{"hash":"1850702342916928005","title":"Gene Regulation and Autophagy","description":"This cluster centers on regulatory processes governing gene expression and cellular turnover, highlighted by autophagy, epigenetic programming, and inhibition of protein degradation, with supporting links to immune signaling (NF-kappaB/MHC I). Despite some organism-specific terms, the dominant theme is regulation of transcriptional programs and protein homeostasis.","confidence":"Medium","size":23,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":"autophagy","members":[{"accession":"XP_065926051.1","go_terms":["GO:0045087","GO:0090086","GO:0007026","GO:1902187","GO:0035372","GO:0043569","GO:0046597","GO:0048384","GO:0046598","GO:1900458","GO:0070842","GO:1900246","GO:0071641","GO:0043045","GO:1902261","GO:1901536","GO:2000059","GO:1900226","GO:0007182","GO:0070562","GO:0001778","GO:0006914","GO:0043123","GO:0036353","GO:0007014","GO:0030578","GO:1903762","GO:0061158","GO:0051092","GO:0060669","GO:0032897","GO:0050713","GO:0051607","GO:0045345","GO:0031664","GO:0070534","GO:0045869","GO:0051865","GO:1901253","GO:2000637","GO:2000653"]},{"accession":"XP_065930416.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065943068.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_011417017.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_011423000.3","go_terms":["GO:0016558","GO:0016557","GO:0045046","GO:0032581","GO:0048137","GO:0022615"]},{"accession":"XP_011444296.3","go_terms":[]},{"accession":"XP_065931325.1","go_terms":["GO:0007469","GO:0006355","GO:0006351","GO:0045316"]},{"accession":"XP_065936194.1","go_terms":["GO:0051044","GO:0072584","GO:0038028","GO:0046664","GO:0048268","GO:0050904","GO:0030050","GO:0048488","GO:0030708","GO:0046847","GO:0036006","GO:0031532","GO:0038109","GO:1904703","GO:0070102","GO:0007015","GO:0060996","GO:0048666","GO:0021816","GO:0051489","GO:0035426","GO:0010762","GO:0090339","GO:0044331","GO:0042058","GO:0036119","GO:0051092","GO:0038095","GO:0042503","GO:0036010","GO:0010324","GO:0097320","GO:1903476","GO:0033007","GO:0045806","GO:0070836"]},{"accession":"XP_065938875.1","go_terms":["GO:0045087","GO:0090086","GO:0007026","GO:1902187","GO:0035372","GO:0043569","GO:0046597","GO:0048384","GO:0046598","GO:1900458","GO:0070842","GO:1900246","GO:0071641","GO:0043045","GO:1902261","GO:1901536","GO:2000059","GO:1900226","GO:0007182","GO:0070562","GO:0001778","GO:0006914","GO:0043123","GO:0036353","GO:0007014","GO:0030578","GO:1903762","GO:0061158","GO:0051092","GO:0060669","GO:0032897","GO:0050713","GO:0051607","GO:0045345","GO:0031664","GO:0070534","GO:0045869","GO:0051865","GO:1901253","GO:2000637","GO:2000653"]},{"accession":"XP_011426899.3","go_terms":["GO:0035775","GO:0023019","GO:0051891","GO:0003344","GO:0003151","GO:0001829","GO:0002302","GO:0030857","GO:0045662","GO:0043282","GO:0042684","GO:0060017","GO:0021524","GO:0003294","GO:0003007","GO:0072045","GO:0003215","GO:0007521","GO:0001756","GO:0060044","GO:0003166","GO:0003167","GO:0014028","GO:0003218","GO:0035844","GO:0060395","GO:0060413","GO:0060412","GO:0042694","GO:0021554","GO:0046551","GO:0003281","GO:0021538","GO:0055109","GO:0003342","GO:0003175","GO:0003205","GO:0060931","GO:0003203","GO:0014018","GO:0036342","GO:0060465","GO:0048318","GO:0048705","GO:0048706","GO:0008015","GO:0048620","GO:0060923","GO:0021895","GO:0039023","GO:1901211","GO:0060809","GO:0035922","GO:0097156","GO:0008595","GO:0010159","GO:0010092","GO:0006351","GO:0003180","GO:0003181","GO:0035909","GO:0021902","GO:0048304","GO:0035223","GO:0060596","GO:0048389","GO:0060045","GO:0021764","GO:0060577","GO:1901208","GO:0021761","GO:0030324","GO:0001661","GO:0001707","GO:0030381","GO:0030540","GO:0001947","GO:0032275","GO:0003197","GO:0060444","GO:0003193","GO:0010991","GO:0021796","GO:0048332","GO:0042733","GO:0046884","GO:0021772","GO:0072001","GO:0007402","GO:0001714","GO:0072513","GO:0061371","GO:0003257","GO:0032609","GO:0010002","GO:0061327","GO:0060028","GO:0060023","GO:0060349","GO:0060021","GO:0021982","GO:0021983","GO:0036302","GO:0036306","GO:0032525","GO:0060039","GO:0070121","GO:0060034","GO:0001570","GO:0035050","GO:0048596","GO:0035115","GO:0035116","GO:0014043","GO:0035294","GO:0035119","GO:0035462","GO:0007341","GO:0001839","GO:0003146","GO:0043704","GO:0003148","GO:0090398","GO:0030539","GO:0003272","GO:0007509","GO:2000223"]},{"accession":"XP_011428769.3","go_terms":[]},{"accession":"XP_019929315.3","go_terms":["GO:0045087","GO:0090086","GO:0007026","GO:1902187","GO:0035372","GO:0043569","GO:0046597","GO:0048384","GO:0046598","GO:1900458","GO:0070842","GO:1900246","GO:0071641","GO:0043045","GO:1902261","GO:1901536","GO:2000059","GO:1900226","GO:0007182","GO:0070562","GO:0001778","GO:0006914","GO:0043123","GO:0036353","GO:0007014","GO:0030578","GO:1903762","GO:0061158","GO:0051092","GO:0060669","GO:0032897","GO:0050713","GO:0051607","GO:0045345","GO:0031664","GO:0070534","GO:0045869","GO:0051865","GO:1901253","GO:2000637","GO:2000653","GO:1903265","GO:1903886","GO:1903883","GO:0035278","GO:0018032","GO:0072089","GO:0010586","GO:0001519"]},{"accession":"XP_034315808.2","go_terms":["GO:1903779","GO:0007614","GO:0007596","GO:2001238","GO:0032967","GO:0070371","GO:0001822","GO:0007595","GO:0051055","GO:0033668","GO:0032930","GO:2000098","GO:0014824","GO:0001999","GO:0010976","GO:0010873","GO:0001300","GO:0007202","GO:0048505","GO:0042177","GO:1904754","GO:0010535","GO:0021683","GO:0060570","GO:0048711","GO:0071260","GO:0090181","GO:0035411","GO:0042311","GO:0060770","GO:0035009","GO:0048169","GO:0002438","GO:0002034","GO:1901201","GO:0042628","GO:0030199","GO:0006883","GO:0045893","GO:0061098","GO:1904707","GO:0045721","GO:0071279","GO:0090190","GO:0035425","GO:0006953","GO:0051604","GO:0003331","GO:0051966","GO:0048659","GO:0051969","GO:0035491","GO:0007204","GO:1902042","GO:0030308","GO:0090207","GO:0048144","GO:0032964","GO:0061107","GO:0045429","GO:1905010","GO:0061108","GO:0042270","GO:0003051","GO:0002027","GO:0045879","GO:0045742","GO:0001869","GO:0010766","GO:0070471","GO:0050974","GO:2000352","GO:0090331","GO:0014068","GO:0014067","GO:0014061","GO:2000266","GO:0060291","GO:0007565","GO:0002018","GO:0045777","GO:2001275","GO:0042730","GO:0060512","GO:0033363","GO:0051387","GO:0014912","GO:0010666","GO:0008211","GO:0061044","GO:0061049","GO:0001525","GO:0050663","GO:0002009","GO:0090026","GO:0045766","GO:0033629","GO:0003433","GO:0035815","GO:0046628","GO:0034104","GO:0007584","GO:0070327","GO:0002448","GO:0051403","GO:0010951","GO:1905589","GO:0010595","GO:0002019","GO:0010596","GO:0060384","GO:0051918","GO:0010757","GO:0071636","GO:0032757","GO:1903598"]},{"accession":"XP_034325582.