{"hash":"1265379872828886217","title":"Nuclear gene expression and ribosome biogenesis","description":"This cluster centers on nucleosome assembly, transcription regulation by RNA polymerase II, and ribosome biogenesis, pointing to nuclear processes that govern gene expression and protein synthesis. Some terms such as sporulation and cytokine response appear as outliers or broader annotations, but the dominant signal suggests coordination of chromatin organization and ribosome production. ","confidence":"Medium","size":20,"edges":3,"triangles":0,"max_degree":3,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_029180274.1","go_terms":["GO:0061481","GO:0042274","GO:1905053","GO:0042254","GO:0000056","GO:0006412","GO:0006407","GO:0044830","GO:0048024","GO:0022013","GO:0070935","GO:0097222","GO:0006402","GO:0098908","GO:2000627","GO:0016120","GO:0033129","GO:0043577","GO:1902416","GO:0090503","GO:0010610","GO:1901254","GO:0010323","GO:0000398","GO:2000637","GO:0010738","GO:0045716","GO:0010586","GO:0071345","GO:2000628","GO:0061014","GO:0045019","GO:0061158","GO:0048025"]},{"accession":"XP_029206725.1","go_terms":["GO:0017183","GO:0007117","GO:0002098"]},{"accession":"XP_044173048.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029200549.2","go_terms":["GO:0007065","GO:0007059","GO:0001808","GO:0051257"]},{"accession":"XP_029204844.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_044172626.1","go_terms":["GO:0005975","GO:0030209"]},{"accession":"XP_044169520.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029179378.2","go_terms":["GO:0016126","GO:0032435","GO:0048633","GO:0032288","GO:0046716","GO:1902902","GO:0035038","GO:0098755","GO:0035335","GO:0043087","GO:0071442","GO:0007343","GO:0051262","GO:0046856","GO:0046855","GO:0048666","GO:0035039","GO:0071391","GO:0030259","GO:0045815","GO:0045109","GO:0031642","GO:0002233","GO:0032120"]},{"accession":"XP_044184751.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029199516.2","go_terms":["GO:0090305","GO:0006313"]},{"accession":"XP_029212582.2","go_terms":["GO:0016584","GO:0070828","GO:0006334","GO:0071169","GO:0098532","GO:0097298","GO:0080182"]},{"accession":"XP_029182574.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_029213377.1","go_terms":["GO:0035774","GO:0031036","GO:0042554","GO:0007616","GO:0007614","GO:0051281","GO:0098735","GO:0010842","GO:0072286","GO:0060048","GO:0086004","GO:0072221","GO:0072205","GO:1901841","GO:1901844","GO:0055003","GO:0019749","GO:0099509","GO:0035502","GO:0006816","GO:0060315","GO:0051764","GO:0042994","GO:0000272","GO:0010459","GO:1900271","GO:0035191","GO:0042694","GO:1901077","GO:2000678","GO:0006470","GO:0036444","GO:0022011","GO:0021762","GO:1902527","GO:0014032","GO:0036324","GO:0014883","GO:0002027","GO:1903244","GO:1905205","GO:0051091","GO:0060316","GO:0035562","GO:0055117","GO:0050774","GO:0000754","GO:0014029","GO:0005513","GO:0045944","GO:0097274","GO:0010880","GO:0033234","GO:0032516","GO:1903799","GO:0070315","GO:0035690","GO:2001015","GO:0001525","GO:0051343","GO:0008218","GO:0001569","GO:0051561","GO:0032465","GO:0014718","GO:0099566","GO:0006919","GO:0048741","GO:0033555","GO:0071277","GO:0014044","GO:0060079","GO:0060487","GO:0007507","GO:0006491","GO:0030948","GO:0051531","GO:0051533","GO:0033173","GO:0014898","GO:0008365","GO:0048143","GO:0043950","GO:0042403","GO:0060040","GO:0051562","GO:0090281","GO:0007602","GO:0055010","GO:0043123","GO:0008284","GO:0032972","GO:0007601","GO:0006607","GO:0051591","GO:0051597","GO:0007409","GO:0007613","GO:0060291","GO:0070588","GO:0031284","GO:0051384","GO:0016237","GO:0051028","GO:0048168","GO:0030437","GO:0000278","GO:0050665","GO:0000742","GO:0045921","GO:0043065","GO:0046549","GO:0071456","GO:1901387","GO:0045917","GO:0006469","GO:0007020","GO:0008016","GO:0048708","GO:0008594","GO:1903525","GO:0042144","GO:0007269","GO:0048015","GO:0007114","GO:0048855","GO:1903087","GO:0001837","GO:0008360","GO:0032120","GO:0010515","GO:0006479","GO:0000086","GO:0038163","GO:0010801","GO:0051412","GO:1902896","GO:2000256","GO:0010800","GO:0007205","GO:0043647","GO:0010881","GO:0031954","GO:0043388","GO:0071902","GO:0043547","GO:1903479","GO:0007223","GO:0038095","GO:0045163","GO:0001975","GO:0005980","GO:0007190","GO:2000300","GO:0051000","GO:0070886","GO:0016061","GO:0071574","GO:1901339","GO:0022400","GO:0050906","GO:0002086","GO:0002576","GO:0009738","GO:1900242","GO:0006468","GO:0090151","GO:0086029","GO:0043931","GO:1901896","GO:0097050","GO:0007275","GO:0003220","GO:0003151","GO:0003073","GO:0098907","GO:0001824","GO:0071313","GO:0098904","GO:0043129","GO:0097264","GO:2001246","GO:0043588","GO:0007586","GO:0014808","GO:0036368","GO:0060056","GO:1901379","GO:0071872","GO:0007520","GO:0036151","GO:0016540","GO:0098910","GO:0014850","GO:0060438","GO:0043473","GO:0007504","GO:0010595","GO:0033591","GO:0010811","GO:0060173","GO:0030916","GO:0070278","GO:0060348","GO:0035592","GO:0030198","GO:0007165","GO:0019800","GO:0016525","GO:0001937"]},{"accession":"XP_044166825.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029180373.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_029204925.2","go_terms":["GO:0007124","GO:0015843","GO:0019740","GO:0001403","GO:0072488","GO:0060586","GO:0006808","GO:0070634","GO:0080181","GO:0015670"]},{"accession":"XP_044163939.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_044167201.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_029184452.2","go_terms":["GO:1902947","GO:0060309","GO:0002542","GO:0031017","GO:0007596","GO:0048771","GO:0055123","GO:0035264","GO:0032496","GO:0006958","GO:0044130","GO:0003050","GO:0045079","GO:0000122","GO:0050720","GO:0031639","GO:0045766","GO:0016055","GO:0001867","GO:0071333","GO:0001878","GO:0070684","GO:0022617","GO:0044537","GO:1900738","GO:0051919","GO:0042127","GO:0032078","GO:0014909","GO:2000097","GO:0097186","GO:0007586","GO:0010756","GO:0070946","GO:0050832","GO:0006953","GO:0050830","GO:0014068","GO:0061113","GO:0031214","GO:0050754","GO:0002523","GO:0009791","GO:0042730","GO:0070947","GO:0045415","GO:0030574","GO:0045944","GO:0030901","GO:1903238","GO:0045752","GO:1903142","GO:0030194"]},{"accession":"XP_044177957.1","go_terms":["GO:0010204","GO:0072422","GO:0071352","GO:0000350","GO:0009870","GO:1904568","GO:1990646","GO:0035390","GO:0043044","GO:0000183","GO:0035066","GO:1903770","GO:1901347","GO:1901348","GO:0061820","GO:1904792","GO:0010338","GO:0009737","GO:0009736","GO:0009753","GO:1904911","GO:0009739","GO:0080113","GO:0010082","GO:1901430","GO:0070933","GO:1904850","GO:1905839","GO:0010520","GO:0031848","GO:1905615","GO:1900386","GO:1905778","GO:0009301","GO:0035522","GO:0009751","GO:0072362","GO:0031627","GO:0006970","GO:0006334","GO:1903086","GO:1900056","GO:1900033","GO:0009723","GO:0016032","GO:0030154","GO:0010380","GO:1990414","GO:0071919"]}],"graph":[["XP_029206725.1","XP_029180274.1",0.608],["XP_029180274.1","XP_029179378.2",0.835],["XP_029180274.1","XP_029204844.2",0.73]],"all_go_terms":{"GO:0042254":1,"GO:0006407":1,"GO:0071345":1,"GO:2000627":1,"GO:0061481":1,"GO:0010323":1,"GO:0022013":1,"GO:0010610":1,"GO:0044830":1,"GO:0061158":1,"GO:1902416":1,"GO:0061014":1,"GO:0000056":1,"GO:1905053":1,"GO:0006412":1,"GO:0045716":1,"GO:0048024":1,"GO:0090503":1,"GO:0070935":1,"GO:0042274":1,"GO:0098908":1,"GO:2000628":1,"GO:0010586":1,"GO:1901254":1,"GO:0016120":1,"GO:0048025":1,"GO:0043577":1,"GO:0000398":1,"GO:2000637":1,"GO:0010738":1,"GO:0006402":1,"GO:0045019":1,"GO:0033129":1,"GO:0097222":1,"GO:0007117":1,"GO:0017183":1,"GO:0002098":1,"GO:0051257":1,"GO:0007059":1,"GO:0001808":1,"GO:0007065":1,"GO:0005975":1,"GO:0030209":1,"GO:0016126":1,"GO:0035335":1,"GO:0071442":1,"GO:0048633":1,"GO:0032288":1,"GO:0035039":1,"GO:0046855":1,"GO:0098755":1,"GO:0045815":1,"GO:0031642":1,"GO:0045109":1,"GO:0007343":1,"GO:0002233":1,"GO:0043087":1,"GO:0046856":1,"GO:0032120":2,"GO:1902902":1,"GO:0035038":1,"GO:0046716":1,"GO:0032435":1,"GO:0048666":1,"GO:0071391":1,"GO:0051262":1,"GO:0030259":1,"GO:0090305":1,"GO:0006313":1,"GO:0098532":1,"GO:0006334":2,"GO:0016584":1,"GO:0071169":1,"GO:0080182":1,"GO:0097298":1,"GO:0070828":1,"GO:0043950":1,"GO:0010459":1,"GO:0072205":1,"GO:0010811":1,"GO:0071872":1,"GO:0019800":1,"GO:0060291":1,"GO:0060316":1,"GO:0000742":1,"GO:0031036":1,"GO:0008365":1,"GO:0006816":1,"GO:0042694":1,"GO:0036444":1,"GO:0048741":1,"GO:0060079":1,"GO:0043473":1,"GO:2001246":1,"GO:0032465":1,"GO:1901841":1,"GO:0007275":1,"GO:0046549":1,"GO:0030437":1,"GO:0035690":1,"GO:0098904":1,"GO:0006919":1,"GO:0007020":1,"GO:0008594":1,"GO:0042403":1,"GO:0038095":1,"GO:0035592":1,"GO:0086029":1,"GO:0007586":2,"GO:0070588":1,"GO:0032516":1,"GO:0014898":1,"GO:0007409":1,"GO:0050665":1,"GO:0070278":1,"GO:0060438":1,"GO:0032972":1,"GO:1900242":1,"GO:0003151":1,"GO:0098907":1,"GO:0060056":1,"GO:0055010":1,"GO:0007114":1,"GO:0033234":1,"GO:0060315":1,"GO:0051000":1,"GO:1901387":1,"GO:0043065":1,"GO:0060048":1,"GO:0006469":1,"GO:0030948":1,"GO:0031954":1,"GO:0060487":1,"GO:0003073":1,"GO:0098735":1,"GO:2000678":1,"GO:0014044":1,"GO:0022011":1,"GO:0050774":1,"GO:0007269":1,"GO:1901379":1,"GO:0030198":1,"GO:0099566":1,"GO:0014032":1,"GO:0008284":1,"GO:1905205":1,"GO:0008360":1,"GO:0033591":1,"GO:0060173":1,"GO:0060348":1,"GO:0070315":1,"GO:0050906":1,"GO:0045944":2,"GO:0051561":1,"GO:0045163":1,"GO:0007602":1,"GO:0070886":1,"GO:0000086":1,"GO:0009738":1,"GO:0097050":1,"GO:0051531":1,"GO:0036151":1,"GO:0001525":1,"GO:0006607":1,"GO:0071456":1,"GO:0000754":1,"GO:0035562":1,"GO:0006468":1,"GO:0007616":1,"GO:0033173":1,"GO:0035502":1,"GO:2000300":1,"GO:0007507":1,"GO:0071574":1,"GO:0090151":1,"GO:1903525":1,"GO:0071902":1,"GO:0014850":1,"GO:0003220":1,"GO:0007504":1,"GO:0051091":1,"GO:0097274":1,"GO:2000256":1,"GO:0060040":1,"GO:1901896":1,"GO:0008016":1,"GO:0048708":1,"GO:0006479":1,"GO:0010842":1,"GO:0043931":1,"GO:0071313":1,"GO:0043129":1,"GO:0007614":1,"GO:0086004":1,"GO:0097264":1,"GO:0016540":1,"GO:0098910":1,"