{"hash":"357371215342693154","title":"Nuclear transcription and DNA replication machinery","description":"The cluster centers on transcription-related processes (DNA-templated transcription, RNA Pol II regulation) and core replication components (GINS assembly, DNA replication, mitotic replication initiation, DNA strand elongation), with accompanying RNA processing terms (spliceosome assembly, mRNA/tRNA splicing). This suggests a cohesive nuclear module coordinating transcription, RNA processing, and DNA replication. The viral process term likely reflects incidental annotations rather than a defining function of the cluster.","confidence":"High","size":21,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_002501807.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002507843.1","go_terms":["GO:0045292","GO:0000244"]},{"accession":"XP_002503166.1","go_terms":["GO:0006388"]},{"accession":"XP_002508231.1","go_terms":["GO:0006270","GO:0000727","GO:0032508","GO:0001833","GO:0006260","GO:0071165","GO:1902969","GO:1902983","GO:1902977","GO:1902975"]},{"accession":"XP_002504203.1","go_terms":["GO:0018023"]},{"accession":"XP_002508117.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002506844.1","go_terms":["GO:0035751","GO:0010807","GO:0006904","GO:0008333","GO:0032418","GO:0030220","GO:1902902","GO:0099022","GO:0070889","GO:0007412","GO:0030073","GO:0035855","GO:0072659","GO:0048070","GO:0016188","GO:0007274","GO:0002576","GO:0060292","GO:0090330","GO:0015758","GO:0045956","GO:0045955","GO:0001909","GO:0099525","GO:0032400","GO:0022615","GO:0006914","GO:0051291","GO:0048210","GO:0035543","GO:0070177","GO:0007269","GO:0035544","GO:0000011","GO:0006623","GO:0006896","GO:0006895","GO:0051469","GO:0043312","GO:0032229","GO:0048280","GO:0043524","GO:0070527"]},{"accession":"XP_002502838.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0007166","GO:0023051"]},{"accession":"XP_002505438.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002507152.1","go_terms":["GO:0035390","GO:0043044","GO:0000183","GO:0035066","GO:1903770","GO:1901347","GO:1901348","GO:0061820","GO:1904792","GO:0010338","GO:0009737","GO:0009736","GO:0009753","GO:1904911","GO:0009739","GO:0080113","GO:0010082","GO:1901430","GO:0070933","GO:1904850","GO:1905839","GO:0010520","GO:0031848","GO:1905615","GO:1900386","GO:1905778","GO:0009301","GO:0035522","GO:0009751","GO:0072362","GO:0031627","GO:0006970","GO:0006334","GO:1903086","GO:1900056","GO:1900033","GO:0009723","GO:0016032","GO:0030154","GO:0010380","GO:1990414","GO:0071919"]},{"accession":"XP_002508726.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002500100.1","go_terms":["GO:0019827","GO:0006351","GO:0030521"]},{"accession":"XP_002500687.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002500748.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002501063.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002505180.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002505994.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002508409.