{"hash":"642259650815850373","title":"Ubiquitin-like modification pathways","description":"The proteins in this cluster are strongly associated with processes that attach ubiquitin-like modifiers (neddylation, sumoylation, ufmylation, urmylation) and related protein lipidation, pointing to a cohesive theme of post-translational modification by ubiquitin-like systems. Additional GO terms for tRNA wobble uridine thiolation and related RNA modifications appear, but the dominant signal remains ubiquitin-like modification pathways, making this a coherent functional cluster. The defense-related term may reflect regulatory cross-talk between stress responses and PTMs. ","confidence":"High","size":7,"edges":11,"triangles":5,"max_degree":6,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_061511599.1","go_terms":["GO:0006777","GO:0016236","GO:0034727","GO:1990592","GO:0021764","GO:0002143","GO:0032447","GO:0045116","GO:0018192","GO:0006501","GO:0032258","GO:0009229","GO:0009228","GO:0050832","GO:2000220","GO:0044805","GO:0045892","GO:0061504","GO:0016925","GO:0007113","GO:0000422","GO:0051726","GO:0039521","GO:1902617","GO:0090298","GO:0032446","GO:0071455","GO:0071315"]},{"accession":"XP_308769.2","go_terms":["GO:1902042","GO:2000347","GO:2000349","GO:0071108","GO:0071947","GO:1990167","GO:0032495","GO:1990168","GO:0002385","GO:0002677","GO:0070433","GO:0035871","GO:0032691","GO:0043124","GO:0070536","GO:0032703","GO:2000352","GO:0001922","GO:0002634","GO:0034140","GO:0035523","GO:0034148","GO:0072573","GO:0044313","GO:0070429","GO:0032717","GO:0016567"]},{"accession":"XP_310708.6","go_terms":["GO:0034389","GO:0007253","GO:0031134","GO:1904293","GO:0031468","GO:0002814","GO:2000157","GO:0030433","GO:0061060","GO:0008219","GO:1903094","GO:0046324"]},{"accession":"XP_313754.4","go_terms":["GO:0006777","GO:0016236","GO:0034727","GO:1990592","GO:0021764","GO:0002143","GO:0032447","GO:0045116","GO:0018192","GO:0006501","GO:0032258","GO:0009229","GO:0009228","GO:0050832","GO:2000220","GO:0044805","GO:0045892","GO:0061504","GO:0016925","GO:0007113","GO:0000422","GO:0051726"]},{"accession":"XP_313978.2","go_terms":["GO:0007113","GO:0045116","GO:0051726","GO:0038061","GO:0045892","GO:0006777","GO:0016236","GO:0034727","GO:1990592","GO:0021764","GO:0002143","GO:0032447","GO:0018192","GO:0006501","GO:0032258","GO:0009229","GO:0009228","GO:0050832","GO:2000220","GO:0044805","GO:0061504","GO:0016925","GO:0000422"]},{"accession":"XP_061511598.1","go_terms":["GO:0006777","GO:0016236","GO:0034727","GO:1990592","GO:0021764","GO:0002143","GO:0032447","GO:0045116","GO:0018192","GO:0006501","GO:0032258","GO:0009229","GO:0009228","GO:0050832","GO:2000220","GO:0044805","GO:0045892","GO:0061504","GO:0016925","GO:0007113","GO:0000422","GO:0051726","GO:0039521","GO:1902617","GO:0090298","GO:0032446","GO:0071455","GO:0071315"]},{"accession":"XP_061511600.1","go_terms":["GO:0006777","GO:0016236","GO:0034727","GO:1990592","GO:0021764","GO:0002143","GO:0032447","GO:0045116","GO:0018192","GO:0006501","GO:0032258","GO:0009229","GO:0009228","GO:0050832","GO:2000220","GO:0044805","GO:0045892","GO:0061504","GO:0016925","GO:0007113","GO:0000422","GO:0051726"]}],"graph":[["XP_313978.2","XP_308769.2",0.938],["XP_313978.2","XP_310708.6",0.936],["XP_313978.2","XP_313754.4",0.8],["XP_313754.4","XP_310708.6",0.842],["XP_061511600.1","XP_308769.2",0.891],["XP_061511600.1","XP_310708.6",0.931],["XP_310708.6","XP_061511598.1",0.789],["XP_310708.6","XP_061511599.1",0.878],["XP_310708.6","XP_308769.2",0.909],["XP_061511598.1","XP_308769.2",0.778],["XP_308769.2","XP_061511599.1",0.961]],"all_go_terms":{"GO:0002143":5,"GO:0039521":2,"GO:0032446":2,"GO:0061504":5,"GO:0006501":5,"GO:0050832":5,"GO:0090298":2,"GO:0045892":5,"GO:1990592":5,"GO:0045116":5,"GO:0071315":2,"GO:0016925":5,"GO:0006777":5,"GO:0032447":5,"GO:0034727":5,"GO:0032258":5,"GO:0009229":5,"GO:0021764":5,"GO:1902617":2,"GO:0007113":5,"GO:0071455":2,"GO:0000422":5,"GO:2000220":5,"GO:0016236":5,"GO:0018192":5,"GO:0009228":5,"GO:0044805":5,"GO:0051726":5,"GO:0002385":1,"GO:0032717":1,"GO:1902042":1,"GO:0034148":1,"GO:0071108":1,"GO:0002677":1,"GO:2000352":1,"GO:1990167":1,"GO:0002634":1,"GO:1990168":1,"GO:0032495":1,"GO:0072573":1,"GO:0034140":1,"GO:0070433":1,"GO:0035523":1,"GO:0044313":1,"GO:0016567":1,"GO:0043124":1,"GO:2000349":1,"GO:0070536":1,"GO:0035871":1,"GO:0032703":1,"GO:0001922":1,"GO:0071947":1,"GO:0032691":1,"GO:2000347":1,"GO:0070429":1,"GO:0030433":1,"GO:0061060":1,"GO:0007253":1,"GO:1903094":1,"GO:0046324":1,"GO:0031468":1,"GO:0031134":1,"GO:0002814":1,"GO:0034389":1,"GO:2000157":1,"GO:0008219":1,"GO:1904293":1,"GO:0038061":1},"recipe_readded":[]}