{"hash":"1964296233223052935","title":"Bacterial transcriptional regulation and biofilm switch","description":"This cluster centers on bacterial regulatory processes, including regulation of DNA-templated transcription and phosphorelay signaling, together with life-cycle decisions like biofilm formation and flagellum control. The presence of biofilm adhesion, motility regulation, and antibiotic response suggests a cohesive theme of transcriptional control guiding lifestyle switches and stress responses in bacteria, with some metabolic context from glycolysis. Some terms appear less coherent with bacteria (e.g., embryonic neurocranium morphogenesis), indicating possible annotation noise, but the core signal aligns with bacterial transcriptional regulation and biofilm/motility switching.","confidence":"Medium","size":24,"edges":47,"triangles":32,"max_degree":20,"top_function":"regulation of DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_005778149.1","go_terms":["GO:1990355","GO:0070301","GO:0006464","GO:0055114","GO:0030091"]},{"accession":"XP_005790440.1","go_terms":["GO:0030324","GO:0017000","GO:0046677","GO:0042574","GO:0009710","GO:0045150","GO:0006729","GO:0042438","GO:0008207","GO:0055114","GO:0071768","GO:0042619","GO:0031427","GO:0030497","GO:0006355","GO:0008209","GO:0030148","GO:0006710","GO:0042572","GO:0042761","GO:0042376","GO:0006666","GO:0006704","GO:0006703","GO:0002138","GO:0061370"]},{"accession":"XP_005782914.1","go_terms":["GO:0060576","GO:0016311","GO:0033133","GO:0010666","GO:0009410","GO:0006096","GO:0006094","GO:0006564","GO:0046835","GO:0009236","GO:0071279","GO:1902153","GO:0006914","GO:0007585","GO:0043456","GO:0007420","GO:1901525","GO:0045730","GO:1904024","GO:0045820","GO:0006003","GO:0006000"]},{"accession":"XP_005791772.1","go_terms":["GO:0043709","GO:0000160","GO:1902201","GO:0006355","GO:0007049","GO:1902209"]},{"accession":"XP_005794514.1","go_terms":["GO:0090501","GO:0051017","GO:0032212","GO:0051225","GO:0006397","GO:0050960","GO:0050968","GO:0007205","GO:0071260","GO:0070213","GO:0043403","GO:1901187","GO:0035556","GO:0021707","GO:0071901","GO:0002268","GO:0016049","GO:0007253","GO:0090162","GO:2000031","GO:2000171","GO:1903589","GO:0016477","GO:0097284","GO:0070682","GO:1900383","GO:0035994","GO:0035508","GO:0033280","GO:0098703","GO:1901594","GO:0045083","GO:0009408","GO:0003213","GO:0044707","GO:0016055","GO:0003270","GO:0016567","GO:0071446","GO:0033028","GO:0046475","GO:0060843","GO:0061408","GO:1904355","GO:0072660","GO:0070212","GO:1900827","GO:0010845","GO:1904743","GO:1904908","GO:0010650","GO:0070198","GO:0043709","GO:0000160","GO:1902201","GO:0006355","GO:0007049","GO:1902209","GO:2000340","GO:0050966","GO:0000083","GO:0045038","GO:0045444","GO:0097497","GO:0051209","GO:1903759","GO:0048265","GO:0043488","GO:0070431","GO:0071642","GO:0098907","GO:0010745","GO:1903444","GO:0050955","GO:1904357","GO:0060743","GO:0035544","GO:0009409","GO:0086070","GO:0032088","GO:0030103","GO:0070427","GO:0071651","GO:0048549","GO:2001275"]},{"accession":"XP_005764193.1","go_terms":["GO:0043709","GO:0000160","GO:1902201","GO:0006355","GO:0007049","GO:1902209"]},{"accession":"XP_005785094.1","go_terms":["GO:0018393","GO:0051606","GO:0009736","GO:0080117","GO:0000160","GO:0006355","GO:0043158","GO:0030435","GO:0006351","GO:0042173","