{"hash":"644406713603950821","title":"DNA Damage Response, Transcription, and Apoptosis","description":"The cluster is enriched for transcription regulation terms (positive/negative regulation of transcription by RNA polymerase II, regulation during G1/S) and an intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage, plus anoikis. Other terms point to development and cell cycle processes, but the prominent links are to DNA damage sensing, transcriptional control, and cell fate decisions via apoptosis. This suggests a cohesive theme around how cells sense DNA damage, adjust transcription, and decide between survival and programmed cell death.","confidence":"Medium","size":21,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_051080269.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001323241.1","go_terms":["GO:0060718","GO:0043276","GO:0048146","GO:0008069","GO:0072332","GO:2000134","GO:0030330","GO:0001946","GO:0008015","GO:0030900","GO:0032466","GO:0002040","GO:0070365","GO:0045850","GO:0070345","GO:1990086","GO:0060707","GO:0019760","GO:0042023","GO:0032877","GO:0048255","GO:0071930","GO:0008630","GO:0071466","GO:0045944","GO:0006351","GO:0033301"]},{"accession":"XP_051110568.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001295631.1","go_terms":["GO:0035390","GO:0043044","GO:0000183","GO:0035066","GO:1903770","GO:1901347","GO:1901348","GO:0061820","GO:1904792","GO:0010338","GO:0009737","GO:0009736","GO:0009753","GO:1904911","GO:0009739","GO:0080113","GO:0010082","GO:1901430","GO:0070933","GO:1904850","GO:1905839","GO:0010520","GO:0031848","GO:1905615","GO:1900386","GO:1905778","GO:0009301","GO:0035522","GO:0009751","GO:0072362","GO:0031627","GO:0006970","GO:0006334","GO:1903086","GO:1900056","GO:1900033","GO:0009723","GO:0016032","GO:0030154","GO:0010380","GO:1990414","GO:0071919"]},{"accession":"XP_051085208.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001579985.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_051090105.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_051077158.1","go_terms":["GO:0071931"]},{"accession":"XP_051075940.1","go_terms":["GO:0071931"]},{"accession":"XP_001290145.2","go_terms":["GO:0071931"]},{"accession":"XP_001309416.1","go_terms":["GO:0035390","GO:0043044","GO:0000183","GO:0035066","GO:1903770","GO:1901347","GO:1901348","GO:0061820","GO:1904792","GO:0010338","GO:0009737","GO:0009736","GO:0009753","GO:1904911","GO:0009739","GO:0080113","GO:0010082","GO:1901430","GO:0070933","GO:1904850","GO:1905839","GO:0010520","GO:0031848","GO:1905615","GO:1900386","GO:1905778","GO:0009301","GO:0035522","GO:0009751","GO:0072362","GO:0031627","GO:0006970","GO:0006334","GO:1903086","GO:1900056","GO:1900033","GO:0009723","GO:0016032","GO:0030154","GO:0010380","GO:1990414","GO:0071919"]},{"accession":"XP_001327303.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001583952.1","go_terms":["GO:0060718","GO:0043276","GO:0048146","GO:0008069","GO:0072332","GO:2000134","GO:0030330","GO:0001946","GO:0008015","GO:0030900","GO:0032466","GO:0002040","GO:0070365","GO:0045850","GO:0070345","GO:1990086","GO:0060707","GO:0019760","GO:0042023","GO:0032877","GO:0048255","GO:0071930","GO:0008630","GO:0071466","GO:0045944","GO:0006351","GO:0033301"]},{"accession":"XP_051077368.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_051078920.1","go_terms":["GO:0071931"]},{"accession":"XP_051086579.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001285058.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001294745.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001300224.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001304355.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001305607.1","go_terms":[]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0043276":2,"GO:0070345":2,"GO:0008630":2,"GO:0071930":2,"GO:0001946":2,"GO:0032466":2,"GO:0048255":2,"GO:0030900":2,"GO:0045944":2,"GO:0032877":2,"GO:0008069":2,"GO:0006351":2,"GO:0030330":2,"GO:0060707":2,"GO:0071466":2,"GO:0042023":2,"GO:2000134":2,"GO:0008015":2,"GO:0019760":2,"GO:0070365":2,"GO:0002040":2,"GO:0072332":2,"GO:1990086":2,"GO:0060718":2,"GO:0048146":2,"GO:0045850":2,"GO:0033301":2,"GO:1990414":2,"GO:1905839":2,"GO:1904792":2,"GO:0010380":2,"GO:0009723":2,"GO:0035066":2,"GO:0009737":2,"GO:1904911":2,"GO:0080113":2,"GO:0031627":2,"GO:1903770":2,"GO:0043044":2,"GO:0010082":2,"GO:0009753":2,"GO:0016032":2,"GO:1901348":2,"GO:0010520":2,"GO:0009739":2,"GO:0035522":2,"GO:1900056":2,"GO:0035390":2,"GO:1905615":2,"GO:0061820":2,"GO:0031848":2,"GO:0070933":2,"GO:0000183":2,"GO:0030154":2,"GO:1900386":2,"GO:0072362":2,"GO:0006970":2,"GO:0010338":2,"GO:1901347":2,"GO:0009301":2,"GO:0009751":2,"GO:1905778":2,"GO:1900033":2,"GO:1901430":2,"GO:1904850":2,"GO:0006334":2,"GO:0009736":2,"GO:0071919":2,"GO:1903086":2,"GO:0071931":4},"recipe_readded":["XP_001305614.2","XP_001581220.1","XP_001303202.1","XP_001301493.1","XP_001329029.1","XP_001582336.1"]}