{"hash":"886828075230207062","title":"Proteasome-ubiquitin\u2013mediated antigen processing","description":"The cluster centers on proteasome core assembly and ubiquitin-dependent protein degradation, which underpin peptide generation for MHC class I antigen presentation (TAP-dependent). The presence of SCF ubiquitination, deubiquitination, and related immune signaling terms (T cell and Fc receptor pathways) supports a cohesive theme of proteasome- and ubiquitin-mediated antigen processing and immune activation.","confidence":"High","size":8,"edges":5,"triangles":1,"max_degree":2,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_005822365.1","go_terms":["GO:0006355","GO:0006351"]},{"accession":"XP_005835522.1","go_terms":["GO:0006355","GO:0006351"]},{"accession":"XP_005839084.1","go_terms":["GO:0090263","GO:0038061","GO:0033209","GO:0051437","GO:0051436","GO:0061418","GO:0080129","GO:0006521","GO:0002223","GO:0090090","GO:0050852","GO:0031146","GO:0031145","GO:0002862","GO:0010972","GO:0060071","GO:0010499","GO:0016032","GO:0010043","GO:0009651","GO:0043488","GO:0002479","GO:0046686","GO:0010950","GO:0038095","GO:0010363","GO:0016579"]},{"accession":"XP_005833252.1","go_terms":["GO:0007420","GO:0046705","GO:0046939","GO:0015951","GO:0001889","GO:0046041","GO:0046940","GO:0006172","GO:0044209"]},{"accession":"XP_005828207.1","go_terms":["GO:0032922","GO:2000323","GO:0071000","GO:2000850","GO:0019915","GO:0009650","GO:0045475","GO:1902448","GO:0009638","GO:0042332","GO:0050980","GO:0009584","GO:0050958","GO:0048574","GO:0009588","GO:0033762","GO:1902347","GO:0006975","GO:0000719","GO:0042754","GO:0018298","GO:0009785","GO:0009646","GO:0010117","GO:0010343","GO:1901371","GO:1901332","GO:0010617","GO:0010075","GO:1901672","GO:0010244","GO:0045187","GO:2000001","GO:0043153","GO:0010118"]},{"accession":"XP_005833251.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_005828958.1","go_terms":["GO:0090263","GO:0038061","GO:0033209","GO:0051437","GO:0051436","GO:0061418","GO:0080129","GO:0006521","GO:0002223","GO:0090090","GO:0050852","GO:0031146","GO:0031145","GO:0002862","GO:0010972","GO:0060071","GO:0010499","GO:0016032","GO:0010043","GO:0009651","GO:0043488","GO:0002479","GO:0046686","GO:0010950","GO:0038095","GO:0010363","GO:0016579"]},{"accession":"XP_005835494.1","go_terms":["GO:0090263","GO:0038061","GO:0033209","GO:0051437","GO:0051436","GO:0061418","GO:0080129","GO:0006521","GO:0002223","GO:0090090","GO:0050852","GO:0031146","GO:0031145","GO:0002862","GO:0010972","GO:0060071","GO:0010499","GO:0016032","GO:0010043","GO:0009651","GO:0043488","GO:0002479","GO:0046686","GO:0010950","GO:0038095","GO:0010363","GO:0016579"]}],"graph":[["XP_005822365.1","XP_005835522.1",0.96],["XP_005835494.1","XP_005828958.1",0.99],["XP_005835494.1","XP_005839084.1",0.967],["XP_005833251.1","XP_005828207.1",0.602],["XP_005828958.1","XP_005839084.1",0.963]],"all_go_terms":{"GO:0006351":2,"GO:0006355":2,"GO:0016032":3,"GO:0002479":3,"GO:0016579":3,"GO:0080129":3,"GO:0038095":3,"GO:0031146":3,"GO:0090090":3,"GO:0010950":3,"GO:0046686":3,"GO:0050852":3,"GO:0010499":3,"GO:0038061":3,"GO:0043488":3,"GO:0090263":3,"GO:0010363":3,"GO:0061418":3,"GO:0006521":3,"GO:0051437":3,"GO:0060071":3,"GO:0009651":3,"GO:0002862":3,"GO:0002223":3,"GO:0031145":3,"GO:0033209":3,"GO:0051436":3,"GO:0010043":3,"GO:0010972":3,"GO:0007420":1,"GO:0044209":1,"GO:0006172":1,"GO:0015951":1,"GO:0001889":1,"GO:0046041":1,"GO:0046705":1,"GO:0046939":1,"GO:0046940":1,"GO:2000850":1,"GO:0042332":1,"GO:0010244":1,"GO:0071000":1,"GO:0009584":1,"GO:0018298":1,"GO:0050980":1,"GO:0009638":1,"GO:0042754":1,"GO:0045187":1,"GO:0019915":1,"GO:0010343":1,"GO:2000323":1,"GO:0048574":1,"GO:0006975":1,"GO:0050958":1,"GO:1902347":1,"GO:0010617":1,"GO:0010117":1,"GO:2000001":1,"GO:0009646":1,"GO:0009785":1,"GO:0032922":1,"GO:0045475":1,"GO:1901332":1,"GO:1902448":1,"GO:0010075":1,"GO:0000719":1,"GO:1901371":1,"GO:0033762":1,"GO:0009588":1,"GO:0009650":1,"GO:0043153":1,"GO:0010118":1,"GO:1901672":1},"recipe_readded":["XP_005834307.1","XP_005835835.1","XP_005818342.1","XP_005831498.1","XP_005836881.1","XP_005818296.1","XP_005830670.1","XP_005830437.1","XP_005821885.1","XP_005831666.1","XP_005830359.1","XP_005823348.1","XP_005840414.1","XP_005842498.1","XP_005832222.1","XP_005821197.1","XP_005836842.1","XP_005830619.1","XP_005833090.1","XP_005819857.1"]}