{"hash":"1858022880762251222","title":"Bacterial Transcription and Ribosome Biogenesis with Transport","description":"This cluster centers on DNA-templated transcription and ribosome biogenesis (including small subunit export) and a SOS response, complemented by multiple membrane transport and secretion-related GO terms (teichoic acid transport, amino acid transport, thiamine transport, glycerophosphodiester transport, and Type I secretion). Together these suggest a bacterial gene set coordinating gene expression, ribosome assembly, stress response, and envelope/transport functions.","confidence":"Medium","size":23,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_002288751.1","go_terms":["GO:0018293","GO:0010719","GO:0017013","GO:0006121","GO:0006105","GO:0034553"]},{"accession":"XP_002293513.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002293819.1","go_terms":["GO:0015914","GO:0031288","GO:0010949","GO:0055099","GO:2000032","GO:0010212","GO:0046618","GO:0009877","GO:0080168","GO:0010222","GO:1900753","GO:0006855","GO:0015772","GO:0007584","GO:0006727","GO:0030299","GO:0042632","GO:0042891","GO:0010345","GO:0071366","GO:0070731","GO:0045796","GO:0043215","GO:0042493","GO:0080051","GO:0033344","GO:0006824","GO:0030253","GO:0030153","GO:0017004","GO:0031460","GO:0046677","GO:0009432","GO:0099040","GO:0042883","GO:0015734","GO:0008643","GO:0042760","GO:0015910","GO:0015777","GO:0019885","GO:0099133","GO:0090374","GO:0046689","GO:0060702","GO:0006289","GO:0015821","GO:0045332","GO:0015803","GO:0000770","GO:0015888","GO:0035461","GO:0043213","GO:0003333","GO:0001407","GO:0042953","GO:0072089","GO:0015689","GO:0015886"]},{"accession":"XP_002295139.1","go_terms":["GO:0000747","GO:0042274","GO:0000055","GO:0042254","GO:1901001","GO:0002181","GO:1903833","GO:0051301","GO:0006400","GO:0090529","GO:0007049","GO:0006260","GO:0006270","GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617","GO:0071232","GO:0045900","GO:0071264","GO:0000056","GO:0019062","GO:0018142","GO:0019082","GO:0018144","GO:0039546","GO:0044694","GO:0039611","GO:0051259","GO:0039520","GO:0039522","GO:0039707","GO:0039690","GO:0039544","GO:0006351","GO:0006824","GO:0030253","GO:0030153","GO:0017004","GO:0031460","GO:0010949","GO:0046677","GO:0009432","GO:0099040","GO:0046618","GO:0042883","GO:0015734","GO:0008643","GO:0042760","GO:0015910","GO:1900753","GO:0015777","GO:0006855","GO:0019885","GO:0099133","GO:0090374","GO:0046689","GO:0060702","GO:0006289","GO:0015821","GO:0045332","GO:0015803","GO:0000770","GO:0015888","GO:0035461","GO:0043213","GO:0045796","GO:0003333","GO:0043215","GO:0001407","GO:0042953","GO:0072089","GO:0015689","GO:0015886"]},{"accession":"XP_002286110.1","go_terms":["GO:0035774","GO:0007507","GO:0007420","GO:0014823","GO:0042182","GO:0019552","GO:0042594","GO:0060612","GO:0046952","GO:0046459"]},{"accession":"XP_002286628.1","go_terms":["GO:0042273","GO:0042255","GO:0042254","GO:1902626","GO:0000463"]},{"accession":"XP_002286784.1","go_terms":["GO:0000183","GO:0021629","GO:0030220","GO:0046716","GO:0098779","GO:0008065","GO:1902083","GO:0090043","GO:0006348","GO:0035066","GO:0071470","GO:0035855","GO:0010520","GO:0010742","GO:0016203","GO:0043969","GO:0014809","GO:0018076","GO:0043923","GO:0061635","GO:0001756","GO:0006990","GO:0048281","GO:1990414","GO:0035390","GO:0043044","GO:1903770","GO:1901347","GO:1901348","GO:0061820","GO:1904792","GO:0010338","GO:0009737","GO:0009736","GO:0009753","GO:1904911","GO:0009739","GO:0080113","GO:0010082","GO:1901430","GO:0070933","GO:1904850","GO:1905839","GO:0031848","GO:1905615","GO:1900386","GO:1905778","GO:0009301","GO:0035522","GO:0009751","GO:0072362","GO:0031627","GO:0006970","GO:0006334","GO:1903086","GO:1900056","GO:1900033","GO:0009723","GO:0016032","GO:0030154","GO:0010380","GO:0071919"]},{"accession":"XP_002287627.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002288072.1","go_terms":["GO:0006609","GO:0008033","GO:0034501","GO:0035048","GO:0000055","GO:0010824","GO:0042176","GO:0010014","GO:0007270","GO:0035281","GO:0009944","GO:0071528","GO:0042331","GO:0000122","GO:0042493","GO:1900370","GO:0000056","GO:0046825","GO:0006404","GO:0006406"]},{"accession":"XP_002288424.1","go_terms":["GO:0000289","GO:0010606","GO:0006397","GO:0034729","GO:0000245","GO:0048149","GO:1990108","GO:0071108","GO:0021551","GO:0051568","GO:0001662","GO:0035871","GO:0008583","GO:1904667","GO:0010995","GO:0070537","GO:0010992","GO:1904378","GO:0060013","GO:1903070","GO:0035520","GO:0035523","GO:0008343","GO:0044313","GO:1900425","GO:1901026","GO:0035192","GO:0006355","GO:0006511","GO:0006351","GO:0035616","GO:0061734","GO:0008277","GO:0034983","GO:0010029","GO:0070845","GO:0070846","GO:0070842","GO:0051289","GO:0071218","GO:0060997","GO:0090231","GO:0048668","GO:0035522","GO:1901300","GO:0010870","GO:0090035"]},{"accession":"XP_002290573.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002296019.1","go_terms":["GO:0006574","GO:0046392","GO:1902777","GO:0046487","GO:0055114","GO:0006571","GO:0019322","GO:0042183","GO:0006813","GO:0042853","GO:0046177","GO:0030435","GO:0006098","GO:0009099","GO:0009097","GO:0009051","GO:0006740"]},{"accession":"XP_002288472.1","go_terms":["GO:0032259","GO:0043642","GO:0006479","GO:0009809","GO:0042135","GO:0009236","GO:0006584"]},{"accession":"XP_002286824.1","go_terms":["GO:0050847","GO:0019089","GO:0090085","GO:2000203","GO:2000780","GO:0035519","GO:0061753","GO:0061734","GO:0061736","GO:0060360","GO:0002669","GO:1903861","GO:0070936","GO:0048260","GO:0033160","GO:0006513","GO:0043162","GO:0003197","GO:0042921","GO:2000058","GO:0010768","GO:0032443","GO:2000238","GO:1901165","GO:2000235","GO:0042787","GO:0034517","GO:2000232","GO:0071211","GO:0045723","GO:0035037","GO:0070534","GO:0070086","GO:0010796","GO:0010794","GO:0010793","GO:0031384","GO:0046642","GO:0010994","GO:1901315","GO:2000009","GO:0030579","GO:0060736","GO:1901016","GO:0045732","GO:0051865","GO:2000650"]},{"accession":"XP_002293511.1","go_terms":["GO:0071480","GO:0000304","GO:0034620","GO:2001033","GO:0060136","GO:1900365","GO:1900462","GO:1990911","GO:1990910","GO:0033169","GO:0061408","