{"hash":"1535913712322036279","title":"DNA repair and retroviral integration factors","description":"This cluster is dominated by GO terms for DNA metabolism and handling (DNA recombination, replication, base-excision repair, DNA integration) along with retroviral processes (viral penetration into the host nucleus and proviral latency). The presence of xenobiotic response and cell-cycle regulation hints at broader stress-responsive functions, but the core pattern is DNA repair/processing linked to retroviral integration events.","confidence":"High","size":14,"edges":60,"triangles":109,"max_degree":12,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"XP_069979165.1","go_terms":["GO:0006296","GO:0033158","GO:0009416","GO:0006307","GO:0032355","GO:0072421","GO:0043066","GO:0006284","GO:0071276","GO:0045471","GO:0002526","GO:0006289","GO:0045007","GO:0007568","GO:0051593","GO:0042493","GO:0045008","GO:1902800","GO:1901291","GO:0033683","GO:0007004","GO:0003313","GO:0070987"]},{"accession":"XP_069993521.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_069996032.1","go_terms":["GO:0032922","GO:2000323","GO:0071000","GO:2000850","GO:0019915","GO:0009650","GO:0045475","GO:1902448","GO:0009638","GO:0042332","GO:0050980","GO:0009584","GO:0050958","GO:0048574","GO:0009588","GO:0033762","GO:1902347","GO:0006975","GO:0000719","GO:0042754","GO:0018298","GO:0009785","GO:0009646","GO:0010117","GO:0010343","GO:1901371","GO:1901332","GO:0010617","GO:0010075","GO:1901672","GO:0010244","GO:0045187","GO:2000001","GO:0043153","GO:0010118"]},{"accession":"XP_069996260.1","go_terms":["GO:0032922","GO:2000323","GO:0071000","GO:2000850","GO:0019915","GO:0009650","GO:0045475","GO:1902448","GO:0009638","GO:0042332","GO:0050980","GO:0009584","GO:0050958","GO:0048574","GO:0009588","GO:0033762","GO:1902347","GO:0006975","GO:0000719","GO:0042754","GO:0018298","GO:0009785","GO:0009646","GO:0010117","GO:0010343","GO:1901371","GO:1901332","GO:0010617","GO:0010075","GO:1901672","GO:0010244","GO:0045187","GO:2000001","GO:0043153","GO:0010118"]},{"accession":"XP_069998665.1","go_terms":["GO:0032024","GO:0035773","GO:0006906","GO:0034351","GO:0031340","GO:0048260","GO:0016188","GO:0002669","GO:0032443","GO:2000238","GO:2000235","GO:0034517","GO:0061736","GO:0032425","GO:0048174","GO:0046488","GO:0060313","GO:0046642","GO:0098746","GO:0001302","GO:0032228","GO:0045723","GO:0060304","GO:1903861","GO:0007340","GO:0007343","GO:0006886","GO:0002432","GO:0045945","GO:0021814","GO:0002337","GO:0030579","GO:0071277","GO:0010796","GO:0010794","GO:0010793","GO:0032959","GO:0009789","GO:0001324","GO:0001778","GO:0007520","GO:0007420","GO:0016540","GO:0043314","GO:0090119","GO:0030948","GO:1990926","GO:1990927","GO:0002692","GO:1905433","GO:2000300","GO:2000203","GO:1901002","GO:0035023","GO:0043087","GO:0007416","GO:0009395","GO:0036324","GO:0048015","GO:0043619","GO:0099526","GO:0099525","GO:0006646","GO:1904468","GO:0016082","GO:0060291","GO:0046580","GO:0072699","GO:1900122","GO:0045943","GO:1905415","GO:0031384","GO:0046470","GO:0016525","GO:0038026","GO:0061753","GO:0050861","GO:1905171","GO:0038028","GO:0061511","GO:0014059","GO:0050764","GO:0009738","GO:0035249","GO:0043065","GO:0071236","GO:1902479","GO:0070086","GO:0060963","GO:0007269","GO:0002316","GO:0021997","GO:0090158","GO:0090153","GO:0046456","GO:0031914","GO:2000344","GO:0033135","GO:0032237","GO:0051282","GO:0060716","GO:0008277","GO:0048009","GO:0035477","GO:0070498","GO:0001525","GO:0003073","GO:0007213","GO:0007214","GO:0007215","GO:0035723","GO:0035722","GO:0050859","GO:0060466","GO:0002322","GO:0050852","GO:0032065","GO:0032835","GO:0006816","GO:1902634","GO:0050913","GO:0002092","GO:0007268","GO:0071364","GO:0043536","GO:0001402","GO:2000438","GO:0032735","GO:2000560","GO:0000086","GO:0046673","GO:0021987","GO:0045663","GO:1900087","GO:0040019","GO:0043647"]},{"accession":"XP_027220101.1","go_terms":["GO:0009213","GO:0051276","GO:0006193"]},{"accession":"XP_027235087.1","go_terms":["GO:0042254","GO:0000447","GO:0006412"]},{"accession":"XP_069971517.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_069973969.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_069974804.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"XP_069979412.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_027209071.2","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"XP_027237106.2","go_terms":["GO:0006468","GO:0007623","GO:0000725","GO:0006355","GO:0070297","GO:0042754","GO:0006351","GO:0009649","GO:0000722","GO:2000269","GO:0071480","GO:0009636","GO:0051106","GO:0090267","GO:0036297","GO:0000732","GO:0007294","GO:0007066","GO:0007533","GO:0007141","GO:0010165","GO:0001541","GO:1990918","GO:0009949","GO:0051260","GO:0007129","GO:0000707","GO:0001556","GO:1990426","GO:0072757","GO:0000709","GO:0072719","GO:0010569","GO:0072711","GO:0007286","GO:0042148","GO:0007131","GO:0007130","GO:1904631","GO:0090656","GO:0009951","GO:0045003","GO:0006268","GO:0001832","GO:0030491","GO:0042493","GO:0030717","GO:1990414","GO:0001932","GO:0071140","GO:0016539","GO:0006260","GO:0006269"]},{"accession":"XP_027223583.1","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]}],"graph":[["XP_069979165.1","XP_069971517.1",0.734],["XP_069979165.1","XP_069973969.1",0.659],["XP_069979165.1","XP_069974804.1",0.59],["XP_069979165.1","XP_069979412.1",0.713],["XP_069979165.1","XP_069993521.1",0.589],["XP_069979165.1","XP_069996032.1",0.797],["XP_069979165.1","XP_069996260.1",0.845],["XP_069979165.1","XP_027209071.2",0.752],["XP_069979165.1","XP_027220101.1",0.617],["XP_069979165.1","XP_027223583.1",0.872],["XP_069979165.1","XP_027235087.1",0.803],["XP_069973969.1","XP_069979412.1",0.551],["XP_069973969.1","XP_027209071.2",0.534],["XP_069973969.1","XP_027220101.1",0.58],["XP_069973969.1","XP_027235087.1",0.574],["XP_069973969.1","XP_027237106.2",0.681],["XP_069973969.1","XP_069974804.1",0.56],["XP_027220101.1","XP_027209071.2",0.