{"hash":"215277560628633999","title":"Ubiquitin-Driven Signaling and Chromatin Regulation","description":"This cluster centers on regulatory processes involving ubiquitin signaling and chromatin modification: protein ubiquitination, histone modifications (H4-K20 methylation, H4-K16 acetylation), and signaling pathway regulation (I-kappaB phosphorylation/NF-kB, JNK cascade) along with cell cycle control. Although several GO terms are obsolete, the core pattern points to regulation of gene expression through ubiquitin-mediated signaling and chromatin remodeling.","confidence":"Medium","size":3,"edges":2,"triangles":0,"max_degree":2,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_040503428.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XP_015138089.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:1902187","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0070534","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0032436","GO:0048752","GO:0033081","GO:0048066","GO:0021766","GO:0090243","GO:0043507","GO:0007417","GO:0090103","GO:0045602","GO:0010464","GO:0021957","GO:0061373","GO:0097324","GO:1903056","GO:0060030","GO:0048668","GO:0021540","GO:0032480","GO:0010792","GO:0001755","GO:0001756","GO:0051216","GO:0050772","GO:0051150","GO:0021846","GO:1902748","GO:0048596","GO:0045636"]},{"accession":"XP_015138091.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:1902187","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0070534","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]}],"graph":[["XP_015138089.1","XP_015138091.1",0.5],["XP_040503428.1","XP_015138091.1",0.517]],"all_go_terms":{"GO:0033151":3,"GO:0046328":3,"GO:0070512":3,"GO:1900095":3,"GO:0009048":3,"GO:0071157":3,"GO:2000620":3,"GO:0016567":3,"GO:0030433":3,"GO:1903721":3,"GO:0051865":3,"GO:0007250":3,"GO:0070936":3,"GO:0000122":3,"GO:0002250":3,"GO:0000209":3,"GO:0034121":3,"GO:1903265":3,"GO:0060816":3,"GO:0042981":3,"GO:0090073":3,"GO:0043066":3,"GO:1901253":3,"GO:0042787":3,"GO:0085020":3,"GO:0036205":3,"GO:0070535":3,"GO:1903762":3,"GO:0046621":3,"GO:0038018":3,"GO:0060544":3,"GO:0016558":3,"GO:0039536":3,"GO:0033209":3,"GO:0090103":1,"GO:0070534":2,"GO:0033081":1,"GO:0045636":1,"GO:1903886":2,"GO:0021766":1,"GO:0060546":2,"GO:0046597":2,"GO:0051216":1,"GO:0043029":2,"GO:0043123":2,"GO:0046007":2,"GO:0031664":2,"GO:0090243":1,"GO:0009896":2,"GO:0051092":2,"GO:0048066":1,"GO:0001782":2,"GO:0000185":2,"GO:0010792":1,"GO:0060030":1,"GO:0045623":2,"GO:0048536":2,"GO:0045602":1,"GO:0007417":1,"GO:0097324":1,"GO:0048752":1,"GO:0002635":2,"GO:0021540":1,"GO:1902187":2,"GO:0001756":1,"GO:0051607":2,"GO:0045087":2,"GO:0032480":1,"GO:0032897":2,"GO:0021957":1,"GO:1902748":1,"GO:0001755":1,"GO:0035372":2,"GO:0050999":2,"GO:0097039":2,"GO:0061470":2,"GO:1903883":2,"GO:0048490":2,"GO:0043507":1,"GO:0048596":1,"GO:0061158":2,"GO:0048535":2,"GO:0048668":1,"GO:0032436":1,"GO:0033280":2,"GO:0021846":1,"GO:0007014":2,"GO:0042098":2,"GO:0006914":2,"GO:0010464":1,"GO:0051150":1,"GO:1901224":2,"GO:0007026":2,"GO:0050772":1,"GO:1903056":1,"GO:0061373":1},"recipe_readded":[]}