{"hash":"215836051575299712","title":"Ubiquitin-mediated transcription regulation","description":"The GO terms cluster around deubiquitination and ubiquitin ligase regulation (monoubiquitinated protein deubiquitination, negative regulation of ubiquitin ligase activity), along with histone modifications (H2B deubiquitination, H3-K79 methylation) and DNA-templated transcription, pointing to a core function in controlling transcription through ubiquitin signaling and chromatin state. Some peripheral terms (ethanol response, ERAD, cell differentiation) may reflect broader roles of ubiquitin pathways but do not contradict the central theme.","confidence":"High","size":15,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_025184678.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_025167564.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_025185081.2","go_terms":["GO:0000289","GO:0010606","GO:0006397","GO:0034729","GO:0000245","GO:0048149","GO:1990108","GO:0071108","GO:0021551","GO:0051568","GO:0001662","GO:0035871","GO:0008583","GO:1904667","GO:0010995","GO:0070537","GO:0010992","GO:1904378","GO:0060013","GO:1903070","GO:0035520","GO:0035523","GO:0008343","GO:0044313","GO:1900425","GO:1901026","GO:0035192","GO:0006355","GO:0006511","GO:0006351","GO:0035616"]},{"accession":"XP_065990232.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065994564.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065992346.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065992068.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065996481.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_065995880.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_025179237.1","go_terms":["GO:0032026","GO:1903251","GO:0000320","GO:0007595","GO:0000082","GO:0019085","GO:0019086","GO:0060153","GO:0033197","GO:0051301","GO:0000411","GO:0010165","GO:0035186","GO:0000122","GO:0007129","GO:0000086","GO:0030857","GO:0071157","GO:0044828","GO:1990069","GO:0033601","GO:0044321","GO:2001165","GO:0046626","GO:1905866","GO:0060070","GO:0010673","GO:0033598","GO:0033327","GO:0060749","GO:0010389","GO:0030968","GO:0097421","GO:0045737","GO:0006351","GO:2000775","GO:0010696"]},{"accession":"XP_065990744.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_025171863.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_025177407.1","go_terms":["GO:0006461","GO:0070262","GO:0050790","GO:1903538","GO:0042176","GO:0051754","GO:0007143","GO:0051306","GO:2001241","GO:0051232","GO:0008033","GO:0008612","GO:0033674","GO:0006610","GO:0000060","GO:0000188","GO:0051028","GO:0038202","GO:0097711","GO:0042518","GO:0007084","GO:0060561","GO:0071230","GO:0060188","GO:0006607","GO:0051292","GO:0043547","GO:0006335","GO:0006275","GO:0001938","GO:0045945","GO:0006672"]},{"accession":"XP_066000657.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_025184684.1","go_terms":[]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0035616":1,"GO:0048149":1,"GO:0035520":1,"GO:0034729":1,"GO:1904667":1,"GO:0008583":1,"GO:1904378":1,"GO:1900425":1,"GO:0035192":1,"GO:0010992":1,"GO:0010995":1,"GO:1901026":1,"GO:0000245":1,"GO:0021551":1,"GO:0008343":1,"GO:0044313":1,"GO:0051568":1,"GO:0060013":1,"GO:0070537":1,"GO:1903070":1,"GO:0006351":2,"GO:0010606":1,"GO:0035523":1,"GO:0071108":1,"GO:0001662":1,"GO:0035871":1,"GO:1990108":1,"GO:0006511":1,"GO:0000289":1,"GO:0006355":1,"GO:0006397":1,"GO:0033197":1,"GO:0097421":1,"GO:2001165":1,"GO:0000320":1,"GO:0071157":1,"GO:1905866":1,"GO:0033327":1,"GO:0030857":1,"GO:0007129":1,"GO:1990069":1,"GO:0000122":1,"GO:0010165":1,"GO:0000082":1,"GO:0000411":1,"GO:0033598":1,"GO:0046626":1,"GO:0030968":1,"GO:1903251":1,"GO:0010673":1,"GO:0051301":1,"GO:0045737":1,"GO:0060749":1,"GO:0007595":1,"GO:0060153":1,"GO:0060070":1,"GO:0033601":1,"GO:0010696":1,"GO:0044321":1,"GO:0032026":1,"GO:0010389":1,"GO:2000775":1,"GO:0019086":1,"GO:0044828":1,"GO:0019085":1,"GO:0035186":1,"GO:0000086":1,"GO:0006461":1,"GO:0001938":1,"GO:0008033":1,"GO:0042518":1,"GO:0071230":1,"GO:0006335":1,"GO:0097711":1,"GO:0051306":1,"GO:0043547":1,"GO:0038202":1,"GO:0006275":1,"GO:0007143":1,"GO:0008612":1,"GO:0006672":1,"GO:0051292":1,"GO:0051028":1,"GO:0006610":1,"GO:0051232":1,"GO:0033674":1,"GO:0060188":1,"GO:0000060":1,"GO:0060561":1,"GO:0070262":1,"GO:0051754":1,"GO:0000188":1,"GO:0042176":1,"GO:0045945":1,"GO:2001241":1,"GO:0007084":1,"GO:0050790":1,"GO:0006607":1,"GO:1903538":1},"recipe_readded":["XP_025169670.2","XP_065998012.1","XP_025170935.2","XP_066001458.1","XP_065995526.1","XP_066001901.1","XP_025187614.1","XP_025170531.1","XP_025185508.2","XP_065996979.1"]}