{"hash":"1409774455927416372","title":"RNA Pol II Transcription Regulation","description":"Most of the top GO terms describe transcription-related processes tied to RNA polymerase II, including transcription initiation, transcription regulation, and transcription-coupled DNA repair, with a minor signal for mRNA export regulation and chromatin context. This constellation suggests the cluster comprises transcription regulators and factors involved in RNAP II\u2013coupled processes, hence the label focusing on RNAP II transcription regulation.","confidence":"High","size":21,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_029695052.1","go_terms":["GO:0001193","GO:0031564","GO:0051123","GO:0031440","GO:0060303","GO:0070827","GO:2001253","GO:0006362","GO:0010793","GO:0090239","GO:0006368","GO:0042797","GO:0032968","GO:0045899","GO:0006283","GO:0001172","GO:0042254","GO:0006363","GO:0006367","GO:0006366","GO:0006386","GO:0006379","GO:0042790","GO:0097190"]},{"accession":"XP_011606682.2","go_terms":["GO:0006915","GO:0033081"]},{"accession":"XP_029693860.1","go_terms":["GO:0000055","GO:0032298","GO:0000398","GO:1903026","GO:0060707","GO:0003323","GO:0060806","GO:0035270","GO:0060972","GO:0060536","GO:0003198","GO:0007498","GO:0060021","GO:0031069","GO:0010957"]},{"accession":"XP_029703797.1","go_terms":["GO:0097639","GO:0097638","GO:0006527","GO:0097640","GO:0044690","GO:0042941","GO:0042942","GO:0002537","GO:0010923","GO:0042116","GO:0043030","GO:0006809","GO:1902274","GO:0006884","GO:0098713","GO:0070634","GO:0071477","GO:1902269","GO:0015812","GO:0035826"]},{"accession":"XP_003970171.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029700019.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_011601826.1","go_terms":["GO:0060347","GO:0022011","GO:0046597","GO:0044871","GO:0061045","GO:0019933","GO:0050766","GO:0050830","GO:0060385","GO:0010745","GO:0045087","GO:0051131","GO:0032930","GO:2000482","GO:0006953","GO:0008228","GO:0044869","GO:0097756","GO:0002674","GO:0010579","GO:0045429","GO:0045656","GO:0001878","GO:0010888"]},{"accession":"XP_029703410.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029690490.1","go_terms":["GO:0002938","GO:0000453"]},{"accession":"XP_003975585.1","go_terms":["GO:0006783","GO:0019353","GO:0006730","GO:0015995"]},{"accession":"XP_011612086.1","go_terms":["GO:0006621","GO:0030970","GO:1904153","GO:0030433","GO:0046835","GO:0001889","GO:0072001","GO:0016256"]},{"accession":"XP_003977639.2","go_terms":["GO:1905552","GO:0032436","GO:0051092","GO:1905050","GO:1990592","GO:0033146","GO:1903721","GO:1905636","GO:0001701","GO:0048142","GO:0043248","GO:0007127","GO:0075525","GO:0000122","GO:0008283","GO:0002188","GO:0035914","GO:1902416","GO:0071033","GO:0006283","GO:0030182","GO:0070196","GO:0000338","GO:0075522","GO:0006446","GO:0034260","GO:0070321","GO:0010972","GO:0048863","GO:0001732","GO:0001731","GO:0048140","GO:0036099","GO:0090054","GO:0090052","GO:0000715","GO:0000973","GO:0006511","GO:0006355","GO:0006351"]},{"accession":"XP_003961998.2","go_terms":["GO:0042552","GO:0090002","GO:0046854"]},{"accession":"XP_003965596.