{"hash":"1610525751057169299","title":"Ubiquitin-Dependent Protein Degradation","description":"This cluster centers on ubiquitination and downstream proteolysis: autoubiquitination, ubiquitin-dependent ERAD, K48-linked ubiquitination, and general ubiquitin-dependent protein catabolic processes. It also touches on related signaling and turnover roles, such as NF-kappaB activation, Wnt receptor degradation, and regulation of apoptosis, with additional hints from chromatin-related ubiquitination and V(D)J recombination. Together, these terms point to the ubiquitin-proteasome system governing protein turnover and signaling, justifying a label focused on ubiquitination and degradation.","confidence":"High","size":13,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":"autophagy","members":[{"accession":"NP_001190339.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"NP_176085.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0006295","GO:0006294","GO:0006296","GO:0045116","GO:0010265","GO:0043162","GO:0000717","GO:0006293","GO:0000715","GO:0016567","GO:1902104","GO:0042769","GO:0016032","GO:0051759","GO:0031146","GO:0070911","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:1902187","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0070534","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0070979","GO:0031145","GO:0051301","GO:0039536","GO:0002250","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"NP_176569.1","go_terms":["GO:0006311","GO:0070534","GO:0006915","GO:0060028","GO:1903343","GO:1902187","GO:0043045","GO:0045869","GO:1901536","GO:1904262","GO:0090309","GO:0016925","GO:0010508","GO:0051026","GO:0060669","GO:0034198","GO:0070936","GO:0001825","GO:2000653","GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0006295","GO:0006294","GO:0006296","GO:0045116","GO:0010265","GO:0043162","GO:0000717","GO:0006293","GO:0000715","GO:0016567","GO:1902104","GO:0042769","GO:0016032","GO:0051759","GO:0031146","GO:0070911","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0031030","GO:0032186","GO:1902364","GO:0000921","GO:0031578","GO:0097271","GO:0044810","GO:0090337","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"NP_177636.1","go_terms":["GO:0006311","GO:0070534","GO:0006915","GO:0060028","GO:1903343","GO:1902187","GO:0043045","GO:0045869","GO:1901536","GO:1904262","GO:0090309","GO:0016925","GO:0010508","GO:0051026","GO:0060669","GO:0034198","GO:0070936","GO:0001825","GO:2000653","GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"NP_187722.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0006295","GO:0006294","GO:0006296","GO:0045116","GO:0010265","GO:0043162","GO:0000717","GO:0006293","GO:0000715","GO:0016567","GO:1902104","GO:0042769","GO:0016032","GO:0051759","GO:0031146","GO:0070911","GO:0031030","GO:0032186","GO:1902364","GO:0000921","GO:0031578","GO:0097271","GO:0044810","GO:0090337"]},{"accession":"NP_683308.2","go_terms":["GO:0008626","GO:0030579","GO:0090035","GO:0010200","GO:0071361","GO:0090359","GO:0051865","GO:0030433","GO:0031943","GO:0070534"]},{"accession":"NP_850456.2","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0031030","GO:0032186","GO:1902364","GO:0000921","GO:0031578","GO:0097271","GO:0044810","GO:0090337","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"NP_193839.4","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:1902187","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0070534","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0035390","GO:1905765","GO:0033152","GO:0033153","GO:0006471","GO:0071169","GO:0006297","GO:0051103","GO:0051102","GO:0007000","GO:0010569","GO:0042276","GO:0002328","GO:2000232","GO:0031848","GO:0070200","GO:0010165","GO:0000463","GO:0010833","GO:0000466","GO:0061819","GO:0048239","GO:0072363","GO:0000012","GO:0071919","GO:0097680","GO:0044786","GO:0060261","GO:0048304","GO:0035066","GO:1903775","GO:0051568","GO:0060717","GO:1990166","GO:0060612","GO:0043542","GO:0000416","GO:1990683","GO:0030330","GO:2000781","GO:0051571","GO:0034184","GO:0001570","GO:0000910","GO:0045666","GO:1990966","GO:0006271","GO:0070212","GO:2001170","GO:0006039","GO:0070914","GO:0006260","GO:0006288"]},{"accession":"NP_178727.1","go_terms":["GO:0031146"