{"hash":"1673782176118310005","title":"RNA Pol II transcription initiation and promoter clearance","description":"Most top GO terms cluster around RNA polymerase II promoter clearance, promoter opening, and initiation steps, suggesting the proteins are involved in forming and initiating transcription by RNA Pol II. The other terms (DNA repair, replication, mRNA decay, immune signaling) may reflect ancillary roles or annotation noise in a mixed cluster, but the dominant theme is transcription initiation.","confidence":"High","size":5,"edges":10,"triangles":10,"max_degree":4,"top_function":"DNA replication","members":[{"accession":"XP_001329985.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"XP_001581975.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717","GO:0000027"]},{"accession":"XP_001304070.2","go_terms":["GO:0006260","GO:0030163","GO:0030494","GO:0015979","GO:0006270","GO:0051301","GO:0007018","GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617","GO:0016311","GO:0016032","GO:0006281","GO:0006355","GO:0006351","GO:0000160","GO:0006808","GO:0019062","GO:0018142","GO:0019082","GO:0018144","GO:0039546","GO:0044694","GO:0039611","GO:0051259","GO:0039520","GO:0039522","GO:0039707","GO:0039690","GO:0039544","GO:0031412","GO:0003341","GO:1990048","GO:0000027","GO:2001235","GO:0030154","GO:0034352","GO:0046672","GO:0002921","GO:0007291","GO:0035006","GO:0021556","GO:0001666","GO:0007275","GO:0035070","GO:0033353","GO:0001843","GO:0070328","GO:0035071","GO:0034349","GO:0007584","GO:0051402","GO:0010659","GO:0007568","GO:1902510","GO:0008635","GO:0072432","GO:0007420","GO:0007399","GO:0070059","GO:0070050","GO:0009626","GO:0071560","GO:0048813","GO:0030900","GO:1901053","GO:0019629","GO:0009399","GO:0009401","GO:0000184","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009432","GO:0009650","GO:0035315","GO:0006306","GO:0033683","GO:0006265","GO:0006367","GO:0006268","GO:0006269","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717","GO:0006824","GO:0030253","GO:0030153","GO:0017004","GO:0031460","GO:0010949","GO:0046677","GO:0099040","GO:0046618","GO:0042883","GO:0015734","GO:0008643","GO:0042760","GO:0015910","GO:1900753","GO:0015777","GO:0006855","GO:0019885","GO:0099133","GO:0090374","GO:0046689","GO:0060702","GO:0015821","GO:0045332","GO:0015803","GO:0000770","GO:0015888","GO:0035461","GO:0043213","GO:0045796","GO:0003333","GO:0043215","GO:0001407","GO:0042953","GO:0072089","GO:0015689","GO:0015886"]},{"accession":"XP_001328793.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"XP_001276924.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717","GO:0000027"]}],"graph":[["XP_001304070.2","XP_001276924.1",0.879],["XP_001304070.2","XP_001328793.1",0.764],["XP_001304070.2","XP_001329985.1",0.733],["XP_001304070.2","XP_001581975.1",0.861],["XP_001581975.1","XP_001328793.1",0.909],["XP_001581975.1","XP_001329985.1",0.921],["XP_001581975.1","XP_001276924.1",0.963],["XP_001329985.1","XP_001328793.1",0.906],["XP_001329985.1","XP_001276924.1",0.956],["XP_001328793.1","XP_001276924.1",0.922]],"all_go_terms":{"GO:0001111":5,"GO:0033683":5,"GO:0009432":5,"GO:0018144":5,"GO:0039530":5,"GO:0006369":4,"GO:0016441":4,"GO:0042255":4,"GO:0001113":5,"GO:0031124":4,"GO:0006367":5,"GO:0001178":4,"GO:0048026":4,"GO:0000716":4,"GO:0000388":4,"GO:0006260":5,"GO:0071051":4,"GO:0090394":4,"GO:0000390":4,"GO:0000463":4,"GO:0000467":