{"hash":"415058046156058726","title":"Transcription Regulation and tRNA Modification","description":"The dominant GO terms point to transcriptional control (DNA-templated transcription; negative regulation of transcription by RNA polymerase II) and tRNA modification (tRNA methylation; tRNA wobble uridine modification). While a few terms refer to lipopolysaccharide response or biosynthetic processes in other organisms, the strongest shared function among the cluster members appears to be involvement in gene expression regulation at both the level of transcription and tRNA modification.","confidence":"Medium","size":5,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_015610822.1","go_terms":["GO:0019595","GO:0051160","GO:0003016","GO:0042572","GO:0032496","GO:0042573","GO:0009809","GO:0033859","GO:0000947","GO:0006116","GO:0046688","GO:1900116","GO:0033498","GO:0018119","GO:0046370","GO:0051409","GO:0019518","GO:0045777","GO:0043458","GO:0046294","GO:1901159","GO:0006062","GO:0010430","GO:0006068","GO:0006069","GO:0006633","GO:0006693","GO:0097327","GO:0055114"]},{"accession":"XP_015618533.2","go_terms":["GO:0009236","GO:0017000","GO:0035690","GO:0006656","GO:0019919","GO:0009102","GO:0030488","GO:0016049","GO:0018012","GO:0006744","GO:0010189","GO:0016126","GO:0043985","GO:0070476","GO:0046690","GO:0002098","GO:0000056","GO:0001300","GO:0090398","GO:0030961","GO:0006370","GO:0009877","GO:0031167","GO:0018364","GO:0036068","GO:0018026","GO:0018027","GO:0036265","GO:1901052","GO:0006479","GO:0006364","GO:0000122","GO:0009809","GO:0042135","GO:0009805","GO:0050668","GO:0060117","GO:0032259","GO:0045963","GO:0042420","GO:0006596","GO:0000154","GO:0000183","GO:0018023","GO:0018013"]},{"accession":"NP_001389358.1","go_terms":["GO:0009718","GO:0001081","GO:0009242","GO:0006541","GO:0006012","GO:0006351","GO:1901006","GO:0009699","GO:0055114","GO:0009243","GO:0010253","GO:0019835","GO:0042351","GO:0097171","GO:0006556","GO:0009244","GO:0019305","GO:0045226","GO:0019673","GO:0009103","GO:0080110","GO:0042619","GO:0035754","GO:0060716","GO:0001942","GO:0016126","GO:0008204","GO:1902653","GO:0033320","GO:0033499","GO:0033358","GO:0033481","GO:0019306","GO:0019878","GO:1902987","GO:0008611","GO:0010025","GO:0035336","GO:0019388"]},{"accession":"NP_001404184.1","go_terms":["GO:0052889","GO:0030851","GO:0042135","GO:0034720","GO:0042493","GO:0045227","GO:0010725","GO:0046203","GO:0021762","GO:0042742","GO:0042551","GO:0021983","GO:0046208","GO:0032496","GO:0042420","GO:0010044","GO:0051572","GO:0001701","GO:0000380","GO:0045648","GO:0006783","GO:0006782","GO:0044179","GO:0055114","GO:0050768","GO:0016575","GO:0071555","GO:0033184","GO:2000648","GO:0060992","GO:1990138","GO:0008283","GO:0006915","GO:1901307","GO:0010976","GO:0046886","GO:0046098","GO:0021987","GO:0035563","GO:0051573","GO:0014063","GO:0045793","GO:0045471","GO:0071320","GO:0