{"hash":"104215717133293115","title":"Ubiquitin-regulated transcription and protein turnover","description":"This cluster is dominated by ubiquitination-related GO terms (protein ubiquitination, negative regulation of protein ubiquitination, and ubiquitin-dependent protein catabolic process) and transcriptional regulation (positive regulation of transcription by RNA polymerase II, plus NF-kappaB activity regulation). These together suggest a cohesive theme around ubiquitin signaling controlling gene expression and protein degradation. Some related terms like stress fiber assembly or viral release hint broader signaling roles but do not outweigh the central ubiquitin/transcription focus.","confidence":"Medium","size":29,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_001459465.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001462342.1","go_terms":["GO:0046704","GO:0006264","GO:0015949","GO:0006240","GO:0003014","GO:1902254","GO:0055114"]},{"accession":"XP_001436165.1","go_terms":["GO:0002291","GO:0003429","GO:0030212","GO:0070208","GO:0034113","GO:1905050","GO:0045123","GO:0007229","GO:0007596","GO:0006929","GO:0007161","GO:0031104","GO:0006956","GO:0035987","GO:1901202","GO:0015995","GO:0048455","GO:0006511","GO:0043248","GO:0006471","GO:0050908"]},{"accession":"XP_001436547.1","go_terms":["GO:0031030","GO:1902543","GO:0048227","GO:0032889","GO:0006886","GO:0031578","GO:1902018","GO:1902953","GO:0031338","GO:0044829","GO:0070309","GO:0032483","GO:0046726","GO:0032486","GO:0034499","GO:0090110","GO:0051534","GO:0090630","GO:0035526","GO:0045737","GO:0071955"]},{"accession":"XP_001442513.1","go_terms":["GO:0035774","GO:0072583","GO:0035025","GO:0060041","GO:0060613","GO:0009253","GO:0031651","GO:0016060","GO:0043161","GO:0031398","GO:0031397","GO:1900136","GO:0050975","GO:0019076","GO:0060189","GO:0032695","GO:0007601","GO:0007602","GO:0044252","GO:0032226","GO:0090240","GO:0042699","GO:0016567","GO:0045944","GO:0002032","GO:0070374","GO:0045494","GO:0090327","GO:0033138","GO:0071228","GO:0042742","GO:0022400","GO:0019835","GO:0032092","GO:0043547","GO:2000397","GO:0032691","GO:0045953","GO:0006366","GO:0002031","GO:0043149","GO:0006915","GO:0018298","GO:0070086","GO:0002092","GO:0060765","GO:0071879","GO:0016998","GO:0032088","GO:0032717","GO:0043154","GO:0032715"]},{"accession":"XP_001444951.1","go_terms":["GO:0060195","GO:0033082","GO:0071168","GO:0014834","GO:0021766","GO:0098532","GO:0051567","GO:0097198","GO:0097676","GO:0048387","GO:2000134","GO:0021695","GO:0048298","GO:0034244","GO:0045857","GO:0071314","GO:0071549","GO:0014904","GO:0070314","GO:0034773","GO:0034772","GO:0034771","GO:1903709","GO:0031060","GO:0060669","GO:0051154","GO:0035441","GO:0043433","GO:0036333","GO:0006334","GO:1901674","GO:0080182","GO:0071440","GO:0045944","GO:0097421","GO:0033138","GO:2000616","GO:1903699","GO:1990654","GO:0090309","GO:1900006","GO:0014013","GO:0036166","GO:0045605","GO:0010424","GO:0006469","GO:0048316","GO:0032635","GO:2001040","GO:0003290","GO:0007507","GO:0043516","GO:0035984","GO:0003289","GO:0045128","GO:1904772","GO:0006354","GO:0044648","GO:0006351","GO:0014898"]},{"accession":"XP_001445827.