{"hash":"887556142670854394","title":"Retroviral DNA integration and proviral latency","description":"The top GO terms cluster around DNA synthesis and genome integration (DNA replication, DNA recombination, DNA integration, RNA-templated DNA biosynthetic process) and viral life cycle steps (viral penetration into host nucleus, establishment of integrated proviral latency). The inclusion of terms related to siRNA processing regulation and host apoptosis activation further supports viral manipulation of host defenses. Together, they point to retroviral genome integration and latency as the core theme of this cluster.","confidence":"High","size":17,"edges":39,"triangles":24,"max_degree":10,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"XP_030850605.1","go_terms":["GO:1990172","GO:0008333","GO:0061003","GO:0080034","GO:0015991","GO:0006607","GO:0031144","GO:0007301","GO:0048542","GO:0060135","GO:0048069","GO:0007035","GO:0061075","GO:0016032","GO:0035735","GO:0006610","GO:0006461","GO:0070262","GO:0050790","GO:1903538","GO:0042176","GO:0051754","GO:0007143","GO:0051306","GO:2001241","GO:0051232","GO:0033674","GO:0000060","GO:0000188","GO:0051028","GO:0038202","GO:0097711","GO:0042518","GO:0007084","GO:0060561","GO:0071230","GO:0060188","GO:0051292","GO:0043547","GO:0006335","GO:0006275","GO:0001938","GO:0045945","GO:0006672","GO:1904501","GO:0060492","GO:0072053","GO:0072054","GO:0003340","GO:0061380","GO:0051561","GO:0060916","GO:0071681","GO:0007050","GO:0031274","GO:0051211","GO:0000011","GO:0098911","GO:0061550","GO:0060066","GO:0010909","GO:0072033","GO:0045110","GO:2000017","GO:0001840","GO:0016477","GO:0060789","GO:0048096","GO:1904888","GO:0060769","GO:0048496","GO:0042144","GO:0003338","GO:0048364","GO:0021550","GO:1904798","GO:1904793","GO:0070602","GO:0044334","GO:0000281","GO:0044336","GO:0045976","GO:0008285","GO:0071255","GO:0006974","GO:1904948","GO:0086019","GO:0090138","GO:0010172","GO:0007403","GO:0001711","GO:0009833","GO:0072699","GO:0086091","GO:0071562","GO:0032471","GO:0061324","GO:0034333","GO:0016339","GO:0007026","GO:0036023","GO:0030720","GO:0043065","GO:0061198","GO:0032467","GO:0090090","GO:0030997","GO:0022006","GO:0002159","GO:0022009","GO:0035293","GO:0086073","GO:0007398","GO:1990791"]},{"accession":"XP_030852558.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_030854464.1","go_terms":["GO:0002574","GO:0001112","GO:0090074","GO:0070893","GO:0070898","GO:0006384","GO:0045945","GO:0051123","GO:0006355","GO:0001113","GO:0001174","GO:1904798","GO:0006351","GO:0006367","GO:0050434"]},{"accession":"XP_780711.1","go_terms":["GO:0006654","GO:0036089","GO:0051044","GO:0031139","GO:1990126","GO:0006907","GO:0008333","GO:0060348","GO:0061512","GO:1990502","GO:1990854","GO:0071800","GO:0000902","GO:0071539","GO:0010252","GO:1903595","GO:2000769","GO:0034498","GO:0032258","GO:0034499","GO:2000642","GO:1904179","GO:0048310","GO:0000278","GO:0060378","GO:1904888","GO:0001654","GO:0000281","GO:0072673","GO:0048015","GO:0045022","GO:0043547","GO:0022617","GO:0002051","GO:0097320","GO:0070676","GO:0032120","GO:0032005","GO:0032534"]},{"accession":"XP_785185.2","go_terms":[]},{"accession":"XP_030831270.