GO:0070207","GO:1904843","GO:0071276","GO:0072738","GO:0001892","GO:0071280","GO:1900427","GO:1903936","GO:0043497","GO:0006351"]},{"accession":"XP_002296042.1","go_terms":["GO:0042273","GO:0010835","GO:0007475"]},{"accession":"XP_002297048.1","go_terms":["GO:0071042","GO:0001178","GO:1990120","GO:0071049","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006260","GO:1902775","GO:0006268","GO:0006269","GO:0034475","GO:0034476","GO:0071051","GO:0006283","GO:0072715","GO:0006605","GO:0000462","GO:0000463","GO:0000464","GO:0000466","GO:0000467","GO:0070870","GO:0000393","GO:0000390","GO:0000716","GO:0000398","GO:0071441","GO:0016441","GO:0060303","GO:0018144","GO:1902626","GO:0016973","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006363","GO:0006369","GO:0048701","GO:0008306","GO:1900050","GO:0048026","GO:0042273","GO:1903241","GO:0019079","GO:0017038","GO:0045944","GO:0071894","GO:2000616","GO:0009432","GO:0070417","GO:1904570","GO:0010501","GO:1904574","GO:0071031","GO:0071035","GO:0071038","GO:0031047","GO:0043629","GO:0000378","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0090394","GO:1990416","GO:1990417","GO:0000027"]},{"accession":"XP_002286953.1","go_terms":["GO:0006355","GO:0030435","GO:0006351","GO:0001123","GO:0009408"]},{"accession":"XP_002286535.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002287798.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002288066.1","go_terms":["GO:0035774","GO:0007507","GO:0007420","GO:0014823","GO:0042182","GO:0019552","GO:0042594","GO:0060612","GO:0046952","GO:0046459"]},{"accession":"XP_002290444.1","go_terms":["GO:0034724","GO:0030574","GO:0034396","GO:0035551"]},{"accession":"XP_002293473.1","go_terms":["GO:1902039","GO:0000288","GO:1900246","GO:0034063","GO:0001308","GO:0000056","GO:0000472","GO:0016441","GO:0000447","GO:0000480","GO:2000637","GO:0061157","GO:1902416","GO:0042273","GO:0010835","GO:0007475"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0018293":1,"GO:0006105":1,"GO:0017013":1,"GO:0006121":1,"GO:0010719":1,"GO:0034553":1,"GO:0015777":2,"GO:0003333":2,"GO:0030253":2,"GO:0015910":2,"GO:0015888":2,"GO:0001407":2,"GO:0015886":2,"GO:0099040":2,"GO:0015803":2,"GO:0043215":2,"GO:0035461":2,"GO:0042493":2,"GO:0019885":2,"GO:0033344":1,"GO:0055099":1,"GO:0006824":2,"GO:0017004":2,"GO:0043213":2,"GO:0015689":2,"GO:0046677":2,"GO:0006855":2,"GO:0008643":2,"GO:0099133":2,"GO:0060702":2,"GO:0009432":3,"GO:0015914":1,"GO:0015821":2,"GO:0000770":2,"GO:0042953":2,"GO:0031288":1,"GO:0010949":2,"GO:0080051":1,"GO:0006289":2,"GO:0046689":2,"GO:0045332":2,"GO:0010222":1,"GO:0071366":1,"GO:0006727":1,"GO:0080168":1,"GO:0007584":1,"GO:0042632":1,"GO:0072089":2,"GO:2000032":1,"GO:0010212":1,"GO:0042883":2,"GO:0031460":2,"GO:0030299":1,"GO:0010345":1,"GO:0090374":2,"GO:0045796":2,"GO:1900753":2,"GO:0070731":1,"GO:0009877":1,"GO:0015772":1,"GO:0046618":2,"GO:0015734":2,"GO:0042760":2,"GO:0030153":2,"GO:0042891":1,"GO:0035617":1,"GO:0033314":1,"GO:0016485":1,"GO:0071232":1,"GO:0002181":1,"GO:0006888":1,"GO:0039522":1,"GO:0019079":2,"GO:0030