{"hash":"2240933906062826168","title":"DNA damage response and transcriptional regulation","description":"This cluster centers on transcriptional regulation (GO:0006355) and chromatin/modification processes (histone dephosphorylation), coupled with stress-responsive pathways including DNA damage checkpoint signaling, apoptotic DNA fragmentation, and ER-stress\u2013related translation initiation. While some terms are obsolete or less directly related (e.g., morphine response, brain development), the overarching theme suggests nuclear regulation of gene expression in response to genomic stress and cellular stress signals. Confidence: Medium","confidence":"","size":5,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_065676485.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065645494.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065654429.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065674919.1","go_terms":["GO:0071357","GO:0030850","GO:0046661","GO:0006463","GO:0050689","GO:0071360","GO:0045087","GO:0008277","GO:0051301","GO:0071945","GO:0071973","GO:0001041","GO:0070206","GO:0008653","GO:0007346","GO:0071908","GO:0071492","GO:0045070","GO:0071909","GO:0003283","GO:0051661","GO:0072189","GO:0046890","GO:0048496","GO:0050714","GO:0000160","GO:0006355","GO:0006351","GO:2001235","GO:0030154","GO:0034352","GO:0046672","GO:0002921","GO:0007291","GO:0035006","GO:0021556","GO:0001666","GO:0007275","GO:0035070","GO:0051260","GO:0033353","GO:0001843","GO:0070328","GO:0035071","GO:0034349","GO:0007584","GO:0051402","GO:0010659","GO:0007568","GO:1902510","GO:0008635","GO:0072432","GO:0007420","GO:0007399","GO:0070059","GO:0070050","GO:0009626","GO:0071560","GO:0048813","GO:0030900","GO:1901053","GO:0070979","GO:0042787","GO:0007091","GO:0030433","GO:0006478","GO:0045842","GO:0006986","GO:0051348","GO:0016570","GO:2001162","GO:0000278","GO:0035457","GO:1903071","GO:0031145","GO:1903546","GO:0036494","GO:0090526","GO:0051607","GO:1902391","GO:1905515","GO:0048312","GO:0055059","GO:0009938","GO:2000324","GO:0015979","GO:0000413","GO:0009736","GO:0035955","GO:0016576","GO:1903646","GO:1902325","GO:1903070","GO:0010288","GO:0070301","GO:0051291","GO:2000531","GO:0071276","GO:0043278","GO:1901215","GO:0031400"]},{"accession":"XP_065672526.1","go_terms":["GO:0060192","GO:2000378","GO:0030730","GO:0006642","GO:0031999","GO:1990044","GO:0010890","GO:0010897","GO:0034389","GO:0031887","GO:0032000","GO:0010867","GO:0035359"]}],"graph":[["XP_065645494.1","XP_065676485.1",0.858]],"all_go_terms":{"GO:0016576":1,"GO:0043278":1,"GO:0006355":1,"GO:0030154":1,"GO:0035955":1,"GO:0072432":1,"GO:1902510":1,"GO:0036494":1,"GO:0007420":1,"GO:0035071":1,"GO:0051301":1,"GO:0071909":1,"GO:0051291":1,"GO:0071276":1,"GO:2001235":1,"GO:0001666":1,"GO:0006986":1,"GO:0046890":1,"GO:0046672":1,"GO:1903070":1,"GO:0006463":1,"GO:0070206":1,"GO:1903546":1,"GO:0007091":1,"GO:1901053":1,"GO:0030900":1,"GO:0045842":1,"GO:1903071":1,"GO:0050714":1,"GO:0070979":1,"GO:0070328":1,"GO:0034352":1,"GO:0045087":1,"GO:0006478":1,"GO:0070059":1,"GO:0003283":1,"GO:0006351":1,"GO:0001843":1,"GO:2000324":1,"GO:0048312":1,"GO:0051402":1,"GO:0031400":1,"GO:0007346":1,"GO:0007291":1,"GO:0035457":1,"GO:2000531":1,"GO:0050689":1,"GO:0071908":1,"GO:0021556":1,"GO:0035070":1,"GO:0071357":1,"GO:0090526":1,"GO:0034349":1,"GO:0071945":1,"GO:0048813":1,"GO:0031145":1,"GO:1905515":1,"GO:0009626":1,"GO:1902325":1,"GO:0007275":1,"GO:0008635":1,"GO:0007568":1,"GO:2001162":1,"GO:0070301":1,"GO:0010659":1,"GO:0035006":1,"GO:0010288":1,"GO:0071360":1,"GO:0030433":1,"GO:0000278":1,"GO:0046661":1,"GO:0045070":1,"GO:0055059":1,"GO:0009736":1,"GO:0002921":1,"GO:1902391":1,"GO:0001041":1,"GO:1901215":1,"GO:0000160":1,"GO:0051607":1,"GO:0009938":1,"GO:0007399":1,"GO:0070050":1,"GO:0000413":1,"GO:0033353":1,"GO:0007584":1,"GO:0015979":1,"GO:0048496":1,"GO:0030850":1,"GO:0071492":1,"GO:0051260":1,"GO:1903646":1,"GO:0071973":1,"GO:0008277":1,"GO:0008653":1,"GO:0071560":1,"GO:0016570":1,"GO:0051348":1,"GO:0051661":1,"GO:0072189":1,"GO:0042787":1,"GO:0010890":1,"GO:1990044":1,"GO:0034389":1,"GO:0006642":1,"GO:0031887":1,"GO:0032000":1,"GO:0035359":1,"GO:0060192":1,"GO:0031999":1,"GO:0010897":1,"GO:0030730":1,"GO:0010867":1,"GO:2000378":1},"recipe_readded":["XP_065643839.1","XP_065643841.1","XP_065643840.1","XP_065652494.1","XP_065657344.1","XP_065647148.1","XP_065661193.1","XP_065654011.1","XP_065676701.1","XP_065644331.1","XP_065672263.1","XP_065670275.1","XP_065673507.1","XP_065645945.1","XP_065673715.1","XP_065644332.1","XP_065667054.1","XP_065667056.1","XP_065652018.1","XP_065666999.1"]}