{"hash":"2184623186919969565","title":"RNA Pol II Transcription Regulation","description":"Top terms are dominated by DNA-templated transcription and transcription from RNA polymerase II promoter, with several \u201cpositive regulation of transcription\u201d terms, indicating a transcription-regulatory cluster. Occasional cell-cycle or development terms likely reflect context-dependent regulation rather than a separate module. Overall, labeling as RNA Pol II Transcription Regulation captures the central theme.","confidence":"High","size":29,"edges":10,"triangles":0,"max_degree":6,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_012046202.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012046454.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012046552.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012046624.1","go_terms":["GO:0071032","GO:0071042","GO:0071035","GO:1904354","GO:0071039","GO:0071038","GO:0000467","GO:0071051","GO:0070481","GO:0090502","GO:0016973","GO:0070478","GO:0070651"]},{"accession":"XP_012047303.1","go_terms":["GO:1900399","GO:2001196","GO:0061415","GO:0061429","GO:2001158","GO:0035959","GO:0043457","GO:0035948","GO:0045122","GO:0035961","GO:0006351","GO:1904741","GO:2001278","GO:0061414","GO:0035969"]},{"accession":"XP_012047530.1","go_terms":["GO:0060195","GO:0033082","GO:0071168","GO:0014834","GO:0021766","GO:0098532","GO:0051567","GO:0097198","GO:0097676","GO:0048387","GO:2000134","GO:0021695","GO:0048298","GO:0034244","GO:0045857","GO:0071314","GO:0071549","GO:0014904","GO:0070314","GO:0034773","GO:0034772","GO:0034771","GO:1903709","GO:0031060","GO:0060669","GO:0051154","GO:0035441","GO:0043433","GO:0036333","GO:0006334","GO:1901674","GO:0080182","GO:0071440","GO:0045944","GO:0097421","GO:0033138","GO:2000616","GO:1903699","GO:1990654","GO:0090309","GO:1900006","GO:0014013","GO:0036166","GO:0045605","GO:0010424","GO:0006469","GO:0048316","GO:0032635","GO:2001040","GO:0003290","GO:0007507","GO:0043516","GO:0035984","GO:0003289","GO:0045128","GO:1904772","GO:0006354","GO:0044648","GO:0006351","GO:0014898"]},{"accession":"XP_012047552.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012048391.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012048506.1","go_terms":["GO:1901717","GO:0035959","GO:1901714","GO:1900399","GO:0061414","GO:0006351","GO:2001158","GO:0001080"]},{"accession":"XP_012049293.1","go_terms":["GO:0000821","GO:2001196","GO:0035961","GO:1904741","GO:0035969","GO:1900399","GO:0061415","GO:0061429","GO:2001158","GO:0035959","GO:0043457","GO:0035948","GO:0045122","GO:0006351","GO:2001278","GO:0061414"]},{"accession":"XP_012049766.1","go_terms":["GO:0000821","GO:2001196","GO:0035961","GO:1904741","GO:0035969","GO:1900399","GO:0061415","GO:0061429","GO:2001158","GO:0035959","GO:0043457","GO:0035948","GO:0045122","GO:0006351","GO:2001278","GO:0061414"]},{"accession":"XP_012049841.