{"hash":"2148321326203018085","title":"Spliceosome-driven RNA processing","description":"This cluster is dominated by GO terms for mRNA splicing via the spliceosome, spliceosomal complex assembly, and regulation of splicing, along with related mRNA metabolism activities (deadenylation-dependent decapping, mRNA processing, and regulatory ncRNA-mediated silencing). The consistent presence of splicing and RNA decay terms suggests proteins involved in RNA processing and gene expression regulation at the RNA level, with a few chromatin-related terms that may reflect broader nuclear RNA biology. Overall, the theme is best captured by spliceosome-mediated RNA processing functions.","confidence":"High","size":5,"edges":10,"triangles":10,"max_degree":4,"top_function":"regulatory ncRNA-mediated gene silencing","members":[{"accession":"XP_004348993.1","go_terms":["GO:0008033","GO:0033962","GO:0008334","GO:0070317","GO:0051170","GO:1990141","GO:0009414","GO:0042633","GO:0000245","GO:0000387","GO:0000290","GO:0009737","GO:0030490","GO:0006369","GO:0045292"]},{"accession":"XP_004343004.1","go_terms":["GO:0008033","GO:0033962","GO:0008334","GO:0070317","GO:0051170","GO:1990141","GO:0009414","GO:0042633","GO:0000245","GO:0000387","GO:0000290","GO:0009737","GO:0030490","GO:0006369","GO:0045292"]},{"accession":"XP_004364148.1","go_terms":["GO:1905663","GO:1902625","GO:0048025","GO:0048026","GO:0075522","GO:0075525","GO:0000380","GO:0016556","GO:0001825","GO:1900363","GO:0002188","GO:0000381","GO:1903586","GO:0006406","GO:0006446","GO:0060211","GO:0031047","GO:0048255","GO:0035278","GO:0001731","GO:0010610","GO:0045292","GO:1901407","GO:0097010","GO:0006376","GO:0034462","GO:0006378"]},{"accession":"XP_004365923.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003"]},{"accession":"XP_004345649.1","go_terms":["GO:1905663","GO:1902625","GO:0048025","GO:0048026","GO:0075522","GO:0075525","GO:0000380","GO:0016556","GO:0001825","GO:1900363","GO:0002188","GO:0000381","GO:1903586","GO:0006406","GO:0006446","GO:0060211","GO:0031047","GO:0048255","GO:0035278","GO:0001731","GO:0010610","GO:0045292","GO:1901407","GO:0097010","GO:0006376","GO:0034462","GO:0006378"]}],"graph":[["XP_004345649.1","XP_004343004.1",0.966],["XP_004345649.1","XP_004348993.1",0.951],["XP_004345649.1","XP_004364148.1",0.986],["XP_004345649.1","XP_004365923.1",0.897],["XP_004365923.1","XP_004343004.1",0.972],["XP_004365923.1","XP_004348993.1",0.955],["XP_004365923.1","XP_004364148.1",0.974],["XP_004348993.1","XP_004343004.1",0.76],["XP_004348993.1","XP_004364148.1",0.926],["XP_004343004.1","XP_004364148.1",0.951]],"all_go_terms":{"GO:0000290":2,"GO:0008033":2,"GO:0000245":2,"GO:0042633":2,"GO:0045292":4,"GO:1990141":2,"GO:0033962":2,"GO:0008334":2,"GO:0009414":2,"GO:0051170":2,"GO:0000387":2,"GO:0030490":2,"GO:0070317":2,"GO:0009737":2,"GO:0006369":3,"GO:0016556":2,"GO:0000380":2,"GO:0006446":2,"GO:1900363":2,"GO:0048255":2,"GO:0002188":2,"GO:0006378":2,"GO:0006376":2,"GO:0048026":3,"GO:0097010":2,"GO:0048025":2,"GO:1905663":2,"GO:0006406":2,"GO:0035278":2,"GO:1901407":2,"GO:0031047":3,"GO:0010610":2,"GO:0001825":2,"GO:0000381":2,"GO:0075522":2,"GO:0034462":2,"GO:0060211":2,"GO:0075525":2,"GO:0001731":2,"GO:1902625":2,"GO:1903586":2,"GO:0006301":1,"GO:0031124":1,"GO:1904570":1,"GO:0006283":1,"GO:0018144":1,"GO:0071894":1,"GO:0006306":1,"GO:0000472":1,"GO:0000398":1,"GO:0071038":1,"GO:0016584":1,"GO:0070870":1,"GO:0016973":1,"GO:0042255":1,"GO:0008306":1,"GO:0042766":1,"GO:0006260":1,"GO:0006363":1,"GO:0000393":1,"GO:0000388":1,"GO:1902626":1,"GO:0043629":1,"GO:1902775":1,"GO:0000464":1,"GO:0070417":1,"GO:0016441":1,"GO:1990417":1,"GO:0001178":1,"GO:0034476":1,"GO:0006265":1,"GO:0000480":1,"GO:0071031":1,"GO:0006310":1,"GO:0000716":1,"GO:0000467":1,"GO:0006605":1,"GO:0071441":1,"GO:1903241":1,"GO:0042273":1,"GO:0071049":1,"GO:0010501":1,"GO:0006269":1,"GO:0000462":1,"GO:0090394":1,"GO:0000378":1,"GO:0014070":1,"GO:0034475":1,"GO:1904574":1,"GO:1990120":1,"GO:0006268":1,"GO:0045944":1,"GO:1903608":1,"GO:0006311":1,"GO:0072715":1,"GO:0048701":1,"GO:0009432":1,"GO:0071042":1,"GO:0017038":1,"GO:1900050":1,"GO:2000616":1,"GO:0019079":1,"GO:0071051":1,"GO:0045003":1,"GO:0060303":1,"GO:0000390":1,"GO:0000466":1,"GO:1990416":1,"GO:0071035":1,"GO:0043044":1,"GO:0035640":1,"GO:0000184":1,"GO:0000463":1},"recipe_readded":[]}