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0030423","GO:0060269","GO:0007294","GO:0002089","GO:0007140","GO:0007277","GO:0010372","GO:0009949","GO:0030720","GO:0010526","GO:0000335","GO:0008070","GO:0070306","GO:0019090","GO:0007317","GO:0060213","GO:0007286","GO:0007076","GO:0001556","GO:0045451","GO:0030719","GO:0009951","GO:0009566","GO:0007283","GO:0030717","GO:0043046","GO:1990511","GO:0010738","GO:0046843"]},{"accession":"XP_030833450.1","go_terms":["GO:0050847","GO:0019089","GO:0090085","GO:2000203","GO:2000780","GO:0035519","GO:0061753","GO:0061734","GO:0061736","GO:0060360","GO:0002669","GO:1903861","GO:0070936","GO:0048260","GO:0033160","GO:0006513","GO:0043162","GO:0003197","GO:0042921","GO:2000058","GO:0010768","GO:0032443","GO:2000238","GO:1901165","GO:2000235","GO:0042787","GO:0034517","GO:2000232","GO:0071211","GO:0045723","GO:0035037","GO:0070534","GO:0070086","GO:0010796","GO:0010794","GO:0010793","GO:0031384","GO:0046642","GO:0010994","GO:1901315","GO:2000009","GO:0030579","GO:0060736","GO:1901016","GO:0045732","GO:0051865","GO:2000650"]},{"accession":"XP_030835099.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_030839870.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_030840839.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_030841278.1","go_terms":["GO:0007478","GO:0048092","GO:0048060","GO:0007455","GO:0071390","GO:0008628","GO:0007418","GO:0061040","GO:0035297","GO:0008346"]},{"accession":"XP_030849392.1","go_terms":["GO:0048304","GO:0035023","GO:0060717","GO:0060612","GO:0021987","GO:0010212","GO:0032219","GO:0045666","GO:0033314","GO:0030330","GO:1901969","GO:1901972","GO:0051571","GO:0000902","GO:0000910","GO:0070940","GO:0000012","GO:0000416","GO:0007095","GO:0035390","GO:1905765","GO:0033152","GO:0033153","GO:0006471","GO:0071169","GO:0006297","GO:0051103","GO:0051102","GO:0007000","GO:0010569","GO:0042276","GO:0002328","GO:2000232","GO:0031848","GO:0070200","GO:0010165","GO:0000463","GO:0010833","GO:0000466","GO:0061819","GO:0048239","GO:0072363","GO:0071919","GO:0097680","GO:0044786","GO:0060261","GO:0035066","GO:1903775","GO:0051568","GO:1990166","GO:0043542","GO:1990683","GO:2000781","GO:0034184","GO:0001570","GO:0006310","GO:0006288","GO:0090298","GO:0043504","GO:0097681","GO:0071897","GO:2000620","GO:0085020","GO:1990966","GO:0006271","GO:0070212","GO:2001170","GO:0006039","GO:0070512","GO:0070914","GO:0006260"]},{"accession":"XP_030849528.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0006313","GO:0032197"]},{"accession":"XP_030849738.1","go_terms":["GO:0015074"]},{"accession":"XP_030850078.1","go_terms":["GO:0015074","GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_003729104.