{"hash":"173068966144223440","title":"Ubiquitin-Dependent Protein Degradation and Signaling","description":"This cluster is dominated by ubiquitination-related processes: autoubiquitination, ubiquitin-dependent protein catabolic processes, and K63-linked ubiquitination, plus aggresome assembly, all pointing to ubiquitin-driven protein turnover and quality control. The presence of GO terms for regulation of JNK cascade and TNF-mediated signaling suggests ubiquitination\u2019s role in modulating inflammatory signaling. A few development-related terms (placenta morphogenesis) may reflect broader ubiquitin regulation in development. Overall, the core theme is ubiquitin-dependent proteolysis and its influence on signaling.","confidence":"High","size":5,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_062824776.1","go_terms":["GO:0050847","GO:0061734","GO:0061736","GO:0060242","GO:0043524","GO:0043525","GO:1903861","GO:0097676","GO:0002669","GO:0032443","GO:2000238","GO:1901165","GO:2000235","GO:0034517","GO:2000232","GO:2000749","GO:0016203","GO:0030216","GO:0031064","GO:0060669","GO:0046642","GO:0030512","GO:0060393","GO:0051865","GO:2000009","GO:0060575","GO:0021629","GO:0090263","GO:0050821","GO:0046328","GO:0048260","GO:0043547","GO:0071211","GO:0045723","GO:0014809","GO:0032480","GO:0010793","GO:0072307","GO:0035307","GO:0030579","GO:1900180","GO:0010796","GO:0006513","GO:0010794","GO:2000146","GO:1905437","GO:2000650","GO:0048368","GO:0050808","GO:2000203","GO:0019089","GO:0060360","GO:0060044","GO:0035331","GO:0007049","GO:0000413","GO:0043162","GO:0042921","GO:0010768","GO:0060449","GO:0048332","GO:0048339","GO:0035329","GO:0035441","GO:1902459","GO:0061051","GO:0000117","GO:0070534","GO:0045944","GO:0031384","GO:0070373","GO:0035519","GO:0097198","GO:0061753","GO:0060977","GO:0045732","GO:2000059","GO:0042787","GO:0032465","GO:0080182","GO:0030182","GO:0006915","GO:0070086","GO:0060487","GO:1901016","GO:0097118","GO:2000809"]},{"accession":"XP_062815573.1","go_terms":["GO:0043972","GO:0034720","GO:0002509","GO:0032602","GO:0097190","GO:0007098","GO:1901536","GO:0098532","GO:0051569","GO:0002458","GO:0090308","GO:2000791","GO:0010216","GO:0000122","GO:0045869","GO:0051225","GO:0097536","GO:0048513","GO:0070562","GO:0080182","GO:2001040","GO:2000864","GO:0060669","GO:1901097","GO:0007289","GO:1901726","GO:0006334","GO:1901674","GO:1904388","GO:0061087","GO:0061086","GO:0044648","GO:2000584","GO:0061188","GO:2000410","GO:0048655","GO:0000423","GO:0033132","GO:1902236","GO:1901340","GO:1903265","GO:0021888","GO:0014070","GO:0045648","GO:0002109","GO:0006357","GO:0035973","GO:1901799","GO:1902283","GO:0016579","GO:1904378","GO:0030474","GO:0017085","GO:1903071","GO:0006289","GO:0051865","GO:0034140","GO:0030433","GO:0016925","GO:1905366","GO:0000028","GO:0010636","GO:0010637","GO:0000753","GO:0071816","GO:0070842","GO:0097237","GO:1900186","GO:1904021","GO:0006517","GO:1904049","GO:0006412","GO:0010390","GO:0071158","GO:0034968","GO:0080188","GO:0010424"]},{"accession":"XP_062819439.1","go_terms":["GO:0035774","GO:0000423","GO:0032436","GO:0000266","GO:0099074","GO:0090201","GO:0033132","GO:0051865","GO:0043388","GO:0051583","GO:0036205","GO:0051412","GO:0023035","GO:0046329","GO:1903265","GO:0070936","GO:0090258","GO:0006986","GO:0070842","GO:0070979","GO:0048078","GO:0090141","GO:0010918","GO:0085020","GO:0042787","GO:1902283","GO:0071287","GO:1903427","GO:0070534","GO:0043123","GO:0060546","GO:0010636","GO:1903382","GO:2001171","GO:1902530","GO:0055069","GO:1905366","GO:0008344","GO:1903542","GO:0097039","GO:0010637","GO:0090394","GO:1904049","GO:0097237","GO:0042551","GO:0070050","GO:0006513","GO:1903378","GO:0051967","GO:0006351","GO:1903377","GO:0046676","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XP_062826029.