{"hash":"1811404456560642904","title":"DNA replication, repair, and transcription initiation","description":"The cluster consistently shows core DNA metabolism and transcription regulation terms, including DNA replication, nucleotide-excision repair, and RNA Pol II transcription initiation, with some related stress and developmental terms (hypoxia, viral replication, hair cell development) that may reflect broader roles in development or stress responses. Overall, the dominant theme is DNA maintenance and transcription control.","confidence":"High","size":11,"edges":46,"triangles":104,"max_degree":10,"top_function":"DNA replication","members":[{"accession":"XP_030852010.1","go_terms":["GO:0042795","GO:0006367","GO:0001174","GO:0001111","GO:0080163","GO:0006370","GO:0006368","GO:0070940","GO:0050434","GO:0032968","GO:0043085","GO:0010467"]},{"accession":"XP_030852190.1","go_terms":["GO:0006360","GO:0006366","GO:0006386","GO:0006385","GO:0042797","GO:0042254","GO:0001172"]},{"accession":"XP_030853283.1","go_terms":["GO:0006310","GO:0071932","GO:0000002","GO:0097046","GO:0032508","GO:0032211","GO:0044806","GO:1902983","GO:0051974","GO:0043504","GO:1903469","GO:0000723","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493","GO:0090305"]},{"accession":"XP_030854367.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"NP_001091916.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"NP_999786.1","go_terms":["GO:0051123","GO:1903357","GO:0006413","GO:0070893","GO:0007283","GO:0045893","GO:0006352","GO:0042790","GO:0070898","GO:0006383","GO:0006359"]},{"accession":"XP_011681023.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"XP_030836982.1","go_terms":["GO:0034085","GO:0048568","GO:0000717","GO:0032289","GO:0072719","GO:1904506","GO:1902990","GO:0010705","GO:0043249","GO:0035264","GO:0009408","GO:0007064","GO:0043247","GO:0001666","GO:1904976","GO:0010569","GO:0001701","GO:1990918","GO:0008283","GO:0021510","GO:0033683","GO:0030282","GO:0048820","GO:0045951","GO:0006366","GO:0006260","GO:0043588","GO:0010525","GO:0090657","GO:0009411","GO:1904535","GO:0072711","GO:0006289","GO:0007284","GO:1990700","GO:0060218","GO:0035563","GO:0045005","GO:0009791","GO:0007568","GO:0040016","GO:0070816","GO:0036297","GO:0000732","GO:0030198","GO:1901838","GO:0051026","GO:0043388","GO:1904430","GO:0045876","GO:0072520","GO:0035315","GO:0032079","GO:0044806"]},{"accession":"XP_030839050.1","go_terms":["GO:0006260","GO:0006270","GO:0051301","GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617","GO:1904117","GO:1990443","GO:0006267","GO:0016925","GO:1903468"]},{"accession":"XP_030850298.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0002003","GO:0019885","GO:0003081","GO:0030154","GO:0001525","GO:0002005","GO:0045766","GO:0006509","GO:0002250","GO:0007267","GO:0007275","GO:0019370"]},{"accession":"XP_030850299.