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_800415.1","go_terms":["GO:2000343","GO:0090344","GO:1902166","GO:0048146","GO:0043406","GO:0010629","GO:0007166","GO:0002906","GO:0030890","GO:0033033","GO:0070207","GO:0030330","GO:0008283","GO:0090238","GO:0045087","GO:0071157","GO:0001516","GO:0061078","GO:0043518","GO:0006954","GO:0050918","GO:0033138","GO:0032269","GO:0007569","GO:0050715","GO:0031666","GO:0050900","GO:0032572","GO:0061081","GO:0043030","GO:0010739","GO:0042438"]}],"graph":[["XP_030833450.1","XP_030854464.1",0.573],["XP_030833450.1","XP_030852558.1",0.601],["XP_030833450.1","XP_030839870.1",0.635],["XP_030833450.1","XP_030835099.1",0.613],["XP_800415.1","XP_030835099.1",0.546],["XP_800415.1","XP_030839870.1",0.518],["XP_800415.1","XP_030840839.1",0.514],["XP_785185.2","XP_030831270.1",0.562],["XP_785185.2","XP_030852558.1",0.536],["XP_785185.2","XP_030854464.1",0.56],["XP_030835099.1","XP_030849528.1",0.504],["XP_030835099.1","XP_030849738.1",0.539],["XP_030835099.1","XP_030852558.1",0.511],["XP_030835099.1","XP_780711.1",0.587],["XP_030835099.1","XP_030839870.1",0.683],["XP_780711.1","XP_030840839.1",0.571],["XP_030839870.1","XP_030840839.1",0.543],["XP_030839870.1","XP_030841278.1",0.538],["XP_030839870.1","XP_030849392.1",0.583],["XP_030839870.1","XP_030849738.1",0.548],["XP_030839870.1","XP_030850078.1",0.549],["XP_030839870.1","XP_030850605.1",0.658],["XP_030839870.1","XP_030852558.1",0.566],["XP_030852558.1","XP_030841278.1",0.547],["XP_030852558.1","XP_030849392.1",0.522],["XP_030852558.1","XP_030849738.1",0.549],["XP_030852558.1","XP_030854464.1",0.502],["XP_030849528.1","XP_030841278.1",0.573],["XP_030849528.1","XP_030849738.1",0.566],["XP_030849528.1","XP_030854464.1",0.509],["XP_030849528.1","XP_003729104.1",0.547],["XP_030841278.1","XP_030849392.1",0.539],["XP_030841278.1","XP_030854464.1",0.538],["XP_003729104.1","XP_030849392.1",0.516],["XP_030850605.1","XP_030849738.1",0.507],["XP_030850605.1","XP_030854464.1",0.538],["XP_030849738.1","XP_030849392.1",0.502],["XP_030854464.1","XP_030831270.1",0.557],["XP_030854464.1","XP_030849392.1",0.52]],"all_go_terms":{"GO:0007084":1,"GO:0050790":1,"GO:0048096":1,"GO:0001840":1,"GO:0048364":1,"GO:0044336":1,"GO:0001711":1,"GO:0007026":1,"GO:0007403":1,"GO:0002159":1,"GO:0072053":1,"GO:0060769":1,"GO:2000017":1,"GO:0051028":1,"GO:0034333":1,"GO:0070602":1,"GO:0086073":1,"GO:0009833":1,"GO:0006335":1,"GO:0010909":1,"GO:0060789":1,"GO:0071681":1,"GO:0044334":1,"GO:0061324":1,"GO:0007398":1,"GO:0045976":1,"GO:0051306":1,"GO:0000060":1,"GO:0031274":1,"GO:0030720":2,"GO:1990791":1,"GO:0098911":1,"GO:0061550":1,"GO:0061380":1,"GO:0071562":1,"GO:0051232":1,"GO:0016477":1,"GO:0048496":1,"GO:0035735":1,"GO:0007035":1,"GO:0061198":1,"GO:0031144":1,"GO:0086019":1,"GO:0