{"hash":"1557773516801184910","title":"RNA Modification and Transcription Regulation","description":"These proteins cluster around RNA processing/modification and chromatin-based transcription control: tRNA wobble uridine modification, tRNA methylation, and 7-methylguanosine mRNA capping point to RNA processing; histone methylation and peptidyl-lysine dimethylation link to chromatin regulation; and the negative regulation of transcription by RNA polymerase II ties these processes to transcriptional control. Some terms (antibiotic biosynthesis, tellurium ion response, cobalamin biosynthesis) seem peripheral, but the core signals suggest a shared role in RNA/chromatin\u2013mediated regulation.","confidence":"Medium","size":6,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_005838492.1","go_terms":["GO:0016049","GO:0000122","GO:0009236","GO:0018364","GO:0090398","GO:0043985","GO:0031167","GO:0019919","GO:0046690","GO:0036265","GO:0017000","GO:0006596","GO:0002098","GO:0030488","GO:0000154","GO:0006370","GO:0009877","GO:0018012","GO:0018027","GO:0000183","GO:0018023","GO:0018013"]},{"accession":"XP_005830497.1","go_terms":["GO:2000324","GO:1905213","GO:2001034","GO:0031987","GO:0050728","GO:0006986","GO:0006260","GO:1905205","GO:0000082","GO:0060316","GO:0035562","GO:0022011","GO:2000002","GO:0030846","GO:1903799","GO:0010780","GO:0006196","GO:0046086","GO:0051343","GO:0000903","GO:0031573","GO:0001569","GO:0043029","GO:0016576","GO:0006685","GO:0097552","GO:0030847","GO:0098609","GO:0051037","GO:0060079","GO:0010719","GO:0051531","GO:0051533","GO:0030437","GO:0033173","GO:0014898","GO:0010791","GO:0007498","GO:0021762","GO:0051321","GO:0014883","GO:0005981","GO:0072462","GO:0001946","GO:2001241","GO:1903244","GO:0010288","GO:0070262","GO:0043278","GO:0051315","GO:0007114","GO:0050774","GO:0070940","GO:0061587","GO:0005513","GO:1900486","GO:1901901","GO:0035753","GO:0030324","GO:0034501","GO:0032516","GO:0035690","GO:1902660","GO:1990918","GO:1900490","GO:1903501","GO:0099566","GO:0030182","GO:0048741","GO:0014044","GO:0009245","GO:0042220","GO:0006888","GO:0060487","GO:0036496","GO:0009742","GO:0005977","GO:0005979","GO:0001837","GO:0001915"]},{"accession":"XP_005824608.1","go_terms":["GO:0009236","GO:0017000","GO:0035690","GO:0006656","GO:0019919","GO:0009102","GO:0030488","GO:0016049","GO:0018012","GO:0006744","GO:0010189","GO:0016126","GO:0043985","GO:0070476","GO:0046690","GO:0002098","GO:0000056","GO:0001300","GO:0090398","GO:0030961","GO:0006370","GO:0009877","GO:0019062","GO:0036265","GO:0002128","GO:0000466","GO:0000453","GO:0039654","GO:0039520","GO:0039694","GO:0097309","GO:0000463","GO:0002181","GO:0097310","GO:0031167","GO:0018364","GO:0036068","GO:0018026","GO:0018027","GO:1901052","GO:0000122","GO:0006351","GO:0034970","GO:0006596","GO:0000154","GO:0009452","GO:0070901","GO:0031591","GO:0006364","GO:0002939"]},{"accession":"XP_005828584.1","go_terms":["GO:0000902","GO:0090084","GO:1903382","GO:1900035","GO:0000742","GO:0006880","GO:0016226","GO:1902037","GO:0070880","GO:0006260","GO:0034620","GO:0031204","GO:1903751","GO:0006616","GO:0070389"]},{"accession":"XP_005834615.1","go_terms":["GO:0051726","GO:1902476","GO:0060315","GO:1902000","GO:0010880","GO:0051881","GO:0045669","GO:0070527","GO:0009072","GO:0019852","GO:0009407","GO:0042594","GO:0014810","GO:0060316","GO:0006289","GO:0098869","GO:0010731","GO:0006749","GO:0045454","GO:0071243","GO:2001237","GO:0043508","GO:0033591","GO:0048147","GO:0002182","GO:0032930","GO:0018916","GO:0032869","GO:0006808","GO:0001516","GO:0051771","GO:0035726","GO:0043200","GO:0032355","GO:1901687","GO:0009734","GO:0042178","GO:0040008","GO:0002674","GO:0009636","GO:0043651","GO:0070458","GO:0032691","GO:0070664","GO:2000429","GO:0043124","GO:0007417","GO:1904706","GO:0032720","GO:0010804","GO:0007608","GO:0031100","GO:0071