{"hash":"498139788398825352","title":"Ubiquitin-Dependent Regulation and RNA Processing","description":"This cluster is dominated by terms related to ubiquitination and deubiquitination (ubiquitin-dependent protein catabolic process, protein ubiquitination, K48-linked deubiquitination) and includes a connection to NF-kappaB signaling, with an additional signal for mRNA processing. While there are also terms tied to differentiation and tissue-specific processes, the most frequent functional themes center on ubiquitin-mediated regulation of protein turnover and gene expression.","confidence":"Medium","size":15,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_028906740.1","go_terms":["GO:0000289","GO:0010606","GO:0006397","GO:0034729","GO:0000245","GO:0048149","GO:1990108","GO:0071108","GO:0021551","GO:0051568","GO:0001662","GO:0035871","GO:0008583","GO:1904667","GO:0010995","GO:0070537","GO:0010992","GO:1904378","GO:0060013","GO:1903070","GO:0035520","GO:0035523","GO:0008343","GO:0044313","GO:1900425","GO:1901026","GO:0035192","GO:0006355","GO:0006511","GO:0006351","GO:0035616","GO:0000244","GO:0051298","GO:0000266","GO:0060389","GO:0008277","GO:0034394","GO:0007283","GO:0031397","GO:0070536","GO:0030509","GO:0007179"]},{"accession":"XP_001513834.2","go_terms":["GO:0010205","GO:0070542","GO:0050872","GO:1903699","GO:0034435","GO:1903966","GO:0010873","GO:0046512","GO:0033561","GO:0044130","GO:0006667"]},{"accession":"XP_028914788.1","go_terms":["GO:0006633","GO:0001949","GO:0032286","GO:0035754","GO:0080064","GO:0080065","GO:0033490","GO:0006696","GO:0046485","GO:0006675"]},{"accession":"XP_007659398.1","go_terms":["GO:0030593","GO:2001190","GO:0046006","GO:0070231","GO:0048678","GO:0090305","GO:0007165","GO:0048245","GO:0045445","GO:0002724","GO:0048246","GO:0031295","GO:0007157","GO:0046598","GO:0002667","GO:0080147","GO:0010405","GO:0071333","GO:0048354","GO:0070241","GO:2001200","GO:0098586","GO:0043123","GO:0010812","GO:0034120","GO:0010977","GO:0018258","GO:0045598","GO:0002548","GO:0010493","GO:0071407","GO:0042493","GO:0050994","GO:0071677","GO:0035900","GO:0098792","GO:0006259","GO:0002317","GO:2000562"]},{"accession":"XP_028922936.1","go_terms":["GO:0090501","GO:0051017","GO:0032212","GO:0051225","GO:0006397","GO:0050960","GO:0050968","GO:0007205","GO:0071260","GO:0070213","GO:0043403","GO:1901187","GO:0035556","GO:0021707","GO:0071901","GO:0002268","GO:0016049","GO:0007253","GO:0090162","GO:2000031","GO:2000171","GO:1903589","GO:0016477","GO:0097284","GO:0070682","GO:1900383","GO:0035994","GO:0035508","GO:0033280","GO:0098703","GO:1901594","GO:0045083","GO:0009408","GO:0003213","GO:0044707","GO:0016055","GO:0003270","GO:0016567","GO:0071446","GO:0033028","GO:0046475","GO:0060843","GO:0061408","GO:1904355","GO:0072660","GO:0070212","GO:1900827","GO:0010845","GO:1904743","GO:1904908","GO:0010650","GO:0070198","GO:0048709","GO:0045736","GO:0007049","GO:2000340","GO:0050966","GO:0000083","GO:0045038","GO:0045444","GO:0097497","GO:0051209","GO:1903759","GO:0048265","GO:0043488","GO:0070431","GO:0071642","GO:0098907","GO:0010745","GO:1903444","GO:0050955","GO:1904357","GO:0060743","GO:0035544","GO:0009409","GO:0086