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012049965.1","go_terms":["GO:0032026","GO:1903251","GO:0000320","GO:0007595","GO:0000082","GO:0019085","GO:0019086","GO:0060153","GO:0033197","GO:0051301","GO:0000411","GO:0010165","GO:0035186","GO:0000122","GO:0007129","GO:0000086","GO:0030857","GO:0071157","GO:0044828","GO:1990069","GO:0033601","GO:0044321","GO:2001165","GO:0046626","GO:1905866","GO:0060070","GO:0010673","GO:0033598","GO:0033327","GO:0060749","GO:0010389","GO:0030968","GO:0097421","GO:0045737","GO:0006351","GO:2000775","GO:0010696"]},{"accession":"XP_012050619.1","go_terms":["GO:0032026","GO:1903251","GO:0000320","GO:0007595","GO:0000082","GO:0019085","GO:0019086","GO:0060153","GO:0033197","GO:0051301","GO:0000411","GO:0010165","GO:0035186","GO:0000122","GO:0007129","GO:0000086","GO:0030857","GO:0071157","GO:0044828","GO:1990069","GO:0033601","GO:0044321","GO:2001165","GO:0046626","GO:1905866","GO:0060070","GO:0010673","GO:0033598","GO:0033327","GO:0060749","GO:0010389","GO:0030968","GO:0097421","GO:0045737","GO:0006351","GO:2000775","GO:0010696"]},{"accession":"XP_012050824.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012050995.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012051223.1","go_terms":["GO:0032026","GO:1903251","GO:0000320","GO:0007595","GO:0000082","GO:0019085","GO:0019086","GO:0060153","GO:0033197","GO:0051301","GO:0000411","GO:0010165","GO:0035186","GO:0000122","GO:0007129","GO:0000086","GO:0030857","GO:0071157","GO:0044828","GO:1990069","GO:0033601","GO:0044321","GO:2001165","GO:0046626","GO:1905866","GO:0060070","GO:0010673","GO:0033598","GO:0033327","GO:0060749","GO:0010389","GO:0030968","GO:0097421","GO:0045737","GO:0006351","GO:2000775","GO:0010696","GO:0042144","GO:0005979","GO:0005981","GO:0000079","GO:0016242","GO:0050849"]},{"accession":"XP_012051791.1","go_terms":["GO:0032026","GO:1903251","GO:0000320","GO:0007595","GO:0000082","GO:0019085","GO:0019086","GO:0060153","GO:0033197","GO:0051301","GO:0000411","GO:0010165","GO:0035186","GO:0000122","GO:0007129","GO:0000086","GO:0030857","GO:0071157","GO:0044828","GO:1990069","GO:0033601","GO:0044321","GO:2001165","GO:0046626","GO:1905866","GO:0060070","GO:0010673","GO:0033598","GO:0033327","GO:0060749","GO:0010389","GO:0030968","GO:0097421","GO:0045737","GO:0006351","GO:2000775","GO:0010696","GO:0036011","GO:0022416","GO:0010119","GO:0072015","GO:1901409","GO:0070816","GO:0009637","GO:0045498","GO:0045944","GO:2000070","GO:0006367","GO:0006366"]},{"accession":"XP_012051800.1","go_terms":["GO:0006261","GO:0007062"]},{"accession":"XP_012052047.1","go_terms":["GO:0050790","GO:0042176","GO:0006511","GO:0043248","GO:0006461","GO:0070262","GO:1903538","GO:0051754","GO:0007143","GO:0051306","GO:2001241","GO:0051232"]},{"accession":"XP_012052384.1","go_terms":["GO:0006904","GO:1903480","GO:0030050","GO:0045033","GO:1904970","GO:0070493","GO:1902405","GO:0009826","GO:0007107","GO:0021592","GO:0043087","GO:0038089","GO:0032252","GO:0048820","GO:0021678","GO:0021873","GO:0006930","GO:0048313","GO:0045769","GO:0050957","GO:0032529","GO:0031585","GO:0007051","GO:0048496","GO:0007339","GO:0000132","GO:0001778","GO:0051489","GO:0000011","GO:0051661","GO:0007118","GO:0000001","GO:0016198","GO:0051904","GO:1903477","GO:1903478","GO:0060474","GO:1900748"]},{"accession":"XP_012052529.