{"hash":"1934056149992864258","title":"DNA repair and nucleotide signaling","description":"The cluster is dominated by GO terms related to DNA maintenance, including DNA repair and positive regulation of double-strand break repair, with DNA integration also appearing. The presence of diadenosine tetraphosphate/pentaphosphate catabolic processes and dGDP catabolic processes suggests nucleotide turnover/signaling linked to stress responses, which complements the DNA damage repair theme. A few terms like negative regulation of rRNA processing are peripheral but not central to the main motif. Overall, the set points to genome maintenance and nucleotide signaling as the core function.","confidence":"Medium","size":28,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_032225321.2","go_terms":["GO:0033673","GO:0019310","GO:0000122","GO:0042167","GO:0019877","GO:0006012","GO:0009089","GO:0006061","GO:0043433","GO:0055114"]},{"accession":"XP_048581595.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001636570.1","go_terms":["GO:0019677","GO:0015938","GO:0046067","GO:0046656","GO:0006203","GO:1901909","GO:1901907","GO:2000233","GO:0006382","GO:0046709","GO:0006281","GO:0015967","GO:0009240","GO:0046057","GO:2000781","GO:0034656","GO:0045337","GO:0016077","GO:0050992","GO:0071544","GO:1901639","GO:1901911"]},{"accession":"XP_001631166.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_001632379.3","go_terms":["GO:2001235","GO:0021510","GO:0008584","GO:0001501","GO:0035264","GO:0051568","GO:0051567","GO:0038202","GO:0040020","GO:0007369","GO:0000920","GO:0010255","GO:0060528","GO:0032933","GO:0043966","GO:2000728","GO:0000462","GO:0000463","GO:0000466","GO:0030042","GO:0070734","GO:0050731","GO:0001845","GO:0000398","GO:0007200","GO:0060416","GO:0034314","GO:0036265","GO:0090344","GO:0031954","GO:0048568","GO:0034316","GO:0035246","GO:0061641","GO:0000472","GO:0031175","GO:0007064","GO:0060770","GO:0002534","GO:0006888","GO:0043547","GO:2000011","GO:0042254","GO:0016575","GO:1903461","GO:0071456","GO:0061099","GO:0001843","GO:0048705","GO:0060271","GO:0006625","GO:2001162","GO:0070208","GO:0071276","GO:0010659","GO:0090114","GO:0006890","GO:0000132","GO:0007420","GO:0031081","GO:0043982","GO:0001403","GO:0043981","GO:0061087","GO:0006351","GO:0000480","GO:1901976","GO:0034729","GO:0031930","GO:1904263","GO:0060041","GO:0031497","GO:2001125","GO:1902525","GO:0000209","GO:0042273","GO:0006349","GO:0000724","GO:0002188","GO:0043984","GO:2000601","GO:0008283","GO:0051013","GO:0070306","GO:0031146","GO:0031145","GO:0007338","GO:0045143","GO:1902510","GO:0043473","GO:0007568","GO:0050679","GO:0070059","GO:0061586","GO:0071560","GO:0070317","GO:0090307","GO:0060733","GO:0071902","GO:0072520","GO:0000348","GO:0050909","GO:0007275","GO:0001649","GO:0000747","GO:0070262","GO:0051260","GO:0051301","GO:1904668","GO:0043588","GO:0000278","GO:0034349","GO:0007584","GO:0051402","GO:0030433","GO:0000447","GO:0001731","GO:0032995","GO:0000070","GO:0072432","GO:0051028","GO:0035948","GO:0007018","GO:0050830","GO:0030900"]},{"accession":"XP_001633283.3","go_terms":["GO:0048714","GO:1903165","GO:0031214","GO:0031953","GO:1902512","GO:0046325","GO:0036475","GO:0030505","GO:2000394","GO:0045765","GO:0006309","GO:0034638","GO:0006995","GO:0030334","GO:0006935","GO:0071392","GO:0046627","GO:0044849","GO:0006955","GO:0050427","GO:0045599","GO:0030730","GO:0006898","GO:0001953","GO:0045719","GO:0046849"]},{"accession":"XP_001641661.2","go_terms":["GO:0019677","GO:0015938","GO:0046067","GO:0046656","GO:0006203","GO:1901909","GO:1901907","GO:2000233","GO:0006382","GO:0046709","GO:0006281","GO:0015967","GO:0009240","GO:0046057","GO:2000781","GO:0034656","GO:0045337","GO:0016077","GO:0050992","GO:0071544","GO:1901639","GO:1901911","GO:0036172"]},{"accession":"XP_032225116.1","go_terms":["GO:0006614","GO:0071353","GO:0042254","GO:0002181","GO:0000027"]},{"accession":"XP_032226977.