{"hash":"996189876600364671","title":"Plant transcription and secondary cell wall biosynthesis","description":"The GO terms cluster around transcription by RNA polymerase II (initiation and preinitiation complex assembly) and DNA-templated transcription, with additional plant-specific cell wall biosynthesis terms (glucuronoxylan and homogalacturonan) and secondary cell wall biogenesis. This indicates proteins that regulate transcription of cell wall biosynthesis genes in plants. Some peripheral terms (e.g., dexamethasone response, calcium signaling) may be ancillary annotations. Confidence: Medium.","confidence":"","size":22,"edges":18,"triangles":6,"max_degree":6,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_030145256.1","go_terms":["GO:1905213","GO:0070940","GO:0031564","GO:0001174","GO:0030846","GO:0009302","GO:0006368","GO:0030847","GO:0098789","GO:0006378"]},{"accession":"XP_072777592.1","go_terms":["GO:1904355","GO:0042769","GO:0098504","GO:0000105","GO:0098506","GO:0051973","GO:0016311","GO:0016032","GO:0006281"]},{"accession":"XP_030142407.4","go_terms":[]},{"accession":"XP_012427909.5","go_terms":["GO:0071494","GO:0006297","GO:0042276","GO:0070987","GO:0006261"]},{"accession":"XP_030134957.1","go_terms":["GO:0070231","GO:2001238","GO:0010800","GO:0043525","GO:0002906","GO:1904747","GO:0042534","GO:0070431","GO:0032729","GO:0031295","GO:0043123","GO:0010804","GO:0001961","GO:2000484","GO:0045061","GO:0033091","GO:0046330","GO:1902510","GO:0007568","GO:0046641","GO:0002931","GO:1905845","GO:0045416","GO:0002277","GO:0031663","GO:0044351","GO:0002377","GO:0002374","GO:0043330","GO:0071260","GO:0002830","GO:0032498","GO:0032094","GO:0070673","GO:0016045","GO:0045408","GO:0042098","GO:0050702","GO:1902524","GO:2000406","GO:0045087","GO:0001843","GO:0007584","GO:0032760","GO:0014808","GO:0090197","GO:0030277","GO:0006954","GO:0010659","GO:0032755","GO:0050717","GO:0007420","GO:0070059","GO:0050718","GO:0014876","GO:0034142","GO:0033209","GO:0090201","GO:0006968","GO:1902443","GO:1902523","GO:0001666","GO:0000209","GO:1902527","GO:0070970","GO:0016064","GO:1904646","GO:0001783","GO:0045627","GO:2001181","GO:0032740","GO:0035234","GO:0032610","GO:0070269","GO:0050871","GO:0006977","GO:0014736","GO:0051882","GO:0002732","GO:0001554","GO:0008635","GO:0051092","GO:0008630","GO:0070427","GO:0007249","GO:1904417","GO:0071560","GO:0070671","GO:0070374","GO:0071224","GO:0071225","GO:0071223","GO:0097194","GO:0034134","GO:0097192","GO:0010667","GO:0002606","GO:1901224","GO:0007275","GO:0002588","GO:0097202","GO:0070555","GO:0051260","GO:0050852","GO:0032611","GO:1902176","GO:0050856","GO:0034349","GO:0042104","GO:0070266","GO:0045086","GO:0042100","GO:0042228","GO:0051402","GO:1990001","GO:0034121","GO:1900017","GO:0071549","GO:0072432","GO:0007399","GO:0050830","GO:0030900","GO:1902109","GO:0030154","GO:0032688","GO:0045577","GO:1902742"]},{"accession":"XP_072776749.1","go_terms":["GO:0046902","GO:0070940","GO:0030150","GO:1903740","GO:2000134","GO:0010867"]},{"accession":"XP_030127020.1","go_terms":["GO:0090503","GO:0000288","GO:0033962","GO:0035195","GO:0061014","GO:0000290","GO:0045944","GO:0043928","GO:0000289"]},{"accession":"XP_030131102.4","go_terms":["GO:0051123","GO:1903357","GO:0006