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0002003","GO:0019885","GO:0003081","GO:0030154","GO:0001525","GO:0002005","GO:0045766","GO:0006509","GO:0002250","GO:0007267","GO:0007275","GO:0019370"]}],"graph":[["XP_030850299.1","XP_030839050.1",0.613],["XP_030850299.1","XP_030850298.1",0.693],["XP_030850299.1","XP_030852190.1",0.69],["XP_030850299.1","NP_001091916.1",0.572],["XP_030850299.1","NP_999786.1",0.54],["XP_030850299.1","XP_011681023.1",0.515],["XP_011681023.1","NP_001091916.1",0.791],["XP_011681023.1","NP_999786.1",0.716],["XP_011681023.1","XP_030839050.1",0.709],["XP_011681023.1","XP_030836982.1",0.732],["XP_011681023.1","XP_030850298.1",0.631],["XP_011681023.1","XP_030854367.1",0.756],["XP_011681023.1","XP_030853283.1",0.764],["XP_011681023.1","XP_030852010.1",0.73],["XP_011681023.1","XP_030852190.1",0.732],["XP_030852010.1","XP_030836982.1",0.721],["XP_030852010.1","XP_030839050.1",0.706],["XP_030852010.1","XP_030854367.1",0.755],["XP_030852010.1","XP_030852190.1",0.714],["XP_030852010.1","XP_030853283.1",0.772],["XP_030852010.1","NP_001091916.1",0.74],["XP_030852010.1","NP_999786.1",0.782],["XP_030839050.1","XP_030850298.1",0.598],["XP_030839050.1","XP_030852190.1",0.724],["XP_030839050.1","XP_030853283.1",0.752],["XP_030839050.1","XP_030854367.1",0.7],["XP_030839050.1","NP_001091916.1",0.624],["XP_030839050.1","NP_999786.1",0.787],["XP_030839050.1","XP_030836982.1",0.692],["XP_030853283.1","XP_030836982.1",0.767],["XP_030853283.1","XP_030852190.1",0.744],["XP_030853283.1","XP_030854367.1",0.718],["XP_030853283.1","NP_001091916.1",0.71],["XP_030853283.1","NP_999786.1",0.786],["NP_001091916.1","NP_999786.1",0.733],["NP_001091916.1","XP_030836982.1",0.745],["NP_001091916.1","XP_030852190.1",0.714],["NP_001091916.1","XP_030854367.1",0.77],["XP_030852190.1","XP_030836982.1",0.741],["XP_030852190.1","XP_030850298.1",0.569],["XP_030852190.1","XP_030854367.1",0.729],["XP_030852190.1","NP_999786.1",0.814],["NP_999786.1","XP_030836982.1",0.799],["NP_999786.1","XP_030850298.1",0.576],["NP_999786.1","XP_030854367.1",0.666],["XP_030854367.1","XP_030836982.1",0.758]],"all_go_terms":{"GO:0001111":4,"GO:0006370":1,"GO:0006368":1,"GO:0043085":1,"GO:0050434":1,"GO:0080163":1,"GO:0032968":2,"GO:0006367":4,"GO:0042795":1,"GO:0070940":1,"GO:0001174":1,"GO:0010467":1,"GO:0006360":1,"GO:0006386":1,"GO:0001172":1,"GO:0042797":1,"GO:0006366":2,"GO:0006385":1,"GO:0042254":1,"GO:1900087":1,"GO:0090305":1,"GO:0051974":1,"GO:0043488":1,"GO:0044806":2,"GO:0071932":1,"GO:0043504":1,"GO:1902983":1,"GO:0071375":1,"GO:0000723":1,"GO:0006284":1,"GO:0097046":1,"GO:0046856":1,"GO:1903507":1,"GO:0000002":1,"GO:0032508":1,"GO:2000327":1,"GO:0006310":4,"GO:0042493":1,"GO:0014912":1,"GO:0032211":1,"GO:2001153":1,"GO:2000466":1,"GO:0090502":1,"GO:0070301":1,"GO:0080111":1,"GO:0044179":1,"GO:1903469":1,"GO:0006308":1,"GO:0045454":1,"GO:0071320":1,"GO:0003335":1,"GO:0006915":1,"GO:0007568":2,"GO:0000390":3,"GO:1900050":3,"GO:1903241":3,"GO:0071038":3,"GO:0016973":3,"GO:0000388":3,"GO:0001666":4,"GO:0070870":3,"GO:0000398":3,"GO:0001178":3,"GO:0006363":3,"GO:0000464":3,"GO:0009307":3,"GO:0071051":3,"GO:0071441":3,"GO:0071049":3,"GO:0042766":3,"GO:0000463":3,"GO:0042273":3,"GO:0045003":3,"GO:0035640":3,"GO:0000462":3,"GO:0071035":3,"GO:1904570":3,"GO:0090394":3,"GO:0016441":3,"GO:0000480":3,"GO:0006283":3,"GO:0060303":3,"GO:0006260":5,"GO:0042255":3,"GO:0031047":3,"GO:0010501":3,"GO:0000716":3,"GO:0006301":3,"GO:0009650":3,"GO:0034475":3,"GO:0019079":4,"GO:0071042":3,"GO:0070417":3,"GO:0000472":3,"GO:1990120":3,"GO:0006265":3,"GO:0009432":3,"GO:0048568":4,"GO:0006605":3,"GO:0072715":3,"GO:1990416":3,"GO:2000616":3,"GO:0043044":3,"GO:0008306":3,"GO:0048026":3,"GO:0006311":3,"GO:0071031":3,"GO:0048701":3,"GO:0000184":3,"GO:0000466":3,"GO:0031124":3,"GO:0034476":3,"GO:0071894":3,"GO:0033683":4,"GO:0039530":3,"GO:0000467":3,"GO:0006289":4,"GO:1902775":3,"GO:0000378":3,"GO:0035315":4,"GO:0006269":3,"GO:0006369":3,"GO:0001113":3,"GO:0016584":3,"GO:0060543":3,"GO:0000717":4,"GO:0006268":3,"GO:0000393":3,"GO:1990417":3,"GO:0006306":3,"GO:0043629":3,"GO:0017038":3,"GO:1904574":3,"GO:0045944":3,"GO:0018144":3,"GO:1903608":3,"GO:1902626":3,"GO:0014070":3,"GO:0070898":1,"GO:0006413":1,"GO:0007283":1,"GO:0006383":1,"GO:0006359":1,"GO:0006352":1,"GO:0051123":1,"GO:0070893":1,"GO:0042790":1,"GO:0045893":1,"GO:1903357":1,"GO:0010705":1,"GO:0090657":1,"GO:0060218":1,"GO:0021510":1,"GO:1904535":1,"GO:0007064":1,"GO:1990700":1,"GO:0035563":1,"GO:0072520":1,"GO:1902990":1,"GO:0043388":1,"GO:0036297":1,"GO:1904976":1,"GO:0009411":1,"GO:1904506":1,"GO:0000732":1,"GO:0043249":1,"GO:0035264":1,"GO:0032079":1,"GO:0008283":1,"GO:0072719":1,"GO:0072711":1,"GO:1904430":1,"GO:0030198":1,"GO:0045005":1,"GO:0009408":1,"GO:0001701":1,"GO:0010525":1,"GO:1901838":1,"GO:0045876":1,"GO:0040016":1,"GO:0010569":1,"GO:0051026":1,"GO:0034085":1,"GO:0043588":1,"GO:0009791":1,"GO:0043247":1,"GO:0030282":1,"GO:0032289":1,"GO:0007284":1,"GO:0045951":1,"GO:0048820":1,"GO:0070816":1,"GO:1990918":1,"GO:0061166":1,"GO:1903468":1,"GO:0045041":1,"GO:1904117":1,"GO:0033314":1,"GO:0016485":1,"GO:0045053":1,"GO:0016562":1,"GO:0071712":1,"GO:0070407":1,"GO:1903724":1,"GO:0061738":1,"GO:0006270":1,"GO:0070651":1,"GO:0006267":1,"GO:1903715":1,"GO:0097352":1,"GO:2000158":1,"GO:0090296":1,"GO:0090261":1,"GO:0072389":1,"GO:0070370":1,"GO:0051013":1,"GO:1990171":1,"GO:0070676":1,"GO:0006272":1,"GO:0071218":1,"GO:0016558":1,"GO:0000733":1,"GO:0070389":1,"GO:1903007":1,"GO:0048219":1,"GO:0030433":1,"GO:0070682":1,"GO:0034599":1,"GO:0034551":1,"GO:0070842":1,"GO:0001824":1,"GO:0046034":1,"GO:0035494":1,"GO:0006888":1,"GO:0001319":1,"GO:0006406":1,"GO:0051131":1,"GO:0070914":1,"GO:0051301":1,"GO:0018279":1,"GO:0030420":1,"GO:1990443":1,"GO:0061641":1,"GO:0035617":1,"GO:0070987":1,"GO:0031117":1,"GO:1901800":1,"GO:2001171":1,"GO:0016925":1,"GO:0030968":1,"GO:0045899":1,"GO:0043335":1,"GO:0070414":1,"GO:1903862":1,"GO:0034214":1,"GO:0032979":1,"GO:0051260":1,"GO:0019370":2,"GO:0002003":2,"GO:0007267":2,"GO:0030154":2,"GO:0002005":2,"GO:0019885":2,"GO:0002250":2,"GO:0045766":2,"GO:0007275":2,"GO:0006509":2,"GO:0003081":2,"GO:0046718":2,"GO:0001525":2},"recipe_readded":[]}