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_032235097.2","go_terms":["GO:2001200","GO:0043380","GO:1900477","GO:0072156","GO:0042748","GO:0042092","GO:0009638","GO:0007519","GO:0045496","GO:2000176","GO:0048294","GO:0042787","GO:0031397","GO:2000312","GO:0050853","GO:0032764","GO:0048741","GO:0002467","GO:1990390","GO:0009958","GO:0070294","GO:1904431","GO:0045497"]},{"accession":"XP_032237271.2","go_terms":["GO:0071042","GO:1990074","GO:0051306","GO:0016973","GO:0010587","GO:0070478","GO:0033621","GO:0071051","GO:0071035","GO:0071039","GO:0071038","GO:0060237","GO:0000465","GO:0000467","GO:0071028","GO:0070481","GO:0090502","GO:0070651","GO:0034427","GO:0090503"]},{"accession":"XP_032237657.1","go_terms":["GO:0000055","GO:0032298","GO:0000398","GO:1903026","GO:0060707","GO:0003323","GO:0060806","GO:0035270","GO:0060972","GO:0060536","GO:0003198"]},{"accession":"XP_032237856.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_032238429.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_032239462.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_032241702.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_048575877.1","go_terms":["GO:0034067","GO:0030032","GO:0060304","GO:0050901","GO:0035269","GO:0006487","GO:0090164","GO:0045053","GO:0043001","GO:0010467","GO:0048194","GO:0060352","GO:0007053","GO:0007111","GO:0007110","GO:0006890","GO:0030968","GO:0050714"]},{"accession":"XP_048576644.1","go_terms":["GO:0006313","GO:0001935","GO:0090305"]},{"accession":"XP_048577025.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006313","GO:0075713","GO:0032197","GO:0015074","GO:0075732","GO:0039651"]},{"accession":"XP_048578023.1","go_terms":["GO:0071236","GO:0009411","GO:1901170","GO:0006749","GO:0030855","GO:0045454","GO:0055114"]},{"accession":"XP_048579343.1","go_terms":["GO:0015074"]},{"accession":"XP_048580093.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_048581516.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_048581959.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_048582129.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_048586613.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_048588994.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_048589574.1","go_terms":["GO:0071032","GO:0071042","GO:0071035","GO:1904354","GO:0071039","GO:0071038","GO:0000467","GO:0071051","GO:0070481","GO:0090502","GO:0016973","GO:0070478","GO:0070651","GO:0033621","GO:0071028","GO:0000465","GO:1990074","GO:0051306","GO:0010587","GO:0060237","GO:0034427","GO:0090503"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0006061":1,"GO:0043433":1,"GO:0019310":1,"GO:0000122":1,"GO:0033673":1,"GO:0042167":1,"GO:0055114":2,"GO:0006012":1,"GO:0019877":1,"GO:0009089":1,"GO:1901907":2,"GO:0046067":2,"GO:2000781":2,"GO:0050992":2,"GO:0006281":2,"GO:2000233":2,"GO:0015967":2,"GO:1901639":2,"GO:0009240":2,"GO:0016077":2,"GO:0019677":2,"GO:1901911":2,"GO:0006382":2,"GO:0071544":2,"GO:0046057":2,"GO:0006203":2,"GO:1901909":2,"GO:0045337":2,"GO:0046656":2,"GO:0046709":2,"GO:0034656":2,"GO:0015938":2,"GO:0070306":1,"GO:0043473":1,"GO:0007369":1,"GO:0050830":1,"GO:0034316":1,"GO:0000480":1,"GO:0008584":1,"GO:0007568":1,"GO:0045143":1,"GO:0030042":1,"GO:0034314":1,"GO:0000447":1,"GO:0038