042144":1,"GO:0072054":1,"GO:0051292":1,"GO:1904948":1,"GO:0022009":1,"GO:0051754":1,"GO:0061003":1,"GO:0071255":1,"GO:0007301":1,"GO:0021550":1,"GO:1990172":1,"GO:0001938":1,"GO:0045110":1,"GO:0036023":1,"GO:0038202":1,"GO:0097711":1,"GO:0060916":1,"GO:0042518":1,"GO:0006672":1,"GO:0090090":1,"GO:0060492":1,"GO:0006974":1,"GO:0006461":1,"GO:0000281":2,"GO:0048542":1,"GO:0048069":1,"GO:0006607":1,"GO:1904888":2,"GO:0003338":1,"GO:0090138":1,"GO:0043547":2,"GO:0003340":1,"GO:0000188":1,"GO:1904501":1,"GO:0086091":1,"GO:0007143":1,"GO:0006610":1,"GO:0033674":1,"GO:0007050":1,"GO:0016339":1,"GO:0032471":1,"GO:0072033":1,"GO:1904798":2,"GO:0061075":1,"GO:0042176":1,"GO:0032467":1,"GO:0060188":1,"GO:0051561":1,"GO:0070262":1,"GO:0060561":1,"GO:2001241":1,"GO:1903538":1,"GO:0043065":1,"GO:0080034":1,"GO:0008285":1,"GO:0060066":1,"GO:0072699":1,"GO:0006275":1,"GO:1904793":1,"GO:0030997":1,"GO:0060135":1,"GO:0022006":1,"GO:0051211":1,"GO:0015991":1,"GO:0010172":1,"GO:0000011":1,"GO:0071230":1,"GO:0045945":2,"GO:0016032":1,"GO:0008333":2,"GO:0035293":1,"GO:0070898":1,"GO:0006351":1,"GO:0006384":1,"GO:0002574":1,"GO:0050434":1,"GO:0001113":1,"GO:0006367":1,"GO:0051123":1,"GO:0001174":1,"GO:0090074":1,"GO:0070893":1,"GO:0006355":1,"GO:0001112":1,"GO:2000642":1,"GO:0002051":1,"GO:0000278":1,"GO:1904179":1,"GO:0048310":1,"GO:2000769":1,"GO:0006654":1,"GO:0071800":1,"GO:0034499":1,"GO:0070676":1,"GO:1990126":1,"GO:1903595":1,"GO:0072673":1,"GO:0061512":1,"GO:0071539":1,"GO:0010252":1,"GO:0060348":1,"GO:0036089":1,"GO:1990854":1,"GO:0022617":1,"GO:0006907":1,"GO:0048015":1,"GO:0000902":2,"GO:1990502":1,"GO:0031139":1,"GO:0051044":1,"GO:0032258":1,"GO:0001654":1,"GO:0045022":1,"GO:0032534":1,"GO:0034498":1,"GO:0060378":1,"GO:0032120":1,"GO:0097320":1,"GO:0032005":1,"GO:0001556":1,"GO:0045451":1,"GO:0000390":1,"GO:1900050":1,"GO:1903241":1,"GO:0019090":1,"GO:0071038":1,"GO:0016973":1,"GO:0043046":1,"GO:0000388":1,"GO:0070870":1,"GO:0000398":1,"GO:0001178":1,"GO:0006363":1,"GO:0000464":1,"GO:0007076":1,"GO:0071051":1,"GO:0071441":1,"GO:0071049":1,"GO:0042766":1,"GO:0008070":1,"GO:0010738":1,"GO:0000463":2,"GO:0042273":1,"GO:0007286":1,"GO:0045003":1,"GO:0060213":1,"GO:0007317":1,"GO:0035640":1,"GO:0060269":1,"GO:0000462":1,"GO:0030717":1,"GO:0071035":1,"GO:1904570":1,"GO:0090394":1,"GO:0016441":1,"GO:0030423":1,"GO:0000480":1,"GO:0006283":1,"GO:1990511":1,"GO:0060303":1,"GO:0006260":5,"GO:0007140":1,"GO:0042255":1,"GO:0031047":1,"GO:0010501":1,"GO:0000716":1,"GO:0006301":1,"GO:0034475":1,"GO:0019079":1,"GO:0071042":1,"GO:0070417":1,"GO:0000472":1,"GO:1990120":1,"GO:0006265":1,"GO:0009432":1,"GO:0009566":1,"GO:0006605":1,"GO:0072715":1,"GO:0010372":1,"GO:1990416":1,"GO:2000616":1,"GO:0043044":1,"GO:0008306":1,"GO:0048026":1,"GO:0010526":1,"GO:0006311":1,"GO:0071031":1,"GO:0048701":1,"GO:0000184":1,"GO:0000466":2,"GO:0031124":1,"GO:0034476":1,"GO:0071894":