{"hash":"2294451703891021938","title":"Bacterial biosynthesis and catabolic pathways","description":"This cluster includes multiple biosynthetic processes typical of bacteria (lipopolysaccharide, ectoine, L-proline, and antibiotic biosynthesis) as well as catabolic pathways for small molecules (GABA, putrescine) and a note on transcription. The mix suggests a broad bacterial metabolic theme rather than a single precise function, hence a label emphasizing both biosynthesis and catabolism in microbes.","confidence":"Medium","size":13,"edges":7,"triangles":1,"max_degree":5,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"XP_002500788.1","go_terms":["GO:0007029","GO:0019876","GO:0009062","GO:0032543","GO:0070681"]},{"accession":"XP_002508364.1","go_terms":["GO:0006564","GO:0019509","GO:0016311","GO:0033574","GO:0097755","GO:0006874","GO:0070574","GO:0071577","GO:0006825","GO:0009103","GO:0046839","GO:0019373","GO:0046272","GO:0046380","GO:0005975","GO:0046295","GO:0006045","GO:0019700"]},{"accession":"XP_002500670.1","go_terms":["GO:0001561","GO:0018924","GO:0019516","GO:0046296","GO:0009853","GO:0008299","GO:0009854"]},{"accession":"XP_002501871.1","go_terms":["GO:0090296","GO:0051131","GO:0000725","GO:0016558","GO:0070407","GO:0030163","GO:0006515","GO:0034599","GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0006260","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0051301","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0072389","GO:0045041","GO:0000733","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617","GO:0090073","GO:0034766","GO:0032463","GO:0031412","GO:0003341","GO:1990048","GO:0000027"]},{"accession":"XP_002507798.1","go_terms":["GO:0010142","GO:0061623","GO:0019288","GO:0019287","GO:0000435","GO:0046396","GO:0042352","GO:0046835","GO:0006695","GO:0009088","GO:0019402","GO:0009086","GO:0009092"]},{"accession":"XP_002500109.1","go_terms":["GO:0019491","GO:0097089","GO:1902181","GO:0042400","GO:0001561"]},{"accession":"XP_002500636.1","go_terms":["GO:0006561","GO:0010133","GO:0006351","GO:0055114","GO:0007494","GO:0048566","GO:0031016","GO:0031076","GO:0009450","GO:0060324","GO:0021983","GO:0021915","GO:0042572","GO:0042574","GO:0048384","GO:0021768","GO:0035799","GO:0014032","GO:0050885","GO:0009258","GO:0001568","GO:0006540","GO:0042904","GO:0043584","GO:0019545","GO:0019544","GO:1901023","GO:0009954","GO:0019285","GO:0007584","GO:0060013","GO:0070384","GO:0060166","GO:0009447","GO:0003007","GO:0035115","GO:0051591","GO:0006678","GO:0042472","GO:0009952","GO:0002072","GO:0019413","GO:0036293","GO:0055129","GO:0015976","GO:0032180","GO:0048738","GO:0071300","GO:0006537","GO:0030900","GO:0030902","GO:0009855","GO:0001936","GO:0006068","GO:0006069","GO:0006355"]},{"accession":"XP_002507139.1","go_terms":["GO:0034720","GO:0070544","GO:0045668","GO:0030961","GO:2001214","GO:0042264","