{"hash":"159394340115126151","title":"TNF-NF-\u03baB/JNK immune signaling","description":"This cluster is driven by GO terms related to TNF-mediated signaling, activation of NF-kappaB-inducing kinase, and regulation of the JNK cascade, pointing to a core theme of TNF-driven inflammatory and stress signaling in immune contexts. Additional terms touch on immune processes such as V(D)J recombination and antiviral transport regulation, as well as epigenetic regulation, suggesting broader immune- and chromatin-related roles. Overall, the strongest common thread is TNF/NF-\u03baB/JNK signaling in immune responses.","confidence":"Medium","size":17,"edges":2,"triangles":0,"max_degree":2,"top_function":null,"members":[{"accession":"XP_002940628.1","go_terms":["GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0042787","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0051865"]},{"accession":"XP_002941911.2","go_terms":["GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0042787","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0051865"]},{"accession":"XP_004918725.1","go_terms":["GO:0032609","GO:0071479","GO:0032640","GO:1903003","GO:0071356","GO:0032635","GO:0071347","GO:0007249","GO:0042110","GO:0044565","GO:0032607","GO:0043124","GO:2000158","GO:0097028"]},{"accession":"NP_001006828.1","go_terms":[]},{"accession":"NP_001120407.1","go_terms":["GO:0016192","GO:0006886","GO:0048268","GO:1900126","GO:0006914","GO:0051301","GO:0000278"]},{"accession":"XP_002931692.3","go_terms":[]},{"accession":"XP_002941041.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_004915704.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_004917292.1","go_terms":["GO:0045907","GO:0021510","GO:0060716","GO:0045988","GO:1904693","GO:0038203","GO:0016185","GO:0007213","GO:0007217","GO:0001893","GO:0097473","GO:1990504","GO:0007032","GO:0030212","GO:0060709","GO:0007605","GO:0010925","GO:0007281","GO:0045792","GO:0060313","GO:0016197","GO:0007205","GO:0030845","GO:0046847","GO:0035924","GO:0006924","GO:0061000","GO:0048009","GO:0046329","GO:0032094","GO:0060048","GO:0045725","GO:0032012","GO:0016477","GO:0035621","GO:1903526","GO:1903527","GO:0044128","GO:0003108","GO:0032956","GO:0002291","GO:0043491","GO:0043314","GO:0031641","GO:0097011","GO:0035655","GO:0070560","GO:0032000","GO:0032485","GO:0010920","GO:1904261","GO:0035020","GO:0035023","GO:0050432","GO:1901998","GO:0098761","GO:1900026","GO:0002344","GO:0097194","GO:0001865","GO:0001782","GO:0010763","GO:0010765","GO:0016126","GO:0008286","GO:0051489","GO:0016082","GO:0014065","GO:0030259","GO:0008637","GO:0071364","GO:0090630","GO:0010572","GO:1904140","GO:0002031","GO:2001275","GO:0016079","GO:0030097","GO:0002029","GO:0018107","GO:0032287","GO:0000266","GO:0071380","GO:0030032","GO:0030036","GO:0051146","GO:0070493","GO:0051932","GO:0051262","GO:0015758","GO:0010748","GO:1903423","GO:0033622","GO:0033623","GO:0050851","GO:0032633","GO:0072583","GO:0046580","GO:0007340","GO:0007264","GO:0008344","GO:0007507