{"hash":"1947716210006042887","title":"Bacterial biosynthesis pathways","description":"Based on the top GO terms, the cluster centers on biosynthetic processes in bacteria, including lipopolysaccharide (LPS) and O-antigen biosynthesis (and related heptose sugar production), clavulanic acid and carnitine biosynthesis, and other metabolic biosynthesis activities (e.g., L-glutamine). A few terms like proteolysis or transcription antitermination are more general cellular processes and are not defining, but the dominant signal is diverse bacterial biosynthesis. ","confidence":"Medium","size":19,"edges":5,"triangles":0,"max_degree":2,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_025180611.1","go_terms":["GO:0009255","GO:0009099","GO:0009097"]},{"accession":"XP_066006631.1","go_terms":["GO:0031564","GO:0006508"]},{"accession":"XP_025179679.2","go_terms":["GO:1902564"]},{"accession":"XP_065996390.1","go_terms":["GO:1902564"]},{"accession":"XP_065998498.1","go_terms":["GO:1902564"]},{"accession":"XP_065999958.1","go_terms":["GO:1902564"]},{"accession":"XP_066003159.1","go_terms":["GO:1902564"]},{"accession":"XP_025181465.1","go_terms":["GO:2001059","GO:0044209","GO:0097171","GO:0009750","GO:0046835","GO:1902777","GO:0006175","GO:0061615","GO:0009744","GO:0010264","GO:0019512","GO:0019303","GO:0006169"]},{"accession":"XP_025183353.1","go_terms":["GO:0009718","GO:0001081","GO:0009242","GO:0006541","GO:0006012","GO:0006351","GO:1901006","GO:0009699","GO:0055114","GO:0019673","GO:0009243","GO:0009244","GO:0009103","GO:0080110","GO:0042619","GO:0042351","GO:0097171","GO:0019305"]},{"accession":"XP_065990296.1","go_terms":["GO:0033050","GO:0017000","GO:0046300","GO:0045329","GO:0006151"]},{"accession":"XP_065992708.1","go_terms":["GO:0071357","GO:0030850","GO:0046661","GO:0006463","GO:0050689","GO:0071360","GO:0045087","GO:0008277","GO:0051301","GO:0000492","GO:0001041","GO:0070206","GO:0008653","GO:0007346","GO:0071908","GO:0071492","GO:0045070","GO:0071909","GO:0003283","GO:0051661","GO:0072189","GO:0046890","GO:0048496","GO:0050714","GO:0051348","GO:0006986","GO:0000278","GO:0045842","GO:0034454","GO:0021756","GO:0046548","GO:0060613","GO:1903546","GO:0038108","GO:0090526","GO:0003085","GO:0060296","GO:0061087","GO:0035845","GO:1903646","GO:1905515","GO:0070389","GO:1902855","GO:0070979","GO:0042787","GO:0007091","GO:0030433","GO:0006478","GO:0016570","GO:2001162","GO:0035457","GO:1903071","GO:0031145","GO:0036494","GO:0051607","GO:1902391","GO:0048312","GO:0055059","GO:0009938","GO:2000324","GO:0015979","GO:0000413","GO:0009736","GO:0035955","GO:0016576","GO:1902325","GO:1903070","GO:0010288","GO:0070301","GO:0051291","GO:2000531","GO:0071276","GO:0043278","GO:1901215","GO:0031400"]},{"accession":"XP_065995463.1","go_terms":["GO:0071357