{"hash":"403917062123568558","title":"Chromatin modification and transcription regulation","description":"This cluster centers on histone modification and transcription control terms (H3-K4 demethylation/trimethylation, histone deacetylase activity, and negative regulation of transcription by RNA Pol II), suggesting a theme of chromatin remodeling and gene expression regulation. Additional terms touch on related nuclear processes (DNA/RNA repair) and cell-cycle-associated events (spindle assembly), which may reflect broader coordination of nuclear functions within the cluster.","confidence":"Medium","size":17,"edges":15,"triangles":0,"max_degree":13,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_004364571.2","go_terms":["GO:0097692","GO:0042245","GO:0016311","GO:0016032","GO:0006281"]},{"accession":"XP_004365438.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004365612.1","go_terms":["GO:0034720","GO:0003205","GO:0006349","GO:0014017","GO:0036124","GO:0042921","GO:0006344","GO:0097026","GO:0060996","GO:0080182","GO:0033601","GO:0042063","GO:0034773","GO:2000864","GO:0031061","GO:0034630","GO:0060763","GO:0051574","GO:0061038","GO:0003408","GO:0006338","GO:0097368","GO:1901726","GO:0006337","GO:0006355","GO:0060982"]},{"accession":"XP_004347707.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004348172.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004343419.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_011270613.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004348273.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004347628.1","go_terms":["GO:0043972","GO:0034720","GO:0002509","GO:0032602","GO:0097190","GO:0007098","GO:1901536","GO:0098532","GO:0051569","GO:0002458","GO:0090308","GO:2000791","GO:0010216","GO:0000122","GO:0045869","GO:0051225","GO:0097536","GO:0048513","GO:0070562","GO:0080182","GO:2001040","GO:2000864","GO:0060669","GO:1901097","GO:0007289","GO:1901726","GO:0006334","GO:1901674","GO:1904388","GO:0061087","GO:0061086","GO:0044648","GO:2000584","GO:0061188","GO:2000410","GO:0048655"]},{"accession":"XP_004343695.2","go_terms":["GO:0009236","GO:0017000","GO:0035690","GO:0006656","GO:0019919","GO:0009102","GO:0030488","GO:0016049","GO:0018012","GO:0006744","GO:0010189","GO:0016126","GO:0043985","GO:0070476","GO:0046690","GO:0002098","GO:0000056","GO:0001300","GO:0090398","GO:0030961","GO:0006370","GO:0009877","GO:0031167","GO:0018364","GO:0036068","GO:0018026","GO:0018027","GO:0036265","GO:1901052","GO:0000122","GO:0006596","GO:0000154","GO:0014075","GO:0002347","GO:0070555","GO:0035902","GO:0006972","GO:0042220","GO:0001887"]},{"accession":"XP_004344991.1","go_terms":["GO:0006893"]},{"accession":"XP_004344388.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004348315.1","go_terms":["GO:0006701"]},{"accession":"XP_004349095.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004345008.1","go_terms":["GO:0045033","GO:0032581","GO:0016557","GO:0045046","GO:2000304"]},{"accession":"XP_004365742.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004365626.2","go_terms":["GO:0050960","GO:0050968","GO:0007205","GO:0071260","GO:0070213","GO:0043403","GO:1901187","GO:0035556","GO:0021707","GO:0071901","GO:0002268","GO:0016049","GO:0007253","GO:0032212","GO:0090162","GO:0051225","GO:2000031","GO:2000171","GO:1903589","GO:0016477","GO:0097284","GO:0070682","GO:1900383","GO:0035994","GO:0035508","GO:0033280","GO:0098703","GO:0051017","GO:1901594","GO:0045083","GO:0009408","GO:0003213","GO:0044707","GO:0016055","GO:0003270","GO:0016567","GO:0071446","GO:0033028","GO:0046475","GO:0060843","GO:0071275","GO:0014898","GO:0006904","GO:1903480","GO:0030050","GO:0045033","GO:1904970","GO:0070493","GO:1902405","GO:0009826","GO:0007107","GO:0021592","GO:0043087","GO:0038089","GO:0032252","GO:0048820","GO:0021678","GO:0021873","GO:0006930","GO:0048313","GO:0045769","GO:0050957","GO:0032529","GO:0031585","GO:0007051","GO:0048496","GO:0007339","GO:0000132","GO:0001778","GO:0051489","GO:0000011","GO:0051661","GO:0007118","GO:0000001","GO:0016198","GO:0051904","GO:1903477","GO:1903478","GO:0060474","GO:1900748"]}],"graph":[["XP_004344388.1","XP_004348172.1",0.563],["XP_004343695.2","XP_004348172.1",0.74],["XP_004348273.1","XP_004348172.1",0.535],["XP_004348315.1","XP_004347707.1",0.702],["XP_004348172.1","XP_004343419.2",0.874],["XP_004348172.1","XP_004344991.1",0.548],["XP_004348172.1","XP_004345008.1",0.895],["XP_004348172.1","XP_004347628.1",0.638],["XP_004348172.1","XP_004364571.2",0.615],["XP_004348172.1","XP_004365438.1",0.943],["XP_004348172.1","XP_004365612.1",0.865],["XP_004348172.1","XP_004365626.2",0.661],["XP_004348172.1","XP_004365742.1",0.501],["XP_004348172.1","XP_011270613.1",0.836],["XP_004349095.1","XP_004347707.1",0.819]],"all_go_terms":{"GO:0006281":1,"GO:0042245":1,"GO:0097692":1,"GO:0016032":1,"GO:0016311":1,"GO:1901726":2,"GO:0003205":1,"GO:0060982":1,"GO:0061038":1,"GO:0003408":1,"GO:0097368":1,"GO:0051574":1,"GO:0006337":1,"GO:0031061":1,"GO:0036124":1,"GO:0034773":1,"GO:0034720":2,"GO:2000864":2,"GO:0014017":1,"GO:0006355":1,"GO:0042063":1,"GO:0060763":1,"GO:0042921":1,"GO:0060996":1,"GO:0006349":1,"GO:0034630":1,"GO:0097026":1,"GO:0006338":1,"GO:0033601":1,"GO:0080182":2,"GO:0006344":1,"GO:0048655":1,"GO:0010216":1,"GO:2000410":1,"GO:0070562":1,"GO:0097190":1,"GO:0000122":2,"GO:0006334":1,"GO:0061188":1,"GO:0048513":1,"GO:0032602":1,"GO:0098532":1,"GO:0060669":1,"GO:0002458":1,"GO:1901097":1,"GO:0061087":1,"GO:1901674":1,"GO:0051225":2,"GO:0043972":1,"GO:0051569":1,"GO:2001040":1,"GO:1901536":1,"GO:2000791":1,"GO:0045869":1,"GO:0002509":1,"GO:0097536":1,"GO:0090308":1,"GO:2000584":1,"GO:0044648":1,"GO:0061086":1,"GO:0007098":1,"GO:0007289":1,"GO:1904388":1,"GO:0000056":1,"GO:0046690":1,"GO:0042220":1,"GO:0000154":1,"GO:0010189":1,"GO:0030961":1,"GO:0016049":2,"GO:0019919":1,"GO:0001300":1,"GO:0002347":1,"GO:0070476":1,"GO:0070555":1,"GO:0009877":1,"GO:0035902":1,"GO:0014075":1,"GO:0090398":1,"GO:0030488":1,"GO:0006596":1,"GO:0018026":1,"GO:0006972":1,"GO:0001887":1,"GO:0036265":1,"GO:0016126":1,"GO:0035690":1,"GO:0043985":1,"GO:0018364":1,"GO:0006370":1,"GO:0009236":1,"GO:0009102":1,"GO:0036068":1,"GO:0006656":1,"GO:0018012":1,"GO:0006744":1,"GO:1901052":1,"GO:0002098":1,"GO:0031167":1,"GO:0018027":1,"GO:0017000":1,"GO:0006893":1,"GO:0006701":1,"GO:0045033":2,"GO:0045046":1,"GO:2000304":1,"GO:0032581":1,"GO:0016557":1,"GO:0031585":1,"GO:1903589":1,"GO:0050968":1,"GO:0070213":1,"GO:1903478":1,"GO:0043087":1,"GO:0000132":1,"GO:0035508":1,"GO:0051017":1,"GO:1900748":1,"GO:0045083":1,"GO:1903480":1,"GO:0002268":1,"GO:0007107":1,"GO:0032252":1,"GO:0007118":1,"GO:0006904":1,"GO:0048313":1,"GO:0045769":1,"GO:0070682":1,"GO:0098703":1,"GO:0021707":1,"GO:0050960":1,"GO:0071446":1,"GO:0016198":1,"GO:0001778":1,"GO:0032212":1,"GO:0016477":1,"GO:0016055":1,"GO:0009826":1,"GO:0060843":1,"GO:0038089":1,"GO:0048496":1,"GO:1902405":1,"GO:0060474":1,"GO:0051489":1,"GO:0097284":1,"GO:0046475":1,"GO:0032529":1,"GO:0003213":1,"GO:0050957":1,"GO:0007205":1,"GO:0033028":1,"GO:0000011":1,"GO:1901594":1,"GO:0071275":1,"GO:0033280":1,"GO:0071901":1,"GO:0009408":1,"GO:0021592":1,"GO:0016567":1,"GO:1900383":1,"GO:0044707":1,"GO:1904970":1,"GO:0006930":1,"GO:0007051":1,"GO:0007339":1,"GO:0035994":1,"GO:0030050":1,"GO:0035556":1,"GO:0007253":1,"GO:0048820":1,"GO:1901187":1,"GO:0021678":1,"GO:0070493":1,"GO:0051661":1,"GO:0014898":1,"GO:0090162":1,"GO:0043403":1,"GO:0051904":1,"GO:2000031":1,"GO:0021873":1,"GO:0003270":1,"GO:1903477":1,"GO:0071260":1,"GO:2000171":1,"GO:0000001":1},"recipe_readded":[]}