","GO:0031999","GO:0007018","GO:0003374","GO:0033633"]},{"accession":"XP_012820361.1","go_terms":["GO:0043553","GO:0048227","GO:0072383","GO:0032418","GO:0032483","GO:1903527","GO:0032486","GO:1901097","GO:1901098","GO:0034499","GO:0007179","GO:1903358","GO:0032288","GO:0035023","GO:0071787","GO:0045053","GO:0090160","GO:0035973","GO:0007183","GO:0006622","GO:0030035","GO:0034145","GO:0034141","GO:0034058","GO:0016197","GO:0048549","GO:0046847","GO:1904562","GO:0010256"]},{"accession":"XP_012825103.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_031746132.1","go_terms":["GO:0000747","GO:0042274","GO:0000055","GO:0042254","GO:1901001","GO:0002181","GO:1903833","GO:0051301","GO:0006400","GO:0090529","GO:0007049","GO:0070899"]},{"accession":"XP_031747514.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_031754407.1","go_terms":[]},{"accession":"NP_001017205.1","go_terms":["GO:0006654","GO:0036089","GO:0051044","GO:0031139","GO:1990126","GO:0006907","GO:0008333","GO:0060348","GO:0061512","GO:1990502","GO:1990854","GO:0071800","GO:0000902","GO:0071539","GO:0010252","GO:1903595","GO:2000769","GO:0034498","GO:0032258","GO:0034499","GO:2000642","GO:1904179","GO:0048310","GO:0000278","GO:0060378","GO:1904888","GO:0001654","GO:0000281","GO:0072673","GO:0048015","GO:0045022","GO:0043547","GO:0022617","GO:0002051","GO:0097320","GO:0070676","GO:0032120","GO:0032005","GO:0032534"]},{"accession":"NP_001072703.1","go_terms":["GO:0071222","GO:0034138","GO:0061734","GO:0016236","GO:0050727","GO:0070498","GO:0050829","GO:0023035","GO:0051650","GO:0007252","GO:0000042","GO:0090161","GO:0043001","GO:0034134","GO:0043124","GO:0001920","GO:0085032","GO:0043123","GO:0002755","GO:2000352","GO:0034162","GO:0034142","GO:0051092","GO:0002756","GO:0042348","GO:0007249","GO:1904417","GO:0043032","GO:0070373"]},{"accession":"NP_001106440.1","go_terms":[]}],"graph":[["NP_001106440.1","NP_001120407.1",0.551],["NP_001106440.1","XP_002941041.1",0.513]],"all_go_terms":{"GO:0090073":2,"GO:0033209":2,"GO:0007250":2,"GO:0046328":2,"GO:0033151":2,"GO:1903762":2,"GO:1901253":2,"GO:0009048":2,"GO:2000620":2,"GO:1903265":2,"GO:0042981":2,"GO:1903721":2,"GO:0070512":2,"GO:0051865":2,"GO:0070535":2,"GO:0042787":2,"GO:0036205":2,"GO:0085020":2,"GO:0044565":1,"GO:0071347":1,"GO:1903003":1,"GO:0071356":1,"GO:0007249":2,"GO:0071479":1,"GO:0043124":2,"GO:2000158":1,"GO:0032635":1,"GO:0032607":1,"GO:0042110":1,"GO:0097028":1,"GO:0032640":1,"GO:0032609":1,"GO:0000278":2,"GO:0048268":1,"GO:1900126":1,"GO:0016192":1,"GO:0006886":1,"GO:0051301":2,"GO:0006914":1,"GO:0006924":1,"GO:0033633":1,"GO:0046329":1,"GO:0014065":1,"GO:2001275":1,"GO:0010920":1,"GO:0030036":1,"GO:1903526":1,"GO:0003108":1,"GO:0097011":1,"GO:0044128":1,"GO:0007018":1,"GO:0030212":1,"GO:0008286":1,"GO:0030259":1,"GO:0043491":1,"GO:0010925":1,"GO:0001782":1,"GO:0007213":1,"GO:0000266":1,"GO:0072583":1,"GO:0010748":1,"GO:0010572":1,"GO:0018107":1,"GO:0016082":1,"GO:0033622":1,"GO:0007507":1,"GO:0007217":1,"GO:0016126":1,"GO:0098