{"hash":"1691657774798111399","title":"Nuclear gene expression and ubiquitin regulation","description":"This cluster concentrates on nuclear processes that control gene expression\u2014transcription, splicing, and chromatin assembly\u2014and on ubiquitin-related regulation of protein turnover, including polyubiquitination and ERAD pathways. The presence of translation initiation terms may reflect coordination between nuclear transcript processing and cytoplasmic translation, particularly under heat-stress conditions affecting mRNA export. Overall, these proteins appear to govern gene expression and proteostasis.","confidence":"Medium","size":27,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_001429380.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001443876.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001447979.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001448258.1","go_terms":["GO:0009718","GO:0032435","GO:1903415","GO:1901525","GO:1901098"]},{"accession":"XP_001451327.1","go_terms":["GO:0008626","GO:0071361","GO:0000209","GO:0006513","GO:0051865","GO:0030433","GO:0003222","GO:0030579","GO:0090035","GO:0010200","GO:0090359","GO:0031943","GO:0070534"]},{"accession":"XP_001451473.1","go_terms":["GO:0000082","GO:0043666"]},{"accession":"XP_001461183.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001426451.1","go_terms":["GO:0070197","GO:0034398","GO:0031022","GO:0090286","GO:0090292","GO:0046850","GO:0072766","GO:0045669","GO:0007129","GO:0006998","GO:0007283","GO:0032967","GO:0021817","GO:0051642"]},{"accession":"XP_001438140.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001425132.1","go_terms":["GO:2001235","GO:0021510","GO:0008584","GO:0001501","GO:0035264","GO:0051568","GO:0051567","GO:0038202","GO:0040020","GO:0007369","GO:0000920","GO:0010255","GO:0060528","GO:0032933","GO:0043966","GO:2000728","GO:0000462","GO:0000463","GO:0000466","GO:0030042","GO:0070734","GO:0050731","GO:0001845","GO:0000398","GO:0007200","GO:0060416","GO:0034314","GO:0036265","GO:0090344","GO:0031954","GO:0048568","GO:0034316","GO:0035246","GO:0061641","GO:0000472","GO:0031175","GO:0007064","GO:0060770","GO:0002534","GO:0006888","GO:0043547","GO:2000011","GO:0042254","GO:0016575","GO:1903461","GO:0071456","GO:0061099","GO:0001843","GO:0048705","GO:0060271","GO:0006625","GO:2001162","GO:0070208","GO:0071276","GO:0010659","GO:0090114","GO:0006890","GO:0000132","GO:0007420","GO:0031081","GO:0043982","GO:0001403","GO:0043981","GO:0061087","GO:0006351","GO:0000480","GO:1901976","GO:0034729","GO:0031930","GO:1904263","GO:0060041","GO:0031497","GO:2001125","GO:1902525","GO:0000209","GO:0042273","GO:0006349","GO:0000724","GO:0002188","GO:0043984","GO:2000601","GO:0008283","GO:0051013","GO:0070306","GO:0031146","GO:0031145","GO:0007338","GO:0045143","GO:1902510","GO:0043473","GO:0007568","GO:0050679","GO:0070059","GO:0061586","GO:0071560","GO:0070317","GO:0090307","GO:0060733","GO:0071902","GO:0072520","GO:0000348","GO:0050909","GO:0007275","GO:0001649","GO:0000747","GO:0070262","GO:0051260","GO:0051301","GO:1904668","GO:0043588","GO:0000278","GO:0034349","GO:0007584","GO:0051402","GO:0030433","GO:0000447","GO:0001731","GO:0032995","GO:0000070","GO:0072432","GO:0051028","GO:0035948","GO:0007018","GO:0050830","GO:0030900"]},{"accession":"XP_001433862.1","go_terms":["GO:0055059","GO:0006470","GO:2001034","GO:0072462","GO:1904290","GO:1902660","GO:0045722"]},{"accession":"XP_001434747.