{"hash":"2192559344932967365","title":"RNA Pseudouridine Synthesis","description":"The cluster is dominated by GO terms for pseudouridine synthesis across multiple RNA types (snRNA, rRNA, tRNA, mRNA) and general pseudouridine synthesis, indicating a shared function in RNA modification via pseudouridylation. While other terms (transcription, ER transport, replication) appear, the strongest signal ties to RNA pseudouridylation machinery.","confidence":"High","size":8,"edges":6,"triangles":2,"max_degree":4,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_005205429.2","go_terms":["GO:0031119","GO:0031120","GO:1990481","GO:0000455"]},{"accession":"XP_024853672.1","go_terms":["GO:0043335","GO:0030420","GO:1904287","GO:0001319","GO:0035617","GO:0034214","GO:0070414","GO:0006351","GO:0071218","GO:0016485","GO:0070389","GO:0034975","GO:0070370","GO:0006260","GO:0030163","GO:0030494","GO:0015979","GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:2001171","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0070676","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0051301","GO:0006888","GO:0045053","GO:0035494","GO:0019079","GO:0097352","GO:0016562","GO:2000158","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0031412","GO:0003341","GO:1990048","GO:0000027","GO:0019629","GO:0000160","GO:0009399","GO:0009401","GO:0006355","GO:0006808"]},{"accession":"XP_059741191.1","go_terms":["GO:2000617","GO:0007286","GO:0007279","GO:1901224","GO:0031054","GO:0035278","GO:0035280","GO:0034587","GO:0070919","GO:0033562","GO:0010586","GO:0090625","GO:0043046","GO:0035087","GO:0033168","GO:0043363","GO:0010501","GO:0072091","GO:0007223","GO:0000335","GO:1905618","GO:0060145","GO:0060213","GO:0016246","GO:0035279","GO:0010050","GO:0070924","GO:0090502","GO:0030718","GO:0060903","GO:1904159","GO:0010267","GO:0010492","GO:0035196","GO:0071442","GO:0010599","GO:0006351","GO:0045947","GO:0006413","GO:0030423","GO:0010216","GO:0030727","GO:0009047","GO:0048015","GO:0051214","GO:2000636","GO:0035194","GO:1902183","GO:0009791","GO:0007140","GO:0055046","GO:0010529"]},{"accession":"XP_005221464.1","go_terms":["GO:0055010","GO:0050684","GO:0001822","GO:0048747","GO:0001889"]},{"accession":"XP_005223340.1","go_terms":["GO:0048024","GO:0046833","GO:0045948","GO:0044830","GO:0022013","GO:0070935","GO:0097222","GO:0006402","GO:0098908","GO:2000627","GO:0016120","GO:0033129","GO:0043577","GO:1902416","GO:0090503","GO:0010610","GO:1901254","GO:0010323","GO:0000398","GO:2000637","GO:0010738","GO:0045716"]},{"accession":"NP_001068981.1","go_terms":["GO:0006284","GO:0097510"]},{"accession":"NP_001039354.1","go_terms":["GO:0001547","GO:0015909","GO:0033540","GO:0019254","GO:0008292","GO:0051791","GO:0032000"]},{"accession":"XP_024842586.1","go_terms":["GO:0048313","GO:0006890","GO:0006888","GO:0016185","GO:0043473","GO:0006886","GO:0006896","GO:0036465","GO:0048490","GO:0035646","GO:0051645","GO:0030100","GO:0008344","GO:0048488","GO:0021691"]}],"graph":[["XP_024853672.1","XP_024842586.1",0.507],["XP_024853672.1","NP_001068981.1",0.519],["XP_005221464.1","XP_005205429.2",0.69],["XP_005221464.1","NP_001068981.1",0.74],["XP_005205429.2","NP