{"hash":"1207946430367165970","title":"Chromatin remodeling and transcription regulation","description":"The cluster centers on nuclear chromatin dynamics and transcription control, as shown by recurring GO terms for transcriptional regulation by RNA polymerase II, transcription initiation-coupled chromatin remodeling, rDNA heterochromatin formation, and DNA replication\u2013dependent chromatin assembly, along with nucleus organization. While a few terms (e.g., certain developmental or defense processes) appear, they likely reflect multi-functionality or annotation spillover of chromatin-associated proteins. This suggests a coherent module of chromatin regulation and transcriptional control.","confidence":"High","size":9,"edges":32,"triangles":60,"max_degree":8,"top_function":"regulatory ncRNA-mediated gene silencing","members":[{"accession":"XP_001364046.2","go_terms":["GO:0030466","GO:0019731","GO:0031639","GO:0071169","GO:0008584","GO:0007296","GO:0035264","GO:0035023","GO:1904693","GO:0003344","GO:2000973","GO:0000122","GO:0034184","GO:0030543","GO:0002227","GO:0090230","GO:1902340","GO:0051290","GO:0007283","GO:0007338","GO:0007286","GO:0031509","GO:0006335","GO:0045618","GO:0042692","GO:0031508","GO:0000183","GO:1904815","GO:0061641","GO:0001649","GO:0071674","GO:0003209","GO:0045815","GO:0048477","GO:0033128","GO:0051572","GO:0070481","GO:0006997","GO:0007549","GO:0007420","GO:0035093","GO:0050830","GO:0061086","GO:1901837","GO:0008285","GO:0071392","GO:0043486","GO:0006334","GO:0006357"]},{"accession":"XP_001380078.1","go_terms":["GO:0030466","GO:0019731","GO:0031639","GO:0071169","GO:0008584","GO:0007296","GO:0035264","GO:0035023","GO:1904693","GO:0003344","GO:2000973","GO:0000122","GO:0034184","GO:0030543","GO:0002227","GO:0090230","GO:1902340","GO:0051290","GO:0007283","GO:0007338","GO:0007286","GO:0031509","GO:0006335","GO:0045618","GO:0042692","GO:0031508","GO:0000183","GO:1904815","GO:0061641","GO:0001649","GO:0071674","GO:0003209","GO:0045815","GO:0048477","GO:0033128","GO:0051572","GO:0070481","GO:0006997","GO:0007549","GO:0007420","GO:0035093","GO:0050830","GO:0061086","GO:1901837","GO:0061408","GO:0043966","GO:0000436","GO:0043457","GO:1900446","GO:2000306","GO:0042766","GO:0045898","GO:0008285","GO:0071392","GO:0043486","GO:0006334","GO:0006357"]},{"accession":"XP_056665930.1","go_terms":["GO:1902042","GO:1902044","GO:0032392","GO:0034137","GO:1903672","GO:1990774","GO:0043388","GO:2000819","GO:0034587","GO:0007140","GO:0002643","GO:0002281","GO:0043046","GO:0007129","GO:0002437","GO:0097350","GO:0045819","GO:2000426","GO:0032727","GO:0035767","GO:0017055","GO:2001200","GO:0032425","GO:0032728","GO:0032072","GO:0034145","GO:0002840","GO:0007289","GO:0045063","GO:0050718","GO:0045654","GO:0002270","GO:0045578","GO:0006391","GO:0001935","GO:0048545","GO:0035711","GO:2001237","GO:0033153","GO:0061303","GO:0060009","GO:0001755