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012052648.1","go_terms":["GO:0018027","GO:0000183","GO:0018023","GO:0031167","GO:0018013"]},{"accession":"XP_012053889.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012053897.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0042110","GO:0001666","GO:0001662","GO:0043542","GO:0098869","GO:0036343","GO:0035641","GO:0006508","GO:0031295","GO:0008284","GO:0015996","GO:0050796","GO:0007155","GO:0010716","GO:0033632"]},{"accession":"XP_012053939.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012048589.1","go_terms":["GO:0006470"]},{"accession":"XP_012050766.1","go_terms":["GO:0006654","GO:0036089","GO:0051044","GO:0031139","GO:1990126","GO:0006907","GO:0008333","GO:0060348","GO:0061512","GO:1990502","GO:1990854","GO:0071800","GO:0000902","GO:0071539","GO:0010252","GO:1903595","GO:2000769","GO:0034498","GO:0032258","GO:0034499","GO:2000642","GO:1904179","GO:0048310","GO:0000278","GO:0060378","GO:1904888","GO:0001654","GO:0000281","GO:0072673","GO:0048015","GO:0045022","GO:0043547","GO:0022617","GO:0002051","GO:0097320","GO:0070676","GO:0032120","GO:0032005","GO:0032534"]},{"accession":"XP_012047209.1","go_terms":[]}],"graph":[["XP_012053889.1","XP_012049293.1",0.524],["XP_012046624.1","XP_012052047.1",0.582],["XP_012046454.1","XP_012052047.1",0.555],["XP_012049965.1","XP_012049841.1",0.666],["XP_012049965.1","XP_012052047.1",0.714],["XP_012049965.1","XP_012052384.1",0.666],["XP_012047530.1","XP_012052047.1",0.574],["XP_012047530.1","XP_012047209.1",0.52],["XP_012050824.1","XP_012052047.1",0.621],["XP_012052047.1","XP_012051223.1",0.621]],"all_go_terms":{"GO:1904354":1,"GO:0070478":1,"GO:0071035":1,"GO:0071051":1,"GO:0071039":1,"GO:0071042":1,"GO:0016973":1,"GO:0070651":1,"GO:0071038":1,"GO:0071032":1,"GO:0090502":1,"GO:0070481":1,"GO:0000467":1,"GO:2001196":3,"GO:0035961":3,"GO:0061429":3,"GO:0035948":3,"GO:0043457":3,"GO:0045122":3,"GO:0035959":4,"GO:0006351":9,"GO:2001278":3,"GO:1904741":3,"GO:0061414":4,"GO:0035969":3,"GO:2001158":4,"GO:0061415":3,"GO:1900399":4,"GO:0043516":1,"GO:0010424":1,"GO:0014834":1,"GO:0045605":1,"GO:0060669":1,"GO:0007507":1,"GO:0048387":1,"GO:0036333":1,"GO:0071314":1,"GO:1904772":1,"GO:0048298":1,"GO:0006469":1,"GO:0097198":1,"GO:1903709":1,"GO:0080182":1,"GO:0033082":1,"GO:0045857":1,"GO:0034244":1,"GO:0097676":1,"GO:0097421":5,"GO:2000134":1,"GO:0031060":1,"GO:0051154":1,"GO:0045944":2,"GO:0034773":1,"GO:0044648":1,"GO:0014013":1,"GO:0043433":1,"GO:0036166":1,"GO:0003290":1,"GO:0070314":1,"GO:0071440":1,"GO:1990654":1,"GO:0071168":1,"GO:0071549":1,"GO:0035441":1,"GO:2000616":1,"GO:0003289":1,"GO:0014904":1,"GO:0033138":1,"GO:1903699":1,"GO:0021695":1,"GO:0048316":1,"GO:0098532":1,"GO:0035984":1,"GO:0051567":1,"GO:0034771":1,"GO:0014898":1,"GO:0032635":1,"GO:2001040":1,"GO:0090309":