{"hash":"1393666517920178400","title":"Retroviral entry and proviral latency","description":"This cluster centers on steps of the retroviral life cycle and host interaction: RNA-templated DNA biosynthesis (reverse transcription), DNA replication, DNA integration, viral penetration into the host nucleus, and establishment of integrated proviral latency. Supporting terms indicate host-pathogen dynamics and defense modulation (negative regulation of siRNA processing, symbiont-related apoptosis) and broader host cell entry processes, suggesting a cohesive theme of viral genome integration and host entry/latency with related cellular responses.","confidence":"High","size":23,"edges":26,"triangles":4,"max_degree":21,"top_function":"DNA replication","members":[{"accession":"XP_042239189.1","go_terms":["GO:0001709","GO:0021997","GO:0061005","GO:2000189","GO:0001746","GO:0045138","GO:0060831","GO:0045606","GO:0010875","GO:0006665","GO:0021794","GO:0043616","GO:0021522","GO:0060037","GO:0045879","GO:0071397","GO:0030299","GO:0060603","GO:0042633","GO:0042632","GO:0060644","GO:0008203","GO:0009957","GO:0061053","GO:0018996","GO:0040015","GO:0007225","GO:0010157","GO:0071404","GO:0033344","GO:0060539","GO:0072203","GO:0015936","GO:0035103","GO:0071383","GO:0043407","GO:0008542","GO:0006695","GO:0045540","GO:0032933","GO:0007280","GO:0008299"]},{"accession":"XP_042222345.1","go_terms":["GO:0006903","GO:0034197","GO:0043308","GO:0006888","GO:0043320","GO:1990668","GO:0042144","GO:0042147","GO:0050775","GO:0006891","GO:0006890","GO:0043312","GO:0048280","GO:1903595","GO:0015031","GO:0035493","GO:1900483","GO:0032869","GO:0090161","GO:0043001","GO:0098967","GO:0016240","GO:0090316","GO:0001921","GO:0060291","GO:0016079","GO:1902259","GO:0043134","GO:0070254"]},{"accession":"XP_042228936.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_042232547.1","go_terms":["GO:0044781","GO:0046392","GO:0016051"]},{"accession":"XP_042235544.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0030422","GO:0030177","GO:0043249","GO:0046326","GO:1902895","GO:0032092","GO:0010449","GO:0042635","GO:2000648","GO:1904173","GO:0007004","GO:0022616","GO:0070200","GO:0071456","GO:0007571","GO:1903620","GO:0060729","GO:0010073","GO:0090399","GO:2001240","GO:1904751","GO:1904754","GO:0051000","GO:2000773"]},{"accession":"XP_042239903.1","go_terms":["GO:1903416","GO:0060003","GO:0061454","GO:1990573","GO:1903515","GO:1903249","GO:0098736","GO:1901205","GO:0010107","GO:0015991","GO:0000749","GO:0086009","GO:0051208","GO:0006883","GO:0070574","GO:0061092","GO:0071577","GO:1903243","GO:1900082","GO:1990938","GO:0002028","GO:0010248","GO:0030026","GO:0030007","GO:0021650","GO:0033292","GO:1905122","GO:0045299","GO:0097623","GO:0031448","GO:0036376","GO:0045822","GO:0006754","GO:1903233","GO:0032470","GO:0099132","GO:0070588"]},{"accession":"XP_042229432.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_042233762.1","go_terms":["GO:0035249","GO:0048899","GO:0007616","GO:0050806","GO:0071805","GO:0018964","GO:0043278","GO:0050907","GO:0060134","GO:0021707","GO:0001661","GO:0008542","GO:0008355","GO:0072375","GO:0031630","GO:0042331","GO:0051930","GO:0048169","GO:0007476","GO:0001964","GO:0035235","GO:0035725","GO:0071311","GO:0060992","GO:0065009","GO:0050975","GO:0035176","GO:0006816","GO:0045471","GO:0048172","GO:0060079","GO:0010226","GO:0001919","GO:0021586","GO:1900273","GO:0031623","GO:0010157","GO:0060292","GO:0043056","GO:0001975","GO:0048915","GO:0051967","GO:0001967","GO:0043113"]},{"accession":"XP_042241829.1","go_terms":["GO:0006694"]},{"accession":"XP_042205919.1","go_terms":["GO:0007494","GO:0044344","GO:0001