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0045087","GO:0090086","GO:0007026","GO:1902187","GO:0035372","GO:0043569","GO:0046597","GO:0048384","GO:0046598","GO:1900458","GO:0070842","GO:1900246","GO:0071641","GO:0043045","GO:1902261","GO:1901536","GO:2000059","GO:1900226","GO:0007182","GO:0070562","GO:0001778","GO:0006914","GO:0043123","GO:0036353","GO:0007014","GO:0030578","GO:1903762","GO:0061158","GO:0051092","GO:0060669","GO:0032897","GO:0050713","GO:0051607","GO:0045345","GO:0031664","GO:0070534","GO:0045869","GO:1901253","GO:2000637","GO:2000653","GO:0009896","GO:0046007","GO:0000185","GO:0061470","GO:1901224","GO:0033280","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0097039","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903721","GO:0090073"]},{"accession":"XP_062818440.1","go_terms":["GO:0006311","GO:0070534","GO:0006915","GO:0060028","GO:1903343","GO:1902187","GO:0043045","GO:0045869","GO:1901536","GO:1904262","GO:0090309","GO:0016925","GO:0010508","GO:0051026","GO:0060669","GO:0034198","GO:0070936","GO:0001825","GO:2000653","GO:0045087","GO:0090086","GO:0007026","GO:0035372","GO:0043569","GO:0046597","GO:0048384","GO:0046598","GO:1900458","GO:0070842","GO:1900246","GO:0071641","GO:1902261","GO:2000059","GO:1900226","GO:0007182","GO:0070562","GO:0001778","GO:0006914","GO:0043123","GO:0036353","GO:0007014","GO:0030578","GO:1903762","GO:0061158","GO:0051092","GO:0032897","GO:0050713","GO:0051607","GO:0045345","GO:0031664","GO:0051865","GO:1901253","GO:2000637","GO:0009896","GO:0046007","GO:0030433","GO:0000185","GO:0061470","GO:1901224","GO:0033280","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0097039","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0042787","GO:0070535","GO:1903721","GO:0090073"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0007049":1,"GO:0031064":1,"GO:0080182":2,"GO:0042787":4,"GO:0060242":1,"GO:0060575":1,"GO:0031384":1,"GO:0097118":1,"GO:0061051":1,"GO:0035307":1,"GO:0060449":1,"GO:0061734":1,"GO:0071211":1,"GO:0050821":1,"GO:0010793":1,"GO:2000650":1,"GO:0043162":1,"GO:0060669":4,"GO:0010796":1,"GO:0060977":1,"GO:2000232":1,"GO:1901165":1,"GO:2000146":1,"GO:1903861":1,"GO:0046642":1,"GO:0050808":1,"GO:0045944":1,"GO:0016203":1,"GO:0010768":1,"GO:0000413":1,"GO:2000235":1,"GO:2000749":1,"GO:0051865":5,"GO:0048260":1,"GO:0035331":1,"GO:0072307":1,"GO:0034517":1,"GO:1905437":1,"GO:0046328":4,"GO:0021629":1,"GO:0032465":1,"GO:0006915":2,"GO:0048332":1,"GO:0035441":1,"GO:1900180":1,"GO:0070534":4,"GO:0070086":1,"GO:2000203":1,"GO:0097676":1,"GO:0061753":1,"GO:0060360":1,"GO:0043525":1,"GO:0030182":1,"GO:1902459":1,"GO:0043547":1,"GO:0060393":1,"GO:0070373":1,"GO:0032480":1,"GO:2000809":1,"GO:0014809":1,"GO:0030512":1,"GO:0030216":1,"GO:0060044":1,"GO:2000059":3,"GO:2000009":1,"GO:0000117":1,"GO:0061736":1,"GO:0090263":1,"GO:0048368":1,"GO:0050847":1,"GO:0019089":1,"GO:0002669":1,"GO:0042921":1,"GO:0032443":1,"GO:0043