045654","GO:2000179","GO:0006355","GO:0009851","GO:0043046","GO:0016117","GO:0045964","GO:0010269","GO:0051412","GO:0042391","GO:0051068","GO:0045454","GO:0019383","GO:0009635","GO:0048240","GO:0009106","GO:0007369","GO:0006120","GO:0009229","GO:0009228","GO:0019483","GO:0009409","GO:0019805","GO:0007568","GO:0097054","GO:0006103","GO:0036088","GO:0042416","GO:0006579","GO:0033514","GO:0046653","GO:0019835","GO:0006562","GO:0019563","GO:0046168","GO:1902114","GO:0002097","GO:0055130"]},{"accession":"NP_001409933.1","go_terms":["GO:0033158","GO:0043388","GO:0045454","GO:0000122","GO:0098869","GO:1903206","GO:0006662","GO:0080058","GO:0034599","GO:0018401","GO:0055114","GO:0046826","GO:0006351","GO:0016032","GO:1903026","GO:0034976","GO:0034975","GO:0030091","GO:0030851","GO:0071320","GO:0051068","GO:0034720","GO:0045654","GO:2000648","GO:0043448","GO:0021983","GO:0009106","GO:0006120","GO:0048240","GO:0006096","GO:1990138","GO:0051572","GO:0001701","GO:0000380","GO:0042551","GO:0043046","GO:0007369","GO:0021987","GO:0016575","GO:0010725","GO:0006749","GO:0060992","GO:2000179","GO:0006103","GO:0042391","GO:0019608","GO:0010976","GO:0046886","GO:0046098","GO:0035563","GO:0051573","GO:0045793","GO:0007568","GO:0097054","GO:0045648","GO:0042853","GO:0042208","GO:0019430","GO:0050787","GO:0061732","GO:0006099","GO:0046653","GO:0030488","GO:0070899","GO:0010510","GO:0006554","GO:0070276","GO:0019383","GO:0071455","GO:0042135","GO:0051412","GO:0010044","GO:0014063","GO:0009061","GO:0006121","GO:0042493","GO:0009435","GO:0032496","GO:0042420","GO:0019563","GO:0009228","GO:0045471","GO:0002098","GO:0010269","GO:0045964","GO:0000305","GO:0006550","GO:0006212","GO:0036245","GO:0019646","GO:0042128","GO:0006552","GO:0010731","GO:0006214","GO:0019483","GO:0009083","GO:0003147","GO:0009263","GO:0071473","GO:0030416","GO:2000651"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0006633":1,"GO:0042572":1,"GO:0010430":1,"GO:0006068":1,"GO:0018119":1,"GO:0006069":1,"GO:0006693":1,"GO:0046294":1,"GO:0055114":4,"GO:0033498":1,"GO:0097327":1,"GO:0009809":2,"GO:0019518":1,"GO:1901159":1,"GO:0046688":1,"GO:0046370":1,"GO:0051160":1,"GO:0033859":1,"GO:0032496":3,"GO:0006116":1,"GO:0042573":1,"GO:0051409":1,"GO:0006062":1,"GO:1900116":1,"GO:0000947":1,"GO:0019595":1,"GO:0045777":1,"GO:0043458":1,"GO:0003016":1,"GO:0018027":1,"GO:0042135":3,"GO:0036068":1,"GO:0046690":1,"GO:0090398":1,"GO:0006479":1,"GO:0032259":1,"GO:0006364":1,"GO:0018023":1,"GO:0000183":1,"GO:0050668":1,"GO:0006656":1,"GO:0017000":1,"GO:0070476":1,"GO:0000056":1,"GO:0016049":1,"GO:0030488":2,"GO:0009236":1,"GO:0035690":1,"GO:0031167":1,"GO:0043985":1,"GO:0030961":1,"GO:0036265":1,"GO:0010189":1,"GO:0006744":1,"GO:0000122":2,"GO:0009877":1,"GO:0042420":3,"GO:0016126":2,"GO:0001300":1,"GO:0006596":1,"GO:0018012":1,"GO:0045963":1,"GO:0009805":1,"GO:0000154":1,"GO:1901052":1,"GO:0018013