{"hash":"1635564043939419303","title":"Proviral Integration and DNA Transposition","description":"The terms are dominated by DNA integration, transposition, retrotransposition, proviral latency, and viral entry into the host nucleus, alongside DNA replication-related processes. This suggests the cluster represents genome mobility elements (transposons/retrotransposons and proviruses) and their replication/establishment steps within the host genome rather than a single other pathway. There is some noise from host-symbiont interaction terms, but the mobility-oriented terms prevail.","confidence":"Medium","size":21,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_052827226.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014773261.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014789618.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014772630.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014777021.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006313","GO:0075713","GO:0032197","GO:0015074","GO:0075732","GO:0039651"]},{"accession":"XP_014785732.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006313","GO:0075713","GO:0032197","GO:0015074","GO:0075732","GO:0039651"]},{"accession":"XP_014785323.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014767890.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014786687.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014768165.2","go_terms":["GO:0000722","GO:0006270","GO:0006260","GO:0006269"]},{"accession":"XP_014784242.1","go_terms":["GO:0061418","GO:0033138","GO:0051881","GO:1904120","GO:1902882","GO:0071500","GO:1901858","GO:0048839","GO:0001893","GO:1904031","GO:0010971","GO:1990179","GO:0010800","GO:0051897","GO:0050679"]},{"accession":"XP_014772869.1","go_terms":["GO:0009157","GO:0016310","GO:0046104","GO:0071897"]},{"accession":"XP_014776724.1","go_terms":["GO:0031030","GO:1902543","GO:0048227","GO:0032889","GO:0006886","GO:0031578","GO:1902018","GO:1902953","GO:0031338","GO:0044829","GO:0070309","GO:0032483","GO:0046726","GO:0032486","GO:0034499","GO:0090110","GO:0051534","GO:0090630","GO:0035526","GO:0045737","GO:0071955"]},{"accession":"XP_052828287.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014777410.1","go_terms":["GO:0010923"]},{"accession":"XP_014787664.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014786165.1","go_terms":["GO:2001237","GO:0033153","GO:0061303","GO:0060009","GO:0001755","GO:0061386","GO:0061145","GO:0048866","GO:0001828","GO:0043044","GO:0030916","GO:0032332","GO:2000741","GO:0045662","GO:0003415","GO:0072193","GO:0072197","GO:0048298","GO:0060532","GO:2000726","GO:0061010","GO:0003290","GO:0060018","GO:0001841","GO:0003357","GO:0061153","GO:0003211","GO:0002270","GO:0046533","GO:0003289","GO:0055057","GO:0021538","GO:0048484","GO:0071864","GO:0071866","GO:0010909","GO:0003203","GO:0071353","GO:0060784","GO:0035914","GO:0030879","GO:0035622","GO:0048557","GO:0032072","GO:0048709","GO:0048627","GO:0048625","GO:0014009","GO:0035019","GO:0070898","GO:0060174","GO:0071504","GO:0043049","GO:0007422","GO:0060807","GO:0006351","GO:0021943","GO:0035711","GO:0007493","GO:0031018","GO:0021903","GO:0032808","GO:0045586","GO:1990774","GO:0060956","GO:0090579","GO:0003308","GO:0000122","GO:0044334","GO:0072091","GO:1902262","GO:0003413","GO:0007548","GO:2000426","GO:0060214","GO:0090139","GO:0072190","GO:0045063","GO:2000043","GO:0090190","GO:0071899","GO:0071560","GO:0060517","GO:0033234","GO:0048546","GO:0070318","GO:0048619","GO:2001111","GO:0042662","GO:0060221","GO:0072289","GO:0001195","GO:0010197","GO:0043586","GO:0032696","GO:0070384","GO:2000761","GO:0090090","GO:0014718","GO:0061138","GO:0019100","GO:0002840","GO:0006391","GO:0060729","GO:0044336","GO:0003142","GO:0072034","GO:0010452","GO:0030538","GO:2000020","GO:0060534","GO:0021861"]},{"accession":"XP_014786170.