{"hash":"728968553048237550","title":"TNF\u2013NF-\u03baB signaling and ubiquitination","description":"The top GO terms point to TNF-mediated signaling and NF-\u03baB activation, including TNF signaling, I\u03baB phosphorylation, and NF-\u03baB\u2013inducing kinase activity. The presence of protein ubiquitination and autoubiquitination suggests regulation of these pathways by ubiquitin, which is a key mechanism in TNF/NF-\u03baB signaling and in controlling apoptosis; the histone ubiquitination hint aligns with broader ubiquitin-related regulation. Overall, the cluster appears to represent a TNF/NF-\u03baB signaling module modulated by ubiquitination and linked to apoptotic regulation.","confidence":"High","size":6,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_003382727.2","go_terms":["GO:0008284","GO:0051573","GO:2000616"]},{"accession":"XP_011403498.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XP_011408339.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0031030","GO:0032186","GO:1902364","GO:0000921","GO:0031578","GO:0097271","GO:0044810","GO:0090337","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XP_011409066.2","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:1902187","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0070534","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XP_019860349.1","go_terms":["GO:1904333","GO:1902174","GO:1902231","GO:0010804","GO:0003007","GO:0007296","GO:0060766","GO:0016049","GO:1904290","GO:1990683","GO:0043060","GO:0045838","GO:1990466","GO:0033235","GO:0033234"]},{"accession":"XP_019862374.1","go_terms":["GO:1903265","GO:0030323","GO:0071222","GO:0007249","GO:0033209","GO:0032648","GO:0051023","GO:0070498","GO:0008063","GO:0043507","GO:0002726","GO:0007250","GO:1903721","GO:0051865","GO:0045084","GO:0001843","GO:0070534","GO:0046529","GO:0050852","GO:0007585","GO:0070207","GO:0019886","GO:0032743","GO:2001238","GO:0045087","GO:0030316","GO:0007370","GO:0042475","GO:0042102","GO:0045453","GO:0051092","GO:0003384","GO:0045410","GO:0042088","GO:0090073","GO:0071732","GO:0031666","GO:0032088","GO:0045167","GO:0045672","GO:0097300","GO:0043011","GO:2000679"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0008284":1,"GO:0051573":1,"GO:2000616":1,"GO:0033209":4,"GO:1900095":3,"GO:0016567":3,"GO:0036205":3,"GO:0042981":3,"GO:0070936":3,"GO:0070535":3,"GO:0046621":3,"GO:0030433":3,"GO:0085020":3,"GO:0039536":3,"GO:0051865":4,"GO:1901253":3,"GO:0002250":3,"GO:0042787":3,"GO:0009048":3,"GO:2000620":3,"GO:0046328":3,"GO:1903721":4,"GO:0070512":3,"GO:1903762":3,"GO:0090073":4,"GO:0033151":3,"GO:0038018":3,"GO:0007250":4,"GO:0016558":3,"GO:1903265":4,"GO:0060816":3,"GO:0031030":1,"GO:0097271":1,"GO:0031578":1,"GO:0044810":1,"GO:0000921":1,"GO:0090337":1,"GO:1902364":1,"GO:0032186":1,"GO:0060546":1,"GO:1902187":1,"GO:1901224":1,"GO:0070534":2,"GO:0045623":1,"GO:0031664":1,"GO:0048535":1,"GO:0000185":1,"GO:0033280":1,"GO:0007014":1,"GO:0048536":1,"GO:0002635":1,"GO:0007026":1,"GO:0051607":1,"GO:0097039":1,"GO:0043029":1,"GO:0048490":1,"GO:0032897":1,"GO:0009896":1,"GO:0050999":1,"GO:0043123":1,"GO:1903883":1,"GO:0061158":1,"GO:0006914":1,"GO:0061470":1,"GO:0042098":1,"GO:0051092":2,"GO:0046007":1,"GO:1903886":1,"GO:0001782":1,"GO:0035372":1,"GO:0046597":1,"GO:0045087":2,"GO:1902174":1,"GO:1990466":1,"GO:0045838":1,"GO:1904333":1,"GO:1990683":1,"GO:0003007":1,"GO:1902231":1,"GO:0007296":1,"GO:0033235":1,"GO:0060766":1,"GO:0033234":1,"GO:0010804":1,"GO:0043060":1,"GO:1904290":1,"GO:0016049":1,"GO:0045672":1,"GO:0032088":1,"GO:0042088":1,"GO:0070207":1,"GO:0031666":1,"GO:0042475":1,"GO:0043011":1,"GO:2000679":1,"GO:0032743":1,"GO:0030323":1,"GO:0019886":1,"GO:0043507":1,"GO:0003384":1,"GO:0097300":1,"GO:0007585":1,"GO:0008063":1,"GO:0045084":1,"GO:0007370":1,"GO:0071222":1,"GO:0045410":1,"GO:0045167":1,"GO:0051023":1,"GO:0007249":1,"GO:0030316":1,"GO:0071732":1,"GO:0042102":1,"GO:0045453":1,"GO:0002726":1,"GO:0046529":1,"GO:2001238":1,"GO:0001843":1,"GO:0050852":1,"GO:0070498":1,"GO:0032648":1},"recipe_readded":["XP_019861540.1","XP_019859868.1","XP_019856422.1","XP_003385706.1","XP_019857801.1","XP_003388007.1","XP_019852435.1","XP_011402638.1","XP_003383493.2","XP_003386116.1","XP_003382769.1","XP_003382456.2","XP_003388767.1","XP_003389722.1","XP_003386885.1","XP_003390484.1","XP_003382994.1","XP_019861364.1","XP_011404211.1","XP_019848999.1"]}