{"hash":"1519706701364302047","title":"Retroviral DNA integration and latency","description":"We observe strong representation of DNA recombination, DNA integration, RNA-templated DNA biosynthetic process, and establishment of proviral latency, which together map to retroviral life cycle steps (reverse transcription, genome integration, and latency). The presence of symbiont entry into host cell aligns with intracellular infection, but the core theme is proviral integration and latency. DNA replication and redox-related terms may reflect host\u2013virus interaction contexts but do not override the viral-centric signal.","confidence":"High","size":21,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"XP_065930441.1","go_terms":["GO:0006633","GO:0009234","GO:0019654","GO:0015911","GO:0009437","GO:0001676","GO:0019290","GO:0008206","GO:0008218","GO:0009698","GO:0010030","GO:0010214","GO:0090410","GO:0001579","GO:0036112","GO:0019629","GO:0044539","GO:0070395","GO:0019427","GO:1902987","GO:0010124","GO:0000038","GO:0043041"]},{"accession":"XP_011452354.3","go_terms":["GO:2000324","GO:1905213","GO:2001034","GO:0031987","GO:0050728","GO:0006986","GO:0006260","GO:1905205","GO:0000082","GO:0060316","GO:0035562","GO:0022011","GO:2000002","GO:0030846","GO:1903799","GO:0010780","GO:0006196","GO:0046086","GO:0051343","GO:0000903","GO:0031573","GO:0001569","GO:0043029","GO:0016576","GO:0006685","GO:0097552","GO:0030847","GO:0098609","GO:0051037","GO:0060079","GO:0010719","GO:0051531","GO:0051533","GO:0030437","GO:0033173","GO:0014898","GO:0010791","GO:0007498","GO:0021762","GO:0051321","GO:0014883","GO:0005981","GO:0072462","GO:0001946","GO:2001241","GO:1903244","GO:0010288","GO:0070262","GO:0043278","GO:0051315","GO:0007114","GO:0050774","GO:0070940","GO:0061587","GO:0005513","GO:1900486","GO:1901901","GO:0035753","GO:0030324","GO:0034501","GO:0032516","GO:0035690","GO:1902660","GO:1990918","GO:1900490","GO:1903501","GO:0099566","GO:0030182","GO:0048741","GO:0014044","GO:0009245","GO:0042220","GO:0006888","GO:0060487","GO:0036496","GO:0009742","GO:0005977","GO:0005979","GO:0001837","GO:0001915","GO:0006896","GO:1990126","GO:0042147","GO:0015031"]},{"accession":"XP_065940483.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_011451698.2","go_terms":["GO:0006295","GO:0006294","GO:0006296","GO:0006293","GO:0070816","GO:0006370","GO:0000717","GO:0006361","GO:0006363","GO:0006362","GO:0002031","GO:0070911","GO:0006366","GO:0015995","GO:0048455","GO:0006511","GO:0043248"]},{"accession":"XP_065922898.1","go_terms":["GO:0015937","GO:0034628","GO:0009611","GO:0097171","GO:0019350","GO:0046444","GO:0006747","GO:1990966"]},{"accession":"XP_065939727.1","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"XP_011431075.1","go_terms":["GO:0032024","GO:0006739","GO:0001678","GO:0007595","GO:0061621","GO:0035795","GO:0046324","GO:0032869","GO:0044320","GO:0006013","GO:0010148","GO:0046835","GO:0032445","GO:0006110","GO:0045725","GO:0045721","GO:2000378","GO:1904925","GO:0019660","GO:1901986","GO:0090332","GO:0072656","GO:0051594","GO:0072655","GO:0002931","GO:0009747","GO:0043266","GO:0046323","GO:0070509","GO:0051156","GO:0006000","GO:0006002","GO:0009741"]},{"accession":"XP_065941928.1","go_terms":["GO:0000916","GO:0000918","GO:0000920","GO:0071555","GO:0034217"]},{"accession":"XP_034332822.