{"hash":"504827216480110202","title":"Retroviral DNA integration and latency","description":"The cluster's top GO terms heavily emphasize retroviral lifecycle steps: RNA-templated DNA synthesis (reverse transcription), DNA integration, DNA replication, and establishment of integrated proviral latency, along with viral entry/penetration into the host nucleus. These together form a coherent retroviral replication/latency theme, with some host interaction terms like apoptosis activation by symbionts, reinforcing a virus\u2013host interaction pattern rather than typical host cellular processes.","confidence":"High","size":27,"edges":5,"triangles":0,"max_degree":2,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"KAL5247676.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5248897.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5249471.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5249550.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5253179.1","go_terms":["GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0006310","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5254161.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5255995.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"KAL5257693.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5258269.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5259868.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5262238.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5267710.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5267782.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:0006313"]},{"accession":"KAL5268218.1","go_terms":["GO:0016266","GO:0046373","GO:0070278","GO:0006683","GO:0018243","GO:0018242","GO:0017148","GO:0045493","GO:0031221","GO:0002378","GO:0036108","GO:0030244","GO:0019350","GO:0071555","GO:0006011","GO:0030213"]},{"accession":"KAL5271520.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"KAL5272920.1","go_terms":["GO:0090502","GO:0046718","GO:0006278","GO:0015074","GO:0075713","GO:0075732","GO:0043137","GO:0006310","GO:0039651","GO:0006260","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5253053.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"KAL5269464.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5249753.1","go_terms":["GO:0006313"]},{"accession":"KAL5248062.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5248438.1","go_terms":[]},{"accession":"KAL5255454.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5261067.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5263169.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5265474.1","go_terms":["GO:0090502","GO:0046718","GO:0006278","GO:0015074","GO:0075713","GO:0075732","GO:0043137","GO:0006310","GO:0039651","GO:0006260","GO:1903704"]},{"accession":"KAL5269463.1","go_terms":["GO:0046718","GO:0006310","GO:0006278","GO:0075713","GO:0075732","GO:0015074","GO:0006260","GO:0039651","GO:1903704","GO:2000327","GO:0014912","GO:0003335","GO:2001153","GO:0045454","GO:0071375","GO:0043488","GO:0044179","GO:0006308","GO:0046856","GO:1900087","GO:0090502","GO:0006284","GO:0070301","GO:2000466","GO:0006915","GO:1903507","GO:0080111","GO:0007568","GO:0071320","GO:0042493"]},{"accession":"KAL5272205.1","go_terms":[]}],"graph":[["KAL5267782.1","KAL5268218.1",0.501],["KAL5269464.1","KAL5268218.1",0.658],["KAL5269463.1","KAL5272920.1",0.678],["KAL5272920.1","KAL5255454.1",0.506],["KAL5253053.1","KAL5262238.1",0.503]],"all_go_terms":{"GO:0015074":22,"GO:0006310":23,"GO:0006278":22,"GO:0006260":22,"GO:0075713":22,"GO:0039651":22,"GO:0075732":22,"GO:0046718":22,"GO:1903704":22,"GO:0006313":7,"GO:0070301":5,"GO:0003335":5,"GO:0042493":5,"GO:0014912":5,"GO:0071375":5,"GO:0006915":5,"GO:0007568":5,"GO:0090502":7,"GO:0043488":5,"GO:0080111":5,"GO:2000466":5,"GO:0044179":5,"GO:0006284":5,"GO:0006308":5,"GO:2001153":5,"GO:2000327":5,"GO:1903507":5,"GO:0071320":5,"GO:0046856":5,"GO:0045454":5,"GO:1900087":5,"GO:0030213":1,"GO:0006683":1,"GO:0046373":1,"GO:0018242":1,"GO:0016266":1,"GO:0017148":1,"GO:0070278":1,"GO:0018243":1,"GO:0045493":1,"GO:0002378":1,"GO:0031221":1,"GO:0019350":1,"GO:0071555":1,"GO:0006011":1,"GO:0036108":1,"GO:0030244":1,"GO:0043137":2},"recipe_readded":["KAL5258943.1","KAL5255632.1","KAL5251772.1","KAL5260710.1","KAL5251770.1","KAL5267566.1","KAL5248758.1","KAL5270138.1","KAL5269367.1","KAL5267257.1","KAL5261982.1","KAL5253282.1","KAL5260539.1","KAL5260786.1","KAL5256664.1","KAL5250427.1","KAL5267870.1","KAL5259863.1","KAL5251930.1","KAL5263919.1"]}