"GO:0060313":1,"GO:1900144":1,"GO:0090334":1,"GO:0090051":1,"GO:0051683":1,"GO:0098887":1,"GO:0051497":1,"GO:0051684":1,"GO:0042993":1,"GO:0060268":1,"GO:0046856":1,"GO:0043314":1,"GO:0007264":1,"GO:0048009":1,"GO:0021816":1,"GO:0030036":1,"GO:0030183":1,"GO:0045671":1,"GO:0051895":1,"GO:0035024":1,"GO:0043547":1,"GO:0043114":1,"GO:0007480":1,"GO:0097498":1,"GO:0046626":1,"GO:0060396":1,"GO:0090038":1,"GO:0002692":1,"GO:0008272":1,"GO:2001136":1,"GO:1904425":1,"GO:0008625":1,"GO:0051531":1,"GO:1900103":1,"GO:0035021":1,"GO:0098886":1,"GO:1903026":1,"GO:0007498":1,"GO:0060972":1,"GO:0031069":1,"GO:0000398":1,"GO:0060021":1,"GO:0060536":1,"GO:0003323":1,"GO:0060806":1,"GO:0010957":1,"GO:0060707":1,"GO:0032298":1,"GO:0000055":1,"GO:0003198":1,"GO:0035270":1},"recipe_readded":["XP_011421779.3","XP_011419265.3","XP_011427033.3","XP_065928494.1","NP_001292251.1","XP_065926929.1","XP_065921904.1","XP_034335189.2","XP_011454365.3","XP_034304505.2","XP_034315777.2"]}