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_014786780.1","go_terms":["GO:0018094","GO:0051013","GO:0007288","GO:0030516","GO:1905419","GO:0003353","GO:0003351","GO:0018095"]},{"accession":"XP_052834120.1","go_terms":["GO:0002755","GO:0045410","GO:2000340","GO:0070671","GO:0090073","GO:0034137","GO:2000494","GO:0032738","GO:0034145","GO:0002781","GO:0071651","GO:0071650","GO:0035669","GO:0070935","GO:0035665","GO:0043123","GO:0006461","GO:0070262","GO:0050790","GO:1903538","GO:0042176","GO:0051754","GO:0007143","GO:0051306","GO:2001241","GO:0051232","GO:0033674","GO:0006610","GO:0000060","GO:0000188","GO:0051028","GO:0038202","GO:0097711","GO:0042518","GO:0007084","GO:0060561","GO:0071230","GO:0060188","GO:0006607","GO:0051292","GO:0043547","GO:0006335","GO:0006275","GO:0001938","GO:0045945","GO:0006672"]},{"accession":"XP_052825821.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0015074":3,"GO:0039651":3,"GO:0046718":3,"GO:0032197":2,"GO:0075713":3,"GO:0006313":2,"GO:0075732":3,"GO:0006260":2,"GO:0000722":1,"GO:0006270":1,"GO:0006269":1,"GO:0033138":1,"GO:1990179":1,"GO:0071500":1,"GO:0001893":1,"GO:1904031":1,"GO:0048839":1,"GO:1902882":1,"GO:0051881":1,"GO:0051897":1,"GO:0050679":1,"GO:1901858":1,"GO:0010800":1,"GO:0061418":1,"GO:0010971":1,"GO:1904120":1,"GO:0016310":1,"GO:0009157":1,"GO:0046104":1,"GO:0071897":1,"GO:1902953":1,"GO:0090110":1,"GO:0032483":1,"GO:0032486":1,"GO:0044829":1,"GO:0051534":1,"GO:0046726":1,"GO:0031030":1,"GO:0034499":1,"GO:0032889":1,"GO:0006886":1,"GO:0090630":1,"GO:0031338":1,"GO:0045737":1,"GO:1902543":1,"GO:1902018":1,"GO:0031578":1,"GO:0048227":1,"GO:0070309":1,"GO:0035526":1,"GO:0071955":1,"GO:0010923":1,"GO:0035914":1,"GO:0060534":1,"GO:2000741":1,"GO:0001195":1,"GO:0010452":1,"GO:0007422":1,"GO:2000726":1,"GO:0003211":1,"GO:0072091":1,"GO:0044336":1,"GO:0072034":1,"GO:0070898":1,"GO:0032332":1,"GO:0071504":1,"GO:0048709":1,"GO:0014718":1,"GO:0032808":1,"GO:0071899":1,"GO:0043586":1,"GO:0048557":1,"GO:0045586":1,"GO:0072197":1,"GO:0010197":1,"GO:0046533":1,"GO:0001828":1,"GO:0061010":1,"GO:0090139":1,"GO:0003289":1,"GO:0043049":1,"GO:0045063":1,"GO:0043044":1,"GO:0072289":1,"GO:2000043":1,"GO:0003203":1,"GO:0007548":1,"GO:0044334":1,"GO:0090090":1,"GO:0061138":1,"GO:0032696":1,"GO:0048484":1,"GO:0048546":1,"GO:0021903":1,"GO:0002270":1,"GO:0003290":1,"GO:0070384":1,"GO:0006351":1,"GO:0035711":1,"GO:0060174":1,"GO:0003413":1,"GO:0061303":1,"GO:0071864":1,"GO:0003357":1,"GO:0060517":1,"GO:0072193":1,"GO:0007493":1,"GO:0090579":1,"GO:2000020":1,"GO:0090190":1,"GO:1902262":1,"GO:0048866":1,"GO:0060807":1,"GO:0071866":1,"GO:0061145":1,"GO:0048625":1,"GO:0003308":1,"GO:0000122":1,"GO:0060956":1,"GO:2001111":1,"GO:0045662":1,"GO:0021943":1,"GO:0030916":1,"GO:1990774":1,"GO:0042662":1,"GO:0032072":1,"GO:0035019":1,"GO:0030538":1,"GO:0030879":1,"GO:0021538":1,"GO:0048627":1,"GO:0060018":1,"GO:0048298":1,"GO:0001841":1,"GO:2001237":1,"GO:2000426":1,"GO:0055057":1,"GO:0060532":1,"GO:0060729":1,"GO:0060009":1,"GO:0006391":1,"GO:0014009":1,"GO:0001755":1,"GO:0019100":1,"GO:0071353":1,"GO:0048619":1,"GO:0021861":1,"GO:0070318":1,"GO:0072190":1,"GO:0031018":1,"GO:0060221":1,"GO:0035622":1,"GO:0003142":1,"GO:0033153":1,"GO:0071560":1,"GO:0061153":1,"GO:0061386":1,"GO:0060214":1,"GO:0002840":1,"GO:0060784":1,"GO:0003415":1,"GO:0033234":1,"GO:2000761":1,"GO:0010909":1,"GO:0007288":1,"GO:1905419":1,"GO:0003353":1,"GO:0030516":1,"GO:0018095":1,"GO:0051013":1,"GO:0018094":1,"GO:0003351":1,"GO:0001938":1,"GO:0002755":1,"GO:0006335":1,"GO:0006461":1,"GO:0070671":1,"GO:2001241":1,"GO:0000188":1,"GO:0070262":1,"GO:0007143":1,"GO:0050790":1,"GO:0090073":1,"GO:0051306":1,"GO:0060561":1,"GO:0097711":1,"GO:0060188":1,"GO:0045945":1,"GO:0006607":1,"GO:0045410":1,"GO:0051292":1,"GO:0002781":1,"GO:0051754":1,"GO:0051232":1,"GO:0000060":1,"GO:0032738":1,"GO:0070935":1,"GO:0034137":1,"GO:2000340":1,"GO:0042518":1,"GO:0051028":1,"GO:0035665":1,"GO:0038202":1,"GO:0006610":1,"GO:0033674":1,"GO:0007084":1,"GO:0043547":1,"GO:0043123":1,"GO:0035669":1,"GO:0034145":1,"GO:0071651":1,"GO:1903538":1,"GO:0042176":1,"GO:0006275":1,"GO:2000494":1,"GO:0006672":1,"GO:0071650":1,"GO:0071230":1,"GO:0006310":1,"GO:0006278":1,"GO:1903704":1},"recipe_readded":["XP_052822660.1","XP_014778287.1","XP_014787645.1","XP_014775119.1","XP_014776967.1","XP_014783046.1","XP_014774067.2","XP_014770009.1","XP_014777939.1","XP_014778026.1","XP_014779988.1","XP_014772461.1","XP_014771447.1","XP_014784225.1","XP_014767532.1","XP_014787706.1","XP_014781698.2"]}