1,"GO:1900006":1,"GO:0045128":1,"GO:0034772":1,"GO:0021766":1,"GO:1901674":1,"GO:0060195":1,"GO:0006354":1,"GO:0006334":1,"GO:1901714":1,"GO:0001080":1,"GO:1901717":1,"GO:0000821":2,"GO:0000320":4,"GO:0060153":4,"GO:1990069":4,"GO:0035186":4,"GO:0032026":4,"GO:0044828":4,"GO:0060749":4,"GO:0007595":4,"GO:0044321":4,"GO:0033598":4,"GO:0000082":4,"GO:0071157":4,"GO:0051301":4,"GO:0060070":4,"GO:2001165":4,"GO:1905866":4,"GO:0046626":4,"GO:2000775":4,"GO:0010389":4,"GO:0019085":4,"GO:0033197":4,"GO:0000411":4,"GO:0010165":4,"GO:0033601":4,"GO:1903251":4,"GO:0030857":4,"GO:0000122":4,"GO:0019086":4,"GO:0033327":4,"GO:0030968":4,"GO:0007129":4,"GO:0010673":4,"GO:0010696":4,"GO:0000086":4,"GO:0045737":4,"GO:0016242":1,"GO:0005981":1,"GO:0050849":1,"GO:0000079":1,"GO:0005979":1,"GO:0042144":1,"GO:0022416":1,"GO:0006367":1,"GO:1901409":1,"GO:0036011":1,"GO:0009637":1,"GO:0045498":1,"GO:0070816":1,"GO:0010119":1,"GO:2000070":1,"GO:0006366":1,"GO:0072015":1,"GO:0006261":1,"GO:0007062":1,"GO:0051306":1,"GO:2001241":1,"GO:1903538":1,"GO:0007143":1,"GO:0043248":1,"GO:0051754":1,"GO:0051232":1,"GO:0006461":1,"GO:0042176":1,"GO:0050790":1,"GO:0006511":1,"GO:0070262":1,"GO:1900748":1,"GO:0048496":1,"GO:0048820":1,"GO:0007107":1,"GO:0048313":1,"GO:0000132":1,"GO:0006930":1,"GO:0006904":1,"GO:0070493":1,"GO:0000001":1,"GO:0051661":1,"GO:0031585":1,"GO:0007051":1,"GO:0050957":1,"GO:0001778":1,"GO:0021873":1,"GO:0009826":1,"GO:0021678":1,"GO:0051904":1,"GO:0043087":1,"GO:0045033":1,"GO:0007339":1,"GO:1902405":1,"GO:0038089":1,"GO:1903478":1,"GO:0032252":1,"GO:1903477":1,"GO:0021592":1,"GO:0016198":1,"GO:0060474":1,"GO:0045769":1,"GO:0030050":1,"GO:0051489":1,"GO:0007118":1,"GO:1903480":1,"GO:0000011":1,"GO:0032529":1,"GO:1904970":1,"GO:0018013":1,"GO:0000183":1,"GO:0018027":1,"GO:0018023":1,"GO:0031167":1,"GO:0050796":1,"GO:0046718":1,"GO:0001666":1,"GO:0035641":1,"GO:0007155":1,"GO:0043542":1,"GO:0042110":1,"GO:0033632":1,"GO:0031295":1,"GO:0010716":1,"GO:0036343":1,"GO:0008284":1,"GO:0098869":1,"GO:0015996":1,"GO:0001662":1,"GO:0006508":1,"GO:0006470":1,"GO:0051044":1,"GO:1904179":1,"GO:0032258":1,"GO:0072673":1,"GO:1990502":1,"GO:0032005":1,"GO:0061512":1,"GO:0043547":1,"GO:2000769":1,"GO:0048015":1,"GO:0097320":1,"GO:0071800":1,"GO:0008333":1,"GO:1990126":1,"GO:0071539":1,"GO:0060378":1,"GO:1990854":1,"GO:0036089":1,"GO:0060348":1,"GO:0031139":1,"GO:0010252":1,"GO:0070676":1,"GO:0006907":1,"GO:0000281":1,"GO:0034499":1,"GO:0000278":1,"GO:1903595":1,"GO:2000642":1,"GO:0048310":1,"GO:0022617":1,"GO:0001654":1,"GO:0002051":1,"GO:0032534":1,"GO:0045022":1,"GO:0032120":1,"GO:0034498":1,"GO:0000902":1,"GO:1904888":1,"GO:0006654":1},"recipe_readded":["XP_012048339.1","XP_012050483.1","XP_012046410.1","XP_012050797.1","XP_012048963.1","XP_012048495.1","XP_012047040.1","XP_012046947.1","XP_012047881.1","XP_012046415.1","XP_012050249.1","XP_012046385.1","XP_012046842.1","XP_012051995.1","XP_012046666.1","XP_012050736.1","XP_012046951.1","XP_012050371.1","XP_012046618.1","XP_012046167.1"]}