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001451059.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001461173.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001462403.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001440579.1","go_terms":["GO:0031037","GO:0070266","GO:0016340","GO:1990637","GO:0031952","GO:0051262","GO:1990416","GO:0046777","GO:0071454","GO:0010961"]},{"accession":"XP_001430481.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001447260.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001451563.1","go_terms":["GO:0034729","GO:0000245","GO:0048149","GO:1990108","GO:0071108","GO:0021551","GO:0051568","GO:0001662","GO:0035871","GO:0008583","GO:1904667","GO:0010995","GO:0070537","GO:0010992","GO:1904378","GO:0060013","GO:1903070","GO:0035520","GO:0035523","GO:0008343","GO:0044313","GO:1900425","GO:1901026","GO:0035192","GO:0006355","GO:0006511","GO:0006351","GO:0035616","GO:0000244","GO:0051298","GO:0000266","GO:0060389","GO:0008277","GO:0034394","GO:0007283","GO:0031397","GO:0070536"]},{"accession":"XP_001429532.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001438014.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001452719.1","go_terms":["GO:0035774","GO:0072583","GO:0035025","GO:0060041","GO:0060613","GO:0009253","GO:0031651","GO:0016060","GO:0043161","GO:0031398","GO:0031397","GO:1900136","GO:0050975","GO:0019076","GO:0060189","GO:0032695","GO:0007601","GO:0007602","GO:0044252","GO:0032226","GO:0090240","GO:0042699","GO:0016567","GO:0045944","GO:0002032","GO:0070374","GO:0045494","GO:0090327","GO:0033138","GO:0071228","GO:0042742","GO:0022400","GO:0019835","GO:0032092","GO:0043547","GO:2000397","GO:0032691","GO:0045953","GO:0006366","GO:0002031","GO:0043149","GO:0006915","GO:0018298","GO:0070086","GO:0002092","GO:0060765","GO:0071879","GO:0016998","GO:0032088","GO:0032717","GO:0043154","GO:0032715"]},{"accession":"XP_001434691.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001448974.1","go_terms":["GO:0090501","GO:0051017","GO:0032212","GO:0051225","GO:0006397","GO:0050960","GO:0050968","GO:0007205","GO:0071260","GO:0070213","GO:0043403","GO:1901187","GO:0035556","GO:0021707","GO:0071901","GO:0002268","GO:0016049","GO:0007253","GO:0090162","GO:2000031","GO:2000171","GO:1903589","GO:0016477","GO:0097284","GO:0070682","GO:1900383","GO:0035994","GO:0035508","GO:0033280","GO:0098703","GO:1901594","GO:0045083","GO:0009408","GO:0003213","GO:0044707","GO:0016055","GO:0003270","GO:0016567","GO:0071446","GO:0033028","GO:0046475","GO:0060843","GO:0061408","GO:1904355","GO:0072660","GO:0070212","GO:1900827","GO:0010845","GO:1904743","GO:1904908","GO:0010650","GO:0070198","GO:0048709","GO:0045736","GO:0007049","GO:0061290","GO:0060007","GO:0060658","GO:0051414","GO:0007169","GO:0050929","GO:0019221","GO:0050729","GO:0072224","GO:0071727","GO:0071726","GO:0070434","GO:0032722","GO:0048681","GO:0034162","GO:0050830","GO:0034166","GO:0045