968":1,"GO:0007049":1,"GO:0000056":3,"GO:0032968":1,"GO:0071712":1,"GO:1903833":1,"GO:0006260":2,"GO:0031117":1,"GO:2001171":1,"GO:0070370":1,"GO:0070407":1,"GO:0061738":1,"GO:0070651":1,"GO:0090296":1,"GO:0070914":1,"GO:2000158":1,"GO:0061641":1,"GO:0048219":1,"GO:0070676":1,"GO:0006272":1,"GO:0045899":1,"GO:0034214":1,"GO:0070987":1,"GO:1903007":1,"GO:0032979":1,"GO:1901800":1,"GO:0006400":1,"GO:0070682":1,"GO:0071264":1,"GO:1903715":1,"GO:0044694":1,"GO:0071218":2,"GO:0051260":1,"GO:0045053":1,"GO:0000747":1,"GO:0090261":1,"GO:0018279":1,"GO:0070842":2,"GO:0016558":1,"GO:0051131":1,"GO:0019062":1,"GO:0001824":1,"GO:0006351":4,"GO:0034599":1,"GO:0045900":1,"GO:0051259":1,"GO:0051301":1,"GO:0039611":1,"GO:1903862":1,"GO:0030433":1,"GO:0042274":1,"GO:1990171":1,"GO:0070389":1,"GO:0042254":2,"GO:0045041":1,"GO:0001319":1,"GO:0061166":1,"GO:0018144":2,"GO:0039544":1,"GO:0000055":2,"GO:0097352":1,"GO:0016562":1,"GO:0035494":1,"GO:0018142":1,"GO:0051013":1,"GO:1903724":1,"GO:0006406":2,"GO:0070414":1,"GO:0039707":1,"GO:0019082":1,"GO:1901001":1,"GO:0039690":1,"GO:0039520":1,"GO:0034551":1,"GO:0006270":1,"GO:0030420":1,"GO:0046034":1,"GO:0090529":1,"GO:0000733":1,"GO:0072389":1,"GO:0043335":1,"GO:0039546":1,"GO:0035774":2,"GO:0014823":2,"GO:0060612":2,"GO:0042594":2,"GO:0042182":2,"GO:0019552":2,"GO:0046952":2,"GO:0046459":2,"GO:0007507":2,"GO:0007420":2,"GO:1902626":2,"GO:0042255":2,"GO:0000463":2,"GO:0042273":4,"GO:0009736":1,"GO:1900033":1,"GO:0048281":1,"GO:0010082":1,"GO:1905615":1,"GO:0098779":1,"GO:0035390":1,"GO:1901348":1,"GO:0071919":1,"GO:0009737":1,"GO:1904911":1,"GO:0021629":1,"GO:0009751":1,"GO:0035855":1,"GO:0018076":1,"GO:1904792":1,"GO:0061820":1,"GO:0009739":1,"GO:0035522":2,"GO:0006348":1,"GO:1900056":1,"GO:0090043":1,"GO:0070933":1,"GO:0061635":1,"GO:0031848":1,"GO:0043923":1,"GO:1901430":1,"GO:1905778":1,"GO:0071470":1,"GO:0000183":1,"GO:0006970":1,"GO:1903086":1,"GO:0031627":1,"GO:0006990":1,"GO:0010520":1,"GO:1900386":1,"GO:0014809":1,"GO:0080113":1,"GO:0016032":1,"GO:0010338":1,"GO:0009723":1,"GO:0016203":1,"GO:0006334":1,"GO:0046716":1,"GO:0009753":1,"GO:1902083":1,"GO:1904850":1,"GO:0030154":1,"GO:0010380":1,"GO:1990414":1,"GO:0043044":2,"GO:0009301":1,"GO:0030220":1,"GO:0043969":1,"GO:1903770":1,"GO:1901347":1,"GO:1905839":1,"GO:0035066":1,"GO:0072362":1,"GO:0001756":1,"GO:0008065":1,"GO:0010742":1,"GO:0008033":1,"GO:0046825":1,"GO:0007270":1,"GO:0006609":1,"GO:0035048":1,"GO:0042331":1,"GO:1900370":1,"GO:0010014":1,"GO:0034501":1,"GO:0000122":1,"GO:0071528":1,"GO:0042176":1,"GO:0006404":1,"GO:0009944":1,"GO:0010824":1,"GO:0035281":1,"GO:0070537":1,"GO:0006511":1,"GO:0000289":1,"GO:1901026":1,"GO:0021551":1,"GO:0006397":1,"GO:1901300":1,"GO:0035192":1,"GO:0048668":1,"GO:0051289":1,"GO:0035520":1,"GO:1990108":1,"GO:0090231":1,"GO:0048149":1,"GO:0051568":1,"GO:0061734":2,"GO:0010029":1,"GO:0035616":1,"GO:0070846":1,"GO:0010995":1,"GO:0000245":1,"GO:0034983":1,"GO:0060013":1,"GO:1900425":1,"GO:0035523":1,"GO:0006355":2,"GO:0008583":1,"GO:0008277":1,"GO:0010606":1,"GO:0071108":1,"GO:0010870