{"hash":"878086756485580533","title":"Global Regulation of Gene Expression and Signaling","description":"This cluster centers on regulatory roles across diverse cellular processes: transcription regulation by RNA polymerase II, negative control of signaling pathways (TLR3) and gene expression, chromatin modification, deubiquitination, and regulatory aspects of autophagy and cell cycle structures. The common thread is modulation rather than direct catalytic activity, with several GO terms explicitly describing negative regulation. The variety suggests a broad regulatory theme rather than a single pathway, hence a medium level of confidence.","confidence":"Medium","size":5,"edges":10,"triangles":10,"max_degree":4,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_038429102.1","go_terms":["GO:1990592","GO:0033146"]},{"accession":"XP_038387839.1","go_terms":["GO:0006310","GO:0046718","GO:0019076","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006508","GO:0039651","GO:0039657","GO:0000423","GO:1901097","GO:0033132","GO:1902236","GO:1901340","GO:1903265","GO:0021888","GO:0014070","GO:0010216","GO:0045648","GO:0002109","GO:0006357","GO:0035973","GO:1901799","GO:1902283","GO:0016579","GO:1904378","GO:0030474","GO:0017085","GO:1903071","GO:0006289","GO:0051865","GO:0034140","GO:0030433","GO:0016925","GO:1905366","GO:0000028","GO:0010636","GO:0010637","GO:0000753","GO:0071816","GO:0070842","GO:0097237","GO:1900186","GO:1904021","GO:0006517","GO:1904049","GO:0006412"]},{"accession":"XP_038392266.1","go_terms":["GO:0006310","GO:0046718","GO:0019076","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006508","GO:0039651","GO:0039657","GO:0000423","GO:1901097","GO:0033132","GO:1902236","GO:1901340","GO:1903265","GO:0021888","GO:0014070","GO:0010216","GO:0045648","GO:0002109","GO:0006357","GO:0035973","GO:1901799","GO:1902283","GO:0016579","GO:1904378","GO:0030474","GO:0017085","GO:1903071","GO:0006289","GO:0051865","GO:0034140","GO:0030433","GO:0016925","GO:1905366","GO:0000028","GO:0010636","GO:0010637","GO:0000753","GO:0071816","GO:0070842","GO:0097237","GO:1900186","GO:1904021","GO:0006517","GO:1904049","GO:0006412"]},{"accession":"XP_038393475.1","go_terms":["GO:0032436","GO:0070911","GO:0034126","GO:0090204","GO:0010286","GO:1901896","GO:0071276","GO:0043392","GO:0060334","GO:0051572","GO:0016925","GO:0043433","GO:0035186","GO:0086004","GO:0030578","GO:1902260","GO:0045944","GO:0045759","GO:0000423","GO:1901097","GO:0033132","GO:1902236","GO:1901340","GO:1903265","GO:0021888","GO:0014070","GO:0010216","GO:0045648","GO:0002109","GO:0006357","GO:0035973","GO:1901799","GO:1902283","GO:0016579","GO:1904378","GO:0030474","GO:0017085","GO:1903071","GO:0006289","GO:0051865","GO:0034140","GO:0030433","GO:1905366","GO:0000028","GO:0010636","GO:0010637","GO:0000753","GO:0071816","GO:0070842","GO:0097237","GO:1900186","GO:1904021","GO:0006517","GO:1904049","GO:0006412"]},{"accession":"XP_038421255.1","go_terms":["GO:0000423","GO:1901097","GO:0033132","GO:1902236","GO:1901340","GO:1903265","GO:0021888","GO:0014070","GO:0010216","GO:0045648","GO:0002109","GO:0006357","GO:0035973","GO:1901799","GO:1902283","GO:0016579","GO:1904378","GO:0030474","GO:0017085","GO:1903071","GO:0006289","GO:0051865","GO:0034140","GO:0030433","GO:0016925","GO:1905366","GO:0000028","GO:0010636","GO:0010637","GO:0000753","GO:0071816","GO:0070842","GO:0097237","GO:1900186","GO:1904021","GO:0006517","GO:1904049","GO:0006412","GO:0007023","GO:0031117","GO:0034126","GO:0014889","GO:0031122","GO:0048936"]}],"graph":[["XP_038421255.1","XP_038429102.1",0.823],["XP_038421255.1","XP_038387839.1",0.959],["XP_038421255.1","XP_038392266.1",0.964],["XP_038421255.1","XP_038393475.1",0.912],["XP_038429102.1","XP_038393475.1",0.901],["XP_038429102.1","XP_038387839.1",0.718],["XP_038429102.1","XP_038392266.1",0.94],["XP_038393475.1","XP_038387839.1",0.978],["XP_038393475.1","XP_038392266.1",0.977],["XP_038387839.1","XP_038392266.1",0.879]],"all_go_terms":{"GO:0033146":1,"GO:1990592":1,"GO:0006357":4,"GO:1901097":4,"GO:0030474":4,"GO:0046718":2,"GO:0010216":4,"GO:0016579":4,"GO:0039651":2,"GO:0034140":4,"GO:0000753":4,"GO:1901340":4,"GO:0017085":4,"GO:1902283":4,"GO:0016925":4,"GO:0019076":2,"GO:1903071":4,"GO:0006289":4,"GO:0010636":4,"GO:0006310":2,"GO:1900186":4,"GO:0051865":4,"GO:0035973":4,"GO:1904378":4,"GO:0030433":4,"GO:0000028":4,"GO:0071816":4,"GO:0075732":2,"GO:0070842":4,"GO:0006508":2,"GO:0039657":2,"GO:0033132":4,"GO:0006517":4,"GO:0010637":4,"GO:1904021":4,"GO:1902236":4,"GO:0097237":4,"GO:0006412":4,"GO:0014070":4,"GO:0045648":4,"GO:1901799":4,"GO:1903265":4,"GO:0015074":2,"GO:0000423":4,"GO:1905366":4,"GO:0021888":4,"GO:1904049":4,"GO:0002109":4,"GO:0075713":2,"GO:0032436":1,"GO:0010286":1,"GO:0034126":2,"GO:0043433":1,"GO:0070911":1,"GO:0045759":1,"GO:0086004":1,"GO:1902260":1,"GO:0051572":1,"GO:0035186":1,"GO:0043392":1,"GO:1901896":1,"GO:0060334":1,"GO:0045944":1,"GO:0090204":1,"GO:0071276":1,"GO:0030578":1,"GO:0048936":1,"GO:0007023":1,"GO:0031117":1,"GO:0031122":1,"GO:0014889":1},"recipe_readded":[]}