{"hash":"1142116165916572660","title":"Linkage-specific deubiquitination regulators","description":"The top GO terms cluster around deubiquitination across multiple ubiquitin linkages (K63, K33, K29, K11) and ubiquitin-dependent protein catabolic processes, suggesting the proteins act as deubiquitinases or ubiquitin-cycle regulators. Some terms also indicate negative regulation of immune signaling (IL-1\u03b2, NOD1, TLR3) and germinal center formation, which aligns with ubiquitin-mediated modulation of immune pathways. Overall, this cluster appears to center on ubiquitin editing rather than a single signaling pathway.","confidence":"Medium","size":12,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_038434987.1","go_terms":["GO:1902042","GO:2000347","GO:2000349","GO:0071108","GO:0071947","GO:1990167","GO:0032495","GO:1990168","GO:0002385","GO:0002677","GO:0070433","GO:0035871","GO:0032691","GO:0043124","GO:0070536","GO:0032703","GO:2000352","GO:0001922","GO:0002634","GO:0034140","GO:0035523","GO:0034148","GO:0072573","GO:0044313","GO:0070429","GO:0032717","GO:0016567"]},{"accession":"XP_038383577.1","go_terms":["GO:0000055","GO:0032298","GO:0000398","GO:1903026","GO:0060707","GO:0003323","GO:0060806","GO:0035270","GO:0060972","GO:0060536","GO:0003198","GO:0007498","GO:0060021","GO:0031069","GO:0010957"]},{"accession":"XP_038441019.1","go_terms":[]},{"accession":"NP_001300704.1","go_terms":["GO:0002244"]},{"accession":"NP_001106639.2","go_terms":["GO:0043666","GO:0005977","GO:0009966","GO:0043086"]},{"accession":"XP_038414415.1","go_terms":["GO:0031116","GO:2000617","GO:0006337","GO:0006334","GO:0035041","GO:0071442","GO:0007117","GO:2000035","GO:0015031","GO:0043085"]},{"accession":"XP_038394107.1","go_terms":["GO:0000460","GO:0071039","GO:0071030","GO:0071031"]},{"accession":"XP_038430086.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_038428624.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_038443161.1","go_terms":["GO:1905663","GO:1902625","GO:0048025","GO:0048026","GO:0075522","GO:0075525","GO:0000380","GO:0016556","GO:0001825","GO:1900363","GO:0002188","GO:0000381","GO:1903586","GO:0006406","GO:0006446","GO:0060211","GO:0031047","GO:0048255","GO:0035278","GO:0001731","GO:0010610","GO:0045292","GO:1901407","GO:0097010","GO:0006376","GO:0034462","GO:0006378","GO:0003283","GO:0010378","GO:0071947","GO:1990168","GO:0003203","GO:0000122","GO:0043066","GO:1904404","GO:0046832","GO:0071600","GO:0008380","GO:0070536","GO:0006977","GO:0033132","GO:0035523","GO:1900871","GO:0045023","GO:0090526","GO:0036292","GO:0071301","GO:0016567","GO:0003181","GO:0071157","GO:0007175","GO:1904876","GO:1902570","GO:0032211","GO:0051096","GO:0000390","GO:0000494","GO:0097309","GO:1904751","GO:0006370","GO:1904744"]},{"accession":"XP_038423010.1","go_terms":["GO:0000349","GO:0000387"]},{"accession":"XP_038430084.1","go_terms":[]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0035871":1,"GO:0032691":1,"GO:0070429":1,"GO:0034140":1,"GO:0002634":1,"GO:2000349":1,"GO:0070536":2,"GO:0072573":1,"GO:2000347":1,"GO:0032495":1,"GO:0032703":1,"GO:0002677":1,"GO:1990167":1,"GO:1990168":2,"GO:0071947":2,"GO:0032717":1,"GO:0044313":1,"GO:0016567":2,"GO:0043124":1,"GO:0001922":1,"GO:2000352":1,"GO:0034148":1,"GO:0070433":1,"GO:0071108":1,"GO:0035523":2,"GO:1902042":1,"GO:0002385":1,"GO:0060536":1,"GO:0000398":1,"GO:0060972":1,"GO:0060021":1,"GO:0060806":1,"GO:0010957":1,"GO:0003198":1,"GO:0060707":1,"GO:1903026":1,"GO:0003323":1,"GO:0031069":1,"GO:0035270":1,"GO:0032298":1,"GO:0000055":1,"GO:0007498":1,"GO:0002244":1,"GO:0043666":1,"GO:0043086":1,"GO:0009966":1,"GO:0005977":1,"GO:0043085":1,"GO:0031116":1,"GO:2000035":1,"GO:0071442":1,"GO:2000617":1,"GO:0015031":1,"GO:0006337":1,"GO:0006334":1,"GO:0007117":1,"GO:0035041":1,"GO:0071031":1,"GO:0000460":1,"GO:0071039":1,"GO:0071030":1,"GO:0006977":1,"GO:0045023":1,"GO:0035278":1,"GO:0006370":1,"GO:0000122":1,"GO:1902570":1,"GO:0031047":1,"GO:0075522":1,"GO:0008380":1,"GO:0048025":1,"GO:0071157":1,"GO:0003181":1,"GO:0000381":1,"GO:0048255":1,"GO:0002188":1,"GO:0006378":1,"GO:0001731":1,"GO:0090526":1,"GO:0075525":1,"GO:1900871":1,"GO:1902625":1,"GO:0003283":1,"GO:0034462":1,"GO:0001825":1,"GO:0000494":1,"GO:0006446":1,"GO:0051096":1,"GO:0033132":1,"GO:0010610":1,"GO:1905663":1,"GO:0000380":1,"GO:1901407":1,"GO:0010378":1,"GO:1904404":1,"GO:0000390":1,"GO:0071301":1,"GO:0016556":1,"GO:0097309":1,"GO:0036292":1,"GO:1904751":1,"GO:0007175":1,"GO:0006376":1,"GO:1904744":1,"GO:0048026":1,"GO:0006406":1,"GO:0097010":1,"GO:1904876":1,"GO:0032211":1,"GO:0071600":1,"GO:0043066":1,"GO:0046832":1,"GO:1900363":1,"GO:0060211":1,"GO:0003203":1,"GO:0045292":1,"GO:1903586":1,"GO:0000387":1,"GO:0000349":1},"recipe_readded":["XP_038407190.1","XP_038439202.1","XP_038426728.1","XP_038439946.1","XP_038444740.1","XP_038410636.1","XP_038435337.1","NP_001003243.1","XP_038420070.1","XP_038383091.1","XP_038418439.1","XP_038400306.1","XP_038393812.1","XP_038397244.1","NP_001003327.1","XP_038442555.1","NP_001003288.1","XP_038393813.1","XP_038443414.1","XP_038397708.1"]}