889","GO:0042594","GO:0045984","GO:0000105","GO:0014075","GO:0043200","GO:0032094","GO:0071377","GO:0006207","GO:0000162","GO:0006541","GO:0006526","GO:0071548","GO:0006177","GO:0070365","GO:0008153","GO:0055081","GO:0044210","GO:1903718","GO:0071320","GO:0071400","GO:0044205","GO:0070409","GO:0060416","GO:0019240","GO:0046900","GO:0045471","GO:0006508","GO:0010043","GO:0032868"]},{"accession":"XP_042213337.1","go_terms":["GO:0006478","GO:0030206","GO:0030205","GO:0006044","GO:0018146","GO:0006711","GO:0006477","GO:0006805","GO:0042403","GO:0000103","GO:0002002","GO:0045600","GO:0030210","GO:0048702","GO:0006584","GO:0050427","GO:0030573","GO:0009812","GO:0015012","GO:0015015","GO:0006068"]},{"accession":"XP_042218063.1","go_terms":["GO:0051292","GO:1903896","GO:1902408","GO:1903371","GO:0071786","GO:0071790","GO:1903899"]},{"accession":"XP_042218064.1","go_terms":["GO:0051292","GO:1903896","GO:1902408","GO:1903371","GO:0071786","GO:0071790","GO:1903899"]},{"accession":"XP_042219102.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_042219103.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_042243391.1","go_terms":["GO:1905847","GO:0051610","GO:1903346","GO:0060012","GO:0042066","GO:0061537","GO:0051583","GO:0015734","GO:0015820","GO:0042420","GO:0015824","GO:0036233","GO:0014064","GO:0060092","GO:0021984","GO:0021794"]},{"accession":"XP_042231187.1","go_terms":["GO:0001576","GO:0036210","GO:0051999"]},{"accession":"XP_042220408.1","go_terms":["GO:0042552","GO:0006682"]},{"accession":"XP_042227877.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_042230801.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_042233954.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_042239974.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_042203339.1","go_terms":["GO:0000187","GO:0006457","GO:0040014","GO:0048868","GO:1902235","GO:0000042","GO:0009792","GO:0007313","GO:0008063","GO:0045454","GO:0009306","GO:0050709","GO:0016485"]}],"graph":[["XP_042228936.1","XP_042222345.1",0.575],["XP_042228936.1","XP_042229432.1",0.703],["XP_042228936.1","XP_042235544.1",0.856],["XP_042218064.1","XP_042222345.1",0.796],["XP_042241829.1","XP_042220408.1",0.715],["XP_042241829.1","XP_042233762.1",0.598],["XP_042213337.1","XP_042222345.1",0.835],["XP_042235544.1","XP_042222345.1",0.9],["XP_042235544.1","XP_042229432.1",0.851],["XP_042229432.1","XP_042222345.1",0.957],["XP_042239903.1","XP_042222345.1",0.584],["XP_042231187.1","XP_042222345.1",0.812],["XP_042230801.1","XP_042222345.1",0.547],["XP_042239974.1","XP_042222345.1",0.823],["XP_042220408.1","XP_042222345.1",0.635],["XP_042227877.1","XP_042222345.1",0.726],["XP_042222345.1","XP_042232547.1",0.753],["XP_042222345.1","XP_042233762.1",0.662],["XP_042222345.1","XP_042233954.1",0.8],["XP_042222345.1","XP_042239189.1",0.663],["XP_042222345.1","XP_042243391.1",0.629],["XP_042222345.1","XP_042203339.1",0.785],["XP_042222345.1","XP_042205919.1",0.65],["XP_042222345.1","XP_042218063.1",0.603],["XP_042222345.1","XP_042219102.1",0.838],["XP_042222345.1","XP_042219103.1",0.831]],"all_go_terms":{"GO:0071404":1,"GO:0045540":1,"GO:0032933":1,"GO:0071383":1,"GO:0009957":1,"GO:0043616":1,"GO:0071397":1,"GO:0010875":1,"GO:0043407":1,"GO:0010157":2,"GO:0060644":1,"GO:0035103":1,"GO:0045138":1,"GO:0018996":1,"GO:0006695":1,"GO:0045606":1,"GO:0042633":1,"GO:0007280":1,"GO:0001709":1,"GO:0042632":1,"GO:0061005":1,"GO:0060831":1,"GO:0008299":1,"GO:0040015":1,"GO:0007225":1,"GO:0001746":1,"GO:2000189":1,"GO:0030299":1,"GO:0060539":1,"GO:0033344":1,"GO:0072203":1,"GO:0006665":1,"GO:0045879":1,"GO:0021794":2,"GO:0060603":1,"GO:0060037":1,"GO:0008203":1,"GO