416","GO:0009729","GO:0045410","GO:0042088","GO:0031663","GO:0030199","GO:0043330","GO:0022038","GO:0008063","GO:0050829","GO:0032497","GO:0051770","GO:2001013","GO:0042552","GO:0050707","GO:0003345","GO:0070100","GO:0007186","GO:0045087","GO:1904027","GO:0034146","GO:0034142","GO:0019800","GO:0007252","GO:0002755","GO:0002756","GO:0051607","GO:0070430","GO:1900747","GO:0051965","GO:0061364","GO:0034158","GO:0006954","GO:0070171","GO:0034150","GO:0034154","GO:0007352","GO:0007413","GO:0045078","GO:0010080","GO:0006963","GO:1900227","GO:0090260","GO:0032741","GO:0034123","GO:0051014","GO:0014068","GO:0007409","GO:0002730","GO:0045356","GO:0045359","GO:0042496","GO:0042495","GO:0051901","GO:0032474","GO:0016525","GO:0016239","GO:0071222","GO:0034138","GO:0042116","GO:0034134","GO:0034130","GO:0060348","GO:0072287","GO:0036303","GO:0060427","GO:0048846","GO:0090141","GO:1900155","GO:0021972","GO:0002322","GO:0006469","GO:0046426","GO:0061368","GO:0034346","GO:0002091","GO:0042346","GO:0010596","GO:0072237","GO:2000340","GO:0050966","GO:0000083","GO:0045038","GO:0045444","GO:0097497","GO:0051209","GO:1903759","GO:0048265","GO:0043488","GO:0070431","GO:0071642","GO:0098907","GO:0010745","GO:1903444","GO:0050955","GO:1904357","GO:0060743","GO:0035544","GO:0009409","GO:0086070","GO:0032088","GO:0030103","GO:0070427","GO:0071651","GO:0048549","GO:2001275"]},{"accession":"XP_001434952.1","go_terms":["GO:0080148","GO:0060548","GO:0071277","GO:0090332","GO:1903861","GO:0038128"]},{"accession":"XP_001432307.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001440709.1","go_terms":["GO:0048451","GO:0071044","GO:0051607","GO:0071037","GO:0071036","GO:0006955","GO:0042245","GO:0001680","GO:0046677","GO:0036450","GO:0071076","GO:0043630","GO:0033621","GO:0006378","GO:0006808","GO:0071050"]},{"accession":"XP_001446010.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001457527.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001431591.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001450910.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001451761.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001451125.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_001460705.1","go_terms":["GO:0008585","GO:0031619","GO:0000722","GO:0000724","GO:0010332","GO:1990426","GO:0048478","GO:0007141","GO:0070200","GO:0051298","GO:0033600","GO:0010165","GO:0010225","GO:0006978","GO:0001556","GO:0007420","GO:0007569","GO:0042771","GO:0001833","GO:0030097"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0046704":1,"GO:0003014":1,"GO:0015949":1,"GO:1902254":1,"GO:0055114":1,"GO:0006264":1,"GO:0006240":1,"GO:0015995":1,"GO:0006956":1,"GO:0034113":1,"GO:0031104":1,"GO:0002291":1,"GO:0007229":1,"GO:0006511":2,"GO:1905050":1,"GO:0045123":1,"GO:0007596":1,"GO:0006929":1,"GO:0048455":1,"GO:0070208":1,"GO:1901202":1,"GO:0035987":1,"GO:0030212":1,"GO:0007161":1,"GO:0043248":1,"GO:0006471":1,"GO:0003429":1,"GO:0050908":1,"GO:0048227":1,"GO:0071955":1,"GO:0006886":1,"GO:0035526":1,"GO:0034499":1,"GO:0045737":1,"GO:0032