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_065922911.1","go_terms":["GO:0007427","GO:0046011","GO:0006915","GO:0035289","GO:1902108"]},{"accession":"XP_065925398.1","go_terms":["GO:1905663","GO:1902625","GO:0048025","GO:0048026","GO:0075522","GO:0075525","GO:0000380","GO:0016556","GO:0001825","GO:1900363","GO:0002188","GO:0000381","GO:1903586","GO:0006406","GO:0006446","GO:0060211","GO:0031047","GO:0048255","GO:0035278","GO:0001731","GO:0010610","GO:0045292","GO:1901407","GO:0097010","GO:0006376","GO:0034462","GO:0006378"]},{"accession":"XP_065928691.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_019920303.3","go_terms":[]},{"accession":"XP_034323344.2","go_terms":["GO:0030224","GO:0032786","GO:0046784","GO:0060215","GO:2000002"]},{"accession":"XP_065928197.1","go_terms":["GO:0008625","GO:0010923","GO:2000327","GO:0097192","GO:0090200","GO:0001844"]},{"accession":"XP_065936843.1","go_terms":["GO:0030011","GO:0031175","GO:0051301","GO:0061163","GO:0030382","GO:0000921","GO:0000281","GO:0016476","GO:1902857","GO:0017157","GO:0031107","GO:0030154","GO:0000278","GO:0051291","GO:0007283","GO:0007056","GO:0051311","GO:0010458","GO:0000917","GO:0032186","GO:0007224","GO:0097271","GO:0000747","GO:0042274","GO:0000055","GO:0042254","GO:1901001","GO:0002181","GO:1903833","GO:0006400","GO:0090529","GO:0007049","GO:1903204","GO:0071447","GO:1902083"]},{"accession":"XP_065941849.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_034306326.2","go_terms":["GO:1903351","GO:0000186","GO:0035751","GO:0090263","GO:0061001","GO:0007264","GO:0035641","GO:1900242","GO:1903206","GO:1902692","GO:2000172","GO:1903125","GO:0090394","GO:1903215","GO:0048312","GO:1904887","GO:1902499","GO:0099139","GO:0060161","GO:0034260","GO:1905289","GO:0051966","GO:0014041","GO:0051683","GO:0060079","GO:1902236","GO:0022028","GO:0035564","GO:0045453","GO:0071287","GO:0050732","GO:1902902","GO:0036035","GO:0051900","GO:1905279","GO:0010738","GO:2000300"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0006914":3,"GO:1900458":3,"GO:2000059":3,"GO:0060669":3,"GO:1901536":3,"GO:1901253":3,"GO:0045869":3,"GO:0043045":3,"GO:0051092":4,"GO:0045345":3,"GO:2000653":3,"GO:0031664":3,"GO:1902261":3,"GO:1902187":3,"GO:0090086":3,"GO:0050713":3,"GO:0007014":3,"GO:0048384":3,"GO:0070562":3,"GO:0071641":3,"GO:0035372":3,"GO:0007182":3,"GO:2000637":3,"GO:0001778":3,"GO:0046597":3,"GO:1900226":3,"GO:0070534":3,"GO:0046598":3,"GO:0030578":3,"GO:0051607":3,"GO:0036353":3,"GO:0043569":3,"GO:1903762":3,"GO:0043123":3,"GO:0045087":3,"GO:0061158":3,"GO:0007026":3,"GO:0070842":3,"GO:0051865":3,"GO:0032897":3,"GO:1900246":3,"GO:0016558":1,"GO:0048137":1,"GO:0022615":1,"GO:0016557":1,"GO:0032581":1,"GO:0045046":1,"GO:0045316":1,"GO:0006355":1,"GO:0006351":2,"GO:0007469":1,"GO:0051044":