761":1,"GO:0008637":1,"GO:0032012":1,"GO:0007340":1,"GO:0002029":1,"GO:0030032":1,"GO:0010765":1,"GO:0002031":1,"GO:0035621":1,"GO:0048009":1,"GO:0045988":1,"GO:0046580":1,"GO:0060048":1,"GO:0035655":1,"GO:0007032":1,"GO:0016197":2,"GO:0035924":1,"GO:0032094":1,"GO:0007281":1,"GO:0050851":1,"GO:0030845":1,"GO:0016185":1,"GO:1990504":1,"GO:0045907":1,"GO:0007605":1,"GO:0002344":1,"GO:0071380":1,"GO:0032287":1,"GO:0097473":1,"GO:0045792":1,"GO:0031999":1,"GO:1903423":1,"GO:0008344":1,"GO:0061000":1,"GO:1904261":1,"GO:0050432":1,"GO:0060716":1,"GO:0001865":1,"GO:1904140":1,"GO:0021510":1,"GO:0007264":1,"GO:0051489":1,"GO:1903527":2,"GO:0051262":1,"GO:0016477":1,"GO:0070493":1,"GO:0003374":1,"GO:1904693":1,"GO:0046847":2,"GO:1900026":1,"GO:1901998":1,"GO:0070560":1,"GO:0010763":1,"GO:0001893":1,"GO:0030097":1,"GO:0032000":1,"GO:0035023":2,"GO:0032633":1,"GO:0051932":1,"GO:0060313":1,"GO:0043314":1,"GO:0032485":1,"GO:0015758":1,"GO:0090630":1,"GO:0051146":1,"GO:0033623":1,"GO:0038203":1,"GO:0031641":1,"GO:0071364":1,"GO:0060709":1,"GO:0035020":1,"GO:0097194":1,"GO:0016079":1,"GO:0032956":1,"GO:0045725":1,"GO:0002291":1,"GO:0007205":1,"GO:0045053":1,"GO:0071787":1,"GO:0034058":1,"GO:1904562":1,"GO:0048227":1,"GO:0048549":1,"GO:0010256":1,"GO:0034145":1,"GO:0032486":1,"GO:0030035":1,"GO:0007183":1,"GO:1903358":1,"GO:0035973":1,"GO:0072383":1,"GO:0032483":1,"GO:0032288":1,"GO:0034499":2,"GO:0007179":1,"GO:0043553":1,"GO:0034141":1,"GO:0032418":1,"GO:1901098":1,"GO:0090160":1,"GO:0006622":1,"GO:1901097":1,"GO:1901001":1,"GO:0042254":1,"GO:0000055":1,"GO:0000747":1,"GO:1903833":1,"GO:0007049":1,"GO:0090529":1,"GO:0002181":1,"GO:0006400":1,"GO:0042274":1,"GO:0070899":1,"GO:0060348":1,"GO:0001654":1,"GO:0000902":1,"GO:0036089":1,"GO:1990126":1,"GO:0006907":1,"GO:0072673":1,"GO:2000642":1,"GO:0006654":1,"GO:0043547":1,"GO:0000281":1,"GO:0010252":1,"GO:0070676":1,"GO:0032534":1,"GO:0051044":1,"GO:0032120":1,"GO:0022617":1,"GO:0031139":1,"GO:0032258":1,"GO:0097320":1,"GO:2000769":1,"GO:0048015":1,"GO:0032005":1,"GO:1903595":1,"GO:0034498":1,"GO:0061512":1,"GO:0071539":1,"GO:1904888":1,"GO:0048310":1,"GO:0008333":1,"GO:0045022":1,"GO:1904179":1,"GO:1990854":1,"GO:0002051":1,"GO:0060378":1,"GO:0071800":1,"GO:1990502":1,"GO:0001920":1,"GO:0023035":1,"GO:0000042":1,"GO:0051092":1,"GO:0016236":1,"GO:0043123":1,"GO:2000352":1,"GO:0050727":1,"GO:0090161":1,"GO:0070373":1,"GO:1904417":1,"GO:0042348":1,"GO:0051650":1,"GO:0007252":1,"GO:0002755":1,"GO:0043032":1,"GO:0043001":1,"GO:0002756":1,"GO:0085032":1,"GO:0034162":1,"GO:0050829":1,"GO:0034138":1,"GO:0070498":1,"GO:0071222":1,"GO:0061734":1,"GO:0034142":1,"GO:0034134":1},"recipe_readded":["XP_004916445.1","XP_012826815.1","NP_001017355.1","XP_002932165.1","XP_004913509.1","XP_031759654.1","XP_031762434.1","XP_002934155.3","XP_002939028.1","NP_001015965.1","NP_988874.1","NP_001135697.1","NP_001008127.1","NP_001120272.1","NP_001120903.1","XP_002938650.2","XP_002936603.1","XP_031759799.1","XP_002932557.1","XP_002938535.1"]}