{"hash":"1390585053557065879","title":"Mitochondrial translation and amino acid biosynthesis","description":"The top GO terms strongly point to mitochondrial protein synthesis, with tRNA processing, mitochondrial phenylalanyl-tRNA aminoacylation, and translation. The accompanying biosynthetic processes for several amino acids, pantothenate, and NADPH regeneration suggest linked mitochondrial metabolism and redox activity. Additional terms like copper ion import and inositol catabolic process imply broader, mitochondria-associated metabolic regulation. Overall, the cluster appears to center on mitochondrial translation machinery with connected metabolic pathways.","confidence":"High","size":18,"edges":19,"triangles":12,"max_degree":5,"top_function":null,"members":[{"accession":"NP_001001136.2","go_terms":["GO:0003289","GO:0043966","GO:0045190","GO:0003290","GO:0051571","GO:0051573","GO:1903758","GO:0051096","GO:0006349","GO:0000414","GO:0043046","GO:0010452","GO:0003149","GO:0006346","GO:1903025","GO:0016446","GO:0043045","GO:0048298"]},{"accession":"NP_001039792.1","go_terms":["GO:0072684","GO:1902375","GO:0031426","GO:0036093","GO:1990180","GO:0009395","GO:0090503","GO:0046381","GO:0070291","GO:0008033","GO:0070292","GO:0018189","GO:0035900","GO:0006364","GO:0006198","GO:0006401","GO:1903999","GO:0019700","GO:0030420","GO:0031126","GO:0017001","GO:0034247","GO:0046677","GO:0098789","GO:0034414","GO:0019243"]},{"accession":"NP_001124221.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_059736226.1","go_terms":["GO:0008033","GO:0070156","GO:0006412"]},{"accession":"XP_010807862.1","go_terms":["GO:0006777","GO:0097112","GO:0072579","GO:0018315","GO:0032324"]},{"accession":"NP_001039526.1","go_terms":["GO:0008635","GO:0006915","GO:0018063","GO:0006123","GO:0006122","GO:0042743","GO:0010730","GO:0006470","GO:0015979","GO:0034465"]},{"accession":"NP_001039974.1","go_terms":["GO:0019082","GO:0071169","GO:1904815","GO:0039548","GO:0039520","GO:0039648","GO:0033128","GO:0060701","GO:0039579","GO:0051572","GO:0034184","GO:0007549","GO:0051725","GO:1900231","GO:0039694","GO:0061086","GO:0045618","GO:0039595","GO:1901837"]},{"accession":"XP_024839217.1","go_terms":["GO:0008033","GO:0070156","GO:0006412"]},{"accession":"NP_001030390.1","go_terms":["GO:0045856","GO:2000324","GO:0008588","GO:0031032","GO:0055011","GO:0019417","GO:0030032","GO:0008585","GO:0007160","GO:2000691","GO:0055014","GO:0048482","GO:0060067","GO:0070886","GO:2000346","GO:0035331","GO:0021702","GO:0035995","GO:0030835","GO:0001705","GO:0070527","GO:0003324","GO:2000744","GO:0097477","GO:2000768","GO:0035852","GO:0010088","GO:0042789","GO:0021937","GO:0021871","GO:0021520","GO:0021521","GO:0021524","GO:0048317","GO:0021526","GO:0021527","GO:0050859","GO:0051017","GO:0006887","GO:0061205","GO:2001046","GO:0008045","GO:0090334","GO:0045216","GO:0072284","GO:0030042","GO:0030579","GO:1904948","GO:0071657","GO:0035195","GO:0046013","GO:0097067","GO:0072283","GO:0048735","GO:0010735","GO:0035847","GO:0048936","GO:0045