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001443109.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001429567.1","go_terms":["GO:2001235","GO:0021510","GO:0008584","GO:0001501","GO:0035264","GO:0051568","GO:0051567","GO:0038202","GO:0040020","GO:0007369","GO:0000920","GO:0010255","GO:0060528","GO:0032933","GO:0043966","GO:2000728","GO:0000462","GO:0000463","GO:0000466","GO:0030042","GO:0070734","GO:0050731","GO:0001845","GO:0000398","GO:0007200","GO:0060416","GO:0034314","GO:0036265","GO:0090344","GO:0031954","GO:0048568","GO:0034316","GO:0035246","GO:0061641","GO:0000472","GO:0031175","GO:0007064","GO:0060770","GO:0002534","GO:0006888","GO:0043547","GO:2000011","GO:0042254","GO:0016575","GO:1903461","GO:0071456","GO:0061099","GO:0001843","GO:0048705","GO:0060271","GO:0006625","GO:2001162","GO:0070208","GO:0071276","GO:0010659","GO:0090114","GO:0006890","GO:0000132","GO:0007420","GO:0031081","GO:0043982","GO:0001403","GO:0043981","GO:0061087","GO:0006351","GO:0000480","GO:1901976","GO:0034729","GO:0031930","GO:1904263","GO:0060041","GO:0031497","GO:2001125","GO:1902525","GO:0000209","GO:0042273","GO:0006349","GO:0000724","GO:0002188","GO:0043984","GO:2000601","GO:0008283","GO:0051013","GO:0070306","GO:0031146","GO:0031145","GO:0007338","GO:0045143","GO:1902510","GO:0043473","GO:0007568","GO:0050679","GO:0070059","GO:0061586","GO:0071560","GO:0070317","GO:0090307","GO:0060733","GO:0071902","GO:0072520","GO:0000348","GO:0050909","GO:0007275","GO:0001649","GO:0000747","GO:0070262","GO:0051260","GO:0051301","GO:1904668","GO:0043588","GO:0000278","GO:0034349","GO:0007584","GO:0051402","GO:0030433","GO:0000447","GO:0001731","GO:0032995","GO:0000070","GO:0072432","GO:0051028","GO:0035948","GO:0007018","GO:0050830","GO:0030900","GO:0006654","GO:0036089","GO:0051044","GO:0031139","GO:1990126","GO:0006907","GO:0008333","GO:0060348","GO:0061512","GO:1990502","GO:1990854","GO:0071800","GO:0000902","GO:0071539","GO:0010252","GO:1903595","GO:2000769","GO:0034498","GO:0032258","GO:0034499","GO:2000642","GO:1904179","GO:0048310","GO:0060378","GO:1904888","GO:0001654","GO:0000281","GO:0072673","GO:0048015","GO:0045022","GO:0022617","GO:0002051","GO:0097320","GO:0070676","GO:0032120","GO:0032005","GO:0032534","GO:0030157","GO:1905705","GO:1902426","GO:0035185","GO:0070979","GO:0046784","GO:0032466","GO:0008284","GO:0035721","GO:0051016","GO:0051441","GO:0050773","GO:2000060","GO:0010697","GO:0031915"]},{"accession":"XP_001430522.1","go_terms":["GO:1990180","GO:0006378","GO:0001680","GO:0042245"]},{"accession":"XP_001432031.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001437432.1","go_terms":["GO:0010452","GO:0018027","GO:0006469","GO:0033138","GO:0045184","GO:1900037","GO:0014904","GO:0035914","GO:0043516","GO:1903715","GO:0007507","GO:0071549","GO:0000122","GO:1901532","GO:0036158","GO:0018026","GO:1902035","GO:0006511","GO:0045944","GO:0006351","GO:0060575","GO:0048642","GO:0016579","GO:0006334"]},{"accession":"XP_001437457.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001438909.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001440705.