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_011422174.2","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"XP_065932103.1","go_terms":["GO:0071044","GO:0071042","GO:0071040","GO:1902466","GO:0032066","GO:0009048","GO:0098530","GO:0061820","GO:0040009","GO:0042780","GO:0033259","GO:0045950","GO:0034476","GO:0071037","GO:0071036","GO:0071035","GO:0034473","GO:0071039","GO:0071048","GO:0071049","GO:0090503","GO:0000973"]},{"accession":"XP_065935394.1","go_terms":["GO:0034232","GO:0036108","GO:0042710","GO:0042244","GO:0046677","GO:0009245","GO:0045493","GO:0019428","GO:0009103"]},{"accession":"XP_065937829.1","go_terms":["GO:0000738","GO:0000289","GO:0002107","GO:0010606","GO:0006281","GO:0006261","GO:0000467","GO:0008033","GO:0034415","GO:0031047","GO:0006297","GO:0090305","GO:0042276","GO:0016539","GO:1903460","GO:1902975","GO:0006287","GO:1902981","GO:0045004","GO:0006279","GO:0006278","GO:0000734","GO:1904161","GO:0039693","GO:0043137","GO:1903459","GO:0035822"]},{"accession":"XP_065941348.1","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"XP_011415703.3","go_terms":["GO:0075015","GO:0042248","GO:0010493","GO:0018258","GO:0080147","GO:0010405","GO:0030311","GO:0001744","GO:0007299","GO:0048354","GO:0055016","GO:0032092","GO:0001541","GO:0036011","GO:0045747","GO:0007386","GO:0060576","GO:0016267","GO:0002315","GO:1902367","GO:0007143"]},{"accession":"XP_034299116.2","go_terms":["GO:0009831","GO:2001009","GO:0009663"]},{"accession":"XP_034303719.2","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0030422","GO:0030177","GO:0043249","GO:0046326","GO:1902895","GO:0032092","GO:0010449","GO:0042635","GO:2000648","GO:1904173","GO:0007004","GO:0022616","GO:0070200","GO:0071456","GO:0007571","GO:1903620","GO:0060729","GO:0010073","GO:0090399","GO:2001240","GO:1904751","GO:1904754","GO:0051000","GO:2000773"]},{"accession":"XP_034318540.2","go_terms":["GO:0046718","GO:0006313","GO:0075713","GO:0015074","GO:0071139","GO:0007049","GO:0007059","GO:0051301"]},{"accession":"XP_034329873.1","go_terms":["GO:0009312","GO:0018279"]},{"accession":"XP_065927222.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006313","GO:0075713","GO:0015074","GO:0071139","GO:0007049","GO:0007059","GO:0051301"]},{"accession":"XP_011444981.1","go_terms":["GO:0075015","GO:0042248","GO:0010493","GO:0018258","GO:0080147","GO:0010405","GO:0030311","GO:0001744","GO:0007299","GO:0048354"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0090410":1,"GO:0044539":1,"GO:0009698":1,"GO:0036112":1,"GO:0010030":1,"GO:0009234":1,"GO:0001676":1,"GO:0070395":1,"GO:0015911":1,"GO:0006633":1,"GO:0019654":1,"GO:0008206":1,"GO:0010124":1,"GO:0008218":1,"GO:0000038":1,"GO:0019290":1,"GO:0019427":1,"GO:0019629":1,"GO:0001579":1,"GO:0043041":1,"GO:0010214":1,"GO:1902987":1,"GO:0009437":1,"GO:0001837":1,"GO:0009742":1,"GO:0031573":1,"GO:1905213":1,"GO:0051343":1,"GO:1903799":1,"GO:0005513":1,"GO:0001946":1,"GO:0043278":1,"GO:0042147":1,"GO:1903501":1,"GO:0031987":1,"GO:0033173":1,"GO:0000903":1,"GO:0006986":1,"GO:0007498":1,"GO:0014883":1,"GO:1901901":1,"GO:0097552":1,"GO:1990126":1,"GO:0046086":1,"GO:0030437":1,"GO:0001915":1,"GO:0051321":1,"GO:0050774":1,"GO:0005979":1,"GO:0070940":1,"GO:1902660":1,"GO:0021762":1,"GO:0034501":1,"GO:0035690":1,"GO:0072462":1,"GO:0035562":1,"GO:0099566":1,"GO:0050728":1,"GO:0014898":1,"GO:0061587":1,"GO:0051315":1,"GO:0010791":1,"GO:0032516":1,"GO:0060487":1,"GO:0016576":1,"GO:0042220":1,"GO:0048741":1,"GO:2001241":1,"GO:1903244":1,"GO:0060079":1,"GO:0006260":3,"GO:0001569":1,"GO:0036496":1,"GO:0007114":1,"GO:0051037":1,"GO:0030182":1,"GO:0010780":1,"GO:0010719":1,"GO:0098609":1,"GO:0051531":1,"GO:0005977":1,"GO:0015031":1,"GO:1905205":1,"GO:0030847":1,"GO:0010288":1,"GO:0014044":1,"GO:0005981":1,"GO:0030846":1,"GO:2000324":1,"GO:0006196":1,"GO:2000002":1,"GO:0070262":1,"GO:2001034":1,"GO:0060316":1,"GO:0006896":1,"GO:0043029":1,"GO:0035753":1,"GO:0051533":1,"GO:1900490":1,"GO:1990918":1,"GO:1900486":1,"GO:0000082":1,"GO:0006685":1,"GO:0006888":1,"GO:0030324":1,"GO:0009245":2,"GO:0022011":1,"GO:0039651":2,"GO:0006310":5,"GO:1903704":2,"GO:0006278":3,"GO:0075732":2,"GO:0046718":4,"GO:0075713":4,"GO:0015074":4,"GO:0006370":1,"GO:0006293":1,"GO:0002031":1,"GO:0070816":1,"GO:0006366":1,"GO:0000717":1,"GO:0006296":1,"GO:0006294":1,"GO:0070911":1,"GO:0015995":1,"GO:0048455":1,"GO:0006295":1,"GO:0006363":1,"GO:0006361":1,"GO:0006362":1,"GO:0006511":1,"GO:0043248":1,"GO:1990966":1,"GO:0015937":1,"GO:0046444":1,"GO:0006747":1,"GO:0097171":1,"GO:0034628":1,"GO:0009611":1,"GO:0019350":1,"GO:1900087":3,"GO:0071320":3,"GO:0045454":3,"GO:0070301":3,"GO:0046856":3,"GO:2001153":3,"GO:0071375":3,"GO:0003335":3,"GO:0006915":3,"GO:0044179":3,"GO:0080111":3,"GO:0006308":3,"GO:0090502":3,"GO:0043488":3,"GO:2000327":3,"GO:0014912":3,"GO:0006284":3,"GO:0042493":3,"GO:2000466":3,"GO:1903507":3,"GO:0007568":3,"GO:0046323":1,"GO:0006002":1,"GO:0002931":1,"GO:0032869":1,"GO:0006000":1,"GO:0006739":1,"GO:0046835":1,"GO:0046324":1,"GO:0051156":1,"GO:0009747":1,"GO:0072655":1,"GO:0090332":1,"GO:0007595":1,"GO:1901986":1,"GO:0006110":1,"GO:0045721":1,"GO:0032445":1,"GO:0032024":1,"GO:0009741":1,"GO:0035795":1,"GO:0045725":1,"GO:1904925":1,"GO:0010148":1,"GO:0001678":1,"GO:0019660":1,"GO:0044320":1,"GO:0061621":1,"GO:0072656":1,"GO:0070509":1,"GO:0006013":1,"GO:2000378":1,"GO:0051594":1,"GO:0043266":1,"GO:0000916":1,"GO:0000920":1,"GO:0000918":1,"GO:0034217":1,"GO:0071555":1,"GO:0071048":1,"GO:0071037":1,"GO:0000973":1,"GO:0071039":1,"GO:0009048":1,"GO:0034473":1,"GO:0034476":1,"GO:1902466":1,"GO:0042780":1,"GO:0033259":1,"GO:0071042":1,"GO:0071035":1,"GO:0032066":1,"GO:0045950":1,"GO:0071044":1,"GO:0090503":1,"GO:0071040":1,"GO:0071049":1,"GO:0071036":1,"GO:0040009":1,"GO:0098530":1,"GO:0061820":1,"GO:0045493":1,"GO:0019428":1,"GO:0042244":1,"GO:0046677":1,"GO:0036108":1,"GO:0042710":1,"GO:0009103":1,"GO:0034232":1,"GO:0006287":1,"GO:0000734":1,"GO:0045004":1,"GO:1903459":1,"GO:1904161":1,"GO:0002107":1,"GO:0016539":1,"GO:0010606":1,"GO:0034415":1,"GO:0031047":1,"GO:1903460":1,"GO:0008033":1,"GO:0000289":1,"GO:0000467":1,"GO:0006261":1,"GO:0039693":1,"GO:0000738":1,"GO:0090305":1,"GO:1902981":1,"GO:0006297":1,"GO:0035822":1,"GO:0042276":1,"GO:1902975":1,"GO:0043137":1,"GO:0006281":1,"GO:0006279":1,"GO:0042248":2,"GO:0030311":2,"GO:0036011":1,"GO:0048354":2,"GO:0080147":2,"GO:1902367":1,"GO:0032092":2,"GO:0075015":2,"GO:0045747":1,"GO:0001744":2,"GO:0001541":1,"GO:0007143":1,"GO:0055016":1,"GO:0016267":1,"GO:0060576":1,"GO:0007299":2,"GO:0018258":2,"GO:0007386":1,"GO:0010405":2,"GO:0002315":1,"GO:0010493":2,"GO:0009831":1,"GO:0009663":1,"GO:2001009":1,"GO:0030177":1,"GO:0060729":1,"GO:0051000":1,"GO:0010073":1,"GO:0042635":1,"GO:0046326":1,"GO:0071456":1,"GO:1903620":1,"GO:2000773":1,"GO:1902895":1,"GO:0030422":1,"GO:2000648":1,"GO:1904173":1,"GO:0007571":1,"GO:0010449":1,"GO:0090399":1,"GO:2001240":1,"GO:0043249":1,"GO:0022616":1,"GO:1904754":1,"GO:1904751":1,"GO:0007004":1,"GO:0070200":1,"GO:0071139":2,"GO:0051301":2,"GO:0007059":2,"GO:0006313":2,"GO:0007049":2,"GO:0018279":1,"GO:0009312":1},"recipe_readded":["XP_011429178.3","XP_065940969.1","XP_011448249.3","XP_065921594.1","XP_065924626.1","XP_034318684.2","XP_034321635.1","XP_034301308.2","XP_011425298.1","XP_034328813.2","XP_034318279.2","XP_034309933.2","XP_065933996.1","XP_034298925.2","XP_065932711.1","XP_019919829.3","XP_011442878.3","XP_011449006.3","XP_034307534.2","XP_034308609.2"]}