805","GO:0032458","GO:2000637","GO:0060396","GO:0035849"]},{"accession":"NP_001070273.1","go_terms":["GO:0008033","GO:0070156","GO:0006412"]},{"accession":"XP_024846829.2","go_terms":[]},{"accession":"NP_001014906.1","go_terms":["GO:0006571","GO:0009097","GO:0098706","GO:0015940","GO:0046392","GO:0009099","GO:0015677","GO:0019310","GO:0055129","GO:0006740","GO:1903206","GO:0055114"]},{"accession":"XP_010808566.2","go_terms":["GO:0060347","GO:0046661","GO:0019227","GO:1903779","GO:0055010","GO:0006458","GO:1902991","GO:0032515","GO:0086064","GO:0051775","GO:0051301","GO:0032925","GO:0006939","GO:0000412","GO:1901710","GO:0042098","GO:0030850","GO:0035584","GO:0048680","GO:0007049","GO:0007183","GO:0030073","GO:0006463","GO:0014808","GO:0003007","GO:0060315","GO:0022417","GO:0042026","GO:1990000","GO:0061179","GO:0016925","GO:0061077","GO:0007179","GO:0042542","GO:0009749","GO:0033197"]},{"accession":"XP_059736225.1","go_terms":["GO:0008033","GO:0070156","GO:0006412"]},{"accession":"NP_001029918.1","go_terms":[]},{"accession":"NP_001014957.1","go_terms":["GO:0006571","GO:0009097","GO:0098706","GO:0015940","GO:0046392","GO:0009099","GO:0015677","GO:0019310","GO:0055129","GO:0006740","GO:1903206","GO:0055114"]},{"accession":"NP_001068649.1","go_terms":["GO:0006571","GO:0009097","GO:0098706","GO:0015940","GO:0046392","GO:0009099","GO:0015677","GO:0019310","GO:0055129","GO:0006740","GO:1903206","GO:0055114"]},{"accession":"NP_001030431.1","go_terms":["GO:0006650","GO:0090038","GO:0006094","GO:0086005","GO:0016558","GO:0071356","GO:2000010","GO:0006740","GO:0046168","GO:0046167","GO:0060373","GO:0015940","GO:0006973","GO:0008654","GO:0006127","GO:0071320","GO:0009627","GO:0019432","GO:0045821","GO:0033137","GO:0010765"]}],"graph":[["NP_001124221.1","XP_010807862.1",0.641],["NP_001014906.1","NP_001014957.1",0.721],["NP_001014906.1","NP_001030431.1",0.742],["NP_001014906.1","NP_001039526.1",0.515],["NP_001014906.1","NP_001068649.1",0.731],["NP_001001136.2","NP_001039792.1",0.62],["XP_059736225.1","XP_024839217.1",0.588],["XP_059736225.1","NP_001070273.1",0.711],["XP_024839217.1","XP_024846829.2",0.522],["XP_024839217.1","XP_059736226.1",0.538],["XP_024839217.1","NP_001070273.1",0.649],["NP_001039526.1","NP_001014957.1",0.681],["NP_001039526.1","NP_001030431.1",0.583],["NP_001039526.1","NP_001068649.1",0.61],["NP_001039526.1","XP_024846829.2",0.806],["NP_001030431.1","NP_001014957.1",0.728],["NP_001030431.1","NP_001068649.1",0.727],["XP_059736226.1","NP_001070273.1",0.555],["NP_001014957.1","NP_001068649.1",0.719]],"all_go_terms":{"GO:0043966":1,"GO:0003290":1,"GO:1903025":1,"GO:0000414":1,"GO:0051571":1,"GO:0016446":1,"GO:0051096":1,"GO:0003289":1,"GO:1903758":1,"GO:0043046":1,"GO:0043045":1,"GO:0006349":1,"GO:0003149":1,"GO:0048298":1,"GO:0006346":1,"GO:0045190":1,"GO:0010452":1,"GO:0051573":1,"GO:0034414":1,"GO:0031426":1,"GO:0046381":1,"GO:0017001":1,"GO:0009395":1,"GO:0034247":1,"GO:0019243":1,"GO:0019700":1,"GO:0036093":1,"GO:0070291":1,"GO:0035900":1,"GO:0046677":1,"GO:0070292