{"hash":"193668572236556573","title":"DNA Repair and RNA Processing","description":"The cluster centers on core genome maintenance and RNA biosynthesis: transcription-coupled nucleotide-excision repair and UV protection plus DNA incision and replication indicate a DNA-damage response, while terms for rRNA maturation, preribosome assembly, and spliceosome-mediated splicing point to RNA processing and ribosome biogenesis. A few developmental or stress terms are present but the dominant theme ties DNA repair to RNA/RNA-protein processing.","confidence":"High","size":26,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_001582276.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001326674.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"XP_051078420.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_051100000.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001330797.1","go_terms":["GO:0046685","GO:0015700","GO:2000185","GO:0006813","GO:0006814","GO:0055085"]},{"accession":"XP_001301577.1","go_terms":["GO:0034085","GO:0048568","GO:0000717","GO:0032289","GO:0072719","GO:1904506","GO:1902990","GO:0010705","GO:0043249","GO:0035264","GO:0009408","GO:0007064","GO:0043247","GO:0001666","GO:1904976","GO:0010569","GO:0001701","GO:1990918","GO:0008283","GO:0021510","GO:0033683","GO:0030282","GO:0048820","GO:0045951","GO:0006366","GO:0006260","GO:0043588","GO:0010525","GO:0090657","GO:0009411","GO:1904535","GO:0072711","GO:0006289","GO:0007284","GO:1990700","GO:0060218","GO:0035563","GO:0045005","GO:0009791","GO:0007568","GO:0040016","GO:0070816","GO:0036297","GO:0000732","GO:0030198","GO:1901838","GO:0051026","GO:0043388","GO:1904430","GO:0006295","GO:0006294","GO:0006293","GO:0009650","GO:0035315","GO:0007348","GO:0006363","GO:0006361","GO:0006362","GO:0006283"]},{"accession":"XP_001319651.1","go_terms":["GO:2000185","GO:0035435","GO:0016237","GO:0006814","GO:0042144","GO:0030643","GO:0048016","GO:0016036","GO:0070417","GO:0080040","GO:0046475","GO:0006799","GO:0098656","GO:0015746","GO:0015744","GO:0015743","GO:0015700","GO:0006813","GO:0055085"]},{"accession":"XP_051112600.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001325605.1","go_terms":["GO:0034356","GO:0006218","GO:0006206","GO:0006216","GO:0019358","GO:0006152","GO:0006190","GO:0015949","GO:0006179"]},{"accession":"XP_051089731.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001320940.1","go_terms":["GO:0070131","GO:0042254","GO:0042256","GO:1902626","GO:0006355","GO:0000463","GO:0070475","GO:0002127"]},{"accession":"XP_051094407.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_051098705.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001583487.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001323994.1","go_terms":["GO:1990126","GO:0045053","GO:0006886","GO:0042147"]},{"accession":"XP_001309819.1","go_terms":["GO:0030070","GO:0010815","GO:0007155"]},{"accession":"XP_001324769.1","go_terms":["GO:0090344","GO:0030157","GO:1905705","GO:1904263","GO:0090307","GO:0007064","GO:1902426","GO:0051301","GO:0030042","GO:0040020","GO:0035185","GO:0070979","GO:0046784","GO:1903461","GO:0032466","GO:0008284","GO:0035721","GO:0090114","GO:0070306","GO:0051016","GO:0031145","GO:0030433","GO:0000070","GO:0051441","GO:0050773","GO:0031081","GO:2000060","GO:0010697","GO:0031915"]},{"accession":"XP_001318861.