4,"GO:0000717":5,"GO:0016584":4,"GO:0000378":4,"GO:0014070":4,"GO:0000184":5,"GO:1903241":4,"GO:0071049":4,"GO:0071031":4,"GO:0006310":4,"GO:0000480":4,"GO:0006301":4,"GO:1904570":4,"GO:0070870":4,"GO:0006265":5,"GO:0000464":4,"GO:0009650":5,"GO:0070417":4,"GO:1904574":4,"GO:0043629":4,"GO:0035315":5,"GO:1902626":4,"GO:0034476":4,"GO:0045003":4,"GO:0043044":4,"GO:0045944":4,"GO:0006605":4,"GO:0006363":4,"GO:0000398":4,"GO:0006283":4,"GO:0048701":4,"GO:0071894":4,"GO:0060543":5,"GO:0042273":4,"GO:0006269":5,"GO:0008306":4,"GO:0006306":5,"GO:0031047":4,"GO:1990417":4,"GO:0048568":5,"GO:0000472":4,"GO:0071042":4,"GO:0000462":4,"GO:0006268":5,"GO:0060303":4,"GO:0071035":4,"GO:0034475":4,"GO:0006289":5,"GO:0035640":4,"GO:0019079":5,"GO:0009307":5,"GO:0010501":4,"GO:0017038":4,"GO:0016973":4,"GO:1990416":4,"GO:1990120":4,"GO:2000616":4,"GO:1900050":4,"GO:0000393":4,"GO:0071441":4,"GO:1903608":4,"GO:0006311":4,"GO:0000466":4,"GO:0071038":4,"GO:0072715":4,"GO:0001666":5,"GO:0042766":4,"GO:1902775":4,"GO:0000027":3,"GO:0099133":1,"GO:0048813":1,"GO:0070914":1,"GO:1990048":1,"GO:0090296":1,"GO:0006270":1,"GO:0016032":1,"GO:0070651":1,"GO:0033314":1,"GO:0032979":1,"GO:0043335":1,"GO:2001235":1,"GO:0061641":1,"GO:0030163":1,"GO:0039520":1,"GO:1903715":1,"GO:0007018":1,"GO:0030154":1,"GO:0070059":1,"GO:0039544":1,"GO:0001843":1,"GO:0006824":1,"GO:0046672":1,"GO:0043215":1,"GO:0018279":1,"GO:0035070":1,"GO:0045796":1,"GO:0071560":1,"GO:0039707":1,"GO:0001407":1,"GO:1903862":1,"GO:0035494":1,"GO:0010659":1,"GO:0015734":1,"GO:0099040":1,"GO:0071712":1,"GO:0051402":1,"GO:0046689":1,"GO:0033353":1,"GO:0035006":1,"GO:0006888":1,"GO:2000158":1,"GO:0030900":1,"GO:0035071":1,"GO:0030494":1,"GO:0008635":1,"GO:0071218":1,"GO:0009401":1,"GO:0090374":1,"GO:0007399":1,"GO:0000733":1,"GO:0015886":1,"GO:1902510":1,"GO:0042883":1,"GO:0039690":1,"GO:0070328":1,"GO:1901053":1,"GO:0021556":1,"GO:0000770":1,"GO:0051131":1,"GO:0018142":1,"GO:0090261":1,"GO:0019885":1,"GO:0070389":1,"GO:0008643":1,"GO:0045899":1,"GO:0046618":1,"GO:0006855":1,"GO:0072432":1,"GO:0039546":1,"GO:0045332":1,"GO:0030153":1,"GO:0061166":1,"GO:0015910":1,"GO:0044694":1,"GO:0042953":1,"GO:0009626":1,"GO:0006355":1,"GO:0017004":1,"GO:0072389":1,"GO:0035461":1,"GO:0016562":1,"GO:0031412":1,"GO:0061738":1,"GO:0034551":1,"GO:0097352":1,"GO:0003333":1,"GO:0003341":1,"GO:0070676":1,"GO:0000160":1,"GO:0006281":1,"GO:0039522":1,"GO:0001824":1,"GO:0043213":1,"GO:0048219":1,"GO:0019082":1,"GO:0007584":1,"GO:0070050":1,"GO:0046034":1,"GO:0006351":1,"GO:0001319":1,"GO:0006272":1,"GO:0015979":1,"GO:0030253":1,"GO:0031460":1,"GO:0045041":1,"GO:0019629":1,"GO:0045053":1,"GO:0015888":1,"GO:0051260":1,"GO:0030420":1,"GO:0030433":1,"GO:0030968":1,"GO:0046677":1,"GO:0015689":1,"GO:0016558":1,"GO:0016485":1,"GO:0007420":1,"GO:0006406":1,"GO:0060702":1,"GO:0016311":1,"GO:0072089":1,"GO:0070842":1,"GO:0009399":1,"GO:0070414":1,"GO:0006808":1,"GO:0032968":1,"GO:0007568":1,"GO:0015821":1,"GO:1900753":1,"GO:0051301":1,"GO:1903007":1,"GO:0070987":1,"GO:0070682":1,"GO:0051013":1,"GO:0034349":1,"GO:0015777":1,"GO:0070370":1,"GO:0034214":1,"GO:1903724":1,"GO:0031117":1,"GO:0042760":1,"GO:1990171":1,"GO:0034352":1,"GO:0051259":1,"GO:0007291":1,"GO:0007275":1,"GO:2001171":1,"GO:0034599":1,"GO:0035617":1,"GO:0070407":1,"GO:0019062":1,"GO:0010949":1,"GO:0015803":1,"GO:1901800":1,"GO:0039611":1,"GO:0002921":1},"recipe_readded":[]}