{"hash":"1047937609815331944","title":"Viral integration and proviral latency","description":"The top GO terms point to a retroviral-like lifecycle: DNA replication and recombination, DNA integration, and especially the establishment of integrated proviral latency and viral entry into the host nucleus. These indicate processes involved in integrating viral DNA into the host genome and maintaining latency, with supporting signals of host defense interactions (e.g., negative regulation of siRNA processing). Additional terms about symbiont entry or host apoptosis reflect broader host\u2013microbe interaction contexts but do not outweigh the viral integration theme. Overall, the cluster appears to center on viral genome integration and proviral latency within the host.","confidence":"Medium","size":6,"edges":10,"triangles":7,"max_degree":5,"top_function":"DNA replication","members":[{"accession":"XP_005102663.1","go_terms":["GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0006260","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0051301","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617","GO:0090305","GO:0071897","GO:0031412","GO:0003341","GO:1990048","GO:0000027","GO:1900264","GO:0006261","GO:0007062"]},{"accession":"XP_005103140.1","go_terms":["GO:0042254","GO:0000028","GO:0006412","GO:0006407"]},{"accession":"XP_012941014.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_012943779.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"XP_005091641.1","go_terms":["GO:0006286","GO:0006287","GO:0006297","GO:1990506","GO:0006290","GO:0061674","GO:0006284","GO:0006288","GO:0051402","GO:0006954","GO:0008630","GO:0055093","GO:0007435","GO:0007568","GO:0048872","GO:0045471","GO:0010332","GO:0071707","GO:0048536","GO:0048535","GO:0016579","GO:0071897","GO:0016446","GO:0006303","GO:0000910","GO:2000620","GO:0045666","GO:0085020","GO:1990966","GO:0006271","GO:0000012","GO:0051102","GO:0070212","GO:2001170","GO:0006039","GO:0070512","GO:0070914","GO:0006260","GO:0060717"]},{"accession":"XP_005097465.1","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]}],"graph":[["XP_005103140.1","XP_005102663.1",0.856],["XP_012943779.1","XP_005091641.1",0.735],["XP_012943779.1","XP_005097465.1",0.629],["XP_012943779.1","XP_005102663.1",0.864],["XP_012943779.1","XP_012941014.1",0.878],["XP_012941014.1","XP_005091641.1",0.727],["XP_012941014.1","XP_005097465.1",0.597],["XP_012941014.1","XP_005102663.1",0.728],["XP_005097465.1","XP_005102663.1",0.696],["XP_005102663.1","XP_005091641.1",0.705]],"all_go_terms":{"GO:1903715":1,"GO:0090305":1,"GO:0070842":1,"GO:0001824":1,"GO:0043335":1,"GO:0016485":1,"GO:0032968":1,"GO:0070407":1,"GO:0031117":1,"GO:0071897":2,"GO:0032979":1,"GO:0000733":1,"GO:0051013":1,"GO:0000027":1,"GO:0034214":1,"GO:0006272":1,"GO:2001171":1,"GO:0006888":1,"GO:0070682":1,"GO:0006406":1,"GO:0051260":1,"GO:0048219":1,"GO:0045041":1,"GO:0035617":1,"GO:0034551":1,"GO:1903862":1,"GO:0070414":1,"GO:0030420":1,"GO:0001319":1,"GO:0006260":4,"GO:0018279":1,"GO:0006261":1,"GO:0071712":1,"GO:1990048":1,"GO:0090296":1,"GO:0007062":1,"GO:0070370":1,"GO:0097352":1,"GO:1903724":1,"GO:1990171":1,"GO:0033314":1,"GO:0045899":1,"GO:0051301":1,"GO:1900264":1,"GO:0061641":1,"GO:0071218":1,"GO:0035494":1,"GO:0070651":1,"GO:0051131":1,"GO:0031412":1,"GO:0070676":1,"GO:0030968":1,"GO:0090261":1,"GO:0034599":1,"GO:0061738":1,"GO:0030433":1,"GO:2000158":1,"GO:0016558":1,"GO:0045053":1,"GO:0003341":1,"GO:1901800":1,"GO:0070987":1,"GO:0019079":1,"GO:0061166":1,"GO:0070389":1,"GO:0070914":2,"GO:1903007":1,"GO:0072389":1,"GO:0046034":1,"GO:0016562":1,"GO:0042254":1,"GO:0006412":1,"GO:0000028":1,"GO:0006407":1,"GO:1903704":2,"GO:0006310":3,"GO:0075713":2,"GO:0039651":2,"GO:0015074":2,"GO:0075732":2,"GO:0046718":2,"GO:0006278":2,"GO:0007568":2,"GO:0060717":1,"GO:0000012":1,"GO:0007435":1,"GO:0051402":1,"GO:0016579":1,"GO:0000910":1,"GO:0010332":1,"GO:1990966":1,"GO:0048872":1,"GO:2001170":1,"GO:0048535":1,"GO:0070212":1,"GO:0045471":1,"GO:0006290":1,"GO:0006954":1,"GO:2000620":1,"GO:0071707":1,"GO:0006271":1,"GO:1990506":1,"GO:0008630":1,"GO:0006288":1,"GO:0006287":1,"GO:0048536":1,"GO:0061674":1,"GO:0006039":1,"GO:0006286":1,"GO:0070512":1,"GO:0006297":1,"GO:0016446":1,"GO:0051102":1,"GO:0045666":1,"GO:0085020":1,"GO:0055093":1,"GO:0006303":1,"GO:0006284":2,"GO:1903507":1,"GO:2000466":1,"GO:2001153":1,"GO:0003335":1,"GO:0006915":1,"GO:0043488":1,"GO:0042493":1,"GO:0071375":1,"GO:2000327":1,"GO:0090502":1,"GO:0006308":1,"GO:1900087":1,"GO:0080111":1,"GO:0071320":1,"GO:0045454":1,"GO:0070301":1,"GO:0044179":1,"GO:0014912":1,"GO:0046856":1},"recipe_readded":[]}