","GO:0061386","GO:0061145","GO:0048866","GO:0001828","GO:0043044","GO:0030916","GO:0032332","GO:2000741","GO:0045662","GO:0003415","GO:0072193","GO:0072197","GO:0048298","GO:0060532","GO:2000726","GO:0061010","GO:0003290","GO:0060018","GO:0001841","GO:0003357","GO:0061153","GO:0003211","GO:0046533","GO:0003289","GO:0055057","GO:0021538","GO:0048484","GO:0071864","GO:0071866","GO:0010909","GO:0003203","GO:0071353","GO:0060784","GO:0035914","GO:0030879","GO:0035622","GO:0048557","GO:0048709","GO:0048627","GO:0048625","GO:0014009","GO:0035019","GO:0070898","GO:0060174","GO:0071504","GO:0043049","GO:0007422","GO:0060807","GO:0006351","GO:0021943","GO:0007493","GO:0031018","GO:0021903","GO:0032808","GO:0045586","GO:0060956","GO:0090579","GO:0003308","GO:0000122","GO:0044334","GO:0072091","GO:1902262","GO:0003413","GO:0007548","GO:0060214","GO:0090139","GO:0072190","GO:2000043","GO:0090190","GO:0071899","GO:0071560","GO:0060517","GO:0033234","GO:0048546","GO:0070318","GO:0048619","GO:2001111","GO:0042662","GO:0060221","GO:0072289","GO:0001195","GO:0010197","GO:0043586","GO:0032696","GO:0070384","GO:2000761","GO:0090090","GO:0014718","GO:0061138","GO:0019100","GO:0060729","GO:0044336","GO:0003142","GO:0072034","GO:0010452","GO:0030538","GO:2000020","GO:0060534","GO:0021861"]},{"accession":"NP_001157151.1","go_terms":["GO:1902042","GO:1902044","GO:0032392","GO:0034137","GO:1903672","GO:1990774","GO:0043388","GO:2000819","GO:0034587","GO:0007140","GO:0002643","GO:0002281","GO:0043046","GO:0007129","GO:0002437","GO:0097350","GO:0045819","GO:2000426","GO:0032727","GO:0035767","GO:0017055","GO:2001200","GO:0032425","GO:0032728","GO:0032072","GO:0034145","GO:0002840","GO:0007289","GO:0045063","GO:0050718","GO:0045654","GO:0002270","GO:0045578","GO:0006391","GO:0001935","GO:0048545","GO:0035711","GO:2001237","GO:0033153","GO:0061303","GO:0060009","GO:0001755","GO:0061386","GO:0061145","GO:0048866","GO:0001828","GO:0043044","GO:0030916","GO:0032332","GO:2000741","GO:0045662","GO:0003415","GO:0072193","GO:0072197","GO:0048298","GO:0060532","GO:2000726","GO:0061010","GO:0003290","GO:0060018","GO:0001841","GO:0003357","GO:0061153","GO:0003211","GO:0046533","GO:0003289","GO:0055057","GO:0021538","GO:0048484","GO:0071864","GO:0071866","GO:0010909","GO:0003203","GO:0071353","GO:0060784","GO:0035914","GO:0030879","GO:0035622","GO:0048557","GO:0048709","GO:0048627","GO:0048625","GO:0014009","GO:0035019","GO:0070898","GO:0060174","GO:0071504","GO:0043049","GO:0007422","GO:0060807","GO:0006351","GO:0021943","GO:0007493","GO:0031018","GO:0021903","GO:0032808","GO:0045586","GO:0060956","GO:0090579","GO:0003308","GO:0000122","GO:0044334","GO:0072091","GO:1902262","GO:0003413","GO:0007548","GO:0060214","GO:0090139","GO:0072190","GO:2000043","GO:0090190","GO:0071899","GO:0071560","GO:0060517","GO:0033234","GO:0048546","GO:0070318","GO:0048619","GO:2001111","GO:0042662