1,"GO:0048268":1,"GO:0050904":1,"GO:0031532":1,"GO:0044331":1,"GO:0010762":1,"GO:0046664":1,"GO:0007015":1,"GO:0070102":1,"GO:0030050":1,"GO:0036119":1,"GO:1903476":1,"GO:0072584":1,"GO:0036010":1,"GO:0033007":1,"GO:0021816":1,"GO:1904703":1,"GO:0038109":1,"GO:0090339":1,"GO:0036006":1,"GO:0070836":1,"GO:0097320":1,"GO:0048666":1,"GO:0060996":1,"GO:0030708":1,"GO:0051489":1,"GO:0042503":1,"GO:0038028":1,"GO:0045806":1,"GO:0010324":1,"GO:0038095":1,"GO:0048488":1,"GO:0035426":1,"GO:0042058":1,"GO:0046847":1,"GO:0021895":1,"GO:0021524":1,"GO:0048389":1,"GO:0090398":1,"GO:0003180":1,"GO:0003197":1,"GO:0007521":1,"GO:0048304":1,"GO:0035116":1,"GO:0003344":1,"GO:0039023":1,"GO:0070121":1,"GO:0060017":1,"GO:0030857":1,"GO:1901208":1,"GO:0036306":1,"GO:0010002":1,"GO:0035909":1,"GO:0035223":1,"GO:0021761":1,"GO:0048620":1,"GO:0061371":1,"GO:0060413":1,"GO:0001570":1,"GO:0014043":1,"GO:0060809":1,"GO:0003181":1,"GO:0060444":1,"GO:0014018":1,"GO:0060045":1,"GO:0043704":1,"GO:0003342":1,"GO:0003166":1,"GO:0003294":1,"GO:0002302":1,"GO:0046551":1,"GO:0035294":1,"GO:0072001":1,"GO:0001756":1,"GO:0042684":1,"GO:0032525":1,"GO:0003205":1,"GO:0060465":1,"GO:0035115":1,"GO:0048596":1,"GO:0003193":1,"GO:0035462":1,"GO:0021796":1,"GO:0060577":1,"GO:0021554":1,"GO:0007509":1,"GO:0060412":1,"GO:0035119":1,"GO:0060923":1,"GO:0003146":1,"GO:0032275":1,"GO:0010991":1,"GO:0048318":1,"GO:0036342":1,"GO:0003167":1,"GO:0021764":1,"GO:0010092":1,"GO:0003203":1,"GO:0048705":1,"GO:0008015":1,"GO:0046884":1,"GO:0007341":1,"GO:0060349":1,"GO:0060028":1,"GO:0042733":1,"GO:0036302":1,"GO:0030381":1,"GO:2000223":1,"GO:0042694":1,"GO:0060395":1,"GO:0003175":1,"GO:0032609":1,"GO:0003215":1,"GO:0097156":1,"GO:0060023":1,"GO:0001829":1,"GO:0045662":1,"GO:0021772":1,"GO:0001839":1,"GO:0001661":1,"GO:0023019":1,"GO:0003257":1,"GO:0060596":1,"GO:0007402":1,"GO:0003281":1,"GO:0003272":1,"GO:0072513":1,"GO:0060931":1,"GO:0048706":1,"GO:0060044":1,"GO:0043282":1,"GO:0003151":1,"GO:0021538":1,"GO:0030540":1,"GO:0060034":1,"GO:0048332":1,"GO:0061327":1,"GO:0021983":1,"GO:0001707":1,"GO:0003218":1,"GO:0003148":1,"GO:0030539":1,"GO:0060021":1,"GO:0021902":1,"GO:0001714":1,"GO:0010159":1,"GO:0060039":1,"GO:0014028":1,"GO:0035922":1,"GO:0072045":1,"GO:0035844":1,"GO:0035775":1,"GO:0003007":1,"GO:0051891":1,"GO:0035050":1,"GO:0055109":1,"GO:0021982":1,"GO:1901211":1,"GO:0008595":1,"GO:0030324":1,"GO:0001947":1,"GO:0072089":1,"GO:0010586":1,"GO:1903883":1,"GO:0001519":1,"GO:1903265":1,"GO:0018032":1,"GO:1903886":1,"GO:0035278":2,"GO:0007596":1,"GO:0060770":1,"GO:0090181":1,"GO:1905589":1,"GO:0010976":1,"GO:0048659":1,"GO:0090026":1,"GO:0032757":1,"GO:0014824":1,"GO:0033629":1,"GO:0007565":1,"GO:2000352":1,"GO:0003433":1,"GO:0010535":1,"GO:0001822":1,"GO:0010666":1,"GO:0032967":1,"GO:0051403":1,"GO:0061098":1,"GO:0050663":1,"GO:1904754":1,"GO:1901201":1,"GO:0051969":1,"GO:0001525":1,"GO:0010766":1,"GO:0048505":1,"GO:0046628":1,"GO:0007202":1,"GO:0035815":1,"GO:0045879":1,"GO:0010595":1,"GO:0008211":1,"GO:0045721":1,"GO:0032964":1,"GO:0048144":1,"GO:0045429":1,"GO:2000098":1,"GO:1902042":1,"GO:0007614":1,"GO:0070471":1,"GO:2001238":1,"GO:0033668":1,"GO:0014