546],["XP_027220101.1","XP_027237106.2",0.858],["XP_027220101.1","XP_069971517.1",0.57],["XP_027220101.1","XP_069974804.1",0.716],["XP_027220101.1","XP_069996032.1",0.76],["XP_027220101.1","XP_069996260.1",0.516],["XP_069971517.1","XP_069979412.1",0.7],["XP_069971517.1","XP_069996032.1",0.547],["XP_069971517.1","XP_069996260.1",0.503],["XP_069971517.1","XP_069998665.1",0.511],["XP_069971517.1","XP_027209071.2",0.855],["XP_069971517.1","XP_027237106.2",0.614],["XP_069971517.1","XP_069974804.1",0.574],["XP_027209071.2","XP_027223583.1",0.633],["XP_027209071.2","XP_069974804.1",0.736],["XP_027209071.2","XP_027237106.2",0.737],["XP_027209071.2","XP_027235087.1",0.643],["XP_027209071.2","XP_069979412.1",0.6],["XP_027209071.2","XP_069996032.1",0.737],["XP_027209071.2","XP_069996260.1",0.643],["XP_027209071.2","XP_069993521.1",0.575],["XP_069993521.1","XP_027235087.1",0.862],["XP_069993521.1","XP_027237106.2",0.892],["XP_069993521.1","XP_069998665.1",0.777],["XP_069979412.1","XP_069974804.1",0.672],["XP_069979412.1","XP_069996032.1",0.586],["XP_069979412.1","XP_069998665.1",0.841],["XP_069979412.1","XP_027223583.1",0.648],["XP_069979412.1","XP_027235087.1",0.552],["XP_027223583.1","XP_027235087.1",0.619],["XP_027223583.1","XP_027237106.2",0.61],["XP_027223583.1","XP_069974804.1",0.686],["XP_027223583.1","XP_069996032.1",0.648],["XP_027223583.1","XP_069996260.1",0.531],["XP_027223583.1","XP_069998665.1",0.85],["XP_027237106.2","XP_069996032.1",0.773],["XP_027237106.2","XP_069996260.1",0.925],["XP_027237106.2","XP_027235087.1",0.802],["XP_027237106.2","XP_069974804.1",0.642],["XP_027235087.1","XP_069996260.1",0.515],["XP_069998665.1","XP_069974804.1",0.655],["XP_069974804.1","XP_069996032.1",0.705],["XP_069974804.1","XP_069996260.1",0.641]],"all_go_terms":{"GO:0045007":1,"GO:0002526":1,"GO:0045008":1,"GO:0007568":4,"GO:1902800":1,"GO:0009416":1,"GO:0006296":1,"GO:0006307":1,"GO:0070987":1,"GO:0006284":4,"GO:1901291":1,"GO:0051593":1,"GO:0042493":5,"GO:0072421":1,"GO:0003313":1,"GO:0045471":1,"GO:0033683":1,"GO:0007004":1,"GO:0006289":1,"GO:0032355":1,"GO:0033158":1,"GO:0071276":1,"GO:0043066":1,"GO:0050958":2,"GO:2000323":2,"GO:0071000":2,"GO:0009650":2,"GO:0019915":2,"GO:0010117":2,"GO:0042332":2,"GO:0010617":2,"GO:0006975":2,"GO:0009638":2,"GO:0045187":2,"GO:0033762":2,"GO:0009584":2,"GO:1901371":2,"GO:0018298":2,"GO:0010343":2,"GO:0010244":2,"GO:0000719":2,"GO:1901672":2,"GO:0010075":2,"GO:0050980":2,"GO:1901332":2,"GO:1902448":2,"GO:0048574":2,"GO:0045475":2,"GO:2000001":2,"GO:0009785":2,"GO:2000850":2,"GO:0009588":2,"GO:1902347":2,"GO:0042754":3,"GO:0032922":2,"GO:0010118":2,"GO:0009646":2,"GO:0043153":2,"GO:0033135":1,"GO:0050852":1,"GO:0072699":1,"GO:0002322":1,"GO:0001778":1,"GO:0038028":1,"GO:0031384":1,"GO:0048009":1,"GO:0071364":1,"GO:2000238":1,"GO:0035023":1,"GO:0099525":1,"GO:0031340":1,"GO:0002092":1,"GO:0010796":1,"GO:0007416":1,"GO:0032065":1,"GO:0032959":1,"GO:0021997":1,"GO:0046580":1,"GO:0006886":1,"GO:0007