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001582926.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001583081.1","go_terms":["GO:1903342","GO:0009959","GO:0009556","GO:0070058","GO:0030466","GO:0051307","GO:0043007","GO:0007076","GO:0007130","GO:0010032","GO:0051301","GO:0009660","GO:0032438","GO:1990019","GO:0048007","GO:0006888","GO:0090160","GO:0043323","GO:0035646","GO:0098943","GO:0035652","GO:0051138","GO:0006622","GO:0048490","GO:0048499","GO:0006890","GO:0099590","GO:1900126","GO:0061088"]},{"accession":"XP_001581138.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001579955.1","go_terms":["GO:0050766","GO:0006888"]},{"accession":"XP_001327471.1","go_terms":["GO:1905663","GO:1902625","GO:0048025","GO:0048026","GO:0075522","GO:0075525","GO:0000380","GO:0016556","GO:0001825","GO:1900363","GO:0002188","GO:0000381","GO:1903586","GO:0006406","GO:0006446","GO:0060211","GO:0031047","GO:0048255","GO:0035278","GO:0001731","GO:0010610","GO:0045292","GO:1901407","GO:0097010","GO:0006376","GO:0034462","GO:0006378"]},{"accession":"XP_001327750.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_051082743.1","go_terms":["GO:0006314"]},{"accession":"XP_001300452.1","go_terms":["GO:0032436","GO:0001701","GO:0048142","GO:0043248","GO:0007127","GO:0075525","GO:0000122","GO:0008283","GO:0002188","GO:0035914","GO:1902416","GO:0071033","GO:0006283","GO:0030182","GO:0070196","GO:0000338","GO:0075522","GO:0006446","GO:0034260","GO:0070321","GO:0010972","GO:0048863","GO:0001732","GO:0001731","GO:0048140","GO:0036099","GO:0090054","GO:0090052","GO:0000715","GO:0000973","GO:0006511"]}],"graph":[["XP_051094407.1","XP_001582276.1",0.573]],"all_go_terms":{"GO:0001111":1,"GO:0033683":2,"GO:0009432":1,"GO:0018144":1,"GO:0039530":1,"GO:0006369":1,"GO:0016441":1,"GO:0042255":1,"GO:0001113":1,"GO:0031124":1,"GO:0006367":1,"GO:0001178":1,"GO:0048026":2,"GO:0000716":1,"GO:0000388":1,"GO:0006260":2,"GO:0071051":1,"GO:0090394":1,"GO:0000390":1,"GO:0000463":2,"GO:0000467":1,"GO:0000717":2,"GO:0016584":1,"GO:0000378":1,"GO:0014070":1,"GO:0000184":1,"GO:1903241":1,"GO:0071049":1,"GO:0071031":1,"GO:0006310":1,"GO:0000480":1,"GO:0006301":1,"GO:1904570":1,"GO:0070870":1,"GO:0006265":1,"GO:0000464":1,"GO:0009650":2,"GO:0070417":2,"GO:1904574":1,"GO:0043629":1,"GO:0035315":2,"GO:1902626":2,"GO:0034476":1,"GO:0045003":1,"GO:0043044":1,"GO:0045944":1,"GO:0006605":1,"GO:0006363":2,"GO:0000398":1,"GO:0006283":3,"GO:0048701":1,"GO:0071894":1,"GO:0060543":1,"GO:0042273":1,"GO:0006269":1,"GO:0008306":1,"GO:0006306":1,"GO:0031047":2,"GO:1990417":1,"GO:0048568":2,"GO:0000472":1,"GO:0071042":1,"GO:0000462":1,"GO:0006268":1,"GO:0060303":1,"GO:0071035":1,"GO:0034475":1,"GO:0006289":2,"GO:0035640":1,"GO:0019079":1,"GO:0009307":1,"GO:0010501":1,"GO:0017038":1,"GO:0016973":1,"GO:1990416":1,"GO:1990120":1,"GO:2000616":1,"GO:1900050":1,"GO:0000393":1,"GO:0071441":1,"GO:1903608":1,"GO:0006311":1,"GO:0000466":1,"GO:0071038":1,"GO:0072715":1,"GO:0001666":2,"GO:0042766":1,"GO:1902775":1,"GO:0046685":1,"GO:2000185":2,"GO:0055085":2,"GO:0006813":2,"GO:0006814":2,"GO:0015700