413","GO:0070893","GO:0007283","GO:0045893","GO:0006352","GO:0042790","GO:0070898","GO:0006383","GO:0006359"]},{"accession":"XP_002196484.5","go_terms":["GO:0060718","GO:0043276","GO:0048146","GO:0008069","GO:0072332","GO:2000134","GO:0030330","GO:0001946","GO:0008015","GO:0030900","GO:0032466","GO:0002040","GO:0070365","GO:0045850","GO:0070345","GO:1990086","GO:0060707","GO:0019760","GO:0042023","GO:0032877","GO:0048255","GO:0071930","GO:0008630","GO:0071466","GO:0045944","GO:0006351","GO:0033301","GO:0043392","GO:0045599","GO:0000278","GO:0051726","GO:0006884"]},{"accession":"XP_002196758.5","go_terms":["GO:0005975","GO:0006487"]},{"accession":"XP_012425096.5","go_terms":["GO:0035269","GO:0016266","GO:0010289","GO:0006012","GO:0005978","GO:0071555","GO:0010192","GO:0043403","GO:0010417","GO:0009834"]},{"accession":"XP_012428289.4","go_terms":["GO:0006295","GO:0006286","GO:0045876","GO:0006284","GO:0035753","GO:0045190","GO:0090267","GO:0007613","GO:0006289","GO:0031292","GO:0002455","GO:0001302","GO:0000734","GO:0006260","GO:0016446","GO:1903469","GO:0071140"]},{"accession":"XP_030132923.2","go_terms":["GO:0035269","GO:0016266","GO:0010289","GO:0006012","GO:0005978","GO:0071555","GO:0010192","GO:0043403","GO:0010417","GO:0009834"]},{"accession":"XP_072787955.1","go_terms":["GO:0035269","GO:0016266","GO:0010289","GO:0006012","GO:0005978","GO:0071555","GO:0010192","GO:0043403","GO:0010417","GO:0009834"]},{"accession":"XP_030125781.1","go_terms":["GO:0007124","GO:0051123","GO:0043966","GO:0001403","GO:0009960","GO:0006366","GO:0016578"]},{"accession":"XP_030136430.2","go_terms":["GO:0015937","GO:0034628","GO:0009611","GO:0097171","GO:0019350","GO:0046444","GO:0006747","GO:1990966"]},{"accession":"XP_030138014.4","go_terms":["GO:0060575","GO:0032436","GO:0045892","GO:0010976","GO:1903715","GO:0008407","GO:0045746","GO:0030851","GO:0045820","GO:0010452","GO:0018027","GO:0006469","GO:0033138","GO:0045184","GO:1900037","GO:0014904","GO:0035914","GO:0043516","GO:0007507","GO:0071549","GO:0000122","GO:1901532","GO:0036158","GO:0018026","GO:1902035","GO:0006511","GO:0045944","GO:0006351","GO:0048642","GO:0016579","GO:0006334","GO:0051123","GO:0006352","GO:2000648"]},{"accession":"XP_072782935.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0035108","GO:1901879","GO:0014808","GO:0031585","GO:0060021","GO:0060316","GO:0060047","GO:0060325","GO:0090158","GO:0097202","GO:0086036","GO:0042264","GO:0032237","GO:0010880","GO:1901846"]},{"accession":"XP_072782939.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0035108","GO:1901879","GO:0014808","GO:0031585","GO:0060021","GO:0060316","GO:0060047","GO:0060325","GO:0090158","GO:0097202","GO:0086036","GO:0042264","GO:0032237","GO:0010880","GO:1901846"]},{"accession":"XP_030122264.1","go_terms":["GO:0060575","GO:0032436","GO:0045892","GO:0010976","GO:1903715","GO:0008407","GO:0045746","GO:0030851","GO:0045820","GO:0010452","GO:0018027","GO:0006469","GO:0033138","GO:0045184","GO:1900037","GO:0014904","GO:0035914","GO:0043516","GO:0007507","GO:0071549","GO:0000122","GO:1901532","GO:0036158","GO:0018026","GO:1902035","GO:0006511","GO:0045944","GO:0006351","GO:0048642","GO:0016579","GO:0006334","GO:0051123","GO:0006352","GO:2000648"]},{"accession":"XP_030125