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_003974898.1","go_terms":["GO:0032511","GO:0006892","GO:0006636","GO:0007619","GO:0042761","GO:0048794","GO:0034625","GO:0034626","GO:0035338","GO:0019367","GO:0042759","GO:0030148","GO:0042810"]},{"accession":"XP_011602815.2","go_terms":["GO:0035750","GO:0045198","GO:0015879","GO:2000474","GO:0032416","GO:2000463","GO:0006470","GO:0045199","GO:0030036","GO:0060088","GO:0050808","GO:1990227","GO:0035023","GO:0007168","GO:0046328","GO:0090557","GO:0035418","GO:0051612","GO:0045186","GO:0090103","GO:0097120","GO:0045075","GO:0098924","GO:0003096","GO:0022007","GO:0035640","GO:0070433","GO:0043004","GO:0090630","GO:0021694","GO:0051835","GO:0060997","GO:0071625","GO:1901206","GO:0008285","GO:0030033","GO:1903361","GO:1903760","GO:0016080","GO:0032782","GO:0071315","GO:0050953","GO:0016358","GO:0051660","GO:1904781","GO:0006887","GO:0007268","GO:0007605","GO:0007266","GO:0070830","GO:2000821","GO:0014047","GO:2000670","GO:0090179","GO:0060292","GO:0019933","GO:0030111","GO:1903028","GO:0035176","GO:0051683","GO:0043113","GO:2000009","GO:0097291","GO:0071896","GO:0018107","GO:0061737","GO:0043951","GO:0032423","GO:0043407","GO:0035414","GO:0021881","GO:0045988","GO:0022400","GO:0045444","GO:0035556","GO:0060048","GO:0003139","GO:0060087","GO:0043547","GO:0007213","GO:0007217","GO:0060823","GO:0085033","GO:0003413","GO:0033605","GO:0007601","GO:0071877","GO:0007051","GO:0055119","GO:0003108","GO:0070602","GO:0007507","GO:0010070","GO:0010614","GO:0003315","GO:0001957","GO:0010519","GO:0060394","GO:0002031","GO:0060452","GO:0002029","GO:0031914","GO:0061181"]},{"accession":"XP_029683282.1","go_terms":["GO:2000253","GO:0018095","GO:0060296"]},{"accession":"XP_029691156.1","go_terms":["GO:0006348","GO:0021591","GO:0042464","GO:0006183","GO:0006228","GO:0006241","GO:0048515","GO:0051568","GO:1902176","GO:0003351"]},{"accession":"XP_029698072.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029702533.1","go_terms":["GO:1902043","GO:0032926","GO:0048147","GO:0060244","GO:0035263","GO:0043388","GO:0046545","GO:0010626","GO:0010944","GO:0000122","GO:0002260","GO:0001825","GO:0001967","GO:0021702","GO:0048098","GO:0045668","GO:0048666","GO:0070207","GO:0014902","GO:0070306","GO:1902231","GO:0030514","GO:0030512","GO:0007179","GO:0060395","GO:0021936","GO:0033262","GO:0045880","GO:0007050"]},{"accession":"XP_029704067.1","go_terms":[]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0060303":1,"GO:0006367":1,"GO:0001172":1,"GO:0070827":1,"GO:0031564":1,"GO:0042254":1,"GO:0010793":1,"GO:0006379":1,"GO:0045899":1,"GO:0031440":1,"GO:0090239":1,"GO:0001193":1,"GO:0006366":1,"GO:0006368":1,"GO:2001253":1,"GO:0042797":1,"GO:0006386":1,"GO:0051123":1,"GO:0097190":1,"GO:0042790":1,"GO:0006362":1,"GO:0006283":2,"GO:0006363":1,"GO:0032968":1,"GO:0033081":1,"GO:0006915":1,"GO:0060806":1,"GO:0031069":1,"GO:0010957":1,"GO:0060972":1,"GO:0007498":1,"GO:0032298":1,"GO:0000398":1,"GO:1903026":1,"GO:0060536":1,"GO:0000055":1,"GO:0003323":1,"GO:0003198":1,"GO:0060707":1,"GO:0060021":1,"GO:0035270":1,"GO:0006809":1,"GO:1902274":1,"GO:0043030":1,"GO:0006527":1,"GO:0098713":1,"GO:0097639":1,"GO:0042116":1,"GO:0002537":1,"GO:0010923":1,"GO:0042941":1,"GO:0044690":1,"GO:0042942":1,"GO:0015812":1,"GO:0035826":1,"GO:0070634":1,"GO:0097638":1,"GO:0071477":1,"GO:1902269":1,"GO:0006884":1,"GO:0097640":1,"GO:0008228":1,"GO:0032930":1,"GO:0051131":1,"GO:0097756":1,"GO:0044871":1,"GO:0045429":1,"GO:0010745":1,"GO:0046597":1,"GO:0006953":1,"GO:0050830":1,"GO:0050766":1,"GO:0022011":1,"GO:0045087":1,"GO:0061045":1,"GO:0001878":1,"GO:0045656":1,"GO:0019933":2,"GO:2000482