GO:0042265","GO:0036138","GO:0045746","GO:0006351","GO:0045663","GO:0061428"]},{"accession":"XP_002505882.1","go_terms":["GO:0033050","GO:0017000","GO:0046300","GO:0045329","GO:0006151"]},{"accession":"XP_002503201.1","go_terms":["GO:0009102","GO:0019491","GO:0048148","GO:0017000","GO:0009450","GO:0009413","GO:0055129","GO:0019878","GO:0015995","GO:0006782","GO:0006593","GO:0010121","GO:0009447","GO:0019481","GO:0019483","GO:0042450","GO:0009089"]},{"accession":"XP_002506025.1","go_terms":["GO:0009718","GO:0001081","GO:0009242","GO:0006541","GO:0006012","GO:0006351","GO:1901006","GO:0009699","GO:0055114","GO:0009243","GO:0010253","GO:0019835","GO:0042351","GO:0097171","GO:0006556","GO:0009244","GO:0019305","GO:0045226","GO:0019673","GO:0009103","GO:0080110","GO:0042619","GO:0035754","GO:0060716","GO:0001942","GO:0016126","GO:0008204","GO:1902653","GO:0033320","GO:0033499","GO:0033358","GO:0033481","GO:0019306","GO:0019878","GO:1902987","GO:0008611","GO:0010025","GO:0035336","GO:0019388"]},{"accession":"XP_002507584.1","go_terms":["GO:0051262","GO:1902031","GO:0006090","GO:0006108","GO:0043464"]},{"accession":"XP_002500637.1","go_terms":["GO:0010098","GO:0002136","GO:0032447","GO:0002143","GO:0070814","GO:0006747","GO:0019344","GO:0019379","GO:0006750","GO:0009086"]}],"graph":[["XP_002500109.1","XP_002508364.1",0.804],["XP_002500670.1","XP_002500788.1",0.516],["XP_002507139.1","XP_002508364.1",0.798],["XP_002500636.1","XP_002505882.1",0.562],["XP_002500636.1","XP_002508364.1",0.504],["XP_002505882.1","XP_002508364.1",0.797],["XP_002506025.1","XP_002508364.1",0.543]],"all_go_terms":{"GO:0009062":1,"GO:0070681":1,"GO:0019876":1,"GO:0007029":1,"GO:0032543":1,"GO:0006564":1,"GO:0006874":1,"GO:0046380":1,"GO:0046295":1,"GO:0006825":1,"GO:0097755":1,"GO:0033574":1,"GO:0071577":1,"GO:0046272":1,"GO:0070574":1,"GO:0009103":2,"GO:0046839":1,"GO:0005975":1,"GO:0006045":1,"GO:0019700":1,"GO:0016311":1,"GO:0019373":1,"GO:0019509":1,"GO:0046296":1,"GO:0018924":1,"GO:0009854":1,"GO:0001561":2,"GO:0009853":1,"GO:0008299":1,"GO:0019516":1,"GO:0070914":1,"GO:0030420":1,"GO:0018279":1,"GO:0070842":1,"GO:0030968":1,"GO:0090261":1,"GO:0035494":1,"GO:0072389":1,"GO:0032463":1,"GO:0070987":1,"GO:0090296":1,"GO:0043335":1,"GO:0061166":1,"GO:0070389":1,"GO:0045041":1,"GO:0000725":1,"GO:0051260":1,"GO:1903724":1,"GO:0070407":1,"GO:0000027":1,"GO:1903862":1,"GO:1901800":1,"GO:0006260":1,"GO:0070676":1,"GO:0051301":1,"GO:0003341":1,"GO:1903715":1,"GO:0001824":1,"GO:0034599":1,"GO:0032979":1,"GO:0031117":1,"GO:0001319":1,"GO:0061738":1,"GO:0031412":1,"GO:0034214":1,"GO:0045053":1,"GO:1990048":1,"GO:0048219":1,"GO:0051131":1,"GO:0030163":1,"GO:0006272":1,"GO:0097352":1,"GO:0000733":1,"GO:0019079":1,"GO:0070414":1,"GO:0071712":1,"GO:0070651":1,"GO:1903007":1,"GO:0006888":1,"GO:0061641":1,"GO:2000158":1,"GO:0016562":1,"GO:0045899":1,"GO:0070682":