":1,"GO:1903070":1,"GO:0070845":1,"GO:0034729":1,"GO:0035871":1,"GO:0010992":1,"GO:1904667":1,"GO:0090035":1,"GO:0001662":1,"GO:0008343":1,"GO:0044313":1,"GO:0060997":1,"GO:1904378":1,"GO:0006574":1,"GO:0009051":1,"GO:0030435":2,"GO:0046392":1,"GO:0006571":1,"GO:0006740":1,"GO:0042183":1,"GO:1902777":1,"GO:0009097":1,"GO:0042853":1,"GO:0055114":1,"GO:0046177":1,"GO:0006098":1,"GO:0006813":1,"GO:0019322":1,"GO:0009099":1,"GO:0046487":1,"GO:0006584":1,"GO:0009236":1,"GO:0006479":1,"GO:0043642":1,"GO:0032259":1,"GO:0009809":1,"GO:0042135":1,"GO:0042787":1,"GO:2000009":1,"GO:0035037":1,"GO:0050847":1,"GO:0010768":1,"GO:0070534":1,"GO:2000650":1,"GO:1903861":1,"GO:0060736":1,"GO:2000232":1,"GO:0051865":1,"GO:2000235":1,"GO:0033160":1,"GO:0010796":1,"GO:0035519":1,"GO:0006513":1,"GO:0070086":1,"GO:2000780":1,"GO:0042921":1,"GO:0060360":1,"GO:2000203":1,"GO:0032443":1,"GO:0003197":1,"GO:0010793":1,"GO:0019089":1,"GO:0034517":1,"GO:0070936":1,"GO:2000238":1,"GO:0045732":1,"GO:0071211":1,"GO:0043162":1,"GO:0010794":1,"GO:0030579":1,"GO:0048260":1,"GO:0002669":1,"GO:0045723":1,"GO:0090085":1,"GO:0010994":1,"GO:0061753":1,"GO:0061736":1,"GO:1901165":1,"GO:0031384":1,"GO:0046642":1,"GO:2000058":1,"GO:1901315":1,"GO:1901016":1,"GO:0060136":1,"GO:0043497":1,"GO:2001033":1,"GO:1904843":1,"GO:0071276":1,"GO:0061408":1,"GO:0033169":1,"GO:0071280":1,"GO:0000304":1,"GO:1900427":1,"GO:1990911":1,"GO:1900462":1,"GO:1990910":1,"GO:0072738":1,"GO:0070207":1,"GO:1900365":1,"GO:0071480":1,"GO:1903936":1,"GO:0034620":1,"GO:0001892":1,"GO:0010835":2,"GO:0007475":2,"GO:0045944":1,"GO:0071031":1,"GO:0006363":1,"GO:0006605":1,"GO:0010501":1,"GO:0071051":1,"GO:1903241":1,"GO:0000398":1,"GO:0000462":1,"GO:0048026":1,"GO:0016441":2,"GO:1990417":1,"GO:0006269":1,"GO:0071042":1,"GO:0060303":1,"GO:0048701":1,"GO:0071894":1,"GO:0006306":1,"GO:0070417":1,"GO:0000464":1,"GO:1904570":1,"GO:0071035":1,"GO:1904574":1,"GO:0016973":1,"GO:0031047":1,"GO:0072715":1,"GO:0034475":1,"GO:0043629":1,"GO:1900050":1,"GO:0000378":1,"GO:0045003":1,"GO:0016584":1,"GO:0071038":1,"GO:0090394":1,"GO:0070870":1,"GO:0000393":1,"GO:0001178":1,"GO:0035640":1,"GO:1990120":1,"GO:0000027":1,"GO:0017038":1,"GO:0071441":1,"GO:0006369":1,"GO:1902775":1,"GO:0000716":1,"GO:0006283":1,"GO:0000466":1,"GO:2000616":1,"GO:0071049":1,"GO:0006311":1,"GO:0034476":1,"GO:0000390":1,"GO:0042766":1,"GO:1990416":1,"GO:0000388":1,"GO:0006301":1,"GO:0000467":1,"GO:0008306":1,"GO:0006268":1,"GO:0009408":1,"GO:0001123":1,"GO:0034724":1,"GO:0030574":1,"GO:0034396":1,"GO:0035551":1,"GO:1900246":1,"GO:0000472":1,"GO:0000288":1,"GO:2000637":1,"GO:0061157":1,"GO:0034063":1,"GO:0000480":1,"GO:1902416":1,"GO:0000447":1,"GO:0001308":1,"GO:1902039":1},"recipe_readded":["XP_002292280.1","XP_002294793.1","XP_002288685.1","XP_002287361.1","XP_002296263.1","XP_002296581.1","XP_002293208.1","XP_002287154.1","XP_002287835.1","XP_002286218.1","XP_002295558.1","XP_002296173.1","XP_002286811.1","XP_002292624.1","XP_002288512.1","XP_002293036.1","XP_002296472.1","XP_002294000.1","XP_002291469.1","XP_002289939.1"]}