:0021522":1,"GO:0015936":1,"GO:0008542":2,"GO:0061053":1,"GO:0021997":1,"GO:0035493":1,"GO:0006903":1,"GO:0006891":1,"GO:0043134":1,"GO:0090161":1,"GO:0060291":1,"GO:0042147":1,"GO:0043308":1,"GO:0043320":1,"GO:0016079":1,"GO:1990668":1,"GO:0048280":1,"GO:0098967":1,"GO:1902259":1,"GO:0006890":1,"GO:0016240":1,"GO:0001921":1,"GO:0034197":1,"GO:1903595":1,"GO:0043001":1,"GO:1900483":1,"GO:0006888":1,"GO:0032869":1,"GO:0050775":1,"GO:0015031":1,"GO:0042144":1,"GO:0043312":1,"GO:0070254":1,"GO:0090316":1,"GO:0006310":3,"GO:0006278":3,"GO:0006260":3,"GO:0075732":3,"GO:0075713":3,"GO:0015074":3,"GO:0039651":3,"GO:1903704":3,"GO:0046718":3,"GO:0046392":1,"GO:0044781":1,"GO:0016051":1,"GO:1904173":1,"GO:0042635":1,"GO:0046326":1,"GO:0030422":1,"GO:0022616":1,"GO:0060729":1,"GO:0010073":1,"GO:0051000":1,"GO:1904754":1,"GO:0071456":1,"GO:2000773":1,"GO:0043249":1,"GO:0090399":1,"GO:0030177":1,"GO:0007571":1,"GO:0007004":1,"GO:0070200":1,"GO:0010449":1,"GO:2001240":1,"GO:0032092":1,"GO:2000648":1,"GO:1903620":1,"GO:1902895":1,"GO:1904751":1,"GO:0006754":1,"GO:0099132":1,"GO:1990573":1,"GO:0098736":1,"GO:1903233":1,"GO:0032470":1,"GO:0033292":1,"GO:0097623":1,"GO:0045299":1,"GO:0036376":1,"GO:0071577":1,"GO:0060003":1,"GO:0070574":1,"GO:1901205":1,"GO:0010248":1,"GO:0070588":1,"GO:0002028":1,"GO:0045822":1,"GO:0006883":1,"GO:0031448":1,"GO:0000749":1,"GO:0030026":1,"GO:0010107":1,"GO:1903515":1,"GO:1990938":1,"GO:1903416":1,"GO:0015991":1,"GO:0021650":1,"GO:1903243":1,"GO:1900082":1,"GO:1905122":1,"GO:0051208":1,"GO:0061092":1,"GO:0030007":1,"GO:0061454":1,"GO:0086009":1,"GO:1903249":1,"GO:0035176":1,"GO:0035725":1,"GO:0043056":1,"GO:0048899":1,"GO:0060992":1,"GO:0071805":1,"GO:0006816":1,"GO:0035235":1,"GO:0008355":1,"GO:1900273":1,"GO:0018964":1,"GO:0043278":1,"GO:0051967":1,"GO:0031623":1,"GO:0065009":1,"GO:0051930":1,"GO:0021707":1,"GO:0001661":1,"GO:0072375":1,"GO:0050975":1,"GO:0060079":1,"GO:0001964":1,"GO:0060292":1,"GO:0042331":1,"GO:0071311":1,"GO:0001975":1,"GO:0010226":1,"GO:0001967":1,"GO:0048172":1,"GO:0045471":2,"GO:0048915":1,"GO:0050907":1,"GO:0050806":1,"GO:0043113":1,"GO:0035249":1,"GO:0007616":1,"GO:0031630":1,"GO:0001919":1,"GO:0021586":1,"GO:0048169":1,"GO:0007476":1,"GO:0060134":1,"GO:0006694":1,"GO:0000162":1,"GO:0071320":1,"GO:0055081":1,"GO:0006541":1,"GO:0046900":1,"GO:0019240":1,"GO:0008153":1,"GO:0043200":1,"GO:0044210":1,"GO:0006207":1,"GO:0044205":1,"GO:0071377":1,"GO:0044344":1,"GO:0045984":1,"GO:0042594":1,"GO:0071400":1,"GO:1903718":1,"GO:0006508":1,"GO:0001889":1,"GO:0010043":1,"GO:0060416":1,"GO:0007494":1,"GO:0070365":1,"GO:0032094":1,"GO:0000105":1,"GO:0071548":1,"GO:0006177":1,"GO:0014075":1,"GO:0070409":1,"GO:0006526":1,"GO:0032868":1,"GO:0006478":1,"GO:0015012":1,"GO:0002002":1,"GO:0030210":1,"GO:0018146":1,"GO:0045600":1,"GO:0000103":1,"GO:0006068":1,"GO:0006477":1,"GO:0030206":1,"GO:0006044":1,"GO:0009812":1,"GO:0030205":1,"GO:0050427":1,"GO:0006805":1,"GO:0006711":1,"GO:0042403":1,"GO:0048702":1,"GO:0006584":1,"GO:0015015":1,"GO:0030573":1,"GO:1902408":2,"GO:1903896":2,"GO:0051292":2,"GO:0071790":2,"GO:1903899":2,"GO:0071786":2,"GO:1903371":2,"GO:0042066":1,"GO:1905847":1,"GO:0015824":1,"GO:0036233":1,"GO:0014064":1,"GO:0060012":1,"GO:0060092":1,"GO:0051610":1,"GO:0021984":1,"GO:1903346":1,"GO:0015734":1,"GO:0015820":1,"GO:0042420":1,"GO:0051583":1,"GO:0061537":1,"GO:0051999":1,"GO:0036210":1,"GO:0001576":1,"GO:0006682":1,"GO:0042552":1,"GO:0050709":1,"GO:0000042":1,"GO:0009792":1,"GO:1902235":1,"GO:0009306":1,"GO:0048868":1,"GO:0045454":1,"GO:0008063":1,"GO:0007313":1,"GO:0040014":1,"GO:0016485":1,"GO:0000187":1,"GO:0006457":1},"recipe_readded":[]}