483":1,"GO:0031578":1,"GO:0090110":1,"GO:0032486":1,"GO:1902543":1,"GO:0031338":1,"GO:0046726":1,"GO:0031030":1,"GO:1902018":1,"GO:0044829":1,"GO:0090630":1,"GO:0070309":1,"GO:0051534":1,"GO:1902953":1,"GO:0032889":1,"GO:0071228":2,"GO:0019076":2,"GO:0016567":3,"GO:0090327":2,"GO:0043149":2,"GO:0019835":2,"GO:0031398":2,"GO:0043154":2,"GO:0090240":2,"GO:0033138":3,"GO:0032691":2,"GO:0002032":2,"GO:0035025":2,"GO:0043161":2,"GO:0045494":2,"GO:0018298":2,"GO:0032226":2,"GO:0070086":2,"GO:0060613":2,"GO:0007602":2,"GO:0022400":2,"GO:0060189":2,"GO:0032092":2,"GO:0032715":2,"GO:0035774":2,"GO:1900136":2,"GO:0045953":2,"GO:0042742":2,"GO:0002092":2,"GO:0032088":3,"GO:0016060":2,"GO:0045944":3,"GO:0007601":2,"GO:0031397":3,"GO:0042699":2,"GO:0044252":2,"GO:0032717":2,"GO:0031651":2,"GO:0050975":2,"GO:0009253":2,"GO:0002031":2,"GO:0070374":2,"GO:0032695":2,"GO:0043547":2,"GO:2000397":2,"GO:0071879":2,"GO:0060041":2,"GO:0016998":2,"GO:0006915":2,"GO:0006366":2,"GO:0072583":2,"GO:0060765":2,"GO:0090309":1,"GO:0014834":1,"GO:1903709":1,"GO:0034771":1,"GO:0071314":1,"GO:1901674":1,"GO:0043433":1,"GO:0006334":1,"GO:0045605":1,"GO:0034244":1,"GO:0071168":1,"GO:0048298":1,"GO:1903699":1,"GO:0097676":1,"GO:0060195":1,"GO:0051567":1,"GO:0006469":2,"GO:0043516":1,"GO:0080182":1,"GO:0045857":1,"GO:0071440":1,"GO:0098532":1,"GO:0070314":1,"GO:1904772":1,"GO:0010424":1,"GO:0021766":1,"GO:0031060":1,"GO:0051154":1,"GO:0021695":1,"GO:0014898":1,"GO:2001040":1,"GO:0033082":1,"GO:1900006":1,"GO:0035984":1,"GO:0014904":1,"GO:2000134":1,"GO:0048387":1,"GO:0060669":1,"GO:2000616":1,"GO:0036166":1,"GO:0003290":1,"GO:0035441":1,"GO:0045128":1,"GO:0014013":1,"GO:0097198":1,"GO:0003289":1,"GO:0044648":1,"GO:0032635":1,"GO:0034772":1,"GO:0048316":1,"GO:1990654":1,"GO:0034773":1,"GO:0006351":2,"GO:0036333":1,"GO:0007507":1,"GO:0006354":1,"GO:0071549":1,"GO:0097421":1,"GO:1990416":1,"GO:0010961":1,"GO:0031952":1,"GO:0071454":1,"GO:1990637":1,"GO:0046777":1,"GO:0016340":1,"GO:0031037":1,"GO:0051262":1,"GO:0070266":1,"GO:0070537":1,"GO:0008583":1,"GO:0034394":1,"GO:1900425":1,"GO:0035871":1,"GO:0034729":1,"GO:0000244":1,"GO:1904378":1,"GO:0070536":1,"GO:1901026":1,"GO:0035520":1,"GO:0010995":1,"GO:1904667":1,"GO:1990108":1,"GO:0008277":1,"GO:0060013":1,"GO:0060389":1,"GO:0051298":2,"GO:0001662":1,"GO:0035523":1,"GO:0021551":1,"GO:0008343":1,"GO:0000245":1,"GO:0035616":1,"GO:0051568":1,"GO:0071108":1,"GO:0048149":1,"GO:0007283":1,"GO:0035192":1,"GO:0010992":1,"GO:0044313":1,"GO:0006355":1,"GO:1903070":1,"GO:0000266":1,"GO:0002730":1,"GO:0071642":1,"GO:1901594":1,"GO:0002322":1,"GO:0086070":1,"GO:0060427":1,"GO:0090162":1,"GO:0071651":1,"GO:0032474":1,"GO:0051225":1,"GO:0034123":1,"GO:0070213":1,"GO:0034142":1,"GO:1900155":1,"GO:0036303":1,"GO:0051770":1,"GO:0016239":1,"GO:0007413":1,"GO:0072660":1,"GO:0072287":1,"GO:0051017":1,"GO:0070198":1,"GO:0051901":1,"GO:0050968":1,"GO:0072224":1,"GO:0070431":1,"GO:0032497":1,"GO:0044707":1,"GO:0035994":1,"GO:0034134":1,"GO:0007205":1,"GO:0045087":1,"GO:0071726":1,"GO:0034138":1,"GO:0009729":1,"GO:0033280":1,"GO:1904743":1,"GO:0061290":1,"GO:1900227":1,"GO:0051209":1,"GO:0007352":1,"GO:0070212":1,"GO:0035556":1,"GO:0016055":1,"GO:0003270":1,"GO:0090141":1,"GO:0045736":1,"GO:0034166":1,"GO:0034158":1,"GO:0031663":1,"GO:0032212":1,"GO:0050929":1,"GO:0022038":1,"GO:0050830":1,"GO:0090260":1,"GO:0035544":1,"GO:2000171":1,"GO:1903589":1,"GO:1904027":1,"GO:0042495":1,"GO:1900383":1,"GO:0002756":1,"GO:0007409":1,"GO:0061368":1,"GO:0050960":1,"GO:0046475":1,"GO:0070682":1,"GO:1904908":1,"GO:0050966":1,"GO:0042116":1,"GO:0030103":1,"GO:0061364":1,"GO:0098703":1,"GO:0019800":1,"GO:0071222":1,"GO:0070171":1,"GO:0042552":1,"GO:0045410":1,"GO:0060743":1,"GO:0051014":1,"GO:0048681":1,"GO:0061408":1,"GO:0051965":1,"GO:0071727":1,"GO:0050707":1,"GO:0043488":1,"GO:0032741":1,"GO:0070434":1,"GO:1900827":1,"GO:0016477":1,"GO:0060348":1,"GO:0048265":1,"GO:0010080":1,"GO:0008063":1,"GO:0016525":1,"GO:0045083":1,"GO:0007169":1,"GO:0034130":1,"GO:0045359":1,"GO:0072237":1,"GO:1903444":1,"GO:0003345":1,"GO:0007253":1,"GO:0030199":1,"GO:0043403":1,"GO:0034162":1,"GO:0048549":1,"GO:0010745":1,"GO:0002268":1,"GO:0010845":1,"GO:0016049":1,"GO:0002091":1,"GO:2001013":1,"GO:0071260":1,"GO:0000083":1,"GO:0034154":1,"GO:0033028":1,"GO:2000031":1,"GO:0045356":1,"GO:0045078":1,"GO:0021972":1,"GO:0048709":1,"GO:1904355":1,"GO:0014068":1,"GO:0050729":1,"GO:0002755":1,"GO:0007049":1,"GO:0060658":1,"GO:0006963":1,"GO:0098907":1,"GO:0019221":1,"GO:2001275":1,"GO:1904357":1,"GO:0097497":1,"GO:0071901":1,"GO:0070100":1,"GO:0034150":1,"GO:0045444":1,"GO:0006397":1,"GO:0045416":1,"GO:0071446":1,"GO:0006954":1,"GO:0003213":1,"GO:0034346":1,"GO:0043330":1,"GO:0010596":1,"GO:0042346":1,"GO:0051414":1,"GO:0009408":1,"GO:0060007":1,"GO:0097284":1,"GO:0046426":1,"GO:0032722":1,"GO:0070430":1,"GO:0051607":2,"GO:0010650":1,"GO:0034146":1,"GO:0007252":1,"GO:0090501":1,"GO:1901187":1,"GO:0050829":1,"GO:0021707":1,"GO:0042496":1,"GO:0048846":1,"GO:1903759":1,"GO:0060843":1,"GO:0007186":1,"GO:0035508":1,"GO:2000340":1,"GO:0045038":1,"GO:0070427":1,"GO:1900747":1,"GO:0042088":1,"GO:0009409":1,"GO:0050955":1,"GO:0090332":1,"GO:0080148":1,"GO:1903861":1,"GO:0060548":1,"GO:0071277":1,"GO:0038128":1,"GO:0071044":1,"GO:0048451":1,"GO:0033621":1,"GO:0046677":1,"GO:0071036":1,"GO:0071050":1,"GO:0001680":1,"GO:0043630":1,"GO:0006955":1,"GO:0036450":1,"GO:0042245":1,"GO:0071076":1,"GO:0006378":1,"GO:0006808":1,"GO:0071037":1,"GO:1990426":1,"GO:0033600":1,"GO:0001556":1,"GO:0008585":1,"GO:0000724":1,"GO:0010165":1,"GO:0001833":1,"GO:0007141":1,"GO:0030097":1,"GO:0042771":1,"GO:0048478":1,"GO:0007420":1,"GO:0006978":1,"GO:0070200":1,"GO:0007569":1,"GO:0031619":1,"GO:0000722":1,"GO:0010225":1,"GO:0010332":1},"recipe_readded":["XP_001434946.1","XP_001451112.1","XP_001452065.1","XP_001461730.1","XP_001451404.1","XP_001425419.1","XP_001433664.1","XP_001434158.1","XP_001448437.1","XP_001434827.1","XP_001448531.1","XP_001436639.1","XP_001458124.1","XP_001444856.1","XP_001439025.1","XP_001457079.1","XP_001461540.1","XP_001428807.1","XP_001432282.1","XP_001458829.1"]}