","GO:0060221","GO:0072289","GO:0001195","GO:0010197","GO:0043586","GO:0032696","GO:0070384","GO:2000761","GO:0090090","GO:0014718","GO:0061138","GO:0019100","GO:0060729","GO:0044336","GO:0003142","GO:0072034","GO:0010452","GO:0030538","GO:2000020","GO:0060534","GO:0021861"]},{"accession":"XP_001362777.1","go_terms":["GO:0030466","GO:0019731","GO:0031639","GO:0071169","GO:0008584","GO:0007296","GO:0035264","GO:0035023","GO:1904693","GO:0003344","GO:2000973","GO:0000122","GO:0034184","GO:0030543","GO:0002227","GO:0090230","GO:1902340","GO:0051290","GO:0007283","GO:0007338","GO:0007286","GO:0031509","GO:0006335","GO:0045618","GO:0042692","GO:0031508","GO:0000183","GO:1904815","GO:0061641","GO:0001649","GO:0071674","GO:0003209","GO:0045815","GO:0048477","GO:0033128","GO:0051572","GO:0070481","GO:0006997","GO:0007549","GO:0007420","GO:0035093","GO:0050830","GO:0061086","GO:1901837","GO:0061408","GO:0043966","GO:0000436","GO:0043457","GO:1900446","GO:2000306","GO:0042766","GO:0045898","GO:0008285","GO:0071392","GO:0043486","GO:0006334","GO:0006357"]},{"accession":"XP_001362863.1","go_terms":["GO:0034080","GO:0006335","GO:0000183","GO:0016233","GO:0051290","GO:0031047","GO:1904837","GO:0006303","GO:0045653","GO:0006352","GO:0045815","GO:0007221","GO:0051090","GO:0051123","GO:0043966"]},{"accession":"XP_001367380.2","go_terms":["GO:0030466","GO:0019731","GO:0031639","GO:0071169","GO:0008584","GO:0007296","GO:0035264","GO:0035023","GO:1904693","GO:0003344","GO:2000973","GO:0000122","GO:0034184","GO:0030543","GO:0002227","GO:0090230","GO:1902340","GO:0051290","GO:0007283","GO:0007338","GO:0007286","GO:0031509","GO:0006335","GO:0045618","GO:0042692","GO:0031508","GO:0000183","GO:1904815","GO:0061641","GO:0001649","GO:0071674","GO:0003209","GO:0045815","GO:0048477","GO:0033128","GO:0051572","GO:0070481","GO:0006997","GO:0007549","GO:0007420","GO:0035093","GO:0050830","GO:0061086","GO:1901837","GO:0061408","GO:0043966","GO:0000436","GO:0043457","GO:1900446","GO:2000306","GO:0042766","GO:0045898","GO:0007221","GO:0051123","GO:0032435","GO:0030307","GO:0030707","GO:0006352","GO:0060760","GO:0000492","GO:0001833","GO:0051457","GO:0007275","GO:0045598","GO:0034080","GO:0016233","GO:0031047","GO:1904837","GO:0006303","GO:0045653","GO:0006312","GO:0051382","GO:0000712","GO:0036297","GO:0031297","GO:0051090"]},{"accession":"XP_001367431.3","go_terms":["GO:0030466","GO:0019731","GO:0031639","GO:0071169","GO:0008584","GO:0007296","GO:0035264","GO:0035023","GO:1904693","GO:0003344","GO:2000973","GO:0000122","GO:0034184","GO:0030543","GO:0002227","GO:0090230","GO:1902340","GO:0051290","GO:0007283","GO:0007338","GO:0007286","GO:0031509","GO:0006335","GO:0045618","GO:0042692","GO:0031508","GO:0000183","GO:1904815","GO:0061641","GO:0001649","GO:0071674","GO:0003209","GO:0045815","GO:0048477","GO:0033128","GO:0051572","GO:0070481","GO:0006997","GO:0007549","GO:0007