]},{"accession":"NP_181733.1","go_terms":["GO:0006311","GO:0070534","GO:0006915","GO:0060028","GO:1903343","GO:1902187","GO:0043045","GO:0045869","GO:1901536","GO:1904262","GO:0090309","GO:0016925","GO:0010508","GO:0051026","GO:0060669","GO:0034198","GO:0070936","GO:0001825","GO:2000653","GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"NP_181969.2","go_terms":["GO:0006311","GO:0070534","GO:0006915","GO:0060028","GO:1903343","GO:1902187","GO:0043045","GO:0045869","GO:1901536","GO:1904262","GO:0090309","GO:0016925","GO:0010508","GO:0051026","GO:0060669","GO:0034198","GO:0070936","GO:0001825","GO:2000653","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:0035372","GO:0030433","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0042787","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0051865"]},{"accession":"NP_680579.2","go_terms":["GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0060544","GO:0000122","GO:0034121","GO:0043066","GO:0000209","GO:0071157","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0042787","GO:0070535","GO:1903265","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073","GO:0051865"]},{"accession":"NP_181044.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0031030","GO:0032186","GO:1902364","GO:0000921","GO:0031578","GO:0097271","GO:0044810","GO:0090337"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0070936":10,"GO:0042981":9,"GO:0033151":9,"GO:0070535":9,"GO:1901253":9,"GO:0038018":9,"GO:0007250":9,"GO:1903265":9,"GO:2000620":9,"GO:0016558":9,"GO:0009048":9,"GO:1900095":9,"GO:0036205":9,"GO:1903721":9,"GO:0030433":11,"GO:0033209":9,"GO:0046621":9,"GO:0060816":9,"GO:0085020":9,"GO:0090073":9,"GO:0051865":12,"GO:1903762":9,"GO:0070512":9,"GO:0042787":11,"GO:0046328":9,"GO:0051607":6,"GO:0006914":6,"GO:0046597":6,"GO:0061158":6,"GO:0000717":3,"GO:0048536":6,"GO:0000715":3,"GO:0007014":6,"GO:0051092":6,"GO:0045087":6,"GO:0043123":6,"GO:0051301":1,"GO:0045116":3,"GO:0097039":6,"GO:0048490":6,"GO:0031664":6,"GO:0061470":6,"GO:0070534":7,"GO:0000185":6,"GO:0002635":6,"GO:0046007":6,"GO:0043162":3,"GO:0048535":6,"GO:0016032":3,"GO:0039536":5,"GO:0043029":6,"GO:1903886":6,"GO:1902104":3,"GO:0031145":1,"GO:0009896":6,"GO:0042769":3,"GO:0051759":3,"GO:0070911":3,"GO:0006293":3,"GO:0007026":6,"GO:0035372":6,"GO:0002250":5,"GO:0001782":6,"GO:0060546":6,"GO:0070979":1,"GO:0042098":6,"GO:0006296":3,"GO:0010265":3,"GO:0006295":3,"GO:0032897":6,"GO:1903883":6,"GO:0031146":4,"GO:0050999":6,"GO:0006294":3,"GO:0033280":6,"GO:0045623":6,"GO:1902187":6,"GO:0016567":7,"GO:1901224":6,"GO:0006915":4,"GO:0000921":4,"GO:0090337":4,"GO:0001825":4,"GO:0044810":4,"GO:0032186":4,"GO:1904262":4,"GO:0097271":4,"GO:0043045":4,"GO:1901536":4,"GO:0031578":4,"GO:0051026":4,"GO:0045869":4,"GO:0031030":4,"GO:2000653":4,"GO:0010508":4,"GO:1902364":4,"GO:0060669":4,"GO:0034198":4,"GO:1903343":4,"GO:0016925":4,"GO:0006311":4,"GO:0090309":4,"GO:0060028":4,"GO:0043066":5,"GO:0071157":5,"GO:0000122":5,"GO:0060544":5,"GO:0034121":5,"GO:0000209":5,"GO:0008626":1,"GO:0010200":1,"GO:0030579":1,"GO:0090035":1,"GO:0090359":1,"GO:0071361":1,"GO:0031943":1,"GO:0034184":1,"GO:0060717":1,"GO:0042276":1,"GO:0002328":1,"GO:0061819":1,"GO:2001170":1,"GO:0051568":1,"GO:0072363":1,"GO:0070212":1,"GO:0010833":1,"GO:0070200":1,"GO:0000416":1,"GO:0035390":1,"GO:1990683":1,"GO:0071169":1,"GO:0070914":1,"GO:0006288":1,"GO:0051102":1,"GO:0051571":1,"GO:1990166":1,"GO:0060612":1,"GO:0006297":1,"GO:0051103":1,"GO:0006271":1,"GO:0033152":1,"GO:0006260":1,"GO:0097680":1,"GO:0030330":1,"GO:0043542":1,"GO:0006471":1,"GO:0045666":1,"GO:1990966":1,"GO:0010165":1,"GO:0006039":1,"GO:0035066":1,"GO:0071919":1,"GO:0000012":1,"GO:1905765":1,"GO:0007000":1,"GO:0048304":1,"GO:0000463":1,"GO:0033153":1,"GO:0000466":1,"GO:2000232":1,"GO:0060261":1,"GO:0000910":1,"GO:1903775":1,"GO:0031848":1,"GO:0010569":1,"GO:0048239":1,"GO:0001570":1,"GO:0044786":1,"GO:2000781":1},"recipe_readded":["NP_001320742.1","NP_180508.1","NP_180509.1","NP_177598.1","NP_180506.1","NP_180510.1","NP_177150.2","NP_177958.1","NP_176178.1","NP_180507.1","NP_174034.1","NP_180503.1","NP_177955.1","NP_001184949.1","NP_176176.1","NP_180505.1","NP_198937.1","NP_187538.1","NP_189966.1","NP_173161.1"]}