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002508775.1","go_terms":["GO:0033158","GO:0043388","GO:0045454","GO:0000122","GO:0098869","GO:1903206","GO:0006662","GO:0080058","GO:0034599","GO:0018401","GO:0055114","GO:0046826","GO:0006351","GO:0016032","GO:1903026","GO:0034976","GO:0034975","GO:0030091","GO:2001238","GO:0006621","GO:0015693","GO:0035269","GO:0018279"]},{"accession":"XP_002503613.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_002502391.1","go_terms":["GO:0035794","GO:0010917","GO:0010940"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0000244":1,"GO:0045292":1,"GO:0006388":1,"GO:1902983":1,"GO:0071165":1,"GO:0006260":1,"GO:1902975":1,"GO:0006270":1,"GO:0000727":1,"GO:1902977":1,"GO:0001833":1,"GO:1902969":1,"GO:0032508":1,"GO:0018023":1,"GO:0032229":1,"GO:0032418":1,"GO:0072659":1,"GO:0090330":1,"GO:0060292":1,"GO:0099525":1,"GO:0043312":1,"GO:0032400":1,"GO:0001909":1,"GO:0008333":1,"GO:0030073":1,"GO:0048210":1,"GO:0035544":1,"GO:0006896":1,"GO:0043524":1,"GO:0006895":1,"GO:0002576":1,"GO:0015758":1,"GO:0006623":1,"GO:0070889":1,"GO:0035855":1,"GO:0016188":1,"GO:0045955":1,"GO:0051291":1,"GO:0007269":1,"GO:0006904":1,"GO:0099022":1,"GO:0045956":1,"GO:0000011":1,"GO:0007412":1,"GO:0048280":1,"GO:0022615":1,"GO:0035543":1,"GO:0070527":1,"GO:0007274":1,"GO:1902902":1,"GO:0030220":1,"GO:0070177":1,"GO:0048070":1,"GO:0051469":1,"GO:0010807":1,"GO:0006914":1,"GO:0035751":1,"GO:0042981":1,"GO:0036205":1,"GO:1900095":1,"GO:0070936":1,"GO:0038018":1,"GO:0060816":1,"GO:0070512":1,"GO:0051865":1,"GO:0046328":1,"GO:0085020":1,"GO:0023051":1,"GO:0000209":1,"GO:1903721":1,"GO:0033209":1,"GO:0043066":1,"GO:0000122":2,"GO:0060544":1,"GO:0034121":1,"GO:1903762":1,"GO:2000620":1,"GO:0042787":1,"GO:0007250":1,"GO:1903265":1,"GO:0070535":1,"GO:0071157":1,"GO:0007166":1,"GO:0046621":1,"GO:0090073":1,"GO:1901253":1,"GO:0009048":1,"GO:0016558":1,"GO:0030433":1,"GO:0033151":1,"GO:0000183":1,"GO:0043044":1,"GO:1900386":1,"GO:0006970":1,"GO:0035522":1,"GO:0031848":1,"GO:1901430":1,"GO:0009723":1,"GO:0016032":2,"GO:0035066":1,"GO:1901348":1,"GO:0010380":1,"GO:1905778":1,"GO:1904792":1,"GO:0010082":1,"GO:0009301":1,"GO:0010338":1,"GO:1904850":1,"GO:1905615":1,"GO:1990414":1,"GO:1901347":1,"GO:1903770":1,"GO:0009736":1,"GO:0006334":1,"GO:0009737":1,"GO:0030154":1,"GO:0070933":1,"GO:0072362":1,"GO:0035390":1,"GO:0080113":1,"GO:0009753":1,"GO:0071919":1,"GO:1903086":1,"GO:0061820":1,"GO:1904911":1,"GO:1900033":1,"GO:0009739":1,"GO:1905839":1,"GO:0010520":1,"GO:0009751":1,"GO:0031627":1,"GO:1900056":1,"GO:0006351":2,"GO:0030521":1,"GO:0019827":1,"GO:0018279":1,"GO:0043388":1,"GO:0080058":1,"GO:2001238":1,"GO:0098869":1,"GO:0045454":1,"GO:0034975":1,"GO:0033158":1,"GO:0055114":1,"GO:0015693":1,"GO:1903206":1,"GO:0034599":1,"GO:0035269":1,"GO:0046826":1,"GO:1903026":1,"GO:0030091":1,"GO:0034976":1,"GO:0006662":1,"GO:0006621":1,"GO:0018401":1,"GO:0035794":1,"GO:0010940":1,"GO:0010917":1},"recipe_readded":["XP_002505441.1","XP_002507475.1","XP_002506379.1","XP_002509089.1","XP_002500115.1","XP_002500682.1","XP_002502467.1","XP_002504492.1","XP_002504228.1","XP_002502395.1","XP_002508500.1","XP_002502267.1","XP_002504273.1","XP_002500413.1","XP_002502120.1","XP_002500756.1","XP_002504260.1","XP_002509067.1","XP_002500216.1","XP_002509343.1"]}