340":1,"GO:0061753":1,"GO:0002337":1,"GO:1902479":1,"GO:0009395":1,"GO:1990926":1,"GO:0048015":1,"GO:0009738":1,"GO:0098746":1,"GO:1900122":1,"GO:0035723":1,"GO:0038026":1,"GO:0060963":1,"GO:0043314":1,"GO:0001525":1,"GO:0050764":1,"GO:2000560":1,"GO:0046488":1,"GO:0032024":1,"GO:0002669":1,"GO:2000438":1,"GO:0048260":1,"GO:0030948":1,"GO:0045945":1,"GO:1901002":1,"GO:0035249":1,"GO:0016525":1,"GO:1990927":1,"GO:0046470":1,"GO:0031914":1,"GO:0007268":1,"GO:0032443":1,"GO:0046673":1,"GO:1905433":1,"GO:0032237":1,"GO:0050913":1,"GO:0060466":1,"GO:0090158":1,"GO:0035477":1,"GO:0014059":1,"GO:0090153":1,"GO:0051282":1,"GO:0050861":1,"GO:2000344":1,"GO:0002432":1,"GO:0034351":1,"GO:0060313":1,"GO:0001324":1,"GO:0007520":1,"GO:0006906":1,"GO:2000203":1,"GO:0032425":1,"GO:0000086":1,"GO:0043065":1,"GO:0032228":1,"GO:0043619":1,"GO:0045663":1,"GO:0035773":1,"GO:0061736":1,"GO:0045943":1,"GO:0046456":1,"GO:0043647":1,"GO:0001402":1,"GO:0060304":1,"GO:1905415":1,"GO:2000300":1,"GO:0043087":1,"GO:0048174":1,"GO:0046642":1,"GO:0016082":1,"GO:0007213":1,"GO:0001302":1,"GO:0070498":1,"GO:0032735":1,"GO:0021987":1,"GO:0009789":1,"GO:0007269":1,"GO:0043536":1,"GO:0016188":1,"GO:0099526":1,"GO:0030579":1,"GO:0002316":1,"GO:0060291":1,"GO:0071277":1,"GO:0010794":1,"GO:2000235":1,"GO:0010793":1,"GO:0050859":1,"GO:0090119":1,"GO:1904468":1,"GO:0006646":1,"GO:0036324":1,"GO:0061511":1,"GO:1902634":1,"GO:0007343":1,"GO:0007420":1,"GO:1905171":1,"GO:0032835":1,"GO:0002692":1,"GO:0035722":1,"GO:0060716":1,"GO:0008277":1,"GO:1903861":1,"GO:0070086":1,"GO:0071236":1,"GO:0003073":1,"GO:1900087":4,"GO:0021814":1,"GO:0007215":1,"GO:0034517":1,"GO:0045723":1,"GO:0006816":1,"GO:0016540":1,"GO:0007214":1,"GO:0040019":1,"GO:0006193":1,"GO:0051276":1,"GO:0009213":1,"GO:0006412":1,"GO:0000447":1,"GO:0042254":1,"GO:0006260":5,"GO:0015074":4,"GO:0075732":4,"GO:0075713":4,"GO:0006310":6,"GO:0046718":4,"GO:0039651":4,"GO:1903704":4,"GO:0006278":4,"GO:0014912":3,"GO:0071320":3,"GO:0043488":3,"GO:1903507":3,"GO:0044179":3,"GO:0046856":3,"GO:2000466":3,"GO:0003335":3,"GO:0090502":3,"GO:0045454":3,"GO:2000327":3,"GO:0071375":3,"GO:0070301":3,"GO:2001153":3,"GO:0006308":3,"GO:0080111":3,"GO:0006915":3,"GO:0090656":1,"GO:0009636":1,"GO:0016539":1,"GO:0006468":1,"GO:0009949":1,"GO:0000732":1,"GO:1990918":1,"GO:0007286":1,"GO:1904631":1,"GO:0036297":1,"GO:0010165":1,"GO:0010569":1,"GO:0030491":1,"GO:0072719":1,"GO:0070297":1,"GO:1990414":1,"GO:0007066":1,"GO:2000269":1,"GO:0072711":1,"GO:0006351":1,"GO:0007294":1,"GO:0000722":1,"GO:0006355":1,"GO:0001556":1,"GO:0001541":1,"GO:0071480":1,"GO:0042148":1,"GO:0007130":1,"GO:0007533":1,"GO:0007131":1,"GO:0007141":1,"GO:0009951":1,"GO:0009649":1,"GO:0006268":1,"GO:0001932":1,"GO:0007129":1,"GO:0007623":1,"GO:0090267":1,"GO:0051106":1,"GO:1990426":1,"GO:0071140":1,"GO:0001832":1,"GO:0000725":1,"GO:0000707":1,"GO:0006269":1,"GO:0045003":1,"GO:0072757":1,"GO:0030717":1,"GO:0051260":1,"GO:0000709":1},"recipe_readded":[]}