{"hash":"1822505663199797578","title":"Transcription Regulation and RNA Processing","description":"The cluster centers on transcription-related processes\u2014DNA-templated transcription, transcription elongation by RNA Pol II and I, and transcription antitermination\u2014together with RNA processing activities such as mRNA capping, RNA guanine-N7 methylation, and spliceosomal snRNP assembly. These cohesive terms suggest a group of proteins coordinating transcription with RNA maturation, with a few stress/DNA damage response terms that may be contextual rather than core. Confidence: High","confidence":"","size":15,"edges":11,"triangles":7,"max_degree":4,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_959276.3","go_terms":["GO:2001208","GO:2001209","GO:1900364","GO:0008298","GO:0006351","GO:0090262","GO:0006414","GO:0032968","GO:2000232","GO:1902164","GO:1902167","GO:0032784","GO:0006977","GO:1904803","GO:0042273","GO:0031564","GO:0071480","GO:0006354","GO:0006353","GO:0045727","GO:0006412","GO:0032774","GO:0006370"]},{"accession":"XP_961827.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_962668.1","go_terms":["GO:0006297","GO:1904161","GO:1903460","GO:0006260","GO:0043150","GO:1903459"]},{"accession":"XP_962920.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_963295.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_963855.1","go_terms":["GO:0018230","GO:0048733","GO:0042144"]},{"accession":"XP_964010.1","go_terms":["GO:0072553"]},{"accession":"XP_955983.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_958139.1","go_terms":["GO:1990539","GO:0044381","GO:0052106","GO:0060731","GO:0005989","GO:0071332","GO:1904728","GO:0015753","GO:0042908","GO:0015771","GO:0006817","GO:0097080","GO:0006970","GO:0042149","GO:0043252","GO:0019852","GO:0070715","GO:0070837","GO:1904659","GO:0015747","GO:0006855","GO:0015739","GO:0015707","GO:0015706","GO:0071805","GO:0098700","GO:0035435","GO:1900754","GO:0042128","GO:0035725","GO:0015751","GO:0006004","GO:0042891","GO:0035461","GO:0015757"]},{"accession":"XP_001728424.2","go_terms":["GO:0000387","GO:0045585","GO:0045292","GO:0000481","GO:0010588"]},{"accession":"XP_960790.1","go_terms":["GO:0009236","GO:0017000","GO:0035690","GO:0006656","GO:0019919","GO:0009102","GO:0030488","GO:0016049","GO:0018012","GO:0006744","GO:0010189","GO:0016126","GO:0043985","GO:0070476","GO:0046690","GO:0002098","GO:0000056","GO:0001300","GO:0090398","GO:0030961","GO:0006370","GO:0009877","GO:0006479","GO:1903108","GO:0000462","GO:0031167","GO:0006391","GO:0036265","GO:0006596","GO:0000154"]},{"accession":"XP_961445.1","go_terms":["GO:0019062","GO:0036265","GO:0002128","GO:0000466","GO:0000453","GO:0039654","GO:0039520","GO:0039694","GO:0097309","GO:0006370","GO:0000463","GO:0002181","GO:0097310"]},{"accession":"XP_961530.3","go_terms":["GO:0034724","GO:0030574","GO:0034396","GO:0035551","GO:0006338","GO:0006334","GO:0006261","GO:0006368","GO:0032968","GO:0045899","GO:0030466","GO:0006351","GO:0006281","GO:1990141","GO:0006335","GO:0070869"]},{"accession":"XP_957303.1","go_terms":["GO:0000387","GO:0000398","GO:0007049","GO:2000825"]},{"accession":"XP_959523.1","go_terms":["GO:0010591","GO:1904719","GO:0030036","GO:0098976","GO:2001032","GO:0071318","GO:0031915","GO:0071494","GO:0071456","GO:0003281","GO:0048096","GO:0006977","GO:0003283