070","GO:0032088","GO:0030103","GO:0070427","GO:0071651","GO:0048549","GO:2001275"]},{"accession":"XP_028938456.1","go_terms":["GO:0019896","GO:0071108","GO:0043407","GO:0050905","GO:0061519","GO:0007412","GO:0008283","GO:0007385","GO:0002931","GO:0019233","GO:0006281","GO:0048747","GO:0007628","GO:0042755","GO:0007409","GO:0035522","GO:0010951","GO:0021670","GO:0006310","GO:1900015","GO:0048853","GO:0006511","GO:0030901"]},{"accession":"XP_007670478.1","go_terms":["GO:0090502","GO:0019740","GO:0030324","GO:0007420","GO:0046360","GO:0001822","GO:0006212","GO:0070689","GO:0017148","GO:0070314","GO:0009097","GO:0050680","GO:1902074"]},{"accession":"XP_007670479.1","go_terms":["GO:0090502","GO:0019740","GO:0030324","GO:0007420","GO:0046360","GO:0001822","GO:0006212","GO:0070689","GO:0017148","GO:0070314","GO:0009097","GO:0050680","GO:1902074"]},{"accession":"XP_028934197.1","go_terms":["GO:0016333","GO:0050774","GO:0007030","GO:0007472"]},{"accession":"XP_003430452.1","go_terms":[]},{"accession":"NP_001192047.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_028922346.1","go_terms":["GO:0090086","GO:1902187","GO:0035372","GO:1901896","GO:0043569","GO:0046597","GO:0060776","GO:0007275","GO:0046598","GO:0003220","GO:0003151","GO:0060386","GO:0071313","GO:0071641","GO:0086029","GO:0098904","GO:0098907","GO:1900226","GO:0098910","GO:0021957","GO:0032897","GO:0045087","GO:0043123","GO:0055002","GO:0006936","GO:1901253","GO:0006914","GO:0014808","GO:0043931","GO:0030433","GO:1903608","GO:0001778","GO:0051092","GO:0051607","GO:0097050","GO:0031664","GO:0070534","GO:0005513","GO:0043588","GO:0032479","GO:0032436","GO:0019221","GO:2001214","GO:0060670","GO:0045445","GO:0045444","GO:0045629","GO:0050728","GO:0016567","GO:0042512","GO:0045873","GO:0007259","GO:0048802","GO:0043066","GO:0097699","GO:0045627","GO:0042518","GO:0007472","GO:0060708","GO:0021819","GO:0046627","GO:0007175","GO:0001558","GO:0007173","GO:0060334","GO:0007264","GO:0071404","GO:0030539","GO:0007315","GO:1990967","GO:0071638","GO:0010534","GO:0021942","GO:0060396"]},{"accession":"XP_039766447.1","go_terms":["GO:0035750","GO:0045198","GO:0015879","GO:2000474","GO:0032416","GO:2000463","GO:0006470","GO:0045199","GO:0030036","GO:0060088","GO:0050808","GO:1990227","GO:0035023","GO:0007168","GO:0046328","GO:0090557","GO:0035418","GO:0051612","GO:0045186","GO:0090103","GO:0097120","GO:0045075","GO:0098924","GO:0003096","GO:0022007","GO:0035640","GO:0070433","GO:0043004","GO:0090630","GO:0021694","GO:0051835","GO:0060997","GO:0071625","GO:1901206","GO:0008285","GO:0030033","GO:1903361","GO:1903760","GO:0016080","GO:0032782","GO:0071315","GO:0050953","GO:0016358","GO:0051660","GO:1904781","GO:0006887","GO:0007268","GO:0007605","GO:0007266","GO:0070830","GO:2000821","GO:0014047","GO:2000670","GO:0090179","GO:0060292","GO:0019933","GO:0030111","GO:1903028","GO:0035176","GO:0051683","GO:0043113","GO:2000009","GO:0097291","GO:0071896"]},{"accession":"XP_028934898.1","go_terms":["GO:0071222","GO:0030325","GO:0060242","GO:1903579","GO:0006821","GO:0010042","GO:0010940","GO:0048266","GO:0048265","GO:0071294","GO:0014012","GO:0071476","GO:0045019","GO:0033013","GO:0032720","GO:0060253","GO:0060252","GO:0050810","GO:0008347","GO:0010266","GO:0051928","GO:0033574","GO:0051901","GO:0032570","GO:0072656","GO:1903147"]},{"accession":"XP_028927703.1","go_terms":["GO:0006559","GO:0033345","GO:0006517","GO:0006508"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0021551":1,"GO:0008343":1,"GO:0070537":1,"GO:0060389":1,"GO:0006511":2,"GO:0035192":1,"GO:0006351":1,"GO:0051568":1,"GO:0000244":1,"GO:1990108":1,"GO:0071108":2,"GO:0034394":1,"GO:0070536":1,"GO:0008583":1,"GO:0006397":2,"GO:1900425":1,"GO:0030509":1,"GO:0035523":1,"GO:0000245":1,"GO:0034729":1,"GO:0035871":1,"GO:0006355":1,"GO:0060013":1,"GO:0035520":1,"GO:0010606":1,"GO:1904667":1,"GO:0048149":1,"GO:0010992":1,"GO:0008277":1,"GO:1901026":1,"GO:0010995":1,"GO:0001662":1,"GO:1904378":1,"GO:0051298":1,"GO:0007179":1,"GO:0044313":1,"GO:0035616":1,"GO:1903070":1,"GO:0000289":1,"GO:0007283":1,"GO:0031397":1,"GO:0000266":1,"GO:0046512":1,"GO:0044130":1,"GO:0034435":1,"GO:1903966":1,"GO:0033561":1,"GO:0070542":1,"GO:0050872":1,"GO:0010873":1,"GO:1903699":1,"GO:0010205":1,"GO:0006667":1,"GO:0006696":1,"GO:0080064":1,"GO:0035754":1,"GO:0006633":1,"GO:0032286":1,"GO:0080065":1,"GO:0001949":1,"GO:0006675":1,"GO:0033490":1,"GO:0046485":1,"GO:0031295":1,"GO:0002724":1,"GO:2001190":1,"GO:0006259":1,"GO:0042493":1,"GO:0071407":1,"GO:0007165":1,"GO:0080147":1,"GO:0034120":1,"GO:0018258":1,"GO:0045598":1,"GO:0010405":1,"GO:0098792":1,"GO:0046598":2,"GO:0048245":1,"GO:0048246":1,"GO:0071333":1,"GO:0071677":1,"GO:0070231":1,"GO:0035900":1,"GO:0002548":1,"GO:0007157":1,"GO:2001200":1,"GO:0090305":1,"GO:2000562":1,"GO:0050994":1,"GO:0002667":1,"GO:0002317":1,"GO:0046006":1,"GO:0070241":1,"GO:0030593":1,"GO:0010493":1,"GO:0048354":1,"GO:0098586":1,"GO:0010812":1,"GO:0045445":2,"GO:0048678":1,"GO:0043123":2,"GO:0010977":1,"GO:0046475":1,"GO:0045038":1,"GO:1901594":1,"GO:0016567":2,"GO:0045083":1,"GO:0035556":1,"GO:0070198":1,"GO:0016049":1,"GO:2001275":1,"GO:0050966":1,"GO:1900383":1,"GO:0033028":1,"GO:0043403":1,"GO:0003213":1,"GO:0086070":1,"GO:1903759":1,"GO:0071901":1,"GO:0070431":1,"GO:0035994":1,"GO:1900827":1,"GO:0070427":1,"GO:0021707":1,"GO:0098703":1,"GO:0003270":1,"GO:0009409":1,"GO:0009408":1,"GO:0050960":1,"GO:0060843":1,"GO:0070212":1,"GO:0032088":1,"GO:0002268":1,"GO:0048709":1,"GO:0016477":1,"GO:1903444":1,"GO:0072660":1,"GO:0071260":1,"GO:0048549":1,"GO:0050968":1,"GO:0070682":1,"GO:1901187":1,"GO:0010650":1,"GO:0060743":1,"GO:2000031":1,"GO:0051017":1,"GO:0070213":1,"GO:0033280":1,"GO:0035544":1,"GO:0035508":1,"GO:0010845":1,"GO:0032212":1,"GO:0048265":2,"GO:0045444":2,"GO:0071651":1,"GO:0043488":1,"GO:2000171":1,"GO:0044707":1,"GO:0016055":1,"GO:1904357":1,"GO:0051209":1,"GO:0030103":1,"GO:0051225":1,"GO:0045736":1,"GO:0071446":1,"GO:0098907":2,"GO:0097497":1,"GO:1903589":1,"GO:0061408":1,"GO:0007049":1,"GO:1904355":1,"GO:0097284":1,"GO:0000083":1,"GO:0090162":1,"GO:0090501":1,"GO:0007205":1,"GO:1904743":1,"GO:0071642":1,"GO:0007253":1,"GO:2000340":1,"GO:0050955":1,"GO:0010745":1,"GO:1904908":1,"GO:0019233":1,"GO:0050905":1,"GO:0048747":1,"GO:0010951":1,"GO:0007409":1,"GO:0035522":1,"GO:0006310":1,"GO:0007628":1,"GO:0043407":1,"GO:0007412":1,