{"hash":"669654264923567143","title":"DNA damage response and transcriptional regulation","description":"The cluster centers on transcription (DNA-templated), DNA repair, and RNA turnover (deadenylation-dependent decapping), plus nucleotide metabolism shifts (adenosine-related catabolic processes) and epigenetic regulation (peptidyl-lysine acetylation). The presence of a p53-mediated apoptotic pathway suggests stress-induced cell fate decisions, while lipid catabolism and calcium signaling indicate broader metabolic and signaling context. Overall, the group seems linked to genome maintenance, transcription control, and apoptosis under stress.","confidence":"Medium","size":11,"edges":9,"triangles":1,"max_degree":3,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_006676319.1","go_terms":["GO:0000160","GO:0006355","GO:0060574","GO:0032922","GO:2000323","GO:1904017","GO:0060713","GO:0017006","GO:0061414","GO:2001038","GO:2001016","GO:0051775","GO:0061419","GO:0060137","GO:0051541","GO:0010161","GO:2000074","GO:0090403","GO:0043619","GO:0097411","GO:0001922","GO:0009584","GO:0009585","GO:0021502","GO:0018298","GO:0042753","GO:0046886","GO:0001892","GO:0042634","GO:0010201","GO:0010203","GO:0061415","GO:0009410","GO:0006351","GO:1904322","GO:0052565","GO:0009785","GO:0007168","GO:0035556","GO:0070483","GO:0006182","GO:1900194","GO:0030828","GO:0001973","GO:0071880","GO:0006171","GO:0018106","GO:0006972","GO:0016358","GO:0003382","GO:0035023","GO:0023014","GO:0072659","GO:0090103","GO:0016601","GO:0043652","GO:0051932","GO:0002551","GO:0021799","GO:0060999","GO:0010762","GO:0048532","GO:0021831","GO:1902303","GO:0006813","GO:1904948","GO:0002093","GO:0014041","GO:0021894","GO:0010362","GO:0045453","GO:0043552","GO:0048873","GO:0097178","GO:0048813"]},{"accession":"XP_006682342.1","go_terms":["GO:0050850","GO:0006915","GO:0006281","GO:0015967","GO:0009154","GO:0044240","GO:0072332","GO:0006694","GO:2000757","GO:0006154","GO:0006351","GO:0031086","GO:0090503","GO:0000290","GO:0000288","GO:0036245","GO:0045292","GO:1901919","GO:0043928"]},{"accession":"XP_006679950.1","go_terms":["GO:0042732","GO:0042355","GO:0019569","GO:0019521","GO:0005998","GO:0019563","GO:0019640","GO:0046835","GO:0046167","GO:0035963","GO:0019301","GO:0009372"]},{"accession":"XP_006681482.1","go_terms":["GO:0050850","GO:0006915","GO:0006281","GO:0015967","GO:0009154","GO:0044240","GO:0072332","GO:0006694","GO:2000757","GO:0006154","GO:0006351","GO:0031086","GO:0090503","GO:0000290","GO:0000288","GO:0036245","GO:0045292","GO:1901919","GO:0043928"]},{"accession":"XP_006678902.1","go_terms":["GO:0032436","GO:0001701","GO:0048142","GO:0043248","GO:0007127","GO:0075525","GO:0000122","GO:0008283","GO:0002188","GO:0035914","GO:1902416","GO:0071033","GO:0006283","GO:0030182","GO:0070196","GO:0000338","GO:0075522","GO:0006446","GO:0034260","GO:0070321","GO:0010972","GO:0048863","GO:0001732","GO:0001731","GO:0048140","GO:0036099","GO:0090054","GO:0090052","GO:0000715","GO:0000973","GO:0006511"]},{"accession":"XP_006676908.1","go_terms":["GO:0007494","GO:0044344","GO:0001889","GO:0042594","GO:0045984","