","GO:0003139","GO:0003181","GO:0071301","GO:0003203","GO:0000122","GO:0006337","GO:0043044","GO:0003219","GO:0045023","GO:0016567","GO:0043066","GO:1904404","GO:0003407","GO:0007089","GO:0071157","GO:0043518"]}],"graph":[["XP_955983.1","XP_958139.1",0.675],["XP_958139.1","XP_963295.2",0.516],["XP_960790.1","XP_001728424.2",0.816],["XP_960790.1","XP_961445.1",0.764],["XP_960790.1","XP_961530.3",0.639],["XP_961445.1","XP_001728424.2",0.643],["XP_961445.1","XP_957303.1",0.706],["XP_961445.1","XP_961530.3",0.725],["XP_961530.3","XP_001728424.2",0.741],["XP_961530.3","XP_957303.1",0.77],["XP_957303.1","XP_001728424.2",0.679]],"all_go_terms":{"GO:1902164":1,"GO:2001209":1,"GO:0031564":1,"GO:1904803":1,"GO:2001208":1,"GO:0032774":1,"GO:0032968":2,"GO:0032784":1,"GO:1900364":1,"GO:0006370":3,"GO:0006414":1,"GO:0008298":1,"GO:0071480":1,"GO:0006412":1,"GO:0006351":2,"GO:0006354":1,"GO:0042273":1,"GO:2000232":1,"GO:1902167":1,"GO:0090262":1,"GO:0006353":1,"GO:0006977":2,"GO:0045727":1,"GO:1903460":1,"GO:0006297":1,"GO:0006260":1,"GO:1904161":1,"GO:0043150":1,"GO:1903459":1,"GO:0048733":1,"GO:0042144":1,"GO:0018230":1,"GO:0072553":1,"GO:0015707":1,"GO:0015753":1,"GO:1990539":1,"GO:0035461":1,"GO:0042908":1,"GO:1904728":1,"GO:0042128":1,"GO:0052106":1,"GO:0006970":1,"GO:0060731":1,"GO:0042891":1,"GO:0097080":1,"GO:0071805":1,"GO:0044381":1,"GO:0006004":1,"GO:0035435":1,"GO:0015771":1,"GO:0015747":1,"GO:0015751":1,"GO:1904659":1,"GO:0015706":1,"GO:0042149":1,"GO:0006855":1,"GO:0015757":1,"GO:0043252":1,"GO:0035725":1,"GO:0098700":1,"GO:0070715":1,"GO:0006817":1,"GO:0070837":1,"GO:0071332":1,"GO:0005989":1,"GO:1900754":1,"GO:0015739":1,"GO:0019852":1,"GO:0010588":1,"GO:0045292":1,"GO:0000387":2,"GO:0000481":1,"GO:0045585":1,"GO:0018012":1,"GO:0070476":1,"GO:0006391":1,"GO:0036265":2,"GO:0009236":1,"GO:0001300":1,"GO:0019919":1,"GO:0006744":1,"GO:1903108":1,"GO:0043985":1,"GO:0046690":1,"GO:0006596":1,"GO:0002098":1,"GO:0016126":1,"GO:0010189":1,"GO:0090398":1,"GO:0000462":1,"GO:0030488":1,"GO:0035690":1,"GO:0030961":1,"GO:0000154":1,"GO:0031167":1,"GO:0016049":1,"GO:0006656":1,"GO:0017000":1,"GO:0009877":1,"GO:0006479":1,"GO:0000056":1,"GO:0009102":1,"GO:0000466":1,"GO:0039654":1,"GO:0000453":1,"GO:0002128":1,"GO:0002181":1,"GO:0097310":1,"GO:0097309":1,"GO:0039694":1,"GO:0019062":1,"GO:0039520":1,"GO:0000463":1,"GO:0070869":1,"GO:0034724":1,"GO:0006261":1,"GO:0045899":1,"GO:1990141":1,"GO:0006338":1,"GO:0030574":1,"GO:0035551":1,"GO:0006335":1,"GO:0034396":1,"GO:0030466":1,"GO:0006334":1,"GO:0006281":1,"GO:0006368":1,"GO:0000398":1,"GO:2000825":1,"GO:0007049":1,"GO:1904719":1,"GO:0048096":1,"GO:0071318":1,"GO:0003219":1,"GO:0098976":1,"GO:0031915":1,"GO:0003281":1,"GO:0071157":1,"GO:1904404":1,"GO:0045023":1,"GO:2001032":1,"GO:0003203":1,"GO:0043518":1,"GO:0003139":1,"GO:0043066":1,"GO:0016567":1,"GO:0007089":1,"GO:0030036":1,"GO:0043044":1,"GO:0071301":1,"GO:0010591":1,"GO:0000122":1,"GO:0003283":1,"GO:0003407":1,"GO:0071494":1,"GO:0071456":1,"GO:0003181":1,"GO:0006337":1},"recipe_readded":["XP_957318.2","XP_011394131.1","XP_958901.2","XP_962495.3","XP_955818.1","XP_011393540.1","XP_961863.2","XP_001728337.2","XP_965740.1","XP_960559.2","XP_959210.1","XP_961984.1","XP_959265.1","XP_956683.1","XP_965585.2","XP_959151.2","XP_011393264.1","XP_956365.2","XP_960821.1","XP_011393259.1"]}