1,"GO:0032968":1,"GO:1990171":1,"GO:0046034":1,"GO:0006515":1,"GO:0033314":1,"GO:0070370":1,"GO:0006406":1,"GO:0034551":1,"GO:0051013":1,"GO:0090073":1,"GO:0016485":1,"GO:0071218":1,"GO:0034766":1,"GO:0016558":1,"GO:2001171":1,"GO:0030433":1,"GO:0035617":1,"GO:0010142":1,"GO:0000435":1,"GO:0006695":1,"GO:0019287":1,"GO:0019288":1,"GO:0046396":1,"GO:0061623":1,"GO:0019402":1,"GO:0042352":1,"GO:0009088":1,"GO:0009086":2,"GO:0046835":1,"GO:0009092":1,"GO:0097089":1,"GO:1902181":1,"GO:0019491":2,"GO:0042400":1,"GO:0051591":1,"GO:0001936":1,"GO:0006069":1,"GO:0007494":1,"GO:0060013":1,"GO:0021768":1,"GO:0035799":1,"GO:0043584":1,"GO:0035115":1,"GO:0036293":1,"GO:0006678":1,"GO:0006355":1,"GO:0042472":1,"GO:0032180":1,"GO:0019285":1,"GO:0003007":1,"GO:0060324":1,"GO:0009855":1,"GO:0006561":1,"GO:0042572":1,"GO:0055114":2,"GO:0048566":1,"GO:0019544":1,"GO:0002072":1,"GO:0015976":1,"GO:0048738":1,"GO:0030900":1,"GO:0006351":3,"GO:0009258":1,"GO:0014032":1,"GO:0010133":1,"GO:0060166":1,"GO:0030902":1,"GO:0019413":1,"GO:0006540":1,"GO:0001568":1,"GO:0042574":1,"GO:0007584":1,"GO:0009450":2,"GO:0070384":1,"GO:0009954":1,"GO:0050885":1,"GO:0019545":1,"GO:0048384":1,"GO:0009952":1,"GO:0042904":1,"GO:0031076":1,"GO:0009447":2,"GO:0021983":1,"GO:0031016":1,"GO:0006068":1,"GO:0021915":1,"GO:0071300":1,"GO:1901023":1,"GO:0055129":2,"GO:0006537":1,"GO:0042265":1,"GO:0061428":1,"GO:0034720":1,"GO:0036138":1,"GO:0030961":1,"GO:0045663":1,"GO:0045746":1,"GO:0042264":1,"GO:0070544":1,"GO:2001214":1,"GO:0045668":1,"GO:0017000":2,"GO:0006151":1,"GO:0046300":1,"GO:0045329":1,"GO:0033050":1,"GO:0006593":1,"GO:0009413":1,"GO:0015995":1,"GO:0006782":1,"GO:0009089":1,"GO:0019878":2,"GO:0048148":1,"GO:0010121":1,"GO:0019481":1,"GO:0019483":1,"GO:0009102":1,"GO:0042450":1,"GO:1902987":1,"GO:0008204":1,"GO:0001942":1,"GO:1902653":1,"GO:1901006":1,"GO:0009243":1,"GO:0035754":1,"GO:0042351":1,"GO:0045226":1,"GO:0006012":1,"GO:0042619":1,"GO:0009242":1,"GO:0006541":1,"GO:0019305":1,"GO:0019835":1,"GO:0033499":1,"GO:0019673":1,"GO:0009718":1,"GO:0010025":1,"GO:0080110":1,"GO:0019388":1,"GO:0016126":1,"GO:0006556":1,"GO:0009699":1,"GO:0008611":1,"GO:0097171":1,"GO:0060716":1,"GO:0010253":1,"GO:0035336":1,"GO:0001081":1,"GO:0033320":1,"GO:0033481":1,"GO:0033358":1,"GO:0009244":1,"GO:0019306":1,"GO:0043464":1,"GO:0006108":1,"GO:0051262":1,"GO:1902031":1,"GO:0006090":1,"GO:0006747":1,"GO:0010098":1,"GO:0070814":1,"GO:0002136":1,"GO:0019344":1,"GO:0006750":1,"GO:0019379":1,"GO:0002143":1,"GO:0032447":1},"recipe_readded":["XP_002508306.1","XP_002501642.1","YP_002808656.1","XP_002509254.1","XP_002508168.1","XP_002499449.1","XP_002504144.1","XP_002501613.1","XP_002503354.1","XP_002500996.1","XP_002507034.1","XP_002501973.1","XP_002503083.1","XP_002503629.1","XP_002499950.1","XP_002502202.1","XP_002499838.1","XP_002502086.1","XP_002507333.1","XP_002502498.1"]}