GO:0000105","GO:0014075","GO:0043200","GO:0032094","GO:0071377","GO:0006207","GO:0000162","GO:0006541","GO:0006526","GO:0071548","GO:0006177","GO:0070365","GO:0008153","GO:0055081","GO:0044210","GO:1903718","GO:0071320","GO:0071400","GO:0044205","GO:0070409","GO:0060416","GO:0019240","GO:0046900","GO:0045471","GO:0006508","GO:0010043","GO:0032868"]},{"accession":"XP_006678422.1","go_terms":["GO:0032026","GO:1903251","GO:0000320","GO:0007595","GO:0000082","GO:0019085","GO:0019086","GO:0060153","GO:0033197","GO:0051301","GO:0000411","GO:0010165","GO:0035186","GO:0000122","GO:0007129","GO:0000086","GO:0030857","GO:0071157","GO:0044828","GO:1990069","GO:0033601","GO:0044321","GO:2001165","GO:0046626","GO:1905866","GO:0060070","GO:0010673","GO:0033598","GO:0033327","GO:0060749","GO:0010389","GO:0030968","GO:0097421","GO:0045737","GO:0006351","GO:2000775","GO:0010696"]},{"accession":"XP_006676714.1","go_terms":["GO:0008285","GO:0070544","GO:0031146","GO:0046785","GO:0006516","GO:0007057","GO:0021678","GO:0021993","GO:0051436","GO:0001556","GO:0060386","GO:0031571","GO:0071406","GO:1902916","GO:0071276","GO:0030174","GO:0042752","GO:1903378","GO:0042787","GO:0046685","GO:0000083","GO:0000209"]},{"accession":"XP_006677372.1","go_terms":["GO:0046835","GO:0061621","GO:0005980","GO:0006002","GO:0093001"]},{"accession":"XP_006680236.1","go_terms":["GO:0071244","GO:0015976","GO:2000122"]},{"accession":"XP_006682526.1","go_terms":["GO:0006360","GO:0070816","GO:0006289","GO:0032436","GO:0070911","GO:0034126","GO:0090204","GO:0010286","GO:1901896","GO:0071276","GO:0043392","GO:0060334","GO:0051572","GO:0016925","GO:0043433","GO:0035186","GO:0086004","GO:0030578","GO:1902260","GO:0045944","GO:0045759"]}],"graph":[["XP_006676714.1","XP_006681482.1",0.961],["XP_006676714.1","XP_006682342.1",0.861],["XP_006681482.1","XP_006676319.1",0.507],["XP_006681482.1","XP_006678422.1",0.762],["XP_006680236.1","XP_006676908.1",0.934],["XP_006680236.1","XP_006679950.1",0.927],["XP_006676319.1","XP_006682342.1",0.825],["XP_006676908.1","XP_006677372.1",0.974],["XP_006676908.1","XP_006679950.1",0.915]],"all_go_terms":{"GO:0000160":1,"GO:0051775":1,"GO:0001892":1,"GO:0061415":1,"GO:0048873":1,"GO:0060999":1,"GO:0006171":1,"GO:0021502":1,"GO:0018298":1,"GO:0018106":1,"GO:0001973":1,"GO:0090403":1,"GO:0072659":1,"GO:0035556":1,"GO:0090103":1,"GO:0043619":1,"GO:0035023":1,"GO:0097411":1,"GO:0071880":1,"GO:0060137":1,"GO:0006813":1,"GO:0048813":1,"GO:0021799":1,"GO:0010201":1,"GO:0016358":1,"GO:0010362":1,"GO:0032922":1,"GO:0009584":1,"GO:0060713":1,"GO:2001038":1,"GO:1904948":1,"GO:0030828":1,"GO:2000074":1,"GO:0006355":1,"GO:0043652":1,"GO:0006351":4,"GO:0006972":1,"GO:0048532":1,"GO:0043552":1,"GO:0070483":1,"GO:0051932":1,"GO:0016601":1,"GO:0007168":1,"GO:0060574":1,"GO:0051541":1,"GO:0042634":1,"GO:0017006":1,"GO:0010762":1,"GO:0045453":1,"GO:2000323":1,"GO:0009785":1,"GO:0009410":1,"GO:0097178":1,"GO:1904322":1,"GO:1902303":1,"GO:0010161":1,"GO:0002551":1,"GO:0046886":1,"GO:0023014":1,"GO:0061419":1,"GO:1900194":1,"GO:0042753":1,"GO:0003382":1,"GO:0061414":1,"GO:0052565":1,"GO:0021894":1,"GO:0021831":1,"GO:0010203":1,"GO:0009585":1,"GO:0002093":1,"GO:0006182":1,"GO:2001016":1,"GO:1904017":1,"GO:0014041":1,"GO:0001922":1,"GO:2000757":2,"GO:0000290":2,"GO:0006281":2,"GO:0006154":2,"GO:0090503":2,"GO:0015967":2,"GO:0072332":2,"GO:0044240":2,"GO:0050850":2,"GO:0043928":2,"GO:0031086":2,"GO:0009154":2,"GO:1901919":2,"GO:0045292":2,"GO:0006694":2,"GO:0036245":2,"GO:0006915":2,"GO:0000288":2,"GO:0005998":1,"GO:0046835":2,"GO:0019301":1,"GO:0019640":1,"GO:0009372":1,"GO:0019521":1,"GO:0035963":1,"GO:0042732":1,"GO:0042355":1,"GO:0019569":1,"GO:0019563":1,"GO:0046167":1,"GO:0070321":1,"GO:0000715":1,"GO:0075522":1,"GO:0032436":2,"GO:0006283":1,"GO:0001701":1,"GO:0000338":1,"GO:0010972":1,"GO:0006446":1,"GO:0048863":1,"GO:0001732":1,"GO:0036099":1,"GO:0035914":1,"GO:0043248":1,"GO:0071033":1,"GO:0048142":1,"GO:0030182":1,"GO:0007127":1,"GO:0090052":1,"GO:0000973":1,"GO:0090054":1,"GO:0008283":1,"GO:0001731":1,"GO:0075525":1,"GO:0048140":1,"GO:0070196":1,"GO:0006511":1,"GO:0034260":1,"GO:1902416":1,"GO:0000122":2,"GO:0002188":1,"GO:0044205":1,"GO:0007494":1,"GO:0006508":1,"GO:0071400":1,"GO:0044210":1,"GO:0000162":1,"GO:0044344":1,"GO:0060416":1,"GO:0019240":1,"GO:0070365":1,"GO:1903718":1,"GO:0055081":1,"GO:0008153":1,"GO:0070409":1,"GO:0071548":1,"GO:0071377":1,"GO:0006177":1,"GO:0006526":1,"GO:0010043":1,"GO:0071320":1,"GO:0045471":1,"GO:0043200":1,"GO:0032094":1,"GO:0042594":1,"GO:0006207":1,"GO:0006541":1,"GO:0001889":1,"GO:0014075":1,"GO:0046900":1,"GO:0032868":1,"GO:0045984":1,"GO:0000105":1,"GO:0060070":1,"GO:0071157":1,"GO:0044828":1,"GO:0032026":1,"GO:0046626":1,"GO:0060153":1,"GO:1990069":1,"GO:2001165":1,"GO:0030857":1,"GO:0033197":1,"GO:0097421":1,"GO:0000086":1,"GO:2000775":1,"GO:0007129":1,"GO:0010696":1,"GO:1905866":1,"GO:0010389":1,"GO:0000320":1,"GO:0007595":1,"GO:0033601":1,"GO:0019085":1,"GO:0051301":1,"GO:0030968":1,"GO:1903251":1,"GO:0010673":1,"GO:0000082":1,"GO:0010165":1,"GO:0045737":1,"GO:0035186":2,"GO:0044321":1,"GO:0033598":1,"GO:0060749":1,"GO:0000411":1,"GO:0033327":1,"GO:0019086":1,"GO:0031571":1,"GO:0046785":1,"GO:0021993":1,"GO:0070544":1,"GO:0051436":1,"GO:0071406":1,"GO:0031146":1,"GO:1903378":1,"GO:0042787":1,"GO:0000209":1,"GO:0000083":1,"GO:0030174":1,"GO:0060386":1,"GO:0007057":1,"GO:0008285":1,"GO:1902916":1,"GO:0046685":1,"GO:0001556":1,"GO:0071276":2,"GO:0042752":1,"GO:0021678":1,"GO:0006516":1,"GO:0005980":1,"GO:0093001":1,"GO:0061621":1,"GO:0006002":1,"GO:0015976":1,"GO:2000122":1,"GO:0071244":1,"GO:0060334":1,"GO:0016925":1,"GO:0043392":1,"GO:0045759":1,"GO:1902260":1,"GO:0006289":1,"GO:0070911":1,"GO:0051572":1,"GO:0045944":1,"GO:0043433":1,"GO:0090204":1,"GO:0034126":1,"GO:0010286":1,"GO:1901896":1,"GO:0030578":1,"GO:0070816":1,"GO:0086004":1,"GO:0006360":1},"recipe_readded":["XP_006677786.1","XP_006680978.1","XP_006675129.1","XP_006678757.1","XP_006681339.1","XP_006680587.1","XP_006679179.1","XP_006675360.1","XP_006682527.1","XP_006680757.1","XP_006679792.1","XP_006677098.1","XP_006679800.1","XP_006678839.1","XP_006680602.1","XP_006681580.1","XP_006679982.1","XP_006675145.1","XP_006677785.1","XP_006677526.1"]}