420","GO:0035093","GO:0050830","GO:0061086","GO:1901837","GO:0061408","GO:0043966","GO:0000436","GO:0043457","GO:1900446","GO:2000306","GO:0042766","GO:0045898","GO:0034080","GO:0016233","GO:0031047","GO:1904837","GO:0006303","GO:0045653","GO:0006352","GO:0007221","GO:0051090","GO:0051123"]},{"accession":"XP_001372534.3","go_terms":["GO:0030466","GO:0019731","GO:0031639","GO:0071169","GO:0008584","GO:0007296","GO:0035264","GO:0035023","GO:1904693","GO:0003344","GO:2000973","GO:0000122","GO:0034184","GO:0030543","GO:0002227","GO:0090230","GO:1902340","GO:0051290","GO:0007283","GO:0007338","GO:0007286","GO:0031509","GO:0006335","GO:0045618","GO:0042692","GO:0031508","GO:0000183","GO:1904815","GO:0061641","GO:0001649","GO:0071674","GO:0003209","GO:0045815","GO:0048477","GO:0033128","GO:0051572","GO:0070481","GO:0006997","GO:0007549","GO:0007420","GO:0035093","GO:0050830","GO:0061086","GO:1901837","GO:0061408","GO:0043966","GO:0000436","GO:0043457","GO:1900446","GO:2000306","GO:0042766","GO:0045898","GO:0008285","GO:0071392","GO:0043486","GO:0006334","GO:0006357"]}],"graph":[["XP_001367380.2","NP_001157151.1",0.678],["XP_001367380.2","XP_001362777.1",0.916],["XP_001367380.2","XP_001362863.1",0.884],["XP_001367380.2","XP_001364046.2",0.786],["XP_001367380.2","XP_001367431.3",0.97],["XP_001367380.2","XP_001372534.3",0.694],["XP_001367380.2","XP_001380078.1",0.926],["XP_001367380.2","XP_056665930.1",0.779],["XP_001364046.2","NP_001157151.1",0.504],["XP_001364046.2","XP_001362777.1",0.895],["XP_001364046.2","XP_001367431.3",0.888],["XP_001364046.2","XP_001362863.1",0.897],["XP_001364046.2","XP_001380078.1",0.876],["XP_001364046.2","XP_056665930.1",0.675],["XP_001367431.3","XP_001362777.1",0.842],["XP_001367431.3","XP_001362863.1",0.898],["XP_001367431.3","XP_001372534.3",0.784],["XP_001367431.3","XP_001380078.1",0.873],["XP_001367431.3","XP_056665930.1",0.531],["NP_001157151.1","XP_001362777.1",0.75],["NP_001157151.1","XP_001362863.1",0.898],["NP_001157151.1","XP_001380078.1",0.809],["NP_001157151.1","XP_056665930.1",0.741],["XP_001380078.1","XP_056665930.1",0.687],["XP_001380078.1","XP_001362777.1",0.904],["XP_001380078.1","XP_001362863.1",0.913],["XP_001380078.1","XP_001372534.3",0.606],["XP_001362777.1","XP_001362863.1",0.926],["XP_001362777.1","XP_001372534.3",0.822],["XP_001362777.1","XP_056665930.1",0.627],["XP_056665930.1","XP_001362863.1",0.908],["XP_001362863.1","XP_001372534.3",0.859]],"all_go_terms":{"GO:0006997":6,"GO:0003209":6,"GO:0035023":6,"GO:0007338":6,"GO:0000183":7,"GO:0050830":6,"GO:0030466":6,"GO:0043486":4,"GO:0035093":6,"GO:0045815":7,"GO:0090230":6,"GO:0042692":6,"GO:0033128":6,"GO:0008285":4,"GO:0006357":4,"GO:0000122":8,"GO:0051290":7,"GO:0007286":6,"GO:0061086":6,"GO:0003344":6,"GO:0031508":6,"GO:0001649":6,"GO:0002227":6,"GO:0045618":6,"GO:0071674":6,"GO:0034184":6,"GO:0070481":6,"GO:0007283":6,"GO:0035264":6,"GO:0007420