{"hash":"2001935859081416944","title":"Ubiquitin-Proteasome Regulation of DNA Repair and Cell Cycle","description":"This cluster is enriched for ubiquitin-related proteolysis and cell-cycle processes: SCF- and APC/C-mediated ubiquitination, various ubiquitin linkages (K48, K11), neddylation, proteasomal degradation, plus nucleotide-excision repair and cell division, indicating a cohesive theme of regulated protein turnover coordinating DNA repair and cell-cycle progression. The presence of viral process terms may reflect host-virus interactions with the UPS but does not override the core UPS/DNA repair/cell-cycle signal.","confidence":"High","size":4,"edges":6,"triangles":4,"max_degree":3,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_012205991.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0006295","GO:0006294","GO:0006296","GO:0045116","GO:0010265","GO:0043162","GO:0000717","GO:0006293","GO:0000715","GO:0016567","GO:1902104","GO:0042769","GO:0016032","GO:0051759","GO:0031146","GO:0070911","GO:0070979","GO:0031145","GO:0051301","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XP_012193971.1","go_terms":["GO:1901487","GO:0032020","GO:0042138","GO:0010390","GO:0043951","GO:0090089","GO:0030509","GO:0043524","GO:0051569","GO:0031058","GO:0070936","GO:0006303","GO:0000086","GO:0035666","GO:0070534","GO:0043123","GO:1903955","GO:0010976","GO:0007288","GO:0031505","GO:0070423","GO:0070987","GO:0051865","GO:0016562","GO:0031497","GO:0051026","GO:0070911","GO:1902426","GO:0010620","GO:1990920","GO:0045116","GO:0031571","GO:0070459","GO:0071455","GO:0071596","GO:0033128","GO:0006348","GO:0007059","GO:0042276","GO:0038095","GO:0070193","GO:1901694","GO:0051443","GO:0071347","GO:0016558","GO:0085020","GO:0051965","GO:0045739","GO:0030466","GO:0031939","GO:0010845","GO:0006344","GO:0000722","GO:0007254","GO:0001701","GO:0042275","GO:0000724","GO:0070979","GO:0000729","GO:0060340","GO:1902916","GO:1904153","GO:1901044","GO:0010994","GO:0002223","GO:0031146","GO:0031145","GO:0045141","GO:0051092","GO:0044314","GO:0070076","GO:0070059","GO:0061186","GO:0071894","GO:0035519","GO:1903755","GO:0035458","GO:0000022","GO:0051301","GO:0009737","GO:0071629","GO:0050852","GO:0000278","GO:0006915","GO:0030433","GO:0033182","GO:0010458","GO:0016032"]},{"accession":"XP_012211521.1","go_terms":["GO:1902564"]},{"accession":"XP_012198998.1","go_terms":["GO:0035518","GO:0000086","GO:0000226","GO:0051457","GO:0007275","GO:0009734","GO:0000921","GO:0042787","GO:0046686","GO:2000766","GO:0060542","GO:0031146","GO:0007059","GO:0010458","GO:0045910","GO:0010265","GO:0007035","GO:0016032","GO:0009873","GO:0070911"]}],"graph":[["XP_012211521.1","XP_012193971.1",0.987],["XP_012211521.1","XP_012198998.1",0.984],["XP_012211521.1","XP_012205991.1",0.986],["XP_012198998.1","XP_012193971.1",0.932],["XP_012198998.1","XP_012205991.1",0.969],["XP_012193971.1","XP_012205991.1",0.921]],"all_go_terms":{"GO:0038018":1,"GO:0070936":2,"GO:0006294":1,"GO:0051865":2,"GO:0060816":1,"GO:0045116":2,"GO:0042787":2,"GO:0051301":2,"GO:0070911":3,"GO:0031146":3,"GO:1902104":1,"GO:0051759":1,"GO:0007250":1,"GO:0000715":1,"GO:0070979":2,"GO:0031145":2,"GO:0016032":3,"GO:1900095":1,"GO:0033151":1,"GO:1903721":1,"GO:0070535":1,"GO:0042981":1,"GO:0016567":1,"GO:0000717":1,"GO:0046621":1,"GO:0085020":2,"GO:0009048":1,"GO:0006295":1,"GO:0010265":2,"GO:0036205":1,"GO:0046328":1,"GO:0006296":1,"GO:1901253":1,"GO:1903762":1,"GO:0033209":1,"GO:1903265":1,"GO:0090073":1,"GO:0006293":1,"GO:0042769":1,"GO:2000620":1,"GO:0070512":1,"GO:0030433":2,"GO:0043162":1,"GO:0016558":2,"GO:0043951":1,"GO:0007288":1,"GO:0071596":1,"GO:0035519":1,"GO:0000086":2,"GO:0010458":2,"GO:0033128":1,"GO:0061186":1,"GO:0042138":1,"GO:0030466":1,"GO:1990920":1,"GO:0090089":1,"GO:0038095":1,"GO:0001701":1,"GO:0035666":1,"GO:0070076":1,"GO:1902426":1,"GO:0033182":1,"GO:1901694":1,"GO:1903955":1,"GO:0006344":1,"GO:0010620":1,"GO:0035458":1,"GO:0042275":1,"GO:0016562":1,"GO:0042276":1,"GO:0030509":1,"GO:0051026":1,"GO:0070423":1,"GO:0006303":1,"GO:0051569":1,"GO:0070059":1,"GO:0070193":1,"GO:0006915":1,"GO:0009737":1,"GO:0071629":1,"GO:0000724":1,"GO:0007059":2,"GO:0043123":1,"GO:0051443":1,"GO:1901044":1,"GO:0031571":1,"GO:1904153":1,"GO:1902916":1,"GO:0010390":1,"GO:0032020":1,"GO:0010994":1,"GO:0071347":1,"GO:0000278":1,"GO:0006348":1,"GO:0031505":1,"GO:0051965":1,"GO:0043524":1,"GO:0031058":1,"GO:0060340":1,"GO:0010845":1,"GO:0071455":1,"GO:0010976":1,"GO:0044314":1,"GO:0000729":1,"GO:0000722":1,"GO:0002223":1,"GO:0031497":1,"GO:0007254":1,"GO:0031939":1,"GO:0071894":1,"GO:0070987":1,"GO:0045141":1,"GO:0050852":1,"GO:0070534":1,"GO:0045739":1,"GO:1903755":1,"GO:0051092":1,"GO:0000022":1,"GO:0070459":1,"GO:1901487":1,"GO:1902564":1,"GO:0000226":1,"GO:0051457":1,"GO:0007035":1,"GO:0045910":1,"GO:0060542":1,"GO:0000921":1,"GO:0035518":1,"GO:0009873":1,"GO:0009734":1,"GO:0046686":1,"GO:0007275":1,"GO:2000766":1},"recipe_readded":[]}