724.2","go_terms":["GO:0030210","GO:0007492","GO:0010398","GO:0008101","GO:0072498","GO:0021772","GO:0035118","GO:0009834","GO:0035884","GO:0009969","GO:0009863","GO:0010256","GO:0042353","GO:0015012","GO:0015014","GO:0010417","GO:0001503","GO:0052541","GO:0001707","GO:0019276","GO:0007498","GO:0050650","GO:0007369","GO:0006044","GO:0010401","GO:0045743","GO:0006486"]},{"accession":"XP_002198187.1","go_terms":["GO:0090503","GO:0000288","GO:0033962","GO:0035195","GO:0061014","GO:0000290","GO:0045944","GO:0043928","GO:0000289"]}],"graph":[["XP_030145256.1","XP_002196758.5",0.545],["XP_030145256.1","XP_012425096.5",0.653],["XP_030127020.1","XP_012427909.5",0.601],["XP_002198187.1","XP_002196758.5",0.636],["XP_072777592.1","XP_002196484.5",0.873],["XP_072777592.1","XP_012425096.5",0.585],["XP_072777592.1","XP_012428289.4",0.724],["XP_072777592.1","XP_030132923.2",0.537],["XP_072777592.1","XP_072782939.1",0.54],["XP_012425096.5","XP_030132923.2",0.652],["XP_012425096.5","XP_030122264.1",0.538],["XP_012425096.5","XP_072782935.1",0.597],["XP_012425096.5","XP_072782939.1",0.606],["XP_072782935.1","XP_030132923.2",0.583],["XP_030134957.1","XP_002196758.5",0.522],["XP_002196484.5","XP_012427909.5",0.641],["XP_002196484.5","XP_072782939.1",0.533],["XP_072782939.1","XP_030132923.2",0.532]],"all_go_terms":{"GO:0098789":1,"GO:0031564":1,"GO:0009302":1,"GO:0006378":1,"GO:0006368":1,"GO:0070940":2,"GO:1905213":1,"GO:0030847":1,"GO:0001174":1,"GO:0030846":1,"GO:0098504":1,"GO:0000105":1,"GO:0051973":1,"GO:0016032":1,"GO:0016311":1,"GO:1904355":1,"GO:0042769":1,"GO:0098506":1,"GO:0006281":1,"GO:0042276":1,"GO:0070987":1,"GO:0006261":1,"GO:0071494":1,"GO:0006297":1,"GO:0002830":1,"GO:1902443":1,"GO:0070374":1,"GO:0030277":1,"GO:0070431":1,"GO:0070059":1,"GO:0050871":1,"GO:0071260":1,"GO:0090197":1,"GO:0031663":1,"GO:0070427":1,"GO:0045061":1,"GO:0043123":1,"GO:0007249":1,"GO:0007568":1,"GO:2000406":1,"GO:0032094":1,"GO:1904646":1,"GO:0002732":1,"GO:0034349":1,"GO:1901224":1,"GO:0032498":1,"GO:0042534":1,"GO:0070970":1,"GO:1904747":1,"GO:0032760":1,"GO:0010804":1,"GO:0010659":1,"GO:0097202":3,"GO:0046641":1,"GO:0071560":1,"GO:0050830":1,"GO:0008630":2,"GO:0045408":1,"GO:0014876":1,"GO:0032755":1,"GO:0033209":1,"GO:0034134":1,"GO:1902527":1,"GO:0046330":1,"GO:0042098":1,"GO:0034142":1,"GO:0070266":1,"GO:0031295":1,"GO:0070231":1,"GO:0002377":1,"GO:1904417":1,"GO:0050718":1,"GO:0032611":1,"GO:0001666":1,"GO:1902176":1,"GO:0002374":1,"GO:0002277":1,"GO:0050717":1,"GO:0007275":1,"GO:0001843":1,"GO:0006968":1,"GO:0006954":1,"GO:0030154":1,"GO:0043330":1,"GO:1902524":1,"GO:0045087":1,"GO:0090201":1,"GO:0002906":1,"GO:0042104":1,"GO:0030900":2,"GO:0044351":1,"GO:0032610":1,"GO:0097192":1,"GO:0043525":1,"GO:1900017":1,"GO:1902523":1,"GO:0014736":1,"GO:0097194":1,"GO:0016064":1,"GO:0071223":1,"GO:0007420":1,"GO:0070269":1,"GO:1902742":1,"GO:0016045":1,"GO:2001238":1,"GO:0071225":1,"GO:0002588":1,"GO:0032729":1,"GO:0042100":1,"GO:0050702":1,"GO:1990001":1,"GO:2000484":1,"GO:2001181":1,"GO:0071224":1,"GO:0072432":1,"GO:0007584":1,"GO:0000209":1,"GO:0001961":1,"GO:0008635":1,"GO:1902109":1,"GO:0014808":3,"GO:0070671":1,"GO:0002931":1,"GO:0001554":1,"GO:0034121":1,"GO:0051092":1,"GO:0071549":3,"GO:0006977":1,"GO:0050852":1,"GO