GO:0010105","GO:0006808","GO:0071973","GO:0006935","GO:0060574","GO:0019896","GO:0032922","GO:0071386","GO:0009410","GO:1903715","GO:0061419","GO:0070932","GO:0051541","GO:0097167","GO:0097411","GO:0001922","GO:0002248","GO:0021502","GO:1904862","GO:0061030","GO:0032364","GO:0010573","GO:0051946"]},{"accession":"XP_005761291.1","go_terms":["GO:0006777","GO:0070329","GO:0019346","GO:0000087","GO:0035335","GO:0021510","GO:0018192","GO:0032447","GO:0030855","GO:2000220","GO:0006071","GO:0045454","GO:0002143"]},{"accession":"XP_005780385.1","go_terms":["GO:0009691"]},{"accession":"XP_005770740.1","go_terms":["GO:0009718","GO:0001081","GO:0009242","GO:0006541","GO:0006012","GO:0006351","GO:1901006","GO:0009699","GO:0055114"]},{"accession":"XP_005784581.1","go_terms":["GO:0006457","GO:0017006","GO:0035690","GO:0010105","GO:0046777","GO:0009585","GO:0070483","GO:0000160","GO:0071353","GO:0006265","GO:0006261","GO:0097411","GO:0033160","GO:0009584","GO:0006935","GO:0018298","GO:1903660","GO:0042220","GO:0007059","GO:0001890","GO:0045793","GO:0080117","GO:1901389","GO:0006355","GO:0010510","GO:0006006","GO:1905323"]},{"accession":"XP_005759590.1","go_terms":["GO:0002100","GO:0019858","GO:0006217","GO:0009231","GO:0046109","GO:0046677","GO:0009972","GO:0044206","GO:0006147"]},{"accession":"XP_005766874.1","go_terms":["GO:0030206","GO:0030205","GO:0006044","GO:0018146","GO:0006711","GO:0006477","GO:0006805","GO:0042403","GO:0000103","GO:0002002","GO:0045600","GO:0030210","GO:0048702","GO:0006584","GO:0050427","GO:0030573","GO:0009812","GO:0015012","GO:0015015","GO:0006068"]},{"accession":"XP_005780606.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0051289","GO:1902600","GO:0009060","GO:0042447","GO:0071432","GO:1901143","GO:0032461","GO:0010992","GO:0008286","GO:0006627","GO:0051291","GO:0010815","GO:0044257","GO:0008340","GO:0018189","GO:0006122","GO:0016032","GO:0045861"]},{"accession":"XP_005763806.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_005788334.1","go_terms":["GO:0048208","GO:0048081","GO:0016236","GO:0070278","GO:0021747","GO:0060088","GO:0006888","GO:1901301","GO:0006886","GO:0060463","GO:0019886","GO:2000189","GO:0032876","GO:0035149","GO:0061156","GO:0090110","GO:0003331","GO:0080119","GO:0090178","GO:0003400","GO:0035909","GO:0060982","GO:0045714","GO:0048702"]},{"accession":"XP_005790012.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_005791117.1","go_terms":["GO:0015986","GO:0099132"]},{"accession":"XP_005756905.1","go_terms":["GO:2001059","GO:0030388","GO:0019404","GO:0006094","GO:0006096"]},{"accession":"XP_005786637.1","go_terms":["GO:0006478","GO:0030206","GO:0030205","GO:0006044","GO:0018146","GO:0006711","GO:0006477","GO:0006805","GO:0042403","GO:0000103","GO:0002002","GO:0045600","GO:0030210","GO:0048702","GO:0006584","GO:0050427","GO:0030573","GO:0009812","GO:0015012","GO:0015015","GO:0006068"]},{"accession":"XP_005758999.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_005759991.