":1,"GO:0044869":1,"GO:0060347":1,"GO:0002674":1,"GO:0060385":1,"GO:0010579":1,"GO:0010888":1,"GO:0000453":1,"GO:0002938":1,"GO:0015995":1,"GO:0019353":1,"GO:0006783":1,"GO:0006730":1,"GO:0030970":1,"GO:0072001":1,"GO:0046835":1,"GO:0016256":1,"GO:1904153":1,"GO:0001889":1,"GO:0006621":1,"GO:0030433":1,"GO:0090052":1,"GO:1990592":1,"GO:0051092":1,"GO:0001731":1,"GO:0007127":1,"GO:0090054":1,"GO:0000715":1,"GO:0000338":1,"GO:0008283":1,"GO:0048140":1,"GO:0036099":1,"GO:0001732":1,"GO:0010972":1,"GO:0006351":1,"GO:0006511":1,"GO:0000973":1,"GO:0002188":1,"GO:0033146":1,"GO:1902416":1,"GO:0000122":2,"GO:1905050":1,"GO:0075522":1,"GO:1905552":1,"GO:0070196":1,"GO:0034260":1,"GO:1903721":1,"GO:0070321":1,"GO:0006355":1,"GO:0071033":1,"GO:1905636":1,"GO:0043248":1,"GO:0030182":1,"GO:0048863":1,"GO:0001701":1,"GO:0035914":1,"GO:0048142":1,"GO:0075525":1,"GO:0006446":1,"GO:0032436":1,"GO:0046854":1,"GO:0090002":1,"GO:0042552":1,"GO:0032511":1,"GO:0035338":1,"GO:0042810":1,"GO:0007619":1,"GO:0019367":1,"GO:0006892":1,"GO:0030148":1,"GO:0034626":1,"GO:0048794":1,"GO:0006636":1,"GO:0042759":1,"GO:0042761":1,"GO:0034625":1,"GO:0032416":1,"GO:0035023":1,"GO:0071896":1,"GO:0060394":1,"GO:0085033":1,"GO:0021694":1,"GO:0070830":1,"GO:0060823":1,"GO:0060292":1,"GO:0022400":1,"GO:1903028":1,"GO:0007213":1,"GO:1903361":1,"GO:0090557":1,"GO:0035556":1,"GO:0098924":1,"GO:2000474":1,"GO:2000463":1,"GO:0022007":1,"GO:0055119":1,"GO:0051835":1,"GO:0045075":1,"GO:0033605":1,"GO:0015879":1,"GO:1990227":1,"GO:0060452":1,"GO:1903760":1,"GO:0046328":1,"GO:0007605":1,"GO:2000670":1,"GO:0035176":1,"GO:0016080":1,"GO:0030033":1,"GO:0043547":1,"GO:1901206":1,"GO:0006470":1,"GO:0021881":1,"GO:0010614":1,"GO:0090103":1,"GO:0030036":1,"GO:0051660":1,"GO:0035414":1,"GO:0051683":1,"GO:0014047":1,"GO:0006887":1,"GO:0010070":1,"GO:0045199":1,"GO:0043004":1,"GO:0035750":1,"GO:0070433":1,"GO:0003139":1,"GO:0003096":1,"GO:0050808":1,"GO:0071625":1,"GO:0043951":1,"GO:0051612":1,"GO:0030111":1,"GO:0060997":1,"GO:0061737":1,"GO:0007601":1,"GO:0002031":1,"GO:0007266":1,"GO:0003108":1,"GO:0008285":1,"GO:0003315":1,"GO:0016358":1,"GO:0032423":1,"GO:0001957":1,"GO:0071315":1,"GO:0060088":1,"GO:0007217":1,"GO:0007168":1,"GO:0045198":1,"GO:0007051":1,"GO:0045988":1,"GO:0043113":1,"GO:1904781":1,"GO:0002029":1,"GO:0070602":1,"GO:0032782":1,"GO:0060087":1,"GO:0007507":1,"GO:0097291":1,"GO:0050953":1,"GO:0045444":1,"GO:0010519":1,"GO:0035640":1,"GO:0090179":1,"GO:0090630":1,"GO:2000821":1,"GO:0045186":1,"GO:0031914":1,"GO:0071877":1,"GO:0097120":1,"GO:0043407":1,"GO:0003413":1,"GO:2000009":1,"GO:0018107":1,"GO:0061181":1,"GO:0060048":1,"GO:0007268":1,"GO:0035418":1,"GO:0060296":1,"GO:2000253":1,"GO:0018095":1,"GO:0051568":1,"GO:0006348":1,"GO:1902176":1,"GO:0006228":1,"GO:0042464":1,"GO:0048515":1,"GO:0006183":1,"GO:0003351":1,"GO:0021591":1,"GO:0006241":1,"GO:0021936":1,"GO:0060244":1,"GO:0048147":1,"GO:0021702":1,"GO:0030512":1,"GO:0010626":1,"GO:0002260":1,"GO:0070207":1,"GO:0001967":1,"GO:0035263":1,"GO:0060395":1,"GO:0032926":1,"GO:0014902":1,"GO:0070306":1,"GO:0043388":1,"GO:0010944":1,"GO:1902231":1,"GO:0033262":1,"GO:0045880":1,"GO:0045668":1,"GO:0007179":1,"GO:0007050":1,"GO:1902043":1,"GO:0048666":1,"GO:0001825":1,"GO:0030514":1,"GO:0046545":1,"GO:0048098":1},"recipe_readded":["XP_003963500.1","XP_003965665.2","XP_011618898.1","XP_003961702.2","XP_029706852.1"]}