{"hash":"1466507337903437473","title":"Retroviral entry, integration, and latency","description":"The top GO terms point to steps in the retroviral life cycle: entry into the host cell and nucleus, reverse transcription (RNA-templated DNA synthesis), and genome integration with establishment of proviral latency. Additional terms involving DNA recombination and replication support genome integration events. Together these indicate a cohesive theme of retroviral infection and dormancy.","confidence":"High","size":8,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"XP_035829011.1","go_terms":["GO:1990535","GO:0090307","GO:0032886","GO:0000022","GO:0007100","GO:0030951","GO:0031534","GO:0031535","GO:0009904","GO:0007080","GO:0033624","GO:0021693","GO:0072092","GO:0060404","GO:0030473","GO:0010938","GO:0051296","GO:0001560","GO:0032487","GO:0045218","GO:0000073","GO:0000911","GO:0000915","GO:0072383","GO:0051255","GO:0036334","GO:0070462","GO:0098971","GO:0048364","GO:0021685","GO:0099607","GO:0035617","GO:1990942"]},{"accession":"XP_012945466.1","go_terms":["GO:0060599","GO:0032922","GO:0060745","GO:0033327","GO:0060008","GO:0060558","GO:0050680","GO:0008584","GO:0060324","GO:0035264","GO:1902894","GO:0060749","GO:0060086","GO:0060005","GO:0050728","GO:0035180","GO:1905695","GO:0036367","GO:0060527","GO:0010891","GO:0002068","GO:0060523","GO:0060520","GO:0043124","GO:0003417","GO:0014842","GO:0060528","GO:0035076","GO:0035073","GO:1902714","GO:0060010","GO:0009444","GO:2000253","GO:0042753","GO:0045994","GO:0010871","GO:0043433","GO:0010875","GO:0044320","GO:0051866","GO:0003406","GO:0043030","GO:0090340","GO:0090341","GO:0090188","GO:1903799","GO:0090187","GO:0060173","GO:0038066","GO:0010906","GO:0060068","GO:0010887","GO:0007621","GO:0042551","GO:0090108","GO:0048384","GO:0045726","GO:0021930","GO:0045720","GO:0060838","GO:0048550","GO:0045872","GO:0032765","GO:0046549","GO:0060164","GO:0070166","GO:0050796","GO:0034144","GO:0043415","GO:0042632","GO:0045713","GO:0038097","GO:0017055","GO:0008050","GO:0042738","GO:1900625","GO:0035902","GO:0006351","GO:0010988","GO:0010980","GO:0034255","GO:0072539","GO:0021764","GO:0060591","GO:0060750","GO:0002154","GO:0030325","GO:0032331","GO:0001547","GO:0071376","GO:0060852","GO:0045925","GO:0060687","GO:0060058","GO:0061469","GO:2000505","GO:1904468","GO:0071391","GO:0031076","GO:0061113","GO:0001657","GO:0001553","GO:0008206","GO:0060748","GO:0001893","GO:0045598","GO:0072363","GO:0051091","GO:0072366","GO:2000288","GO:0007566","GO:0072369","GO:0021960","GO:2001275","GO:1901522","GO:0034971","GO:0042953","GO:1903208","GO:0071222","GO:0055012","GO:0055010","GO:0048752","GO:2000189","GO:0035357","GO:2000195","GO:0045444","GO:0021986