202":1,"GO:0090344":1,"GO:0036265":1,"GO:0071902":1,"GO:0001845":1,"GO:0001731":1,"GO:0051567":1,"GO:0001501":1,"GO:0000209":1,"GO:0008283":1,"GO:0090307":1,"GO:0000724":1,"GO:0031146":1,"GO:0000070":1,"GO:0006351":1,"GO:0031145":1,"GO:1901976":1,"GO:0071456":1,"GO:0043982":1,"GO:0090114":1,"GO:0030433":1,"GO:0006349":1,"GO:1902525":1,"GO:0030900":1,"GO:1904263":1,"GO:0007064":1,"GO:2001125":1,"GO:0034729":1,"GO:2000011":1,"GO:0061087":1,"GO:0060733":1,"GO:0007420":1,"GO:0021510":1,"GO:1904668":1,"GO:0051013":1,"GO:2000728":1,"GO:0002188":1,"GO:0060041":1,"GO:0061641":1,"GO:0051568":1,"GO:0016575":1,"GO:0060528":1,"GO:0043984":1,"GO:0000472":1,"GO:0050731":1,"GO:0031930":1,"GO:0031954":1,"GO:0000278":1,"GO:0070059":1,"GO:0007275":1,"GO:1902510":1,"GO:0070262":1,"GO:0034349":1,"GO:0060416":1,"GO:0043588":1,"GO:0050679":1,"GO:0048568":1,"GO:0072432":1,"GO:0051028":1,"GO:0006890":2,"GO:0070317":1,"GO:0000747":1,"GO:0061586":1,"GO:0043981":1,"GO:0000466":1,"GO:0051260":1,"GO:0070734":1,"GO:0001843":1,"GO:1903461":1,"GO:2001162":1,"GO:0006625":1,"GO:0002534":1,"GO:0071276":1,"GO:0006888":1,"GO:0000462":1,"GO:0031497":1,"GO:0007200":1,"GO:0010255":1,"GO:0007338":1,"GO:0060770":1,"GO:0007584":1,"GO:0035264":1,"GO:0007018":1,"GO:0031175":1,"GO:0000132":1,"GO:0042254":2,"GO:0010659":1,"GO:0000348":1,"GO:0061099":1,"GO:0071560":1,"GO:0001649":1,"GO:2000601":1,"GO:2001235":1,"GO:0000463":1,"GO:0060271":1,"GO:0035246":1,"GO:0043966":1,"GO:0031081":1,"GO:0072520":1,"GO:0051301":1,"GO:0032995":1,"GO:0050909":1,"GO:0043547":1,"GO:0070208":1,"GO:0040020":1,"GO:0051402":1,"GO:0000920":1,"GO:0035948":1,"GO:0032933":1,"GO:0000398":2,"GO:0048705":1,"GO:0042273":1,"GO:0001403":1,"GO:1903165":1,"GO:0071392":1,"GO:0046325":1,"GO:0001953":1,"GO:2000394":1,"GO:0030730":1,"GO:0006898":1,"GO:0034638":1,"GO:0030505":1,"GO:0006935":1,"GO:0006995":1,"GO:0031214":1,"GO:0006309":1,"GO:0045765":1,"GO:0046627":1,"GO:0044849":1,"GO:0045719":1,"GO:0030334":1,"GO:0045599":1,"GO:0046849":1,"GO:0006955":1,"GO:0050427":1,"GO:0031953":1,"GO:0048714":1,"GO:1902512":1,"GO:0036475":1,"GO:0036172":1,"GO:0000027":1,"GO:0002181":1,"GO:0006614":1,"GO:0071353":1,"GO:0042748":1,"GO:0007519":1,"GO:0048741":1,"GO:1990390":1,"GO:0045496":1,"GO:0032764":1,"GO:0042092":1,"GO:0072156":1,"GO:0048294":1,"GO:2000176":1,"GO:0009958":1,"GO:0009638":1,"GO:2000312":1,"GO:1904431":1,"GO:0031397":1,"GO:0045497":1,"GO:1900477":1,"GO:0050853":1,"GO:0042787":1,"GO:0002467":1,"GO:0043380":1,"GO:0070294":1,"GO:2001200":1,"GO:0090502":2,"GO:0033621":2,"GO:0071042":2,"GO:0071035":2,"GO:0034427":2,"GO:0010587":2,"GO:0016973":2,"GO:0071039":2,"GO:0060237":2,"GO:0000465":2,"GO:0051306":2,"GO:0071051":2,"GO:0090503":2,"GO:0000467":2,"GO:0071038":2,"GO:0071028":2,"GO:0070651":2,"GO:1990074":2,"GO:0070481":2,"GO:0070478":2,"GO:0000055":1,"GO:0060536":1,"GO:0032298":1,"GO:0060972":1,"GO:0060806":1,"GO:0035270":1,"GO:0003323":1,"GO:1903026":1,"GO:0003198":1,"GO:0060707":1,"GO:0075732":2,"GO:1903704":1,"GO:0075713":2,"GO:0006260":1,"GO:0039651":2,"GO:0006278":1,"GO:0006310":1,"GO:0046718":2,"GO:0015074":3,"GO:0090164":1,"GO:0010467":1,"GO:0007053":1,"GO:0045053":1,"GO:0007110":1,"GO:0060304":1,"GO:0006487":1,"GO:0050714":1,"GO:0043001":1,"GO:0030968":1,"GO:0030032":1,"GO:0060352":1,"GO:0050901":1,"GO:0007111":1,"GO:0048194":1,"GO:0034067":1,"GO:0035269":1,"GO:0006313":2,"GO:0001935":1,"GO:0090305":1,"GO:0032197":1,"GO:0071236":1,"GO:0045454":1,"GO:1901170":1,"GO:0030855":1,"GO:0006749":1,"GO:0009411":1,"GO:1904354":1,"GO:0071032":1},"recipe_readded":["XP_001634398.3","XP_032233997.1","XP_001636882.2"]}