":1,"GO:0018364":1,"GO:0002098":2,"GO:0019919":1,"GO:0018026":1,"GO:0006370":1,"GO:0060117":1,"GO:0009102":1,"GO:0006541":1,"GO:0010253":1,"GO:0035336":1,"GO:0009244":1,"GO:0010025":1,"GO:0033499":1,"GO:0019673":1,"GO:0001942":1,"GO:0019305":1,"GO:0009718":1,"GO:0009699":1,"GO:0006351":2,"GO:0009242":1,"GO:0001081":1,"GO:0009243":1,"GO:0033320":1,"GO:0008204":1,"GO:1901006":1,"GO:0009103":1,"GO:1902653":1,"GO:1902987":1,"GO:0042619":1,"GO:0019388":1,"GO:0042351":1,"GO:0033481":1,"GO:0019306":1,"GO:0008611":1,"GO:0035754":1,"GO:0033358":1,"GO:0006556":1,"GO:0097171":1,"GO:0080110":1,"GO:0019835":2,"GO:0006012":1,"GO:0019878":1,"GO:0060716":1,"GO:0045226":1,"GO:0002097":1,"GO:0035563":2,"GO:0045654":2,"GO:0097054":2,"GO:0009106":2,"GO:0046168":1,"GO:0051412":2,"GO:0009851":1,"GO:0051572":2,"GO:0045454":2,"GO:0046098":2,"GO:0045227":1,"GO:0019483":2,"GO:0046886":2,"GO:0006783":1,"GO:1990138":2,"GO:0006103":2,"GO:0009409":1,"GO:0051068":2,"GO:0019563":2,"GO:0006915":1,"GO:0014063":2,"GO:0055130":1,"GO:0021983":2,"GO:0010976":2,"GO:1902114":1,"GO:0000380":2,"GO:0050768":1,"GO:0045964":2,"GO:0042416":1,"GO:0042493":2,"GO:0042742":1,"GO:2000179":2,"GO:0046203":1,"GO:0033184":1,"GO:0060992":2,"GO:0009228":2,"GO:0019805":1,"GO:0051573":2,"GO:0006355":1,"GO:0007568":2,"GO:0006120":2,"GO:0071320":2,"GO:0045793":2,"GO:0006562":1,"GO:0010725":2,"GO:0036088":1,"GO:0006782":1,"GO:0043046":2,"GO:0010044":2,"GO:0033514":1,"GO:0048240":2,"GO:0016575":2,"GO:0016117":1,"GO:0001701":2,"GO:0071555":1,"GO:0045648":2,"GO:0042391":2,"GO:0045471":2,"GO:0009229":1,"GO:0021762":1,"GO:0046653":2,"GO:0034720":2,"GO:0008283":1,"GO:2000648":2,"GO:0006579":1,"GO:0044179":1,"GO:0052889":1,"GO:1901307":1,"GO:0042551":2,"GO:0021987":2,"GO:0046208":1,"GO:0030851":2,"GO:0019383":2,"GO:0007369":2,"GO:0009635":1,"GO:0010269":2,"GO:0019646":1,"GO:0006099":1,"GO:0010510":1,"GO:0003147":1,"GO:0019430":1,"GO:0009263":1,"GO:0006212":1,"GO:1903026":1,"GO:0034599":1,"GO:0071455":1,"GO:0034975":1,"GO:0006749":1,"GO:0006214":1,"GO:0071473":1,"GO:0070899":1,"GO:0018401":1,"GO:0009061":1,"GO:0098869":1,"GO:0050787":1,"GO:0042208":1,"GO:0043388":1,"GO:0019608":1,"GO:0046826":1,"GO:0034976":1,"GO:0006550":1,"GO:0030416":1,"GO:0010731":1,"GO:0006121":1,"GO:1903206":1,"GO:0009083":1,"GO:0006662":1,"GO:0042128":1,"GO:0070276":1,"GO:0033158":1,"GO:0080058":1,"GO:0036245":1,"GO:0030091":1,"GO:0016032":1,"GO:0000305":1,"GO:0006096":1,"GO:0061732":1,"GO:0042853":1,"GO:0043448":1,"GO:2000651":1,"GO:0006554":1,"GO:0009435":1,"GO:0006552":1},"recipe_readded":["XP_066160147.1","XP_066160106.1","NP_039380.1","XP_066166053.1","XP_015637160.1","XP_015634335.1","XP_015618799.1","XP_025881521.1","XP_015637173.1","XP_025879721.1","NP_001406798.1","XP_015622986.1","XP_015624024.1","XP_015627562.1","XP_015623888.1","XP_015645233.2","NP_001411082.1","NP_001390205.1","NP_001391576.1","XP_015635837.1"]}