","GO:0048048","GO:0051546","GO:0030520","GO:0071638","GO:0038185","GO:0046321","GO:0048386","GO:0035726","GO:0043066","GO:0060509","GO:0070384","GO:0010745","GO:0003430","GO:0021872","GO:1904179","GO:0010742","GO:0060849","GO:0046628","GO:0072615","GO:0070328","GO:0060038","GO:0035211","GO:0019102","GO:0035053","GO:0035116","GO:0060336","GO:0036315","GO:0003148","GO:0060769","GO:0070858","GO:0070859","GO:0071300","GO:2000020","GO:0060534","GO:2001250"]},{"accession":"XP_012942616.1","go_terms":[]},{"accession":"XP_012943035.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_005091324.1","go_terms":["GO:0008285","GO:0070544","GO:0031146","GO:0046785","GO:0006516","GO:0007057","GO:0021678","GO:0021993","GO:0051436","GO:0001556","GO:1903351","GO:0035751","GO:0016336","GO:0071169","GO:0034130","GO:1903125","GO:0045842","GO:2000172","GO:1904887","GO:0070340","GO:1902499","GO:0060161","GO:0051014","GO:1905289","GO:0014041","GO:0022028","GO:0035564","GO:0002755","GO:0071287","GO:0090394","GO:1903215","GO:1905279","GO:0006954","GO:0051607","GO:0034138","GO:0042116","GO:1902350","GO:0034154","GO:0034158","GO:0008063","GO:0050729","GO:0045078","GO:0050707","GO:0010080","GO:0006963","GO:0002322","GO:0032722","GO:0043330","GO:0032741","GO:0045087","GO:1900155","GO:0034162","GO:0050830","GO:0034166","GO:0034142","GO:0007352","GO:0002730","GO:0009729","GO:0002756","GO:0045416","GO:0045356","GO:0045359","GO:0009620","GO:0048833","GO:0009934","GO:0032621","GO:0071225","GO:2000321","GO:0061303","GO:0034134","GO:0030335","GO:0050701","GO:2000813","GO:0002606","GO:0051639","GO:0051638","GO:0032498","GO:0030011","GO:0050829","GO:0044546","GO:0043086","GO:0051770","GO:0006404","GO:0045345","GO:0002374","GO:0006409","GO:0043124","GO:0006407","GO:0032760","GO:0032611","GO:0002830","GO:0042228","GO:0060335","GO:0035882","GO:0050711","GO:0042345","GO:0031663","GO:0050718","GO:0016045","GO:0032088","GO:1904417","GO:0046827","GO:0032715","GO:0070431","GO:1902745","GO:0032755","GO:0060386","GO:0031571","GO:0071406","GO:1902916","GO:0071276","GO:0030174","GO:0042752","GO:1903378","GO:0042787","GO:0046685","GO:0000083","GO:0000209"]},{"accession":"XP_005108069.1","go_terms":["GO:0008285","GO:0070544","GO:0031146","GO:0046785","GO:0006516","GO:0007057","GO:0021678","GO:0021993","GO:0051436","GO:0001556","GO:0060386","GO:0031571","GO:0071406","GO:1902916","GO:0071276","GO:0030174","GO:0042752","GO:1903378","GO:0042787","GO:0046685","GO:0000083","GO:0000209"]},{"accession":"XP_035828070.1","go_terms":["GO:1902969","GO:0006265","GO:0043007","GO:0051304","GO:0007004","GO:0006310","GO:0045870","GO:0000712","GO:0097046","GO:0030263","GO:0006261","GO:0000819"]},{"accession":"XP_012936958.