{"hash":"2106714455025439023","title":"Nuclear transcription regulation and redox control","description":"The top GO terms cluster around negative regulation of RNA polymerase II transcription, regulation of DNA binding, and nuclear transport processes, pointing to a core function of controlling transcriptional activity in the nucleus. Redox-related terms (cell redox homeostasis, deglutathionylation) suggest redox modulation of these nuclear processes, with a few outlier terms (like prolyl hydroxylation) that may reflect broader protein modification roles. Overall, the theme centers on nuclear transcriptional regulation with redox influence.","confidence":"Medium","size":21,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_041059023.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041059021.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041032609.1","go_terms":["GO:1905765","GO:0000012","GO:0021766","GO:0061819","GO:0002124"]},{"accession":"XP_041038526.1","go_terms":["GO:0031954","GO:1901998","GO:0043328","GO:0016192","GO:2000274","GO:0006622","GO:1903551","GO:0031321","GO:1903543","GO:0045053","GO:0045743","GO:0045752","GO:1904669"]},{"accession":"XP_041035020.1","go_terms":["GO:0034553","GO:0006120"]},{"accession":"XP_041043316.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041040937.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041038361.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041047685.1","go_terms":["GO:0042273","GO:0042274"]},{"accession":"XP_041062884.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041050058.1","go_terms":["GO:0033158","GO:0043388","GO:0045454","GO:0000122","GO:0098869","GO:1903206","GO:0006662","GO:0080058","GO:0034599","GO:0018401","GO:0055114","GO:0046826","GO:0006351","GO:0016032","GO:1903026","GO:0034976","GO:0034975","GO:0030091","GO:0006879","GO:0045041","GO:0016242"]},{"accession":"XP_041050059.1","go_terms":["GO:0033158","GO:0043388","GO:0045454","GO:0000122","GO:0098869","GO:1903206","GO:0006662","GO:0080058","GO:0034599","GO:0018401","GO:0055114","GO:0046826","GO:0006351","GO:0016032","GO:1903026","GO:0034976","GO:0034975","GO:0030091","GO:0006879","GO:0045041","GO:0016242"]},{"accession":"XP_041052636.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041058072.1","go_terms":["GO:1904527","GO:0031116","GO:0030308","GO:0071409","GO:0001578","GO:0060236","GO:0070672","GO:0007080","GO:0045737"]},{"accession":"XP_041063811.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041034686.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041035218.1","go_terms":["GO:0007519","GO:0036268","GO:0072156","GO:0042748","GO:1900242","GO:0042787","GO:0035853","GO:0035914","GO:0031397","GO:2000312","GO:0050853","GO:0048741","GO:0045214","GO:0002467","GO:0007399","GO:1990390","GO:0070294","GO:0060693","GO:2001200","GO:0043380","GO:1900477","GO:0042092","GO:0009638","GO:0045496","GO:2000176","GO:0048294","GO:0032764","GO:0009958","GO:1904431","GO:0045497"]},{"accession":"XP_041050373.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041049493.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_041054314.1","go_terms":["GO:1903351","GO:0035751","GO:0016336","GO:0071169","GO:0034130","GO:1903125","GO:0045842","GO:2000172","GO:1904887","GO:0070340","GO:1902499","GO:0060161","GO:0051014","GO:1905289","GO:0014041","GO:0022028","GO:0035564","GO:0002755","GO:0071287","GO:0090394","GO:1903215","GO:1905279"]},{"accession":"XP_041032856.1","go_terms":[]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0000012":1,"GO:0061819":1,"GO:0021766":1,"GO:1905765":1,"GO:0002124":1,"GO:2000274":1,"GO:1903551":1,"GO:1901998":1,"GO:0006622":1,"GO:0045053":1,"GO:1904669":1,"GO:0045752":1,"GO:0043328":1,"GO:0045743":1,"GO:0031954":1,"GO:1903543":1,"GO:0016192":1,"GO:0031321":1,"GO:0006120":1,"GO:0034553":1,"GO:0042273":1,"GO:0042274":1,"GO:0016242":2,"GO:0043388":2,"GO:0018401":2,"GO:0033158":2,"GO:0046826":2,"GO:1903026":2,"GO:0045454":2,"GO:0080058":2,"GO:0055114":2,"GO:0000122":2,"GO:0006351":2,"GO:0045041":2,"GO:0016032":2,"GO:0006662":2,"GO:0034975":2,"GO:0006879":2,"GO:0098869":2,"GO:1903206":2,"GO:0034976":2,"GO:0030091":2,"GO:0034599":2,"GO:1904527":1,"GO:0060236":1,"GO:0031116":1,"GO:0007080":1,"GO:0070672":1,"GO:0071409":1,"GO:0030308":1,"GO:0045737":1,"GO:0001578":1,"GO:0007519":1,"GO:0072156":1,"GO:0045497":1,"GO:0032764":1,"GO:0042748":1,"GO:2001200":1,"GO:0009638":1,"GO:0042787":1,"GO:0045214":1,"GO:0048741":1,"GO:1900477":1,"GO:0042092":1,"GO:2000312":1,"GO:0035914":1,"GO:0050853":1,"GO:2000176":1,"GO:1990390":1,"GO:0070294":1,"GO:0048294":1,"GO:0060693":1,"GO:0035853":1,"GO:0009958":1,"GO:0036268":1,"GO:0045496":1,"GO:1900242":1,"GO:0007399":1,"GO:1904431":1,"GO:0031397":1,"GO:0002467":1,"GO:0043380":1,"GO:0016336":1,"GO:0071287":1,"GO:0045842":1,"GO:1905289":1,"GO:0090394":1,"GO:0060161":1,"GO:1905279":1,"GO:0070340":1,"GO:1904887":1,"GO:0014041":1,"GO:1903125":1,"GO:0022028":1,"GO:1902499":1,"GO:0051014":1,"GO:0035751":1,"GO:1903351":1,"GO:0034130":1,"GO:0002755":1,"GO:2000172":1,"GO:0035564":1,"GO:0071169":1,"GO:1903215":1},"recipe_readded":["XP_041038173.1","XP_041038172.1","XP_041037782.1","XP_041038230.1","XP_041037771.1","XP_041037786.1","XP_041033723.1","XP_041058588.1","XP_041036603.1","XP_041050833.1","XP_041048575.1","XP_041047159.1","XP_041044038.1","XP_041067510.1","XP_041054915.1","XP_041047042.1","XP_041064691.1","XP_041063359.1"]}