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_005762126.1","go_terms":["GO:0042554","GO:1990451","GO:1902177","GO:0050665","GO:0009590","GO:0048855","GO:0006590","GO:1904845","GO:0003081","GO:0072592","GO:0010467","GO:0051591","GO:0048840","GO:0008365","GO:0045730","GO:0015677","GO:0045726","GO:0045453"]},{"accession":"XP_005765112.1","go_terms":["GO:0019619","GO:1905004","GO:0046874","GO:1905012"]}],"graph":[["XP_005756905.1","XP_005791772.1",0.648],["XP_005762126.1","XP_005791772.1",0.861],["XP_005778149.1","XP_005780385.1",0.96],["XP_005778149.1","XP_005786637.1",0.877],["XP_005778149.1","XP_005761291.1",0.898],["XP_005765112.1","XP_005761291.1",0.818],["XP_005759590.1","XP_005791772.1",0.626],["XP_005759590.1","XP_005794514.1",0.694],["XP_005790440.1","XP_005764193.1",0.891],["XP_005790440.1","XP_005794514.1",0.986],["XP_005790440.1","XP_005791772.1",0.734],["XP_005790440.1","XP_005761291.1",0.798],["XP_005766874.1","XP_005794514.1",0.656],["XP_005766874.1","XP_005791772.1",0.619],["XP_005764193.1","XP_005780385.1",0.96],["XP_005764193.1","XP_005784581.1",0.917],["XP_005764193.1","XP_005785094.1",0.653],["XP_005764193.1","XP_005791772.1",0.946],["XP_005764193.1","XP_005794514.1",0.529],["XP_005764193.1","XP_005761291.1",0.95],["XP_005794514.1","XP_005763806.1",0.609],["XP_005794514.1","XP_005770740.1",0.9],["XP_005794514.1","XP_005780385.1",0.872],["XP_005794514.1","XP_005784581.1",0.982],["XP_005794514.1","XP_005785094.1",0.82],["XP_005794514.1","XP_005788334.1",0.781],["XP_005794514.1","XP_005790012.1",0.589],["XP_005794514.1","XP_005791772.1",0.88],["XP_005794514.1","XP_005758999.1",0.512],["XP_005794514.1","XP_005761291.1",0.983],["XP_005770740.1","XP_005791772.1",0.529],["XP_005790012.1","XP_005791772.1",0.69],["XP_005759991.1","XP_005791772.1",0.635],["XP_005761291.1","XP_005791772.1",0.962],["XP_005761291.1","XP_005788334.1",0.699],["XP_005791772.1","XP_005763806.1",0.707],["XP_005791772.1","XP_005780385.1",0.942],["XP_005791772.1","XP_005780606.1",0.519],["XP_005791772.1","XP_005782914.1",0.529],["XP_005791772.1","XP_005784581.1",0.962],["XP_005791772.1","XP_005785094.1",0.812],["XP_005791772.1","XP_005788334.1",0.844],["XP_005791772.1","XP_005791117.1",0.622],["XP_005791772.1","XP_005758999.1",0.619],["XP_005786637.1","XP_005780606.1",0.631],["XP_005784581.1","XP_005780385.1",0.706],["XP_005784581.1","XP_005782914.1",0.703]],"all_go_terms":{"GO:0055114":3,"GO:0006464":1,"GO:1990355":1,"GO:0070301":1,"GO:0030091":1,"GO:0008209":1,"GO:0006355":6,"GO:0006710":1,"GO:0030324":1,"GO:0045150":1,"GO:0006704":1,"GO:0042438":1,"GO:0071768":1,"GO:0030497":1,"GO:0042619":1,"GO:0042574":1,"GO:0009710":1,"GO:0006666":1,"GO:0002138":1,"GO:0061370":1,"GO:0031427":1,"GO:0042761":1,"GO:0006729":1,"GO:0006703":1,"GO:0008207":1,"GO:0042376":1,"GO:0030148":1,"GO:0042572":1,"GO:0046677":2,"GO:0017000":1,"GO:0006000":1,"GO:0046835":1,"GO:0043456":1,"GO:1904024":1,"GO:0006003":1,"GO:0071279":1,"GO:0006096":2,"GO:0006564":1,"GO:0016311":1,"GO:0060576":1,"GO:0006094":2,"GO:0009410":2,"GO:1902153":1,"GO:0045730":2,"GO:0007420":1,"GO:0045820":1,"GO:0033133":1,"GO:0006914":1,"GO:0010666":1,"GO:0009236":1,"GO:1901525":1,"GO:0007585":1,"GO:0000160":5,"GO:0043709":3,"GO:1902201":3,"GO:1902209":3,"GO:0007049":3,"GO:0086070":1,"GO:1903444":1,"GO:0016477":1,"GO:0007253":1,"GO:0072660":1,"GO:0071642":1,"GO:0050966":1,"GO:0032088":1,"GO:0071651":1,"GO:0097284":1,"GO:1903759":1,"GO:0016049":1,"GO:0097497":1,"GO:0050968":1,"GO:0016567":1,"GO:0043488":1,"GO:2000171":1,"GO:1904357":1,"GO:1904908":1,"GO:0071901":1,"GO:0045083":1,"GO:0010845":1,"GO:0010650":1,"GO:0009408":1,"GO:2000031":1,"GO:0050960":1,"GO:0035556":1,"GO:0010745