{"hash":"510523382578765353","title":"Retroviral integration and latency","description":"The cluster is dominated by GO terms tied to retroviral activity: DNA integration, RNA-templated DNA biosynthesis (reverse transcription), DNA replication, and establishment of integrated proviral latency, along with viral entry into the host nucleus and host cell entry. This combination points to stages of the viral life cycle that include infection, reverse transcription, genome integration, and latent provirus maintenance, with additional signals of host RNAi pathway interaction. Thus the theme best fits proviral integration and latency in a viral context.","confidence":"High","size":15,"edges":0,"triangles":0,"max_degree":0,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"KAL5250694.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5251205.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5254842.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5268667.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5268986.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5257942.1","go_terms":["GO:0000738","GO:0000289","GO:0002107","GO:0010606","GO:0006281","GO:0006261","GO:0000467","GO:0008033","GO:0034415","GO:0031047"]},{"accession":"KAL5249347.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5251660.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5251802.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5252239.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5256017.1","go_terms":["GO:0090502","GO:0046718","GO:0006278","GO:0015074","GO:0075713","GO:0075732","GO:0043137","GO:0006310","GO:0039651"]},{"accession":"KAL5257941.1","go_terms":[]},{"accession":"KAL5265026.1","go_terms":["GO:0006313"]},{"accession":"KAL5265062.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5265305.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]}],"graph":[],"all_go_terms":{"GO:0015074":12,"GO:0070301":2,"GO:0003335":2,"GO:0042493":2,"GO:0014912":2,"GO:0071375":2,"GO:0006915":2,"GO:0007568":2,"GO:0090502":3,"GO:0043488":2,"GO:0039651":12,"GO:0080111":2,"GO:2000466":2,"GO:1903704":11,"GO:0044179":2,"GO:0006284":2,"GO:0006308":2,"GO:0075713":12,"GO:2001153":2,"GO:2000327":2,"GO:1903507":2,"GO:0071320":2,"GO:0046856":2,"GO:0006310":12,"GO:0006278":12,"GO:0006260":11,"GO:0045454":2,"GO:0006313":3,"GO:0075732":12,"GO:0046718":12,"GO:1900087":2,"GO:0000467":1,"GO:0000289":1,"GO:0000738":1,"GO:0006261":1,"GO:0010606":1,"GO:0031047":1,"GO:0008033":1,"GO:0034415":1,"GO:0002107":1,"GO:0006281":1,"GO:0043137":1},"recipe_readded":["KAL5258943.1","KAL5267572.1","KAL5248923.1","KAL5261982.1","KAL5267666.1","KAL5253282.1","KAL5256664.1","KAL5259863.1","KAL5248695.1","KAL5269289.1","KAL5262459.1","KAL5256921.1","KAL5264174.1","KAL5271412.1","KAL5271233.1","KAL5266918.1","KAL5263841.1","KAL5251267.1","KAL5257921.1","KAL5256120.1"]}