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]}],"graph":[["XP_012943035.1","XP_005108069.1",0.86]],"all_go_terms":{"GO:0009904":1,"GO:0070462":1,"GO:0051255":1,"GO:0098971":1,"GO:0036334":1,"GO:0021685":1,"GO:1990535":1,"GO:0010938":1,"GO:0035617":1,"GO:0090307":1,"GO:0030473":1,"GO:0045218":1,"GO:0000915":1,"GO:0099607":1,"GO:0032886":1,"GO:0051296":1,"GO:1990942":1,"GO:0000022":1,"GO:0007080":1,"GO:0048364":1,"GO:0072092":1,"GO:0001560":1,"GO:0021693":1,"GO:0000073":1,"GO:0072383":1,"GO:0000911":1,"GO:0060404":1,"GO:0030951":1,"GO:0033624":1,"GO:0032487":1,"GO:0031535":1,"GO:0031534":1,"GO:0007100":1,"GO:0035073":1,"GO:2000288":1,"GO:0009444":1,"GO:2000253":1,"GO:0031076":1,"GO:0003430":1,"GO:0060591":1,"GO:0045444":1,"GO:0061113":1,"GO:0060687":1,"GO:0045872":1,"GO:1904179":1,"GO:0071222":1,"GO:0060558":1,"GO:0060745":1,"GO:0060749":1,"GO:0001553":1,"GO:0032765":1,"GO:0035357":1,"GO:0060008":1,"GO:0060058":1,"GO:0043066":1,"GO:2001250":1,"GO:2000505":1,"GO:0034144":1,"GO:1900625":1,"GO:0051546":1,"GO:0060068":1,"GO:0001657":1,"GO:1903208":1,"GO:0070384":1,"GO:0007621":1,"GO:0060852":1,"GO:0060509":1,"GO:0038185":1,"GO:0038066":1,"GO:0071638":1,"GO:0014842":1,"GO:0046549":1,"GO:0048386":1,"GO:0072363":1,"GO:0021872":1,"GO:0008050":1,"GO:0035211":1,"GO:0010875":1,"GO:0048048":1,"GO:0019102":1,"GO:0036315":1,"GO:0007566":1,"GO:0060750":1,"GO:0021960":1,"GO:0042632":1,"GO:0060086":1,"GO:0060527":1,"GO:0060769":1,"GO:0090108":1,"GO:0055012":1,"GO:0030520":1,"GO:0071376":1,"GO:0010980":1,"GO:0060164":1,"GO:0010742":1,"GO:0001893":1,"GO:0045598":1,"GO:0051091":1,"GO:0008584":1,"GO:0045925":1,"GO:0045994":1,"GO:0050728":1,"GO:0001547":1,"GO:2000020":1,"GO:0060528":1,"GO:0030325":1,"GO:0070858":1,"GO:0055010":1,"GO:0035053":1,"GO:0046321":1,"GO:0034971":1,"GO:0045726":1,"GO:0060748":1,"GO:0035180":1,"GO:0043030":1,"GO:0070166":1,"GO:0010871":1,"GO:0032331":1,"GO:0072615":1,"GO:0060336":1,"GO:0090340":1,"GO:0060534":1,"GO:0042753":1,"GO:0060838":1,"GO:2000195":1,"GO:0032922":1,"GO:0045720":1,"GO:0021930":1,"GO:1902714":1,"GO:0090341":1,"GO:0021764":1,"GO:0034255":1,"GO:0006351":1,"GO:0043124":2,"GO:0060849":1,"GO:0045713":1,"GO:0035076":1,"GO:0050680":1,"GO:0050796":1,"GO:0010891":1,"GO:0072539":1,"GO:0035726":1,"GO:0044320":1,"GO:1903799":1,"GO:0060324":1,"GO:0033327":1,"GO:0061469":1,"GO:0036367":1,"GO:1901522":1,"GO:0042551":1,"GO:0072366":1,"GO:0008206":1,"GO:0003417":1,"GO:0035264":1,"GO:0051866":1,"GO:0010887":1,"GO:0060038":1,"GO:0048752":1,"GO:0003406":1,"GO:0035116":1,"GO:0017055":1,"GO:0048384":1,"GO:0042738":1,"GO:0010906":1,"GO:0060599":1,"GO:0035902":1,"GO:0043415":1,"GO:0003148":1,"GO:0042953":1,"GO:0090188":1,"GO:0060173":1,"GO:1904468":1,"GO:0072369":1,"GO:1905695":1,"GO:2000