":1,"GO:0006198":1,"GO:0008033":5,"GO:1903999":1,"GO:1990180":1,"GO:0072684":1,"GO:0031126":1,"GO:0006401":1,"GO:0098789":1,"GO:0006364":1,"GO:1902375":1,"GO:0090503":1,"GO:0018189":1,"GO:0030420":1,"GO:0070156":4,"GO:0006412":4,"GO:0072579":1,"GO:0032324":1,"GO:0097112":1,"GO:0006777":1,"GO:0018315":1,"GO:0042743":1,"GO:0006470":1,"GO:0006915":1,"GO:0008635":1,"GO:0015979":1,"GO:0006122":1,"GO:0010730":1,"GO:0018063":1,"GO:0006123":1,"GO:0034465":1,"GO:0039520":1,"GO:0007549":1,"GO:0039548":1,"GO:0051572":1,"GO:0033128":1,"GO:0039579":1,"GO:0051725":1,"GO:0060701":1,"GO:0061086":1,"GO:0039648":1,"GO:1901837":1,"GO:0039595":1,"GO:1904815":1,"GO:0034184":1,"GO:0045618":1,"GO:0039694":1,"GO:0019082":1,"GO:1900231":1,"GO:0071169":1,"GO:0010735":1,"GO:0072283":1,"GO:0097477":1,"GO:0021526":1,"GO:0051017":1,"GO:0001705":1,"GO:0030032":1,"GO:0008585":1,"GO:0035847":1,"GO:0019417":1,"GO:0032458":1,"GO:0021702":1,"GO:0048317":1,"GO:2000691":1,"GO:0035852":1,"GO:0010088":1,"GO:0021521":1,"GO:2000637":1,"GO:0055014":1,"GO:2000744":1,"GO:2000324":1,"GO:0021520":1,"GO:0021524":1,"GO:0072284":1,"GO:0046013":1,"GO:0035995":1,"GO:0008045":1,"GO:2000346":1,"GO:0006887":1,"GO:0070886":1,"GO:0048936":1,"GO:0045856":1,"GO:0021937":1,"GO:0050859":1,"GO:0060067":1,"GO:0045805":1,"GO:1904948":1,"GO:0060396":1,"GO:0030579":1,"GO:0035849":1,"GO:0007160":1,"GO:0030042":1,"GO:0035195":1,"GO:0055011":1,"GO:0097067":1,"GO:0070527":1,"GO:0071657":1,"GO:0008588":1,"GO:0061205":1,"GO:0031032":1,"GO:2000768":1,"GO:0042789":1,"GO:0035331":1,"GO:2001046":1,"GO:0021871":1,"GO:0048482":1,"GO:0048735":1,"GO:0021527":1,"GO:0003324":1,"GO:0045216":1,"GO:0030835":1,"GO:0090334":1,"GO:0015940":4,"GO:0055114":3,"GO:0015677":3,"GO:0019310":3,"GO:0055129":3,"GO:0009099":3,"GO:0006740":4,"GO:1903206":3,"GO:0046392":3,"GO:0006571":3,"GO:0098706":3,"GO:0009097":3,"GO:0006463":1,"GO:1901710":1,"GO:0032925":1,"GO:0061179":1,"GO:0046661":1,"GO:0003007":1,"GO:0051301":1,"GO:0019227":1,"GO:0000412":1,"GO:0060347":1,"GO:0055010":1,"GO:0030073":1,"GO:0042542":1,"GO:0007183":1,"GO:0022417":1,"GO:0006458":1,"GO:0007049":1,"GO:0006939":1,"GO:0048680":1,"GO:0032515":1,"GO:1990000":1,"GO:0060315":1,"GO:0042098":1,"GO:0051775":1,"GO:0030850":1,"GO:1902991":1,"GO:0014808":1,"GO:0016925":1,"GO:1903779":1,"GO:0035584":1,"GO:0009749":1,"GO:0007179":1,"GO:0061077":1,"GO:0033197":1,"GO:0042026":1,"GO:0086064":1,"GO:0060373":1,"GO:0006127":1,"GO:0033137":1,"GO:0090038":1,"GO:0071320":1,"GO:0019432":1,"GO:0009627":1,"GO:0006094":1,"GO:0006973":1,"GO:2000010":1,"GO:0006650":1,"GO:0071356":1,"GO:0045821":1,"GO:0010765":1,"GO:0086005":1,"GO:0046168":1,"GO:0046167":1,"GO:0016558":1,"GO:0008654":1},"recipe_readded":["XP_059747712.1","NP_001095639.1","XP_024850706.1","NP_001075076.1","XP_005217716.1","XP_015331291.1","XP_024839623.1","NP_776771.1","XP_059739351.1","NP_001069281.1","XP_010812931.1","NP_776712.1","XP_024833799.1","XP_059740742.1","XP_024840916.1","XP_010801697.2","XP_002698235.2","NP_001070484.1","NP_001029709.1","XP_002684864.3"]}