GO:0001569":1,"GO:0007190":1,"GO:0030916":1,"GO:0038163":1,"GO:0051028":1,"GO:1902527":1,"GO:0002027":1,"GO:0036324":1,"GO:0000272":1,"GO:0010880":1,"GO:0007520":1,"GO:0016061":1,"GO:0043588":1,"GO:0010595":1,"GO:0090281":1,"GO:0005980":1,"GO:1903087":1,"GO:0042994":1,"GO:0014883":1,"GO:0006470":1,"GO:0051343":1,"GO:0021762":1,"GO:0007205":1,"GO:0002576":1,"GO:0031284":1,"GO:0010515":1,"GO:1901077":1,"GO:0043123":1,"GO:0007223":1,"GO:0007613":1,"GO:0051533":1,"GO:0048015":1,"GO:0033555":1,"GO:0051764":1,"GO:0014029":1,"GO:0035774":1,"GO:0035191":1,"GO:0048143":1,"GO:0036368":1,"GO:0051384":1,"GO:0043647":1,"GO:0014808":1,"GO:1903799":1,"GO:0045921":1,"GO:0042554":1,"GO:0043547":1,"GO:0051591":1,"GO:0051281":1,"GO:0019749":1,"GO:0055117":1,"GO:0072221":1,"GO:0008218":1,"GO:0010881":1,"GO:0007601":1,"GO:0001824":1,"GO:0045917":1,"GO:0010801":1,"GO:0007165":1,"GO:0099509":1,"GO:0048855":1,"GO:0072286":1,"GO:0005513":1,"GO:1900271":1,"GO:1903479":1,"GO:0006491":1,"GO:0001937":1,"GO:0016525":1,"GO:0048168":1,"GO:2001015":1,"GO:0055003":1,"GO:0001837":1,"GO:0001975":1,"GO:0010800":1,"GO:0002086":1,"GO:0022400":1,"GO:0043388":1,"GO:1902896":1,"GO:0051597":1,"GO:0051412":1,"GO:1901339":1,"GO:0014718":1,"GO:1901844":1,"GO:0000278":1,"GO:0071277":1,"GO:0051562":1,"GO:1903244":1,"GO:0042144":1,"GO:0016237":1,"GO:0015670":1,"GO:0072488":1,"GO:0080181":1,"GO:0006808":1,"GO:0019740":1,"GO:0001403":1,"GO:0007124":1,"GO:0015843":1,"GO:0070634":1,"GO:0060586":1,"GO:0045079":1,"GO:0030901":1,"GO:0097186":1,"GO:1903142":1,"GO:0071333":1,"GO:0030574":1,"GO:0061113":1,"GO:0050832":1,"GO:0001867":1,"GO:0055123":1,"GO:0022617":1,"GO:0044537":1,"GO:0031214":1,"GO:0045752":1,"GO:0060309":1,"GO:0070684":1,"GO:0035264":1,"GO:0002523":1,"GO:1903238":1,"GO:0070946":1,"GO:0050754":1,"GO:0051919":1,"GO:0042730":1,"GO:0032078":1,"GO:0050830":1,"GO:0045766":1,"GO:0030194":1,"GO:0006958":1,"GO:0044130":1,"GO:1900738":1,"GO:0002542":1,"GO:0070947":1,"GO:0007596":1,"GO:0009791":1,"GO:0014068":1,"GO:0031017":1,"GO:0032496":1,"GO:0000122":1,"GO:0031639":1,"GO:0045415":1,"GO:1902947":1,"GO:0006953":1,"GO:0010756":1,"GO:0016055":1,"GO:0042127":1,"GO:0003050":1,"GO:0050720":1,"GO:0001878":1,"GO:0014909":1,"GO:0048771":1,"GO:2000097":1,"GO:0080113":1,"GO:0009301":1,"GO:0061820":1,"GO:1990414":1,"GO:0072422":1,"GO:0010380":1,"GO:1904911":1,"GO:1900386":1,"GO:0072362":1,"GO:1900033":1,"GO:1903086":1,"GO:1904850":1,"GO:1904568":1,"GO:0009736":1,"GO:0010520":1,"GO:0031848":1,"GO:0010338":1,"GO:0009739":1,"GO:0009753":1,"GO:1903770":1,"GO:0031627":1,"GO:0016032":1,"GO:0035390":1,"GO:1990646":1,"GO:0071352":1,"GO:1900056":1,"GO:1901347":1,"GO:0010204":1,"GO:0070933":1,"GO:1905839":1,"GO:0009723":1,"GO:1904792":1,"GO:0009870":1,"GO:1905778":1,"GO:0035066":1,"GO:0043044":1,"GO:0035522":1,"GO:0000183":1,"GO:0006970":1,"GO:0009751":1,"GO:0000350":1,"GO:1901348":1,"GO:0009737":1,"GO:1901430":1,"GO:1905615":1,"GO:0030154":1,"GO:0071919":1,"GO:0010082":1},"recipe_readded":["XP_044170661.1","XP_029182817.1","XP_029204455.2","XP_044181829.1","XP_029199526.2","XP_029185457.1","XP_029214012.2","XP_029204454.2","XP_044164608.1","XP_029185450.1","XP_044185009.1","XP_029214010.2","XP_029208356.2","XP_029210093.2","XP_044169193.1","XP_029214011.2","XP_044163182.1","XP_029213409.1","XP_029196455.2","XP_029197410.2"]}