189":1,"GO:0071391":1,"GO:0070859":1,"GO:0010745":1,"GO:0048550":1,"GO:0070328":1,"GO:1902894":1,"GO:0060010":1,"GO:0038097":1,"GO:0010988":1,"GO:0060520":1,"GO:0043433":1,"GO:0002068":1,"GO:0060005":1,"GO:0002154":1,"GO:0090187":1,"GO:0021986":1,"GO:0046628":1,"GO:0060523":1,"GO:2001275":1,"GO:0071300":1,"GO:1903704":2,"GO:0006310":3,"GO:0075713":2,"GO:0039651":2,"GO:0015074":2,"GO:0006260":2,"GO:0075732":2,"GO:0046718":2,"GO:0006278":2,"GO:0000209":2,"GO:0002830":1,"GO:1903215":1,"GO:0032760":1,"GO:0030174":2,"GO:0050707":1,"GO:1903378":2,"GO:0060335":1,"GO:0002756":1,"GO:0002606":1,"GO:0031663":1,"GO:0051436":2,"GO:0070340":1,"GO:0048833":1,"GO:0032715":1,"GO:0008063":1,"GO:0034162":1,"GO:0061303":1,"GO:0051014":1,"GO:0045345":1,"GO:2000172":1,"GO:0006407":1,"GO:0006963":1,"GO:1902350":1,"GO:0009620":1,"GO:0032611":1,"GO:1902916":2,"GO:0034130":1,"GO:0034134":1,"GO:0050829":1,"GO:0002374":1,"GO:0060161":1,"GO:0060386":2,"GO:0051638":1,"GO:0034158":1,"GO:0001556":2,"GO:0030335":1,"GO:0030011":1,"GO:0014041":1,"GO:0051607":1,"GO:0031146":2,"GO:0071225":1,"GO:1902745":1,"GO:1903351":1,"GO:0016045":1,"GO:0035882":1,"GO:0032722":1,"GO:0021993":2,"GO:0051639":1,"GO:0044546":1,"GO:0042228":1,"GO:0046785":2,"GO:1905279":1,"GO:0002755":1,"GO:0032755":1,"GO:0009729":1,"GO:0090394":1,"GO:0006409":1,"GO:0071406":2,"GO:2000813":1,"GO:0071276":2,"GO:0070431":1,"GO:0043086":1,"GO:0050718":1,"GO:0043330":1,"GO:0051770":1,"GO:0071287":1,"GO:0009934":1,"GO:0042345":1,"GO:0008285":2,"GO:0050729":1,"GO:1905289":1,"GO:1904887":1,"GO:0050711":1,"GO:1903125":1,"GO:0000083":2,"GO:0045416":1,"GO:0007057":2,"GO:0035751":1,"GO:0016336":1,"GO:0006404":1,"GO:0010080":1,"GO:0022028":1,"GO:0002322":1,"GO:1902499":1,"GO:0002730":1,"GO:0032498":1,"GO:0050830":1,"GO:0046827":1,"GO:0032741":1,"GO:0045087":1,"GO:0045078":1,"GO:0035564":1,"GO:0046685":2,"GO:0031571":2,"GO:1900155":1,"GO:0006954":1,"GO:0071169":1,"GO:0045356":1,"GO:0042116":1,"GO:0045359":1,"GO:0032088":1,"GO:0007352":1,"GO:0042752":2,"GO:0045842":1,"GO:0034166":1,"GO:0050701":1,"GO:0034154":1,"GO:0042787":2,"GO:0070544":2,"GO:0006516":2,"GO:1904417":1,"GO:0021678":2,"GO:2000321":1,"GO:0034142":1,"GO:0034138":1,"GO:0032621":1,"GO:0045870":1,"GO:0000712":1,"GO:0043007":1,"GO:0006265":1,"GO:0030263":1,"GO:0000819":1,"GO:0051304":1,"GO:0006261":1,"GO:0007004":1,"GO:1902969":1,"GO:0097046":1},"recipe_readded":["XP_005092753.1","XP_012938202.1","XP_012942593.1","XP_005105674.1","XP_005103595.2","XP_035825833.1","XP_012944202.1","XP_005091720.1","XP_005108962.1","XP_005098471.1","XP_005090567.1","XP_005108062.1","XP_005111216.1","XP_005102909.1","XP_005112646.1","XP_012941644.1","XP_005104699.1","XP_005101260.2","XP_005093186.1","XP_005107917.1"]}