:0010667":1,"GO:0070555":1,"GO:0001783":1,"GO:0032688":1,"GO:0045577":1,"GO:0051260":1,"GO:1902510":1,"GO:0002606":1,"GO:0051402":1,"GO:0070673":1,"GO:0045416":1,"GO:0042228":1,"GO:0032740":1,"GO:0051882":1,"GO:1905845":1,"GO:0033091":1,"GO:0045627":1,"GO:0007399":1,"GO:0050856":1,"GO:0010800":1,"GO:0035234":1,"GO:0045086":1,"GO:0010867":1,"GO:2000134":2,"GO:0046902":1,"GO:0030150":1,"GO:1903740":1,"GO:0045944":5,"GO:0000290":2,"GO:0090503":2,"GO:0061014":2,"GO:0035195":2,"GO:0000289":2,"GO:0043928":2,"GO:0033962":2,"GO:0000288":2,"GO:0006359":1,"GO:0045893":1,"GO:0006352":3,"GO:0006413":1,"GO:0070893":1,"GO:0007283":1,"GO:0042790":1,"GO:0070898":1,"GO:0006383":1,"GO:1903357":1,"GO:0051123":4,"GO:0071466":1,"GO:0033301":1,"GO:0071930":1,"GO:0006884":1,"GO:0045599":1,"GO:0072332":1,"GO:0032877":1,"GO:0051726":1,"GO:0006351":3,"GO:0070345":1,"GO:0060718":1,"GO:0048255":1,"GO:0030330":1,"GO:0001946":1,"GO:0043392":1,"GO:0070365":1,"GO:0045850":1,"GO:0048146":1,"GO:0000278":1,"GO:0002040":1,"GO:0042023":1,"GO:0008069":1,"GO:1990086":1,"GO:0008015":1,"GO:0032466":1,"GO:0019760":1,"GO:0043276":1,"GO:0060707":1,"GO:0005975":1,"GO:0006487":1,"GO:0010289":3,"GO:0035269":3,"GO:0010417":4,"GO:0006012":3,"GO:0010192":3,"GO:0071555":3,"GO:0005978":3,"GO:0016266":3,"GO:0009834":4,"GO:0043403":3,"GO:0007613":1,"GO:0006289":1,"GO:0000734":1,"GO:0016446":1,"GO:0045876":1,"GO:0071140":1,"GO:0045190":1,"GO:0031292":1,"GO:1903469":1,"GO:0001302":1,"GO:0090267":1,"GO:0002455":1,"GO:0006284":1,"GO:0006295":1,"GO:0035753":1,"GO:0006260":3,"GO:0006286":1,"GO:0001403":1,"GO:0009960":1,"GO:0007124":1,"GO:0043966":1,"GO:0016578":1,"GO:0006366":1,"GO:0034628":1,"GO:0015937":1,"GO:0019350":1,"GO:1990966":1,"GO:0006747":1,"GO:0097171":1,"GO:0009611":1,"GO:0046444":1,"GO:0008407":2,"GO:0000122":2,"GO:0036158":2,"GO:2000648":2,"GO:0007507":2,"GO:0045746":2,"GO:1901532":2,"GO:0006334":2,"GO:1903715":2,"GO:0018026":2,"GO:0045892":2,"GO:0016579":2,"GO:0032436":2,"GO:0035914":2,"GO:0010976":2,"GO:0045184":2,"GO:0048642":2,"GO:0014904":2,"GO:0060575":2,"GO:0043516":2,"GO:1902035":2,"GO:0006511":2,"GO:0018027":2,"GO:0033138":2,"GO:0030851":2,"GO:0010452":2,"GO:0045820":2,"GO:1900037":2,"GO:0006469":2,"GO:0006278":2,"GO:1901879":2,"GO:0090158":2,"GO:0060316":2,"GO:0010880":2,"GO:1901846":2,"GO:0086036":2,"GO:0046718":2,"GO:0015074":2,"GO:0035108":2,"GO:0075713":2,"GO:0006310":2,"GO:0060325":2,"GO:0032237":2,"GO:0060047":2,"GO:0042264":2,"GO:0075732":2,"GO:0060021":2,"GO:0039651":2,"GO:0031585":2,"GO:1903704":2,"GO:0042353":1,"GO:0015014":1,"GO:0015012":1,"GO:0010398":1,"GO:0001707":1,"GO:0030210":1,"GO:0007369":1,"GO:0009969":1,"GO:0006044":1,"GO:0010401":1,"GO:0010256":1,"GO:0021772":1,"GO:0035884":1,"GO:0072498":1,"GO:0035118":1,"GO:0008101":1,"GO:0050650":1,"GO:0001503":1,"GO:0007498":1,"GO:0045743":1,"GO:0052541":1,"GO:0006486":1,"GO:0009863":1,"GO:0007492":1,"GO:0019276":1},"recipe_readded":["XP_030133224.4","XP_030124861.4","XP_030147421.4","XP_072781652.1","XP_032604869.3","XP_012427797.2","XP_030135316.2","XP_002197483.1","XP_030138727.4","XP_030120343.1","XP_002187661.4","XP_072773996.1","XP_030146438.1","XP_030146440.1","XP_072773997.1","XP_002189028.1","XP_002194163.6","XP_012429630.1","XP_032605076.3","XP_030132134.4"]}