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001442414.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001445041.1","go_terms":["GO:0042391","GO:0098719","GO:0046007","GO:0009454","GO:0007608","GO:0045013","GO:0071805","GO:0045762","GO:0002027","GO:0097338","GO:0097332","GO:0060038","GO:2000480","GO:0045214","GO:0046580","GO:0007264","GO:0034638","GO:0051447","GO:0071321","GO:0071320","GO:0097271","GO:0046827","GO:0006351","GO:0010754"]},{"accession":"XP_001454766.1","go_terms":["GO:0035390","GO:0043044","GO:0000183","GO:0035066","GO:1903770","GO:1901347","GO:1901348","GO:0061820","GO:1904792","GO:0010338","GO:0009737","GO:0009736","GO:0009753","GO:1904911","GO:0009739","GO:0080113","GO:0010082","GO:1901430","GO:0070933","GO:1904850","GO:1905839","GO:0010520","GO:0031848","GO:1905615","GO:1900386","GO:1905778","GO:0009301","GO:0035522","GO:0009751","GO:0072362","GO:0031627","GO:0006970","GO:0006334","GO:1903086","GO:1900056","GO:1900033","GO:0009723","GO:0016032","GO:0030154","GO:0010380","GO:1990414","GO:0071919"]},{"accession":"XP_001455247.1","go_terms":["GO:0031118","GO:0040008","GO:0031120","GO:0032790","GO:0001731","GO:0002188","GO:1990481","GO:0090669","GO:0000495","GO:0006400","GO:0055129","GO:0002192","GO:0007049"]},{"accession":"XP_001460426.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001423660.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001424788.1","go_terms":[]}],"graph":[["XP_001425132.1","XP_001454766.1",0.638]],"all_go_terms":{"GO:0032435":1,"GO:0009718":1,"GO:1901098":1,"GO:1901525":1,"GO:1903415":1,"GO:0090035":1,"GO:0008626":1,"GO:0051865":1,"GO:0030579":1,"GO:0031943":1,"GO:0003222":1,"GO:0030433":3,"GO:0090359":1,"GO:0000209":3,"GO:0071361":1,"GO:0006513":1,"GO:0010200":1,"GO:0070534":1,"GO:0043666":1,"GO:0000082":1,"GO:0070197":1,"GO:0072766":1,"GO:0006998":1,"GO:0031022":1,"GO:0045669":1,"GO:0021817":1,"GO:0046850":1,"GO:0090292":1,"GO:0007283":1,"GO:0032967":1,"GO:0007129":1,"GO:0034398":1,"GO:0051642":1,"GO:0090286":1,"GO:2000728":2,"GO:1904668":2,"GO:0000398":2,"GO:0061641":2,"GO:0002534":2,"GO:1901976":2,"GO:0034349":2,"GO:0007200":2,"GO:0007420":2,"GO:0000466":2,"GO:2000601":2,"GO:0016575":2,"GO:0030042":2,"GO:0031930":2,"GO:0051260":2,"GO:0031145":2,"GO:0070734":2,"GO:0071456":2,"GO:0000070":2,"GO:0051028":2,"GO:0035948":2,"GO:0051402":2,"GO:0001845":2,"GO:0010659":2,"GO:0021510":2,"GO:0060770":2,"GO:0031497":2,"GO:2001162":2,"GO:0000724":2,"GO:0001843":2,"GO:0050830":2,"GO:0007369":2,"GO:0006890":2,"GO:0090344":2,"GO:0043984":2,"GO:1902510":2,"GO:0006888":2,"GO:0006625":2,"GO:1903461":2,"GO:0070262":2,"GO:0032933":2,"GO:0071276":2,"GO:0000348":2,"GO:0007064":2,"GO:0050909":2,"GO:2001235":2,"GO:0071902":2,"GO:0051301":2,"GO:0070208":2,"GO:0008283":2,"GO:0051568":2,"GO:0043547":2,"GO:0070059":2,"GO:0060041":2,"GO:0048705":2,"GO:0090114":2,"GO:2001125":2,"GO:0031175":2,"GO:0030900":2,"GO:0007338":2,"GO:0000132":2,"GO:0043588":2,"GO:0000463":2,"GO:0061586":2,"GO:1902525":2,"GO:0060528":2,"GO:0034729":2,"GO:0000747":2,"GO:0000472":2,"GO:0034316":2,"GO:0072520":2,"GO:0007568":2,"GO:0060733":2,"GO:0031081":2,"GO:0060271":2,"GO:0043982":2,"GO:0060416":2,"GO:0040020":2,"GO:0042273":2,"GO:2000011":2,"GO:0071560":2,"GO:0035264":2,"GO:0031146":2,"GO:0010255":2,"GO:0072432":2,"GO:0043473":2,"GO:0061087":2,"GO:0036265":2,"GO:0050679":2,"GO:1904263":2,"GO:0090307":2,"GO:0001731":3,"GO:0001403":2,"GO:0006351":4,"GO:0051013":2,"GO:0061099":2,"GO:0070306":2,"GO:0008584":2,"GO:0032995":2,"GO:0000278":2,"GO:0006349":2,"GO:0038202":2,"GO:0000447":2,"GO:0000920":2,"GO:0051567":2,"GO:0035246":2,"GO:0007584":2,"GO:0034314":2,"GO:0031954":2,"GO:0045143":2,"GO:0007018":2,"GO:0043966":2,"GO:0050731":2,"GO:0000462":2,"GO:0070317":2,"GO:0001501":2,"GO:0000480":2,"GO:0007275":2,"GO:0042254":2,"GO:0001649":2,"GO:0043981":2,"GO:0048568":2,"GO:0002188":3,"GO:0055059":1,"GO:0045722":1,"GO:2001034":1,"GO:0072462":1,"GO:0006470":1,"GO:1904290":1,"GO:1902660":1,"GO:0097320":1,"GO:0050773":1,"GO:0034499":1,"GO:0000902":1,"GO:1904888":1,"GO:1904179":1,"GO:0034498":1,"GO:0060378":1,"GO:0045022":1,"GO:0051044":1,"GO:0022617":1,"GO:0051441":1,"GO:0032120":1,"GO:0001654":1,"GO:0002051":1,"GO:0031915":1,"GO:0031139":1,"GO:1903595":1,"GO:0032005":1,"GO:0032534":1,"GO:0061512":1,"GO:0060348":1,"GO:1990126":1,"GO:0035185":1,"GO:0036089":1,"GO:2000060":1,"GO:1905705":1,"GO:1902426":1,"GO:0070676":1,"GO:0010252":1,"GO:0006907":1,"GO:1990502":1,"GO:0071800":1,"GO:0051016":1,"GO:0046784":1,"GO:0010697":1,"GO:0006654":1,"GO:1990854":1,"GO:0030157":1,"GO:0000281":1,"GO:0008333":1,"GO:0071539":1,"GO:0070979":1,"GO:0032466":1,"GO:0072673":1,"GO:2000642":1,"GO:0048310":1,"GO:0048015":1,"GO:0008284":1,"GO:0032258":1,"GO:0035721":1,"GO:2000769":1,"GO:1990180":1,"GO:0001680":1,"GO:0042245":1,"GO:0006378":1,"GO:1902035":1,"GO:0006334":2,"GO:0060575":1,"GO:1900037":1,"GO:0033138":1,"GO:0006511":1,"GO:0006469":1,"GO:0043516":1,"GO:0016579":1,"GO:0010452":1,"GO:0000122":1,"GO:1901532":1,"GO:0018026":1,"GO:0048642":1,"GO:0014904":1,"GO:0045944":1,"GO:0036158":1,"GO:0045184":1,"GO:0035914":1,"GO:1903715":1,"GO:0018027":1,"GO:0007507":1,"GO:0071549":1,"GO:2000480":1,"GO:0098719":1,"GO:0071320":1,"GO:0097332":1,"GO:0046827":1,"GO:0010754":1,"GO:0042391":1,"GO:0060038":1,"GO:0097338":1,"GO:0007608":1,"GO:0034638":1,"GO:0046580":1,"GO:0045762":1,"GO:0002027":1,"GO:0051447":1,"GO:0071321":1,"GO:0045013":1,"GO:0009454":1,"GO:0046007":1,"GO:0097271":1,"GO:0007264":1,"GO:0045214":1,"GO:0071805":1,"GO:0061820":1,"GO:0009736":1,"GO:1901347":1,"GO:0072362":1,"GO:0071919":1,"GO:0009301":1,"GO:1904850":1,"GO:0035522":1,"GO:0006970":1,"GO:0009737":1,"GO:0070933":1,"GO:1905839":1,"GO:0009751":1,"GO:0080113":1,"GO:0031627":1,"GO:1901430":1,"GO:0009739":1,"GO:0009723":1,"GO:0010380":1,"GO:1905615":1,"GO:1900056":1,"GO:1904792":1,"GO:0010082":1,"GO:1901348":1,"GO:0035066":1,"GO:0031848":1,"GO:1900386":1,"GO:1905778":1,"GO:0043044":1,"GO:0009753":1,"GO:0010338":1,"GO:1903086":1,"GO:0016032":1,"GO:0000183":1,"GO:0030154":1,"GO:1990414":1,"GO:0010520":1,"GO:1904911":1,"GO:1903770":1,"GO:0035390":1,"GO:1900033":1,"GO:0090669":1,"GO:0000495":1,"GO:0032790":1,"GO:0006400":1,"GO:0055129":1,"GO:0031118":1,"GO:0031120":1,"GO:0040008":1,"GO:1990481":1,"GO:0007049":1,"GO:0002192":1},"recipe_readded":["XP_001426904.1","XP_001442854.1","XP_001423048.1","XP_001450693.1","XP_001447971.1","XP_001441076.1","XP_001423158.1","XP_001443420.1","XP_001435649.1","XP_001436757.1","XP_001440796.1","XP_001461969.1","XP_001425645.1","XP_001461912.1","XP_001423907.1","XP_001449673.1","XP_001445165.1","XP_001444269.1","XP_001432573.1","XP_001429927.1"]}