385","GO:2000469","GO:2000255","GO:0045471","GO:0014003","GO:0042994","GO:0071364","GO:0010044","GO:0071638","GO:0035732","GO:0071460","GO:0071672","GO:0070373","GO:0071285"]},{"accession":"XP_005822924.1","go_terms":["GO:0006515"]}],"graph":[["XP_005838492.1","XP_005824608.1",0.963]],"all_go_terms":{"GO:0000122":2,"GO:0017000":2,"GO:0002098":2,"GO:0046690":2,"GO:0000183":1,"GO:0030488":2,"GO:0043985":2,"GO:0018013":1,"GO:0090398":2,"GO:0009236":2,"GO:0006370":2,"GO:0018027":2,"GO:0018364":2,"GO:0031167":2,"GO:0036265":2,"GO:0016049":2,"GO:0000154":2,"GO:0019919":2,"GO:0009877":2,"GO:0018012":2,"GO:0006596":2,"GO:0018023":1,"GO:1900486":1,"GO:0043278":1,"GO:0060316":2,"GO:0010288":1,"GO:0031987":1,"GO:1903244":1,"GO:0005981":1,"GO:0001569":1,"GO:0005977":1,"GO:2000324":1,"GO:0036496":1,"GO:0034501":1,"GO:0021762":1,"GO:0072462":1,"GO:0030324":1,"GO:0001946":1,"GO:1990918":1,"GO:0051531":1,"GO:1901901":1,"GO:0010791":1,"GO:0060079":1,"GO:0014898":1,"GO:0050728":1,"GO:0051343":1,"GO:0031573":1,"GO:0006685":1,"GO:0051533":1,"GO:0014883":1,"GO:0050774":1,"GO:1905205":1,"GO:0042220":1,"GO:0009742":1,"GO:0030437":1,"GO:2000002":1,"GO:0033173":1,"GO:0030182":1,"GO:1900490":1,"GO:0022011":1,"GO:0070262":1,"GO:0048741":1,"GO:0010719":1,"GO:0005513":1,"GO:0035690":2,"GO:0098609":1,"GO:0061587":1,"GO:0006986":1,"GO:0051321":1,"GO:0007114":1,"GO:1902660":1,"GO:0035753":1,"GO:0001837":1,"GO:0000903":1,"GO:0070940":1,"GO:2001241":1,"GO:0032516":1,"GO:0001915":1,"GO:1905213":1,"GO:0006260":2,"GO:0097552":1,"GO:0016576":1,"GO:2001034":1,"GO:0005979":1,"GO:1903799":1,"GO:0010780":1,"GO:1903501":1,"GO:0006196":1,"GO:0009245":1,"GO:0051315":1,"GO:0060487":1,"GO:0035562":1,"GO:0007498":1,"GO:0099566":1,"GO:0043029":1,"GO:0030847":1,"GO:0014044":1,"GO:0046086":1,"GO:0051037":1,"GO:0000082":1,"GO:0006888":1,"GO:0030846":1,"GO:0006744":1,"GO:0010189":1,"GO:0000453":1,"GO:1901052":1,"GO:0031591":1,"GO:0006364":1,"GO:0000056":1,"GO:0019062":1,"GO:0002181":1,"GO:0016126":1,"GO:0000463":1,"GO:0070901":1,"GO:0002128":1,"GO:0030961":1,"GO:0006656":1,"GO:0070476":1,"GO:0000466":1,"GO:0039654":1,"GO:0036068":1,"GO:0001300":1,"GO:0009102":1,"GO:0097309":1,"GO:0009452":1,"GO:0002939":1,"GO:0039520":1,"GO:0039694":1,"GO:0018026":1,"GO:0006351":1,"GO:0097310":1,"GO:0034970":1,"GO:0031204":1,"GO:0070880":1,"GO:0090084":1,"GO:0000902":1,"GO:0016226":1,"GO:1900035":1,"GO:1903751":1,"GO:0000742":1,"GO:1902037":1,"GO:0034620":1,"GO:0006880":1,"GO:0006616":1,"GO:1903382":1,"GO:0070389":1,"GO:0032355":1,"GO:0045454":1,"GO:0070458":1,"GO:0007417":1,"GO:0071638":1,"GO:0071285":1,"GO:0071460":1,"GO:0071243":1,"GO:0070664":1,"GO:0032930":1,"GO:0043651":1,"GO:1904706":1,"GO:0019852":1,"GO:0035726":1,"GO:0014003":1,"GO:0043508":1,"GO:0002182":1,"GO:0002674":1,"GO:0007608":1,"GO:0043124":1,"GO:0045471":1,"GO:0070373":1,"GO:0009072":1,"GO:2000255":1,"GO:0033591":1,"GO:1902000":1,"GO:0070527":1,"GO:0098869":1,"GO:0051881":1,"GO:0042994":1,"GO:0071385":1,"GO:0045669":1,"GO:0051726":1,"GO:2000429":1,"GO:0071364":1,"GO:0071672":1,"GO:0031100":1,"GO:0060315":1,"GO:0014810":1,"GO:0040008":1,"GO:0032691":1,"GO:2000469":1,"GO:0043200":1,"GO:0035732":1,"GO:1902476":1,"GO:0018916":1,"GO:0042594":1,"GO:0010731":1,"GO:0048147":1,"GO:0010044":1,"GO:1901687":1,"GO:0006808":1,"GO:0042178":1,"GO:0009407":1,"GO:0006749":1,"GO:0010804":1,"GO:0001516":1,"GO:0051771":1,"GO:0009636":1,"GO:0010880":1,"GO:0006289":1,"GO:0009734":1,"GO:0032720":1,"GO:2001237":1,"GO:0032869":1,"GO:0006515":1},"recipe_readded":["XP_005825542.1","XP_005841143.1","XP_005840089.1","XP_005826620.1","XP_005818205.1","XP_005819051.1","XP_005841774.1","XP_005820440.1","XP_005839636.1","XP_005839034.1","XP_005834685.1","XP_005833969.1","XP_005832529.1","XP_005840248.1","XP_005826547.1","XP_005833209.1","XP_005838870.1","XP_005840865.1","XP_005826345.1","XP_005826042.1"]}