"GO:0002931":1,"GO:0008283":1,"GO:0006281":1,"GO:0042755":1,"GO:1900015":1,"GO:0030901":1,"GO:0021670":1,"GO:0007385":1,"GO:0061519":1,"GO:0048853":1,"GO:0019896":1,"GO:0006212":2,"GO:0017148":2,"GO:0046360":2,"GO:0090502":2,"GO:0001822":2,"GO:0050680":2,"GO:0030324":2,"GO:0007420":2,"GO:0070314":2,"GO:0070689":2,"GO:1902074":2,"GO:0019740":2,"GO:0009097":2,"GO:0016333":1,"GO:0007472":2,"GO:0007030":1,"GO:0050774":1,"GO:0043569":1,"GO:0006936":1,"GO:0021819":1,"GO:0060776":1,"GO:0003220":1,"GO:0097050":1,"GO:0046597":1,"GO:0055002":1,"GO:0032479":1,"GO:0071404":1,"GO:0014808":1,"GO:0097699":1,"GO:0007315":1,"GO:0060386":1,"GO:0050728":1,"GO:0090086":1,"GO:0060670":1,"GO:0043066":1,"GO:0019221":1,"GO:0060708":1,"GO:0007173":1,"GO:0060396":1,"GO:0045873":1,"GO:0005513":1,"GO:0021942":1,"GO:0048802":1,"GO:0007275":1,"GO:0046627":1,"GO:1990967":1,"GO:0071638":1,"GO:0007175":1,"GO:0071641":1,"GO:0031664":1,"GO:0070534":1,"GO:0030539":1,"GO:0043931":1,"GO:0021957":1,"GO:0043588":1,"GO:0035372":1,"GO:0045627":1,"GO:0030433":1,"GO:0010534":1,"GO:0001778":1,"GO:0098904":1,"GO:1902187":1,"GO:2001214":1,"GO:0032897":1,"GO:0001558":1,"GO:0007264":1,"GO:0098910":1,"GO:1903608":1,"GO:0051607":1,"GO:1901253":1,"GO:0051092":1,"GO:0045087":1,"GO:0045629":1,"GO:0007259":1,"GO:0086029":1,"GO:0042512":1,"GO:0032436":1,"GO:0003151":1,"GO:1900226":1,"GO:0042518":1,"GO:0071313":1,"GO:0006914":1,"GO:0060334":1,"GO:1901896":1,"GO:0030111":1,"GO:0046328":1,"GO:1904781":1,"GO:0032416":1,"GO:0045198":1,"GO:0071315":1,"GO:0098924":1,"GO:0014047":1,"GO:0006887":1,"GO:0043113":1,"GO:0032782":1,"GO:0008285":1,"GO:1903361":1,"GO:1903760":1,"GO:1903028":1,"GO:2000474":1,"GO:0035418":1,"GO:0045199":1,"GO:2000009":1,"GO:0051660":1,"GO:0051683":1,"GO:0070830":1,"GO:0007168":1,"GO:0090557":1,"GO:0071896":1,"GO:0030036":1,"GO:2000821":1,"GO:0090103":1,"GO:0043004":1,"GO:0060292":1,"GO:0060088":1,"GO:1990227":1,"GO:0035640":1,"GO:0060997":1,"GO:1901206":1,"GO:0050953":1,"GO:0007605":1,"GO:0006470":1,"GO:0045075":1,"GO:0045186":1,"GO:0021694":1,"GO:0090179":1,"GO:0035750":1,"GO:0035023":1,"GO:0007266":1,"GO:0022007":1,"GO:0097291":1,"GO:0071625":1,"GO:0015879":1,"GO:0051612":1,"GO:0090630":1,"GO:0016080":1,"GO:0016358":1,"GO:0007268":1,"GO:0003096":1,"GO:2000670":1,"GO:2000463":1,"GO:0019933":1,"GO:0035176":1,"GO:0050808":1,"GO:0070433":1,"GO:0030033":1,"GO:0097120":1,"GO:0051835":1,"GO:0060252":1,"GO:0051928":1,"GO:0010266":1,"GO:0010940":1,"GO:0050810":1,"GO:0006821":1,"GO:0033013":1,"GO:0071476":1,"GO:0072656":1,"GO:0060242":1,"GO:0071222":1,"GO:0048266":1,"GO:0032720":1,"GO:0014012":1,"GO:0060253":1,"GO:0008347":1,"GO:0071294":1,"GO:0045019":1,"GO:0030325":1,"GO:0033574":1,"GO:1903147":1,"GO:0051901":1,"GO:0032570":1,"GO:0010042":1,"GO:1903579":1,"GO:0006559":1,"GO:0033345":1,"GO:0006508":1,"GO:0006517":1},"recipe_readded":["XP_028915301.1","XP_001510289.1","XP_028936747.1","XP_028929862.1","XP_028929070.1","XP_028911881.1","XP_028906449.1","XP_028910419.1","XP_028938072.1","XP_007663478.1","XP_028937643.1","XP_028906456.1","XP_028938442.1","NP_001229675.1","XP_028908082.1","XP_028915979.1","XP_001521715.2","XP_007654611.1","XP_028921137.1","XP_028921138.1"]}