067":1,"GO:0007204":1,"GO:0035411":1,"GO:0042270":1,"GO:0045766":1,"GO:0042177":1,"GO:0061107":1,"GO:0061108":1,"GO:0061049":1,"GO:1904707":1,"GO:0010873":1,"GO:0071260":1,"GO:1903598":1,"GO:0051055":1,"GO:0035009":1,"GO:0070371":1,"GO:0007595":1,"GO:0010757":1,"GO:0060570":1,"GO:0035425":1,"GO:0090190":1,"GO:0002448":1,"GO:0001869":1,"GO:0001300":1,"GO:0060512":1,"GO:0045742":1,"GO:0051966":2,"GO:0002438":1,"GO:0010596":1,"GO:0003331":1,"GO:0061044":1,"GO:2000266":1,"GO:0014912":1,"GO:0002019":1,"GO:0070327":1,"GO:0042628":1,"GO:0060384":1,"GO:0035491":1,"GO:0034104":1,"GO:2001275":1,"GO:1903779":1,"GO:0050974":1,"GO:0090331":1,"GO:0010951":1,"GO:0030199":1,"GO:0002009":1,"GO:0002027":1,"GO:0014061":1,"GO:0051604":1,"GO:0003051":1,"GO:0002018":1,"GO:0045893":1,"GO:0051387":1,"GO:0051918":1,"GO:0006953":1,"GO:0071636":1,"GO:0045777":1,"GO:0030308":1,"GO:0001999":1,"GO:0014068":1,"GO:0006883":1,"GO:0042311":1,"GO:0071279":1,"GO:0021683":1,"GO:0032930":1,"GO:0042730":1,"GO:0002034":1,"GO:1905010":1,"GO:0060291":1,"GO:0007584":1,"GO:0033363":1,"GO:0090207":1,"GO:0048169":1,"GO:0048711":1,"GO:0046011":1,"GO:1902108":1,"GO:0007427":1,"GO:0006915":1,"GO:0035289":1,"GO:0034462":1,"GO:0006378":1,"GO:0097010":1,"GO:0075522":1,"GO:0006406":1,"GO:0001825":1,"GO:0006446":1,"GO:1905663":1,"GO:0031047":1,"GO:1900363":1,"GO:0045292":1,"GO:0001731":1,"GO:0006376":1,"GO:1903586":1,"GO:0060211":1,"GO:0048025":1,"GO:0048255":1,"GO:0016556":1,"GO:0048026":1,"GO:0002188":1,"GO:1902625":1,"GO:0000381":1,"GO:0000380":1,"GO:1901407":1,"GO:0075525":1,"GO:0010610":1,"GO:0030224":1,"GO:0060215":1,"GO:0032786":1,"GO:0046784":1,"GO:2000002":1,"GO:0097192":1,"GO:0090200":1,"GO:0008625":1,"GO:0001844":1,"GO:2000327":1,"GO:0010923":1,"GO:0051311":1,"GO:0097271":1,"GO:0051301":1,"GO:1901001":1,"GO:0000747":1,"GO:0016476":1,"GO:0007283":1,"GO:0031175":1,"GO:1902857":1,"GO:0051291":1,"GO:0042274":1,"GO:0042254":1,"GO:0000917":1,"GO:0007049":1,"GO:0000055":1,"GO:1903204":1,"GO:0061163":1,"GO:1902083":1,"GO:0071447":1,"GO:0030011":1,"GO:0007224":1,"GO:0030154":1,"GO:0017157":1,"GO:0090529":1,"GO:0030382":1,"GO:0000281":1,"GO:0010458":1,"GO:0031107":1,"GO:1903833":1,"GO:0000278":1,"GO:0000921":1,"GO:0002181":1,"GO:0006400":1,"GO:0007056":1,"GO:0032186":1,"GO:0071287":1,"GO:1903215":1,"GO:0048312":1,"GO:2000172":1,"GO:1902236":1,"GO:0051683":1,"GO:0050732":1,"GO:0035641":1,"GO:0007264":1,"GO:0051900":1,"GO:0035564":1,"GO:0014041":1,"GO:0060161":1,"GO:0036035":1,"GO:0099139":1,"GO:0061001":1,"GO:0060079":1,"GO:1904887":1,"GO:1905289":1,"GO:0035751":1,"GO:1903206":1,"GO:2000300":1,"GO:0034260":1,"GO:0010738":1,"GO:0022028":1,"GO:0090394":1,"GO:1905279":1,"GO:1903351":1,"GO:1903125":1,"GO:0000186":1,"GO:0090263":1,"GO:1902902":1,"GO:1902499":1,"GO:0045453":1,"GO:1900242":1,"GO:1902692":1},"recipe_readded":["XP_011440264.3","XP_011431637.3","XP_065933260.1","XP_065927516.1","XP_034331806.1","XP_034331811.1","XP_011442792.3","XP_034308192.2","XP_011414107.3","XP_011441723.3","XP_011449160.3","XP_011441725.3","XP_011449159.3","XP_034324827.2","XP_065921779.1","XP_065933188.1","XP_011441724.3","XP_011449158.3","XP_065921780.1","XP_065922877.1"]}