","GO:0030850","GO:0046661","GO:0006463","GO:0000492","GO:0008653","GO:0007346","GO:0071908","GO:0071492","GO:0045070","GO:0071909","GO:0003283","GO:0051661","GO:0008277","GO:0072189","GO:0046890","GO:0048496","GO:0050714","GO:0045842","GO:0034454","GO:0021756","GO:0046548","GO:0060613","GO:1903546","GO:0038108","GO:0090526","GO:0003085","GO:0060296","GO:0061087","GO:0035845","GO:1903646","GO:1905515","GO:0070389","GO:1902855","GO:0070979","GO:0042787","GO:0007091","GO:0051301","GO:0030433","GO:0006478","GO:0050689","GO:0006986","GO:0051348","GO:0016570","GO:2001162","GO:0000278","GO:0035457","GO:0045087","GO:1903071","GO:0031145","GO:0036494","GO:0051607","GO:0071360","GO:1902391","GO:2000324","GO:0015979","GO:0000413","GO:0009736","GO:0035955","GO:0016576","GO:1902325","GO:1903070","GO:0010288","GO:0070301","GO:0051291","GO:2000531","GO:0071276","GO:0043278","GO:1901215","GO:0031400","GO:0009938"]},{"accession":"XP_065996238.1","go_terms":["GO:0033540","GO:0006693","GO:1904070","GO:0009791","GO:0009409","GO:0001889","GO:0042594","GO:0045329","GO:0006111","GO:0019254","GO:0051793","GO:0055007","GO:0046949","GO:0042758","GO:0018896","GO:0007507","GO:0006574","GO:0033539","GO:0006552","GO:0005978"]},{"accession":"XP_025165542.1","go_terms":["GO:0019878","GO:0006879","GO:0019679","GO:0006099","GO:0050892","GO:0009791","GO:1990641","GO:0009098","GO:0009097","GO:0010040","GO:0032543","GO:0019298","GO:0008585","GO:0006097","GO:1903976","GO:0006749","GO:0071071","GO:0006740","GO:1904465","GO:0060253","GO:0006979","GO:0006537","GO:0006741","GO:0006103","GO:0006102","GO:0060696","GO:0048545"]},{"accession":"XP_065996716.1","go_terms":["GO:0006094","GO:0006565"]},{"accession":"XP_066005496.1","go_terms":["GO:0043617","GO:0070981","GO:0017000","GO:0006541","GO:0033050","GO:0006048","GO:0052704","GO:0009113","GO:0006189","GO:0009116"]},{"accession":"XP_066006632.1","go_terms":["GO:0031564","GO:0006508","GO:0042150","GO:0006276"]},{"accession":"XP_025169604.1","go_terms":["GO:0016310","GO:0046654","GO:0046656","GO:0032259"]},{"accession":"XP_025173362.1","go_terms":["GO:0006048","GO:0046115","GO:0009590","GO:0009243","GO:0005978","GO:0019255","GO:0009298","GO:0071555","GO:0006148","GO:0019388","GO:0009103"]}],"graph":[["XP_065992708.1","XP_025183353.1",0.855],["XP_065992708.1","XP_025173362.1",0.858],["XP_065996390.1","XP_065990296.1",0.887],["XP_065996390.1","XP_065996238.1",0.86],["XP_025181465.1","XP_065998498.1",0.579]],"all_go_terms":{"GO:0009097":2,"GO:0009255":1,"GO:0009099":1,"GO:0006508":2,"GO:0031564":2,"GO:1902564":5,"GO:0061615":1,"GO:0019512":1,"GO:0006169":1,"GO:0097171":2,"GO:0009744":1,"GO:0009750":1,"GO:0019303":1,"GO:2001059":1,"GO:0044209":1,"GO:0010264":1,"GO:1902777":1,"GO:0006175":1,"GO:0046835":1,"GO:0006012":1,"GO:0001