":6,"GO:0031509":6,"GO:0006334":4,"GO:1901837":6,"GO:0019731":6,"GO:0071169":6,"GO:0007549":6,"GO:2000973":6,"GO:0006335":7,"GO:1902340":6,"GO:0071392":4,"GO:0031639":6,"GO:0008584":6,"GO:1904693":6,"GO:0051572":6,"GO:0007296":6,"GO:0061641":6,"GO:1904815":6,"GO:0048477":6,"GO:0030543":6,"GO:0043457":5,"GO:0000436":5,"GO:0061408":5,"GO:2000306":5,"GO:1900446":5,"GO:0043966":6,"GO:0045898":5,"GO:0042766":5,"GO:0071560":2,"GO:0003142":2,"GO:0035622":2,"GO:0061145":2,"GO:0048557":2,"GO:0070318":2,"GO:0048866":2,"GO:1903672":2,"GO:0033153":2,"GO:0071899":2,"GO:0071353":2,"GO:0090579":2,"GO:0002270":2,"GO:0060018":2,"GO:0003290":2,"GO:0090190":2,"GO:0043044":2,"GO:0032728":2,"GO:0060009":2,"GO:0035711":2,"GO:0043049":2,"GO:2001200":2,"GO:0061138":2,"GO:0046533":2,"GO:0002437":2,"GO:0071864":2,"GO:0060784":2,"GO:0021943":2,"GO:0090090":2,"GO:0032072":2,"GO:0032332":2,"GO:0072190":2,"GO:0048627":2,"GO:0001755":2,"GO:0017055":2,"GO:0001935":2,"GO:0032392":2,"GO:0048619":2,"GO:2000043":2,"GO:0003413":2,"GO:1902262":2,"GO:0072193":2,"GO:0021861":2,"GO:0060807":2,"GO:1990774":2,"GO:0061303":2,"GO:0010909":2,"GO:2000761":2,"GO:0007129":2,"GO:0003357":2,"GO:0055057":2,"GO:2000020":2,"GO:0045578":2,"GO:0048545":2,"GO:2000741":2,"GO:0003203":2,"GO:0034587":2,"GO:0070384":2,"GO:0021538":2,"GO:0044334":2,"GO:0060174":2,"GO:2001111":2,"GO:0042662":2,"GO:2001237":2,"GO:0043388":2,"GO:0043586":2,"GO:0002643":2,"GO:0045819":2,"GO:0007548":2,"GO:0003211":2,"GO:0035914":2,"GO:0034137":2,"GO:0060729":2,"GO:0071504":2,"GO:0060517":2,"GO:0031018":2,"GO:0007422":2,"GO:0045662":2,"GO:0002840":2,"GO:0032425":2,"GO:0032808":2,"GO:0014718":2,"GO:1902044":2,"GO:2000426":2,"GO:0007140":2,"GO:0071866":2,"GO:0006351":2,"GO:0019100":2,"GO:2000819":2,"GO:0014009":2,"GO:0001195":2,"GO:0010452":2,"GO:0045586":2,"GO:0007493":2,"GO:0030916":2,"GO:0072034":2,"GO:0032696":2,"GO:1902042":2,"GO:0030538":2,"GO:0060956":2,"GO:0061010":2,"GO:0072197":2,"GO:0097350":2,"GO:0060532":2,"GO:0035019":2,"GO:0048625":2,"GO:0060534":2,"GO:0003308":2,"GO:0002281":2,"GO:0048709":2,"GO:0033234":2,"GO:0072289":2,"GO:0010197":2,"GO:0006391":2,"GO:0001841":2,"GO:0048546":2,"GO:0045654":2,"GO:0003289":2,"GO:0048484":2,"GO:0035767":2,"GO:0050718":2,"GO:0061386":2,"GO:0030879":2,"GO:2000726":2,"GO:0043046":2,"GO:0032727":2,"GO:0072091":2,"GO:0045063":2,"GO:0007289":2,"GO:0061153":2,"GO:0021903":2,"GO:0003415":2,"GO:0060221":2,"GO:0044336":2,"GO:0001828":2,"GO:0070898":2,"GO:0034145":2,"GO:0060214":2,"GO:0090139":2,"GO:0048298":2,"GO:0045653":3,"GO:0034080":3,"GO:0016233":3,"GO:0031047":3,"GO:0051090":3,"GO:1904837":3,"GO:0051123":3,"GO:0006303":3,"GO:0007221":3,"GO:0006352":3,"GO:0060760":1,"GO:0031297":1,"GO:0030307":1,"GO:0007275":1,"GO:0001833":1,"GO:0045598":1,"GO:0030707":1,"GO:0000492":1,"GO:0036297":1,"GO:0051457":1,"GO:0006312":1,"GO:0000712":1,"GO:0032435":1,"GO:0051382":1},"recipe_readded":[]}