524":1,"GO:0097198":1,"GO:0035329":1,"GO:1901016":1,"GO:0030579":1,"GO:2000238":1,"GO:0060487":1,"GO:0010794":1,"GO:0035519":1,"GO:0006513":2,"GO:0045723":1,"GO:0048339":1,"GO:0045732":1,"GO:0044648":1,"GO:0034720":1,"GO:0071158":1,"GO:0010636":2,"GO:0098532":1,"GO:1903071":1,"GO:1904378":1,"GO:0043972":1,"GO:0000423":2,"GO:1902283":2,"GO:1904388":1,"GO:1905366":2,"GO:0017085":1,"GO:0090308":1,"GO:0097237":2,"GO:0061086":1,"GO:0002509":1,"GO:0002109":1,"GO:0002458":1,"GO:0034968":1,"GO:2001040":1,"GO:1901536":3,"GO:0033132":2,"GO:0051569":1,"GO:0016579":1,"GO:1901340":1,"GO:0071816":1,"GO:0007289":1,"GO:1901674":1,"GO:0070842":4,"GO:0007098":1,"GO:0045648":1,"GO:1904021":1,"GO:0000122":1,"GO:0080188":1,"GO:0010390":1,"GO:0061188":1,"GO:2000584":1,"GO:1901799":1,"GO:0070562":3,"GO:0030474":1,"GO:2000791":1,"GO:0048655":1,"GO:0010216":1,"GO:0000028":1,"GO:1902236":1,"GO:0034140":1,"GO:2000864":1,"GO:1903265":4,"GO:0006517":1,"GO:0097536":1,"GO:0010637":2,"GO:0006334":1,"GO:0030433":3,"GO:0097190":1,"GO:0006289":1,"GO:0035973":1,"GO:0010424":1,"GO:0048513":1,"GO:1901726":1,"GO:0061087":1,"GO:2000410":1,"GO:0032602":1,"GO:1901097":1,"GO:0000753":1,"GO:0006357":1,"GO:0051225":1,"GO:0014070":1,"GO:0006412":1,"GO:1900186":1,"GO:0021888":1,"GO:1904049":2,"GO:0045869":3,"GO:0016925":2,"GO:1902530":1,"GO:0099074":1,"GO:0051412":1,"GO:0007250":3,"GO:0070050":1,"GO:0046676":1,"GO:0090258":1,"GO:0000266":1,"GO:1903378":1,"GO:1903762":3,"GO:2000620":3,"GO:0070512":3,"GO:0043388":1,"GO:1903382":1,"GO:0051583":1,"GO:0033151":3,"GO:0085020":3,"GO:0071287":1,"GO:0055069":1,"GO:0090073":3,"GO:0023035":1,"GO:0009048":3,"GO:0035774":1,"GO:0070979":1,"GO:0046329":1,"GO:0048078":1,"GO:0090394":1,"GO:1903721":3,"GO:0042981":3,"GO:0033209":3,"GO:0006351":1,"GO:0032436":1,"GO:0043123":3,"GO:0060546":3,"GO:1903542":1,"GO:0090201":1,"GO:2001171":1,"GO:0042551":1,"GO:0036205":3,"GO:0070936":3,"GO:0006986":1,"GO:0090141":1,"GO:0051967":1,"GO:1901253":3,"GO:1903427":1,"GO:1903377":1,"GO:0070535":3,"GO:0010918":1,"GO:0097039":3,"GO:0008344":1,"GO:0007182":2,"GO:2000653":2,"GO:0048535":2,"GO:0002635":2,"GO:1900458":2,"GO:0036353":2,"GO:0038018":1,"GO:0033280":2,"GO:0045623":2,"GO:0007026":2,"GO:0043569":2,"GO:1900226":2,"GO:1903883":2,"GO:0000185":2,"GO:0061158":2,"GO:0046007":2,"GO:2000637":2,"GO:1902187":2,"GO:0060816":1,"GO:0050713":2,"GO:0051607":2,"GO:1900095":1,"GO:0043029":2,"GO:0046598":2,"GO:0046621":1,"GO:0006914":2,"GO:0045345":2,"GO:0071641":2,"GO:1901224":2,"GO:0043045":2,"GO:0045087":2,"GO:0032897":2,"GO:0048536":2,"GO:0001778":2,"GO:1903886":2,"GO:0051092":2,"GO:0048384":2,"GO:0090086":2,"GO:0016558":1,"GO:1902261":2,"GO:0031664":2,"GO:0009896":2,"GO:0042098":2,"GO:0007014":2,"GO:0046597":2,"GO:0050999":2,"GO:0048490":2,"GO:1900246":2,"GO:0030578":2,"GO:0035372":2,"GO:0001782":2,"GO:0061470":2,"GO:1904262":1,"GO:0039536":1,"GO:0001825":1,"GO:0090309":1,"GO:0006311":1,"GO:0002250":1,"GO:0051026":1,"GO:0034198":1,"GO:0010508":1,"GO:1903343":1,"GO:0016567":1,"GO:0060028":1},"recipe_readded":["XP_003229331.3","XP_003220899.3","XP_003222394.1","XP_062840033.1","XP_008101749.1","XP_003223555.1","XP_016852446.2","XP_008108338.1","XP_008113922.2","XP_003219628.1","XP_003230174.3","XP_003215184.1","XP_008104646.1","XP_003215012.1","XP_062821593.1","XP_008108920.2","XP_062814936.1","XP_008109825.1","XP_003224543.1","XP_008111708.2"]}