":1,"GO:1904355":1,"GO:0003213":1,"GO:0070682":1,"GO:0043403":1,"GO:0035994":1,"GO:1903589":1,"GO:0045444":1,"GO:0061408":1,"GO:0002268":1,"GO:0070198":1,"GO:0035508":1,"GO:0050955":1,"GO:0060843":1,"GO:0060743":1,"GO:1900383":1,"GO:0030103":1,"GO:1901594":1,"GO:0070212":1,"GO:0032212":1,"GO:2000340":1,"GO:0044707":1,"GO:0051225":1,"GO:0048265":1,"GO:0016055":1,"GO:0003270":1,"GO:0090501":1,"GO:0033028":1,"GO:0098907":1,"GO:0007205":1,"GO:0000083":1,"GO:0021707":1,"GO:0071446":1,"GO:0045038":1,"GO:1904743":1,"GO:0048549":1,"GO:0046475":1,"GO:0070213":1,"GO:0035544":1,"GO:0033280":1,"GO:0070427":1,"GO:0071260":1,"GO:0051017":1,"GO:0051209":1,"GO:0006397":1,"GO:1900827":1,"GO:2001275":1,"GO:0070431":1,"GO:0009409":1,"GO:0098703":1,"GO:0090162":1,"GO:1901187":1,"GO:0019896":1,"GO:0010573":1,"GO:0032364":1,"GO:0010105":2,"GO:0097167":1,"GO:0043158":1,"GO:0060574":1,"GO:0070932":1,"GO:0032922":1,"GO:0021502":1,"GO:0042173":1,"GO:0006808":1,"GO:0061419":1,"GO:0097411":2,"GO:0030435":1,"GO:1904862":1,"GO:0071973":1,"GO:0006935":2,"GO:0018393":1,"GO:0002248":1,"GO:0001922":1,"GO:0051606":1,"GO:0006351":2,"GO:0080117":2,"GO:0061030":1,"GO:0051541":1,"GO:0051946":1,"GO:0009736":1,"GO:0071386":1,"GO:1903715":1,"GO:0021510":1,"GO:0035335":1,"GO:0002143":1,"GO:0018192":1,"GO:0030855":1,"GO:0070329":1,"GO:0000087":1,"GO:0006071":1,"GO:0006777":1,"GO:0019346":1,"GO:0045454":1,"GO:2000220":1,"GO:0032447":1,"GO:0009691":1,"GO:1901006":1,"GO:0001081":1,"GO:0009718":1,"GO:0006012":1,"GO:0009242":1,"GO:0009699":1,"GO:0006541":1,"GO:0006261":1,"GO:0035690":1,"GO:0017006":1,"GO:0006457":1,"GO:0046777":1,"GO:1903660":1,"GO:0042220":1,"GO:0006006":1,"GO:0007059":1,"GO:1901389":1,"GO:0045793":1,"GO:0018298":1,"GO:0009584":1,"GO:0033160":1,"GO:0009585":1,"GO:0071353":1,"GO:0006265":1,"GO:0070483":1,"GO:1905323":1,"GO:0010510":1,"GO:0001890":1,"GO:0019858":1,"GO:0044206":1,"GO:0002100":1,"GO:0046109":1,"GO:0006147":1,"GO:0009231":1,"GO:0006217":1,"GO:0009972":1,"GO:0006044":2,"GO:0006477":2,"GO:0048702":3,"GO:0018146":2,"GO:0042403":2,"GO:0000103":2,"GO:0015015":2,"GO:0030205":2,"GO:0002002":2,"GO:0030210":2,"GO:0030573":2,"GO:0015012":2,"GO:0006584":2,"GO:0006068":2,"GO:0050427":2,"GO:0006711":2,"GO:0045600":2,"GO:0009812":2,"GO:0006805":2,"GO:0030206":2,"GO:0009060":1,"GO:0016032":1,"GO:1902600":1,"GO:0006627":1,"GO:1901143":1,"GO:0010992":1,"GO:0046718":1,"GO:0044257":1,"GO:0051289":1,"GO:0042447":1,"GO:0006122":1,"GO:0010815":1,"GO:0008286":1,"GO:0008340":1,"GO:0045861":1,"GO:0071432":1,"GO:0051291":1,"GO:0018189":1,"GO:0032461":1,"GO:0048081":1,"GO:0035909":1,"GO:0048208":1,"GO:0090110":1,"GO:0006888":1,"GO:0061156":1,"GO:0003331":1,"GO:0006886":1,"GO:0080119":1,"GO:0045714":1,"GO:0032876":1,"GO:0019886":1,"GO:0021747":1,"GO:1901301":1,"GO:0070278":1,"GO:0035149":1,"GO:0060463":1,"GO:0090178":1,"GO:0016236":1,"GO:2000189":1,"GO:0060982":1,"GO:0003400":1,"GO:0060088":1,"GO:0015986":1,"GO:0099132":1,"GO:0030388":1,"GO:2001059":1,"GO:0019404":1,"GO:0006478":1,"GO:0050665":1,"GO:1902177":1,"GO:0006590":1,"GO:0051591":1,"GO:0010467":1,"GO:0048840":1,"GO:0042554":1,"GO:0015677":1,"GO:0072592":1,"GO:0008365":1,"GO:1904845":1,"GO:0045453":1,"GO:0048855":1,"GO:0003081":1,"GO:0045726":1,"GO:1990451":1,"GO:0009590":1,"GO:0019619":1,"GO:1905012":1,"GO:0046874":1,"GO:1905004":1},"recipe_readded":[]}