1,"GO:0007277":1,"GO:0009951":1,"GO:0000467":1,"GO:1902775":1,"GO:0007294":1,"GO:0000378":1,"GO:0007283":1,"GO:0006269":1,"GO:0006369":1,"GO:0070306":1,"GO:0016584":1,"GO:0030719":1,"GO:0006268":1,"GO:0006310":5,"GO:0000393":1,"GO:1990417":1,"GO:0006306":1,"GO:0002089":1,"GO:0046843":1,"GO:0043629":1,"GO:0017038":1,"GO:0000335":1,"GO:1904574":1,"GO:0045944":1,"GO:0018144":1,"GO:0009949":1,"GO:1903608":1,"GO:1902626":1,"GO:0014070":1,"GO:0033160":1,"GO:0019089":1,"GO:0032443":1,"GO:0051865":1,"GO:0070936":1,"GO:1901016":1,"GO:2000780":1,"GO:0045732":1,"GO:0060736":1,"GO:2000232":2,"GO:0006513":1,"GO:0060360":1,"GO:1901315":1,"GO:0061736":1,"GO:0002669":1,"GO:0070534":1,"GO:0010796":1,"GO:2000009":1,"GO:2000203":1,"GO:0042921":1,"GO:2000238":1,"GO:2000058":1,"GO:0070086":1,"GO:0010994":1,"GO:0030579":1,"GO:2000650":1,"GO:1903861":1,"GO:0003197":1,"GO:0035037":1,"GO:0031384":1,"GO:0071211":1,"GO:0048260":1,"GO:0035519":1,"GO:1901165":1,"GO:0045723":1,"GO:0061734":1,"GO:0010793":1,"GO:0010768":1,"GO:0034517":1,"GO:0061753":1,"GO:0050847":1,"GO:0010794":1,"GO:0046642":1,"GO:2000235":1,"GO:0042787":1,"GO:0043162":1,"GO:0090085":1,"GO:0048092":1,"GO:0008346":1,"GO:0071390":1,"GO:0007455":1,"GO:0061040":1,"GO:0035297":1,"GO:0007478":1,"GO:0008628":1,"GO:0048060":1,"GO:0007418":1,"GO:0000416":1,"GO:2000620":1,"GO:0006471":1,"GO:0051103":1,"GO:0033314":1,"GO:0051571":1,"GO:0031848":1,"GO:0035023":1,"GO:1990166":1,"GO:0006271":1,"GO:0006288":1,"GO:0002328":1,"GO:0071919":1,"GO:0051568":1,"GO:0048304":1,"GO:0060612":1,"GO:1905765":1,"GO:0043504":1,"GO:0061819":1,"GO:0097681":1,"GO:0043542":1,"GO:1990966":1,"GO:0034184":1,"GO:1901972":1,"GO:0000910":1,"GO:0060261":1,"GO:0097680":1,"GO:0033152":1,"GO:0030330":2,"GO:0085020":1,"GO:0060717":1,"GO:0032219":1,"GO:0010212":1,"GO:0035390":1,"GO:2001170":1,"GO:0045666":1,"GO:0071897":1,"GO:0042276":1,"GO:0000012":1,"GO:0006297":1,"GO:0010569":1,"GO:0070940":1,"GO:0007000":1,"GO:0001570":1,"GO:0070914":1,"GO:0035066":1,"GO:0021987":1,"GO:0051102":1,"GO:0071169":1,"GO:1901969":1,"GO:0048239":1,"GO:0072363":1,"GO:1990683":1,"GO:0033153":1,"GO:0090298":1,"GO:0010165":1,"GO:0070212":1,"GO:0006039":1,"GO:0007095":1,"GO:0010833":1,"GO:1903775":1,"GO:0070200":1,"GO:0070512":1,"GO:0044786":1,"GO:2000781":1,"GO:0006278":3,"GO:0006313":1,"GO:0075732":3,"GO:1903704":3,"GO:0032197":1,"GO:0075713":3,"GO:0046718":3,"GO:0039651":3,"GO:0015074":4,"GO:0045087":1,"GO:0070207":1,"GO:0010629":1,"GO:0043030":1,"GO:0043406":1,"GO:0043518":1,"GO:0090238":1,"GO:0042438":1,"GO:0032269":1,"GO:0007166":1,"GO:0010739":1,"GO:0033033":1,"GO:0008283":1,"GO:0090344":1,"GO:0030890":1,"GO:0002906":1,"GO:0031666":1,"GO:0050715":1,"GO:0007569":1,"GO:0001516":1,"GO:0033138":1,"GO:0050918":1,"GO:0050900":1,"GO:0048146":1,"GO:0006954":1,"GO:2000343":1,"GO:0071157":1,"GO:0061081":1,"GO:0032572":1,"GO:0061078":1,"GO:1902166":1},"recipe_readded":[]}