081":1,"GO:1901006":1,"GO:0009244":1,"GO:0009699":1,"GO:0080110":1,"GO:0055114":1,"GO:0019673":1,"GO:0009718":1,"GO:0009103":2,"GO:0019305":1,"GO:0009242":1,"GO:0006541":2,"GO:0006351":1,"GO:0042619":1,"GO:0009243":2,"GO:0042351":1,"GO:0006151":1,"GO:0045329":2,"GO:0033050":2,"GO:0017000":2,"GO:0046300":1,"GO:1903646":2,"GO:0051661":2,"GO:0006986":2,"GO:0070206":1,"GO:0015979":2,"GO:0055059":1,"GO:0006463":2,"GO:0050714":2,"GO:0003085":2,"GO:0006478":2,"GO:0046890":2,"GO:0070979":2,"GO:0051291":2,"GO:0043278":2,"GO:0016576":2,"GO:0008277":2,"GO:1902391":2,"GO:0038108":2,"GO:0045842":2,"GO:0000413":2,"GO:1902855":2,"GO:1902325":2,"GO:0030850":2,"GO:0061087":2,"GO:0042787":2,"GO:0035457":2,"GO:0060613":2,"GO:1903071":2,"GO:0009938":2,"GO:0009736":2,"GO:0035955":2,"GO:0010288":2,"GO:1905515":2,"GO:0071909":2,"GO:0046661":2,"GO:0051301":2,"GO:0021756":2,"GO:0051607":2,"GO:0031400":2,"GO:0060296":2,"GO:0090526":2,"GO:0048496":2,"GO:0045087":2,"GO:0050689":2,"GO:0031145":2,"GO:1903070":2,"GO:0070301":2,"GO:0071908":2,"GO:0071492":2,"GO:0000492":2,"GO:0007091":2,"GO:0051348":2,"GO:0036494":2,"GO:1901215":2,"GO:0071360":2,"GO:0008653":2,"GO:0003283":2,"GO:0035845":2,"GO:0048312":1,"GO:0070389":2,"GO:2000531":2,"GO:0016570":2,"GO:0071276":2,"GO:0000278":2,"GO:0001041":1,"GO:0071357":2,"GO:0007346":2,"GO:0034454":2,"GO:0046548":2,"GO:2001162":2,"GO:0030433":2,"GO:2000324":2,"GO:1903546":2,"GO:0072189":2,"GO:0045070":2,"GO:0018896":1,"GO:0001889":1,"GO:1904070":1,"GO:0033539":1,"GO:0019254":1,"GO:0007507":1,"GO:0006552":1,"GO:0009791":2,"GO:0033540":1,"GO:0009409":1,"GO:0055007":1,"GO:0042594":1,"GO:0006111":1,"GO:0005978":2,"GO:0051793":1,"GO:0042758":1,"GO:0006574":1,"GO:0006693":1,"GO:0046949":1,"GO:0006097":1,"GO:0006749":1,"GO:0019878":1,"GO:0006741":1,"GO:0050892":1,"GO:0006099":1,"GO:0006103":1,"GO:0019298":1,"GO:0071071":1,"GO:0032543":1,"GO:0010040":1,"GO:0006102":1,"GO:0019679":1,"GO:1904465":1,"GO:0008585":1,"GO:0006740":1,"GO:0060253":1,"GO:1903976":1,"GO:0006537":1,"GO:1990641":1,"GO:0048545":1,"GO:0009098":1,"GO:0060696":1,"GO:0006879":1,"GO:0006979":1,"GO:0006565":1,"GO:0006094":1,"GO:0006189":1,"GO:0070981":1,"GO:0009113":1,"GO:0009116":1,"GO:0006048":2,"GO:0043617":1,"GO:0052704":1,"GO:0042150":1,"GO:0006276":1,"GO:0046654":1,"GO:0046656":1,"GO:0032259":1,"GO:0016310":1,"GO:0009590":1,"GO:0006148":1,"GO:0046115":1,"GO:0071555":1,"GO:0019388":1,"GO:0019255":1,"GO:0009298":1},"recipe_readded":["XP_025183831.1","XP_025169790.1","XP_065990314.1","XP_025181441.2","XP_025178501.1","XP_025185256.1","XP_065993956.1","XP_025181572.1","XP_066004667.1","XP_025180439.1","XP_025165833.1","XP_025182846.1","XP_065998575.1","XP_025168350.1","XP_025169602.1","XP_066005737.1","XP_025190185.1","XP_025181065.1","XP_025190114.1","XP_025180683.1"]}