":2,"GO:0021510":1,"GO:0072711":1,"GO:0007064":2,"GO:1990918":1,"GO:0006366":1,"GO:1904976":1,"GO:0010569":1,"GO:0001701":2,"GO:0006293":1,"GO:0060218":1,"GO:1990700":1,"GO:1904535":1,"GO:0032289":1,"GO:0045005":1,"GO:0007568":1,"GO:0051026":1,"GO:0035264":1,"GO:1904430":1,"GO:0010525":1,"GO:0006295":1,"GO:0072719":1,"GO:0006361":1,"GO:0043249":1,"GO:1904506":1,"GO:0009408":1,"GO:0043388":1,"GO:0006294":1,"GO:1902990":1,"GO:0009791":1,"GO:0008283":2,"GO:0030282":1,"GO:0036297":1,"GO:0090657":1,"GO:0030198":1,"GO:0009411":1,"GO:0000732":1,"GO:0034085":1,"GO:0048820":1,"GO:0043247":1,"GO:0040016":1,"GO:0007284":1,"GO:0070816":1,"GO:0006362":1,"GO:0043588":1,"GO:0045951":1,"GO:0007348":1,"GO:0035563":1,"GO:1901838":1,"GO:0010705":1,"GO:0016036":1,"GO:0098656":1,"GO:0042144":1,"GO:0080040":1,"GO:0015743":1,"GO:0046475":1,"GO:0015746":1,"GO:0015744":1,"GO:0006799":1,"GO:0016237":1,"GO:0048016":1,"GO:0030643":1,"GO:0035435":1,"GO:0006152":1,"GO:0019358":1,"GO:0006179":1,"GO:0034356":1,"GO:0006218":1,"GO:0006190":1,"GO:0015949":1,"GO:0006206":1,"GO:0006216":1,"GO:0002127":1,"GO:0006355":1,"GO:0042254":1,"GO:0070475":1,"GO:0070131":1,"GO:0042256":1,"GO:0045053":1,"GO:0006886":1,"GO:0042147":1,"GO:1990126":1,"GO:0010815":1,"GO:0007155":1,"GO:0030070":1,"GO:0031145":1,"GO:0032466":1,"GO:0031915":1,"GO:0090344":1,"GO:0010697":1,"GO:0070306":1,"GO:1903461":1,"GO:0070979":1,"GO:2000060":1,"GO:0051301":2,"GO:0090307":1,"GO:1904263":1,"GO:0050773":1,"GO:0030042":1,"GO:0035721":1,"GO:0051016":1,"GO:0031081":1,"GO:0046784":1,"GO:0000070":1,"GO:0051441":1,"GO:1902426":1,"GO:0090114":1,"GO:0040020":1,"GO:0035185":1,"GO:0008284":1,"GO:0030157":1,"GO:1905705":1,"GO:0030433":1,"GO:0007076":1,"GO:1990019":1,"GO:0006888":2,"GO:0009959":1,"GO:0048007":1,"GO:0032438":1,"GO:0099590":1,"GO:0070058":1,"GO:0061088":1,"GO:0043323":1,"GO:0048499":1,"GO:0051307":1,"GO:0006622":1,"GO:0098943":1,"GO:0035646":1,"GO:0009556":1,"GO:1900126":1,"GO:0051138":1,"GO:0043007":1,"GO:0030466":1,"GO:1903342":1,"GO:0048490":1,"GO:0035652":1,"GO:0007130":1,"GO:0090160":1,"GO:0006890":1,"GO:0009660":1,"GO:0010032":1,"GO:0050766":1,"GO:0006406":1,"GO:0010610":1,"GO:1900363":1,"GO:0034462":1,"GO:0075525":2,"GO:0048255":1,"GO:0075522":2,"GO:0035278":1,"GO:0006378":1,"GO:0006376":1,"GO:0002188":2,"GO:0048025":1,"GO:0000380":1,"GO:0001731":2,"GO:0045292":1,"GO:0060211":1,"GO:1902625":1,"GO:0000381":1,"GO:0006446":2,"GO:1903586":1,"GO:0097010":1,"GO:0001825":1,"GO:1905663":1,"GO:0016556":1,"GO:1901407":1,"GO:0006314":1,"GO:0000338":1,"GO:1902416":1,"GO:0048140":1,"GO:0070321":1,"GO:0048142":1,"GO:0090052":1,"GO:0000973":1,"GO:0010972":1,"GO:0036099":1,"GO:0000122":1,"GO:0001732":1,"GO:0090054":1,"GO:0006511":1,"GO:0032436":1,"GO:0000715":1,"GO:0034260":1,"GO:0007127":1,"GO:0071033":1,"GO:0030182":1,"GO:0070196":1,"GO:0048863":1,"GO:0043248":1,"GO:0035914":1},"recipe_readded":["XP_051077590.1","XP_001293563.1","XP_051101991.1","XP_051081151.1","XP_001580900.1","XP_001314971.1","XP_001322576.1","XP_051094952.1","XP_001306030.1","XP_001312773.1","XP_051110911.1","XP_001317991.1","XP_001326456.1","XP_001301245.1","XP_001305895.1","XP_001315868.1","XP_001319817.1","XP_001327475.1","XP_001329247.1","XP_001325069.1"]}