_001068981.1",0.514],["XP_024842586.1","NP_001068981.1",0.57]],"all_go_terms":{"GO:0031120":1,"GO:0000455":1,"GO:1990481":1,"GO:0031119":1,"GO:0006272":1,"GO:0061166":1,"GO:0019079":1,"GO:0019629":1,"GO:0031412":1,"GO:0006351":2,"GO:0071218":1,"GO:0070370":1,"GO:0061641":1,"GO:0000733":1,"GO:0000160":1,"GO:0030968":1,"GO:0009401":1,"GO:0016558":1,"GO:0031117":1,"GO:0035494":1,"GO:0097352":1,"GO:0030433":1,"GO:0016485":1,"GO:0070676":1,"GO:0009399":1,"GO:0030163":1,"GO:0034551":1,"GO:0001319":1,"GO:0035617":1,"GO:0090261":1,"GO:0071712":1,"GO:0051131":1,"GO:0045053":1,"GO:0045041":1,"GO:0070682":1,"GO:0048219":1,"GO:2000158":1,"GO:0051301":1,"GO:1903007":1,"GO:0070407":1,"GO:1904287":1,"GO:0070389":1,"GO:1903862":1,"GO:1903715":1,"GO:0034214":1,"GO:2001171":1,"GO:1990171":1,"GO:0000027":1,"GO:0072389":1,"GO:0051260":1,"GO:1901800":1,"GO:0032968":1,"GO:0030494":1,"GO:0070914":1,"GO:0034599":1,"GO:0033314":1,"GO:0015979":1,"GO:0043335":1,"GO:0006406":1,"GO:0018279":1,"GO:0070651":1,"GO:0070987":1,"GO:0030420":1,"GO:0006808":1,"GO:0046034":1,"GO:0003341":1,"GO:0006355":1,"GO:1990048":1,"GO:0051013":1,"GO:0034975":1,"GO:0016562":1,"GO:0070842":1,"GO:0070414":1,"GO:0061738":1,"GO:1903724":1,"GO:0032979":1,"GO:0045899":1,"GO:0006260":1,"GO:0001824":1,"GO:0006888":2,"GO:0090296":1,"GO:0016246":1,"GO:0035087":1,"GO:0035280":1,"GO:0010599":1,"GO:1905618":1,"GO:0010586":1,"GO:0035279":1,"GO:0030727":1,"GO:0060145":1,"GO:0034587":1,"GO:0072091":1,"GO:2000636":1,"GO:0010050":1,"GO:0010216":1,"GO:1901224":1,"GO:0035196":1,"GO:0000335":1,"GO:0033562":1,"GO:0035278":1,"GO:0030423":1,"GO:0035194":1,"GO:0043046":1,"GO:0070924":1,"GO:0055046":1,"GO:0051214":1,"GO:0060903":1,"GO:0010501":1,"GO:0010267":1,"GO:0010492":1,"GO:0045947":1,"GO:0043363":1,"GO:0006413":1,"GO:0090502":1,"GO:0048015":1,"GO:0030718":1,"GO:1904159":1,"GO:0009791":1,"GO:0009047":1,"GO:0031054":1,"GO:2000617":1,"GO:0070919":1,"GO:0060213":1,"GO:0007140":1,"GO:1902183":1,"GO:0007279":1,"GO:0033168":1,"GO:0071442":1,"GO:0090625":1,"GO:0010529":1,"GO:0007286":1,"GO:0007223":1,"GO:0001822":1,"GO:0055010":1,"GO:0048747":1,"GO:0050684":1,"GO:0001889":1,"GO:0098908":1,"GO:0033129":1,"GO:0048024":1,"GO:0097222":1,"GO:0010610":1,"GO:0070935":1,"GO:2000637":1,"GO:2000627":1,"GO:0044830":1,"GO:0045716":1,"GO:1902416":1,"GO:0006402":1,"GO:0010323":1,"GO:0046833":1,"GO:0000398":1,"GO:0022013":1,"GO:0010738":1,"GO:1901254":1,"GO:0045948":1,"GO:0090503":1,"GO:0043577":1,"GO:0016120":1,"GO:0097510":1,"GO:0006284":1,"GO:0019254":1,"GO:0008292":1,"GO:0032000":1,"GO:0033540":1,"GO:0001547":1,"GO:0015909":1,"GO:0051791":1,"GO:0048488":1,"GO:0006896":1,"GO:0006890":1,"GO:0035646":1,"GO:0030100":1,"GO:0016185":1,"GO:0048313":1,"GO:0036465":1,"GO:0051645":1,"GO:0008344":1,"GO:0043473":1,"GO:0048490":1,"GO:0006886":1,"GO:0021691":1},"recipe_readded":["XP_015317303.1","NP_001015534.1","NP_001070465.1","NP_001193212.2","XP_005226933.1","XP_002684864.3","XP_059736583.1","NP_001069247.1","NP_001179689.2","XP_010815250.1","XP_002693760.2","XP_005209734.1","XP_024843446.1","NP_001096709.2","XP_015327194.1","XP_059748705.1","NP_001070462.1","XP_024857125.2","NP_001161483.2","NP_001069616.1"]}